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目的 :应用表达谱芯片检测脊柱结核(spinal tuberculosis,STB)患者椎间盘中差异表达的长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)及mRNA,并筛选有诊断标志物潜力的LncRNA。方法:从2018年9月~2020年12月于宁夏医科大学附属总医院脊柱骨科就诊的患者中选取STB患者(实验组)及脊柱退变患者(对照组)各28例。收集两组患者病变椎间盘并提取总RNA,两组各挑选3例合格标本通过Arraystar人类LncRNA V5.0版芯片进行检测并进行芯片数据处理计算各RNA的差异倍数(fold change,FC),其中FC≥2的LncRNA及mRNA为差异表达的RNA(P0.05)。将差异表达的LncRNA邻近的差异表达的mRNA视为cis-靶基因,将LncRNA可能结合的蛋白质视为trans-靶蛋白,并对mRNA、cis-靶基因、trans-靶蛋白进行基因功能注释分析。从差异表达的LncRNA中选取cis-靶基因与STB发病可能相关的LncRNA用剩余各25例标本进行RT-PCR验证,筛选有诊断标志物潜力的LncRNA并进行基因功能注释分析。结果:基于两组间芯片数据的差异共筛选出444个差异表达的LncRNA、186个差异表达的mRNA。基因功能注释分析提示差异表达的LncRNA的cis-靶基因主要参与对转录、翻译、剪接、免疫反应、自然杀伤细胞介导的细胞毒性等生物学过程的调控及信号通路的传递;trans-靶蛋白主要参与对RNA的剪接、加工、转运等基因表达过程的调控;差异表达的mRNA主要参与对转录、翻译、剪接、炎症反应、免疫反应等生物学过程的调控及信号通路的传递。RT-PCR验证发现LINC01128-201、Lnc-DNALI1-205在STB患者中存在明显下调表达,与芯片检测结果一致,且这两个LncRNA可能通过调控ISG15、SNIP1、HES4表达量在STB发病过程中发挥重要作用。结论:STB患者与脊柱退变患者椎间盘的LncRNA及mRNA存在较大的表达差异,其中下调表达的LINC01128-201、Lnc-DNALI1-205可能在STB发病过程中发挥重要作用,且有成为诊断标志物的潜力。 相似文献
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目的分析脊柱结核(STB)与布鲁氏菌性脊柱炎(BS)患者外周血生化常规指标、红细胞沉降率(ESR)及C反应蛋白(CRP)的水平变化和临床意义。方法选取宁夏医科大学总医院2013年1月至2019年1月住院行手术治疗的STB及BS患者共539例为研究对象,其中STB患者350例为STB组,BS患者189例为BS组。比较两组生化常规指标[血氯、清蛋白(ALB)、球蛋白、胆固醇(CHOL)、丙氨酸氨基转移酶(ALT)、天门冬氨酸氨基转移酶(AST)、碱性磷酸酶(ALP)]、CRP及ESR水平,比较两组不同年龄段、男性与女性患者上述指标水平。结果STB组AST、ALT、ALP水平低于BS组,ALB水平高于BS组,差异均有统计学意义(P<0.05)。年龄≤40岁患者中,STB组ALT水平低于BS组,差异均有统计学意义(P<0.05);年龄>40~60岁患者中,STB组ALB水平高于BS组,ALT水平低于BS组,差异均有统计学意义(P<0.05);年龄>60岁患者中,STB组ALT水平低于BS组,CHOL水平高于BS组,差异均有统计学意义(P<0.05)。男性患者中,STB组ALT、AST及ALP水平均低于BS组,ALB水平高于BS组,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论BS与STB患者外周血AST、ALT、ALP、ALB水平存在差异,且与年龄和性别有一定关系,可能在BS与STB的鉴别诊断、疗效评估等方面具有一定的临床应用价值。 相似文献
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