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目的 探讨阿托伐他汀含药血清干预THP-1源性泡沫细胞模型的机制。方法 提取阿托伐他汀钙片大鼠含药血清;将人源THP-1细胞用佛波酯(PMA)刺激诱导分化成巨噬细胞,后将巨噬细胞通过氧化低密度脂蛋白(ox-LDL)孵育建立泡沫细胞模型;将建模后的泡沫细胞分成模型组和西药组,分别加入正常血清与阿托伐他汀钙片含药血清进行干预;提取总RNA进行miRNA测序;将测序筛选出的差异miRNA结果通过生物信息学方法进行靶基因预测,并对相关靶基因进行基因本体论(GO)富集分析与京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路分析。结果 经测序筛选差异miRNA有56条,预测靶基因1 713个,GO富集分析显示预测靶基因参与18种生物学过程,有15种分子功能,含7种细胞组分类型;KEGG通路富集分析得到20条信号通路。结论 阿托伐他汀含药血清干预THP-1源性泡沫细胞模型差异miRNA中,差异倍数显著且表达量丰富的上、下调miRNA分别为hsa-miR-3184-3p与hsa-miR-423-5p, KEGG通路富集最显著的信号通路为MAPK信号通路、Hippo信号通路、Wnt信号通路。 相似文献
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目的 运用代谢组学技术对比慢性阻塞性肺疾病急性加重(AECOPD)痰热壅肺证患者与健康人的尿液,寻找其可能的尿液代谢标志物,并分析可能的代谢通路。方法 选择10例AECOPD痰热壅肺证患者为试验组,选择同期10例体检健康者为空白组,通过液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)技术检测2组尿液的差异代谢物,并利用主成分分析(PCA)和正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)的方法对差异代谢物进行筛选,再通过京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库和人类代谢组数据库(HMDB)进行通路富集分析并筛选重要的差异代谢物。结果 通过代谢组学技术对比,共筛选出143个差异代谢物,其中上调的代谢物有59个,下调的代谢物有84个,上升的是咖啡因、可可碱、1,7-二甲基尿酸等,下降的是肉毒碱、泛酸、L-半胱氨酸等。2组差异代谢物再经过KEGG数据库和HMDB数据库进行通路富集分析并筛选显示,主要涉及半胱氨酸和蛋氨酸代谢(Cysteine and methionine metabolism)、色氨酸代谢(Tryptophan metabolism)、缬氨酸,亮氨酸和异亮氨酸的降解(Valine, leuci... 相似文献
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