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乳腺癌miRNAs表达谱检测及初步分析 总被引:7,自引:0,他引:7
目的 制作哺乳动物micro RNAs(miRNAs)检测微阵列,筛选乳腺癌miRNAs表达谱并进行初步分析.方法 利用已知的人及小鼠的miRNAs序列,设计了496条探针,制作miRNAs微阵列并验证其可靠性;培养乳腺癌细胞株MCF-7和正常乳腺上皮细胞株MCF-10A,分别抽提细胞总RNA,分离小分子RNA,经T4RNA连接酶荧光标记后与微阵列杂交,通过芯片扫描和数据分析,获得乳腺癌miRNAs表达谱.结果 成功制作哺乳动物miRNAs微阵列,筛选获得57个乳腺癌相关miRNAs,其中,29个为低表达,28个为高表达.结论 建立了哺乳动物miRNAs检测微阵列的技术平台,并筛选到乳腺癌miRNAs表达谱,为进一步研究其在乳腺癌发病机制中的作用打下基础. 相似文献
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目的 构建人肝细胞核因子-1α(hepatocyte nuclear factor 1α,HNF1α)真核表达载体,在体外表达并检测.方法 提取HepG2总RNA,用RT-PCR方法制备HNF1α cDNA,进行T-A 克隆.Hind Ⅲ/EcoR Ⅰ双酶切测序正确的重组质粒,回收HNF1α cDNA片段,将其亚克隆于pcDNA3.1( )载体的多克隆位点内.将构建好的真核表达质粒用脂质体法转染HepG2细胞,RT-PCR和免疫印迹法检测HNF1α的表达. 结果正确构建了pcDNA3.1( )-HNF1α重组载体,并且在转染该质粒的HepG2细胞中检测出了HNF1α的高表达. 结论成功地构建了人HNF1α真核表达载体,其可以在体外表达. 相似文献
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基于基因芯片的乳腺癌干细胞miRNAs检测分析 总被引:4,自引:3,他引:4
目的 利用流式细胞仪(FACS)细胞分选技术从乳腺癌细胞株MCF-7中分选乳腺癌干细胞,并利用基因芯片进行其miRNAs表达谱分析.方法 利用已知的乳腺癌干细胞的表面分子标志(CD44 ESA CD24-/low),以相应的荧光标记抗体对细胞加以标记,FACS细胞分选获得乳腺癌干细胞,NOD-SCID移植瘤实验进行干细胞功能鉴定;分别提取细胞总RNA以及小分子RNA,经荧光标记后与miRNAs基因芯片杂交,获得乳腺癌干细胞miRNAs表达谱.结果 从MCF-7中分选到约1%的CD44 ESA CD24-/low细胞,NOD-SCID移植瘤实验表明其具有干细胞特性,基因芯片杂交获得20个乳腺癌干细胞相关miRNAs,其中4个为低表达,16个为高表达.结论 乳腺癌干细胞具有自身特征性miRNAs,为进一步从干细胞层面研究乳腺癌发病机制及靶向治疗打下基础. 相似文献
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DNA甲基化是哺乳类动物一个重要的基因外遗传信号。有研究表明,DNA甲基化与大多数肿瘤的发生相关,抑癌基因启动子CpG岛的高甲基化可引起抑癌基因表达沉默,细胞出现无节制生长,导致肿瘤的发生[1]。目前,甲基化特异性PCR(methylation-specific PCR,MS-PCR)是研究DNA甲基化最为常用且准确度较高的方法之一,而理想的引物设计则是其成功的关键因素之一。国外互联网上有1个提供免费在线引物设计程序“MethPrimer”,它能够预测CpG岛,根据实验者要求设计硫化测序PCR(bisulfate-sequencing PCR,BSP)和甲基化特异性PCR(methylation-sp… 相似文献
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目的 研究乳腺癌细胞中富含脯氨酸核受体辅活化子(proline-rich nuclear receptor coactivator protein,PNRC)基因启动子CpG岛的甲基化状态及在PNRC转录调节中的作用.方法 应用PT-PCR检测PNRC基因在正常乳腺细胞与乳腺癌细胞中的表达情况,并运用"MethPrimer"软件对PNRC启动子区进行分析,预测CpG岛,通过甲基化特异性PCR(methylation-specific PCR,MSP)检测PNRC启动子区CpG岛的甲基化状况;PT-PCR及Northern杂交检测乳腺癌细胞经甲基转移酶抑制剂5-氮杂-2'-脱氧胞苷(5-aza-2'-deoxycytidine,5-Aza-dc)作用后,PNRC基因mRNA的表达情况;Westernblot检测5-Aza-dc干预对PNRC蛋白表达的影响;将含PNRC启动子序列的报告质粒转染乳腺癌细胞,再经5-Aza-dc处理后,检测PNRC基因启动子的活性.