厦门市139株沙门氏菌血清型分布及分子分型分析

目的了解本地区沙门氏菌血清型分布特征和基因分型情况,建立基因分型数据库,为以后的暴发溯源以及疾病的早期预警提供基础数据。方法采用脉冲场凝胶电泳技术(PFGE)对139株不同来源的沙门氏菌进行分子分型分析,酶切电泳图谱导入BioNumerics软件进行聚类分析。同时按照相关国家标准完成血清学检测。结果沙门氏菌除4株无法分型外,其余135株可分为18个血清型,肠炎沙门氏菌为优势血清型,主要来源于食物中毒标本,占总数的40.29%(56/139),其次为鼠伤寒沙门氏菌和乙型副伤寒沙门氏菌,分别占总数的19.42%和8.63%,主要来源于临床标本。139株菌利用Xba I酶切并经PFGE电泳后产生63个PFGE带型,带型间相似度值在53.7%-100%之间,优势带型为PT51,包含的菌株均为肠炎沙门氏菌。结论厦门地区沙门氏菌血清型以肠炎沙门氏菌为主;分子分型结果呈现多样性,但食物中毒株PFGE带型较单一。     

牛蛙和养殖池霍乱弧菌污染状况及与产肠毒素霍乱弧菌的差异

1996年笔者从牛蛙体内检出01群霍乱弧菌(V.cholerae,VC),从而引起了对牛蛙养殖池污染霍乱弧菌的重视.此后10多年来,在霍乱监测工作中屡从牛蛙及养殖池检出01VC,检出率高于水与其他水产品,但一直未明确其与人间霍乱疫情的关系;由于处理霍乱疫情耗费大量的人力物力,可能造成一定的社会经济影响,因此对如何处置污染霍乱弧菌的养殖池也甚为困惑.     

厦门市2008年至2010年HIV抗体筛查阳性标本复检及确证情况分析

目的分析厦门市HIV抗体筛查实验室检测情况,为指导监测检测工作提供依据,以促进实验室网络检测能力提高。方法采用一种ELISA试剂和一种快速法试剂对2008年至2010年厦门市各HIV抗体筛查实验室初筛阳性送检的799份样本进行复检,采用wB试剂对复检阳性标本进行确证,并对其检测结果分析比较。结果经复检,有402份HIV抗体2种方法均为阴性（402／799,50．3％）,血站送检样本复检阴性率（199／236,84．3％）显著高于医疗和疾控系统;医疗和疾控系统3年来送检样本复检阴性呈现逐年降低的趋势。ELISA和快速法双阳性6WB的阳性符合率为97．8％。HIV抗体不确定的WB带型中p24出现几率最高。结论3年来厦门市Hivg体筛查实验室检测质量在逐步提高,但仍需进一步加强实验室规范化管理;应加强对HIv抗体不确定受检者的随防检测。     

荧光置换探针多重实时PCR检测结核杆菌3种耐药突变

[目的]建立单管检测结核分枝杆菌3种耐药突变的多重实时PCR检测方法,考察其敏感性并应用于痰标本的检测。[方法]将荧光双链置换探针、实时PCR和多重PCR相结合,针对3种一线药物链霉素、异烟肼和乙胺丁醇中最常见的且都是由于点突变而导致的耐药突变位点进行检测。[结果]该检测体系可以检测到5个菌/test。用该体系检测9份已知基因型的结核分枝杆菌培养标本和118份痰标本,所有检测结果均通过ARMS体系验证。[结论]该检测体系具有很高的敏感性和特异性,检测快速,测定突变位点范围较其它技术有较大提高,且操作简便,有利于结核病菌的早期耐药检测和指导医生用药。     

厦门市2008～2010年HIV抗体筛查阳性标本复检及确证情况分析

目的:分析厦门市HIV抗体筛查实验室检测情况,为指导监测检测工作提供依据,以促进实验室网络检测能力提高。方法:采用一种ELISA试剂和一种快速法试剂对2008～2010年厦门市各HIV抗体筛查实验室初筛阳性送检的799份样本进行复检,采用WB试剂对复检阳性标本进行确证,并对其检测结果分析比较。结果:经复检,有402份HIV抗体两种方法均为阴性(402/799,50.3%),血站送检样本复检阴性率(199/236,84.3%)显著高于医疗和疾控系统;医疗和疾控系统3年来送检样本复检阴性呈现逐年降低的趋势。ELISA和快速法双阳性与WB的阳性符合率为97.8%。HIV抗体不确定的WB带型中p24出现几率最高。结论:三年来厦门市HIV抗体筛查实验室检测质量在逐步提高,但仍需进一步加强实验室规范化管理;应加强对HIV抗体不确定受检者的随防检测。     

厦门市2008年至2010年HIV抗体筛查阳性标本复检及确证情况分析

目的 分析厦门市HIV抗体筛查实验室检测情况,为指导监测检测工作提供依据,以促进实验室网络检测能力提高.方法 采用一种ELISA试剂和一种快速法试剂对2008年至2010年厦门市各HIV抗体筛查实验室初筛阳性送检的799份样本进行复检,采用WB试剂对复检阳性标本进行确证,并对其检测结果分析比较.结果 经复检,有402份HIV抗体2种方法均为阴性(402/799,50.3％),血站送检样本复检阴性率(199/236,84.3％)显著高于医疗和疾控系统;医疗和疾控系统3年来送检样本复检阴性呈现逐年降低的趋势.ELISA和快速法双阳性与WB的阳性符合率为97.8％.HIV抗体不确定的WB带型中p24出现几率最高.结论 3年来厦门市HIV抗体筛查实验室检测质量在逐步提高,但仍需进一步加强实验室规范化管理;应加强对HIV抗体不确定受检者的随防检测.     

