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1.
目的: 基于肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)数据库筛选潜在泛癌生物标志物,为多种肿瘤的诊断和预后评估提供帮助。方法: 利用“GDC Data Transfer Tool”和“GDCRNATools”软件包获取TCGA数据库,完成数据整理,将13种肿瘤纳入研究。以错误发现率(false discovery rate, FDR) <0.05且差异倍数(fold change, FC) >1.5作为差异表达标准,筛选在13种肿瘤中均上调或均下调的基因和微小RNA(microRNAs,miRNAs)。利用受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve, ROC曲线)的曲线下面积(area under the curve, AUC)、最佳截断值及对应的灵敏度和特异度反映诊断价值。利用Kaplan-Meier法计算生存概率后进行对数秩(log-rank)检验并计算风险比(hazard ratio, HR)反映预后评估价值。利用DAVID工具对差异表达基因进行GO (Gene Ontology)、KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)富集分析。利用STRING和TargetScan工具对差异表达基因和miRNAs进行调控网络分析。结果: 共发现48个基因和2个miRNAs在13种肿瘤中均差异表达,其中25个基因均表达上调,23个基因和2个miRNAs均表达下调。多数差异表达基因和miRNAs区分病例和对照的能力较好,AUC、灵敏度和特异度可达0.8~0.9。生存分析结果显示,差异表达基因和miRNAs与多种肿瘤患者的生存显著相关,且多数上调基因是患者生存的危险因素(HR>1),而多数下调基因是患者生存的保护因素(0<HR<1)。GO和KEGG富集分析显示,差异表达基因多富集于与细胞增殖有关的生物学事件。在调控网络分析中,共13个基因和2个miRNAs存在调控和相互作用关系。结论: 在13种肿瘤中均差异表达的48个基因和2个miRNAs可能作为潜在泛癌生物标志物,为多种肿瘤的诊断和预后评估提供帮助,并为发展肿瘤治疗的广谱靶点提供线索。 相似文献
2.
3.
目的比较苯并[a]芘(BaP)恶性转化细胞T-16HBE-C1与非转化细胞16HBE全基因组表达谱差异,为进一步阐明BaP致癌机制和筛选BaP致癌生物学标志提供线索。方法选择BaP恶性转化细胞T-16HBE-C1与非转化细胞16HBE作为BaP致癌机制研究模型,利用人全基因组表达谱芯片Human mRNA OneArray?HOA v7 Microarrays筛选细胞间差异表达基因。继而对差异表达基因进行生物信息学分析,包括利用DAVID数据库对差异表达基因进行GO分析和KEGG通路分析。结果人全基因组表达谱芯片共发现689个基因在T-16HBE-C1和16HBE细胞中表达差异在2倍以上(P<0.05),其中339个基因在T-16HBE-C1细胞中的表达高于16HBE细胞,350个基因在T-16HBE-C1细胞中的表达低于16HBE细胞。差异表达基因涉及多种生物学改变,主要包括肿瘤信号转导、细胞增殖与凋亡、细胞代谢和细胞黏附等。结论人支气管上皮16HBE细胞经BaP恶性转化后基因表达谱发生明显改变,差异表达基因可能在BaP致癌中发挥作用,并可能作为BaP致癌的潜在生物学标志。 相似文献
4.
目的 探讨血清25羟维生素D〔25-(OH)D〕水平与新生儿感染性肺炎的关系。方法 选取2015年8月—2017年7月在郑州大学第二附属医院入住新生儿重症监护室的患有感染性肺炎的新生儿65例,根据病情严重程度分为轻症肺炎组34例、重症肺炎组31例;另于同期在本院收集健康新生儿60例为对照组。比较3组血清25-(OH)D、钙离子(Ca2+)、降钙素原(PCT)、C反应蛋白(CRP)、白介素6(IL-6)水平;采用Spearman秩相关分析感染性肺炎患儿血清25-(OH)D水平与血清Ca2+、PCT、CRP、IL-6水平的相关性。结果 3组血清Ca2+水平比较,差异无统计学意义(P>0.05);3组血清25-(OH)D、PCT、CRP、IL-6水平比较,差异有统计学意义(P<0.05)。其中,轻症肺炎组、重症肺炎组血清25-(OH)D水平低于对照组,血清PCT、CRP、IL-6水平高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);重症肺炎组血清25-(OH)D水平低于轻症肺炎组,血清PCT、CRP、IL-6水平高于轻症肺炎组,差异有统计学意义(P<0.05)。感染性肺炎患儿的血清PCT、IL-6水平与血清25-(OH)D水平呈负相关(rs值分别为-0.434、-0.315,P<0.05);血清Ca2+、CRP水平与血清25-(OH)D水平无相关关系(rs值分别为-0.053、-0.184,P>0.05)。结论 感染性肺炎患儿的血清25-(OH)D水平较低,且病情较重者的水平更低,监测血清25-(OH)D水平在新生儿感染性肺炎的病情评估中具有一定临床价值。 相似文献
5.
