上海市2018—2019年度A/H1N1(pdm09)亚型流感病毒的 耐药性及NA基因特性研究

【目的】通过监测2018—2019年度上海市优势流行株A/H1N1(pdm09)亚型流感病毒对神经氨酸酶抑制剂(NAIs)的耐药情况,为上海市流感临床用药提供参考。【方法】随机选取60株A/H1N1(pdm09)亚型流行株,采用神经氨酸酶抑制实验及神经氨酸酶(NA)基因测序的方法,开展流行株对奥司他韦及扎那米韦敏感性和耐药性的监测和分析。【结果】60株流行株均对奥司他韦和扎那米韦敏感,未发现敏感性降低或者显著降低的情况;基因序列分析也未发现NA在催化活性关键位点及辅助位点出现氨基酸变异,佐证了神经氨酸酶抑制实验的表型检测结果。【结论】上海市2018—2019年度流行的A/H1N1(pdm09)亚型流感病毒对神经氨酸酶抑制剂依然敏感,为临床用药提供了科学参考。随着药物的广泛使用,应持续加强流感病毒耐药性监测,以有效指导临床用药。     

新型冠状病毒肺炎患者粪便中新型冠状病毒的分离鉴定

目的分离鉴定新型冠状病毒肺炎（COVID?19）患者粪便标本中的新型冠状病毒（SARS?CoV?2）,并进行生物学特性分析。方法利用Vero E6细胞对收集到的SARS?CoV?2核酸阳性粪便标本开展病毒分离,对产生细胞病变的培养物进行病毒核酸检测、免疫荧光抗原检测、病毒含量测定及全基因组测序分型。收集每代细胞培养物后进行半数组织培养感染剂量（TCID₅₀）实验。结果8份粪便标本经处理后分别接种Vero E6细胞,培养48 h,1份标本在Vero E6细胞上发现明显细胞病变。8例COVID?19患者粪便病毒核酸阳性标本中分离到1株SARS?CoV?2,阳性分离率为12.5%。病毒能稳定传至第3代,P1代病毒TCID₅₀为104.0/0.2 mL,P2代病毒TCID₅₀为104.5/0.2 mL,P3代病毒TCID₅₀为104.75/0.2 mL。8份粪便样本中仅1份有SARS?CoV?2活毒的复制扩增,传代培养的核酸检测Ct值约为10。该分离株的序列与Wuhan?Hu?1株序列（GenBank MN908947）的同源性>99.99%。结论从COVID?19患者粪便中分离到SARS?CoV?2活毒株,COVID?19患者中不仅存在粪便排毒的现象,且有活病毒存在。     

2018-2020年上海市登革1型病毒全基因组序列特征研究

目的 研究2018-2020年上海市本地感染及输入性来源登革1型病毒(Dengue Serotype 1 virus, DENV-1)分离株全基因组序列特征。方法 收集登革热疑似病例血清样本,对DENV-1阳性样本进行病毒分离、全基因组扩增与测序,进一步通过构建进化树对全基因组序列进行同源性分析、核苷酸序列及氨基酸序列相似性分析、编码蛋白氨基酸位点差异分析。结果 从88份DENV-1阳性样本中获得31株分离株的全基因组核苷酸序列,其中3株为本地感染病例来源,28株为输入病例来源。进化分析显示,28株分离株的基因型为G-I型,与G-I型参考序列的核苷酸(氨基酸)相似性均值为96.47%~97.37%(98.78%~99.16%);3株分离株的基因型为G-IV型,与G-IV型参考序列的核苷酸(氨基酸)相似性均值为96.66%~96.86%(99.01%~99.26%);3株本地感染病例来源分离株均为G-I型,根据同源性分析,存在输入性病例引起本地感染可能。分离株与对照株比较各结构蛋白与非结构蛋白氨基酸位点均存在差异,其中E蛋白的495个氨基酸位点中,有31个位点存在差异。结论 2018-2020年上海市DENV-1包含G-I与G-IV两种基因型,以G-I型为主;首次分离得到3株上海市本地感染病例来源DENV-1,为G-I型,存在输入性病例引起本地感染可能。