基于转录组数据分析药用大黄的密码子使用偏好性

目的研究药用大黄Rheum officinale转录组编码序列的密码子使用特点及其影响因素,为蒽醌类化合物异源合成的载体选择及药用大黄分子进化研究提供理论基础。方法利用perl程序及Codon W软件分析4733条药用大黄转录组编码序列的密码子使用偏好性。结果药用大黄转录组编码序列的GC、GC3平均含量分别为45.6%、44.73%,GC12与GC3存在显著正相关(r=0.215,P0.001);ENc-GC3中性图及偏倚性分析结果显示,大部分基因分布于远离期望曲线和平面中心点,大部分基因分布偏离期望曲线和中心点。通过基因高表达筛选密码子方法确定了29个药用大黄的最优密码子,大多数的最优密码子以U和A结尾。结论突变压力在药用大黄转录组编码序列的密码子使用偏好性形成过程这起到主要作用。     

铁皮石斛锌铁调控转运蛋白基因的克隆与表达分析

锌铁调控转运蛋白(ZRT, IRT-like protein, ZIP)在植物生长发育过程中起重要的调控作用。研究采用实时定量PCR(QPCR)和RACE技术,首次从珍稀濒危兰科药用铁皮石斛Dendrobium officinale中克隆得到1个ZIP基因cDNA全长,命名为DoZIP1,提交GenBank获得注册号KJ946203。生物信息学分析显示,该基因开放阅读框1 056 bp,编码1条由351个氨基酸组成的肽链,相对分子质量37.57 kDa,等电点6.09。推定的DoZIP1蛋白具有保守的锌铁调控转运相关蛋白结构域,二级结构包含α螺旋50.71%、延伸链11.11%、β转角1.99%与随机卷曲36.18%,具有信号肽和8个跨膜域,预测定位在质膜。该蛋白质氨基酸序列与拟南芥、苜蓿、水稻等物种ZIP蛋白相似性较高,系统进化分析表明其与AtZIP10,OsZIP3蛋白的亲缘关系较近,聚在一个分支。QPCR分析表明,DoZIP1基因转录本在根中相对表达量较高,为茎中的4.19倍;叶次之,为茎的1.12倍。DoZIP1基因的分子特征为下一步研究其在铁皮石斛生长发育过程的生物学功能奠定基础。     

陕西产重楼属种质资源的SCoT遗传多样性分析

目的对陕西产重楼属6个类群的遗传多样性和亲缘关系进行分析。方法采用SCoT分子标记技术和非加权平均距离法(UPGMA)对陕西产重楼属6个类群48份样品进行遗传多样性和聚类分析。结果从82条SCoT引物中共筛选出12条多态性稳定、清晰的引物,48份重楼样品共扩增出152个DNA片段,多态性片段数为135,平均每个引物扩增出12.67个DNA片段,其多态性为88.82%;重楼属植物在物种水平上具有较高的遗传多样性,Nei’s基因多样性指数(H)为0.267 4,Shannon指数(I)平均值为0.404 1,居群间遗传分化系数(Gst)为0.517 9,种群间基因流(Nm)为0.465 4;6个类群重楼按遗传多样性水平排序为七叶一枝花宽叶重楼具柄重楼狭叶重楼宽瓣重楼北重楼,聚类分析可将北重楼组和其他重楼组区分开来,当遗传距离一定时,重楼属6个类群被完全区分开来。结论 SCoT分子标记可获得多态性丰富、清晰的条带扩增图谱,表明该技术可用于陕西产重楼属主要类群物种分子鉴定和亲缘关系研究,为筛选与药典收载种类近缘的可替代资源种类、指导合理利用地方种类自然资源提供了科学依据。     

冠状动脉CT血管成像对无症状人群非钙化性斑块危险因素的相关性研究

目的对行64排螺旋CT冠状动脉成像的无症状人群非钙化性斑块发生的相关危险因素进行系统分析，为临床早期预防急性冠状动脉综合征提供参考依据。方法对370例无症状患者的冠状动脉CT成像进行回顾性分析。对非钙化性斑块与危险因素及冠状动脉狭窄性心脏病低、中、高危险度的关系进行分析。结果370例患者中，124例患者发现非钙化性斑块。根据Logistic回归分析，高血脂、糖尿病、家族史明显影响非钙化性斑块的发生率。结论糖尿病、高血脂、家族史是非钙化性斑块形成的危险因素。建议对糖尿病与高血脂患者进行CT冠状动脉成像筛查非钙化性斑块，评估急性冠状动脉综合征危险度，指导临床治疗并预防急性冠状动脉综合征的发生。     