结果 PNRC基因在乳腺癌细胞中的表达较正常乳腺细胞明显降低;乳腺癌细胞PNRC基因启动子区存在CpG岛甲基化;乳腺癌细胞经5-Aza-dc处理后,PNRC基因mRNA及蛋白表达水平显著增加,其PNRC基因启动子的活性也明显增强.结论 PNRC基因启动子区的高甲基化导致PNRC在乳腺癌细胞中表达降低. 相似文献
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目的 分析ERR1突变体I240R对ERR1转录活化功能的影响。方法 用重叠延伸PCR构建ERR1的缺失突 变体ERR1 I240R到真核表达质粒pSG5上,通过荧光素酶报告基因表达系统检测ERR1 I240R对ERR1转录活化功能的影 响。结果 测序证实成功构建了ERR1的突变体pSG5 ERR1 I240R。报告基因表达系统检测显示ERR1 I240R激活的荧光 素酶报告基因活性明显高于野生型的ERR1。结论 ERR1突变体ERR1 I240R转录活化功能明显高于野生型的ERR1,为 进一步研究ERR1的结构与功能打下了基础。 相似文献
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作者参照Gottesfeld的DNaseⅡ温和消化、配合Mg~(++)溶解的方法,结合本实验室条件加以改进,将大鼠肝染色质分离成S_2、P_1、P_2三个组份。比较分析了它们的化学组成,模板活性及对DNase Ⅰ消化的敏感性。结果显示:S_2染色质组份富含RNA和非组蛋白,具有高模板活性和高度的DNaseⅠ消化敏感性,其RNA含量为P_1、P_2RNA含量的2倍以上,S_2的模板活性分别为P_1、P_2的7.7倍和3.2倍,它对DNase Ⅰ的消化敏感性分别是P_1、P_2组份的20倍和7倍以上。说明此法分离的S_2染色质组份为肝细胞核内的转录活性染色质,而P_1、P_2组份为转录非活性染色质。 相似文献
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人TRAIL分子胞外区的纯化及活性检测 总被引:1,自引:0,他引:1
目的:利用大肠杆菌表达hTRAIL41-281蛋白,并纯化复性成生物活性形式。方法:以IPTG诱导表达,使用Ni-NTA层析柱分离纯化蛋白,透析法复性,SDS-PAGE和Western blot法进行鉴定,DNA断裂实验检测hTRAIL41-281蛋白的凋亡诱导活性。结果:表达的蛋白以包涵体的形式存在,纯化后得到分子量为30.5kD、纯度在90%以上的蛋白,Western blot证实为hTRARIL41-281分子。经复性,DNA断裂实验检测出该蛋白有较好的诱导肿瘤细胞凋亡活性。结论:成功地利用大肠杆菌表达、Ni—NTA层析柱分离纯化、透析法复性hTRAIL41-281蛋白,并证实其具有诱导肿瘤细胞凋亡的生物学活性。 相似文献
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目的:探讨核受体辅活化子(coactivator)PNRC(proline—rich nuclear receptor coregulatory protein)对乳腺癌细胞生长的影响。方法:以pACT2/PNRC为模板,采用PCR扩增全长PNRC编码序列,将BclⅠ和XhoⅠ消化的PCR产物插入pCMVtaq2c,构建pCMVtaq2c/PNRC真核表达质粒。酶切和测序鉴定后,采用脂质体转染法,分别将pCMVtaq2c/PNRC表达质粒和pCMVtaq2c空质粒转染MCF-7细胞,经G418筛选4周后,分别采用RT—PCR、Northern blot和Western Blot鉴定稳定表达PNRC的MCF-7细胞株。最后,采用MTT法和^3H-胸腺嘧啶掺入法观察了过表达PNRC的MCF-7乳腺癌细胞和pCMVtaq2c空质粒转染的MCF-7乳腺癌细胞生长速率和增殖的差异。结果:成功构建了PNRC的真核表达质粒pCMVtaq2c/PNRC,并筛选到稳定表达PNRC的MCF-7乳腺癌细胞株,转染PNRC的MCF-7细胞的生长速率和增殖明显慢于对照组细胞。结论:过表达的PNRC对MCF-7乳腺癌细胞的生长具有抑制作用。 相似文献