2011年厦门市某医院十例无菌性脑炎暴发病例病原学分析

目的 对2011年5月11-17日厦门某医院收治的10例无菌性脑炎患者进行病原学鉴定.方法 采集10例患者的咽拭子、肛拭子及部分患者的脑脊液,进行总肠道病毒核酸检测.总肠道病毒核酸阳性的样本,分别用肠道病毒A、B、C基因型各自的VP1通用引物扩增,VP1区扩增阳性的标本测序后进行序列分析.同时,用Vero细胞进行病毒分离培养,对培养成功的病毒与原始临床标本进行VP1序列同源性分析,从而对引发本次脑炎的病原进行鉴定.结果 10例脑炎患者中,有7例患者的临床标本总肠道病毒核酸检测阳性.这7例患者的咽拭子和(或)肛拭子标本肠道病毒B基因型VP1通用引物扩增阳性,测序后分析表明均为肠道病毒B基因型埃可病毒30(Echo 30),且与浙江2004年流行毒株的同源性达95.3%～97.1%.其中编号为XM2、XM3、XM4、XM8的咽拭子和XM3、XM6的肛拭子相互间序列同源性为99.4%～100.0%,但与XM1的咽拭子序列存在差异,同源性为92.8%～93.4%.此外,XM1、XM2、XM3、XM4、XM8咽拭子标本Vero细胞分离培养病毒成功,其VP1区部分序列与相应的原始标本同源性大于99.9%.结论 导致这次无菌性脑炎的病原体为肠道病毒B基因型Echo 30,并提示可能存在多种不同遗传背景的Echo 30在流行.

Abstract：

Objective To identify the etiology of an aseptic encephalitis outbreak (ten cases) in a hospital of Xiamen city from 11 to 17 May, 2011.Methods A total of ten patients′ throat swabs, anal swabs and cerebrospinal fluid were collected and detected by RT-PCR for pan-enterovirus. The samples containing detectable pan-enterovirus were tested by PCR with genotype-specific general primers located in VP1 region of enterovirus genotype A, B and C (HEV-A, B and C). The PCR products of VP1 segment were purified and sequenced, and phylogenetic analysis was performed. Meanwhile, the pathogens in those samples were isolated in Vero cell culture. Homologous analysis of VP1 sequences were carried out for the cultured virus samples and the original clinical samples to identify the outbreak etiology.Results Among the ten cases, seven cases were positive for pan-enterovirus nucleic acid. When tested by genotype-specific PCR, the throat and anal swab samples from those 7 patients were positive with HEV-B VP1 primers. Meanwhile, the HEV-B VP1 segments were sequenced and phylogenetic analyzed, which indicated the seven cases were all infected by enterovirus Echo 30. The sequences from those samples had homology of 95.3%-97.1% with the epidemic strains in Zhejiang, 2004. Out of the seven cases, the sequences of XM2,XM3,XM4,XM8 throat swab samples and XM3,XM6 throat samples showed 99.4%-100.0% homology which were different from the sequence of XM1, and the homology was 92.8%-93.4%. Furthermore, the viruses were isolated using Vero cells from XM1,XM2,XM3,XM4 and XM8 throat swab samples,and the VP1 sequence showed more than 99.9% homology with the original specimens.Conclusion The local outbreak of aseptic encephalitis was caused by Echo 30 of enterovirus genotype B, and the epidemic strains may have different genetic background.     

探针熔解分析法快速检测结核分枝杆菌链霉素耐药突变

目的评价探针熔解分析法快速检测结核分枝杆菌链霉素耐药突变的应用价值,为临床应用提供依据。方法首先用中国药品生物制品检定所提供的含37份标准非结核分枝杆菌的标准盘进行特异性评价,然后将野生型结核分枝杆菌H37Rv基因组DNA梯度稀释进行灵敏度考察,最后对906株结核分枝杆菌临床分离株（其中37份有药物敏感性试验结果）的链霉素耐药相关基因进行检测,并对突变菌株、有药敏结果的菌株以及疑似杂合的菌株进行测序分析。结果标准盘评价结果证实该体系特异检测H37Rv结核分枝杆菌。分析灵敏度为5~50拷贝每反应。在所有的906份结核分枝杆菌培养标本中,103份标本发生突变且与测序结果一致,18份标本存在杂合信号,17份标本无信号。37份有药敏结果的标本中,敏感的标本用探针熔解分析法所得结果均为野生型,耐药的16份标本仅检测到7份突变,另有9份耐药的标本实时检测为野生型,与测序结果相符。结论探针熔解分析技术特异性好,可以快速、准确地检测结核分枝杆菌链霉素耐药常见突变,有望直接用于临床标本链霉素耐药性检测。     

应用探针熔解分析法检测结核分枝杆菌rpoB基因突变

摘要：目的研究结核分枝杆菌利福平耐药突变实时PCR检测试剂盒（探针熔解分析）的临床应用价值。方法用37株非结核分枝杆菌考察该方法的特异性,用菌株H37Rv考察其检测限,并检测962份结核分枝杆菌培养标本的rpoB基因利福平耐药决定区突变,检测结果经测序验证。结果37株非结核分枝杆菌中仅有3株出现耐药突变峰,检测限考察结果表明该方法每反应可重复检出30个菌。     

4重荧光PCR技术在霍乱监测与菌株鉴定的应用研究

目的 应用4重荧光PCR技术检测霍乱弧菌并对菌株进行鉴定.方法 用PCR法对2008-2010年监测的水样、水产品标本及食物中毒疑似菌株以进行检测.同时用细菌学方法分离菌株.再进行PCR检测.结果 1606份标本中.PCR法检出O1群霍乱弧菌阳性标本188份.从中分离到菌株150份(79.8％).O139群霍乱弧菌的P...