结膜吸吮线虫基因组序列特征研究

目的 阐明结膜吸吮线虫（Thelazia callipaeda）基因组的序列特征。方法 采用GeneMark、GeneID和GeMoMa软件对结膜吸吮线虫基因组组装数据进行从头预测及同源预测,利用EVM软件对预测结果进行整合,以预测其基因组全部基因;将得到的基因序列分别在公共数据库及3个专有数据库（CAZyme、TCDB和PHI）中进行注释。结果 对结膜吸吮线虫基因组（79.34 Mb）的Scaffolds和Contigs基因结构进行分析,共得到了6 333个基因;通过公共数据库中BLAST比对,发现97.85%的基因可以得到注释,其中NR数据库中注释的基因最多（98.69%）,可以富集到KEGG途径的基因最少（50.50%）。通过KOG数据库分析功能基因,共发现4 517个功能基因。在3个专有数据库（CAZyme、TCDB和PHI）中比对,分别注释得到136、139个和1 498个基因,其中PHI数据库中注释基因数目最多（1 498）。此外,还通过细胞色素酶的专有数据库预测到了238个细胞色素P450基因。结论 本研究初步揭示了结膜吸吮线虫基因组结构特征和注释信息,共得到了6 333个基因。     

静脉溶栓治疗急性脑梗死的护理体会

1996～ 2 0 0 0年 ,我们应用自由清除剂 静脉溶栓法治疗急性脑梗死患者 2 5例 ,效果满意 ,现将护理体会报告如下。一般资料 :62例急性脑梗死患者 ,发病均在 6h内 ,男 3 9例 ,女 2 3例 ;年龄 5 1～ 88岁 ,平均 64.3± 14 .3岁。入院时全部患者意识均清楚 ,部分患者有完全或不完全性失语 ,一侧中枢性面瘫 ,一侧肢体肌力 2～ 0级 ,有或无偏侧感觉障碍 ,有或无病理体征。治疗方法 :入院后经 CT检查 ,排除脑出血。 62例随机分为两组。治疗组 2 5例 ,给予 2 0 %甘露醇 2 5 0 ml、维生素 C5～10 g、地塞米松 5～ 10 mg 静滴 ,尼莫的平 3 0 m g、…     

结膜吸吮线虫基因组中分泌蛋白的规模预测及分析

目的 在对结膜吸吮线虫基因组数据进行注释的基础上对其中分泌蛋白进行规模预测及分析。方法 联合应用 SignalP、TMHMM、MEME、Protcomp、big-PI Predictor和 SecretomeP 等多种生物信息学软件进行分析,完成了结膜吸吮线虫分泌蛋白组的预测,对其进行 GO 功能富集、KEGG 通路分析、结构域统计以及具有抗原性分泌蛋白预测等分析。结果 结膜吸吮线虫含有约 259个分泌蛋白,其长度多集中在 100-700 aa ;GO 功能分析发现这些分泌蛋白多富集在分泌途径及宿主互作中;KEGG 分析显示分泌蛋白在药物及谷胱甘肽代谢中发挥着重要作用;候选分泌蛋白的结构域分析发现存在最多为糖水解酶结构域;大规模筛选预测到 126 个分泌蛋白具有B细胞表位抗原性的功能。结论 结膜吸吮线虫分泌蛋白多为小型蛋白,推测这些蛋白可能参与糖代谢、抗氧化活性,协助虫体的入侵及其在宿主体内的寄生。