不同干燥方法对远志筒及根中主要化学成分的影响

目的考察晒干、阴干、热风干燥(40、50、60、70℃)、微波干燥和冷冻干燥5种干燥方法对远志筒及根中主要化学成分的影响。方法运用HPLC法测定不同干燥方法对远志筒及根中远志酮III、3,6′-二芥子酰基蔗糖、远志酸、远志皂苷元、细叶远志皂苷的组成和含量变化;采用单因素方差分析和TOPSIS法对数据进行综合分析。结果远志筒和根的干燥方法优选顺序存在差异,远志筒不同干燥方法对有效成分影响的优劣排序为微波干燥60℃热风干燥50℃热风干燥70℃热风干燥冷冻干燥40℃热风干燥阴干晒干;远志根中,不同干燥方法的排序为微波干燥60℃热风干燥阴干晒干50℃热风干燥40℃热风干燥70℃热风干燥冷冻干燥。结论结合生产实践,微波干燥和60℃热风干燥是远志筒和根较适宜的干燥方法,可为远志不同规格药材产地干燥方式的确定提供依据。     

白鲜根转录组高通量测序与数据分析

目的获得白鲜Dictamnus dasycarpus根转录组信息特征。方法以白鲜根为研究对象,采用Illumina HiSeq TM 2000150PE进行高通量转录组测序并进行数据分析。结果转录组测序共获得69 643 286条高质量序列(clean reads),Trinity denovo组装获得49 050条unigenes,平均长度841 nt。BLAST分析显示分别有31 636(64.49%)、22 367(45.60%)、19 246(39.23%)、12 595(25.68%)条unigenes在NR、Swiss-port、KOG、KEGG数据库得到注释信息,可归为GO分类的生物过程、细胞组分和分子功能3大类42分支,涉及132个KEGG标准代谢通路,其中包括18个次生代谢标准通路。进一步分析获得90个基因参与多种生物碱生物合成通路。蛋白编码框序列1 908个,高等植物转录因子55个家族;借助MISA软件发现4 579个SSRs,三碱基重复最丰富,有2 021个,出现频率为44.1%;五碱基重复SSRs仅占3.5%。结论利用高通量测序技术获得白鲜根转录组信息特征,为后期白鲜基因功能鉴定、次生代谢途径解析及其调控机制研究奠定基础。     

决明Aux/IAA和ARF基因家族鉴定、表达及蛋白互作分析

植物生长素早期响应基因家族(auxin/indole-3-acetic acid, Aux/IAA)及其与生长素响应转录因子(auxin response factor, ARF)的互作是调控植物生长发育的重要方式。本文基于药用植物决明(Senna tora L.)全基因组数据鉴定到28个StoIAA和24个StoARF成员,分别归为10个和8个亚家族。系统发育树和共线性分析发现,决明与大豆(Glycine max)、蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)的IAA、ARF同源基因均存在密切的进化关系,且基因片段重复事件主导了StoIAA和StoARF的扩张。基因结构分析显示,绝大多数StoIAAs和StoARFs含有特征保守结构域。转录组数据分析显示, StoIAAs和StoARFs在叶、根和种子中均有表达,部分成员具有组织表达特异性。StoIAA和StoARF启动子区域多含有与胁迫响应、生长发育、激素诱导、次生代谢等相关的作用元件。基因表达分析显示许多StoIAAs和StoARFs能够迅速响应干旱和盐胁迫,且在两种胁迫条件下表现出相似的表达模式。酵母双杂交实验证实StoA...     

关于企业医院分离改革的调查

随着我国社会主义市场经济改革和国有企业改革进入实质性攻坚阶段 ,分离企业办社会职能成为当前国企改革的重要问题之一。内江市政协、农工民主党内江市委员会、内江市卫生局于 6月 15日在内江铁路医院 (内江市第六人民医院 )召开了“内江市企业医院改革座谈会”,对内江市属范围内 11家企业医院的现状、分离改革情况、存在的问题等进行了分析、解剖、调研、探讨 ,以便寻求企业医院社会化分离后的出路。笔者有幸参加了这次就内江市企业医院分离改革问题进行的专题调研会。1　企业医院现状内江市目前具有一定规模的企业职工医院共有 11家 ,按…     

四肢手术中电动止血带的应用体会

在骨科手术中，除少数禁忌外，止血带为四肢手术的必备用物。合理的使用止血带可以减少手术中出血，使创面视野清晰，容易辨认组织结构，便于手术操作，避免组织损伤，缩短手术时间。但止血带使用不当可出现局部皮肤损伤、止血带反应，甚至出现神经损伤，止血带休克等严重并发症。我院自2004年1月至2007年12月对1017例骨科四肢手术患者应用电动气压止血仪，效果满意，无1例并发症发生，现报告如下。     

《金匮要略》对耳鼻喉科临床的影响

从主张治未病、重视整体性、注重从脏腑经络辨治、强调辨病与辨证相结合以及灵活运用内治法和外治法五个方面,阐述了《金匮要略》辨证论治的思想对后世耳鼻喉科疾病治疗的影响。认为现代耳鼻喉疾病的发生虽然与古代有所不同,但是《金匮要略》的论治思想和治疗法则仍然对现代耳鼻喉科的临床发挥着重要的指导作用。