6.
双侧同时开颅治疗重型颅脑损伤随机对照临床研究 总被引:1,自引:0,他引:1
目的探讨双侧同时开颅手术治疗重型颅脑损伤(sTBI)的疗效。方法49例sTBI患者,分为双侧同时开颅手术(治疗组)和传统手术方式(对照组)并于3个月后进行COS评定。结果治疗组27例,恢复良好9例,中度残疾5例,重残4例,植物生存2例,死亡7例。对照组22例,恢复良好3例,中度残疾0例,重残3例,植物生存6例,死亡10例,(P〈0.05)。结论采用双侧同时开颅手术治疗sTBI疗效优于传统手术方式。 相似文献
8.
目的比较经皮肾镜采用钬激光和第四代EMS(Electro Medical Systems,EMS)碎石清石系统治疗复杂性肾结石的临床疗效及安全性。方法回顾性分析经皮肾镜联合钬激光或第四代EMS碎石清石系统治疗鹿角型肾结石患者832例的临床资料,观察平均碎石清石时间、平均出血量、近期和远期结石清除率及手术严重并发症等指标,比较两种碎石方法的疗效及安全性。结果832例患者均一期成功建立经皮肾镜通道,所有病例均单通道碎石。钬激光组术后5d结石清除率为76.0%,平均碎石时间(51±6.3)min,平均碎石清石时间(97±5.6)min,平均出血量(75.3±7.6)ml。EMS组术后5d结石清除率为83.5%,平均碎石清石时间为(78±5.0)min,平均出血量(65±7.0)ml。术后1个月时钬激光组和EMS组结石排除率分别为87.0%和91.8%。两组相比,EMS组的平均碎石清石时间、术中出血量、近期及远期结石清除率均优于钬激光组(P〈0.05)。所有病例均未出现顽固性高热、严重血尿、肾周血肿、气胸、穿孔、肾功能损伤等严重并发症。结论经皮肾镜联合EMS碎石清石系统治疗鹿角型肾结石与钬激光相比,具有更加安全、高效的优势。但对于质地较硬的结石两者联合可取得更好的效果。 相似文献
9.
目的研究经皮肾镜联合膀胱软镜钬激光碎石在治疗复杂性肾结石中的安全性和临床疗效。方法回顾分析了采用经皮肾镜碎石清石术联合膀胱软镜钬激光治疗复杂性肾结石患者36例的临床资料,同时选取前期单纯接受经皮肾镜碎石取石术(percutaneousnephrolithotomy,PCNL)患者57例作为对照组,比较两组患者的临床疗效和安全性。结果所有患者均一期成功建立经皮肾镜通道且均单通道取石。联合组术后5d结石清除率94.4%,二次手术率2.8%;对照组术后5d结石清除率77.2%,二次手术率17.5%,术后1个月复查泌尿系平片(Plainfilmofkodney—ureter.bladder,KUB)检查提示联合组和对照组的结石清除率分别为100%和94.7%。联合组的术后5d结石清除率和二次手术率均明显优于对照组(P〈0.05)。两组患者在术后1个月结石清除率和严重并发症发生率等方面比较,差异无显著意义(P〉0.05)。所有病例均未出现严重并发症。结论经皮肾镜联合膀胱软镜下钬激光碎石术治疗复杂性肾结石具有较好的临床疗效和较高的安全性,但是应选择合适的病例。 相似文献
10.
目的探讨功能性内镜鼻窦手术(FESS)后总鼻道不填塞的安全性和患者体验感。方法 138例患者分成两组,一组为总鼻道不填塞组(A组)85例,另一组为填塞组(B组)53例,比较两组术后的临床症状、并发症及患者体验感(VAS评分)。结果 A组在安全性方面和B组无明显差异,而在患者体验感方面明显优于B组,两组评分差异有统计学意义(P0.05)。两组在6个月的随访期内均无明显术腔粘连发生。结论通过术前患者病情轻重程度评估,术中恰当的处理,大多数FESS术后患者可不进行总鼻道填塞,这可明显减轻患者的术后痛苦,节省医疗资源,值得推广应用。 相似文献