2019-2020年甘肃省外环境禽流感病毒及职业暴露人群血清学分析

目的 了解2019-2020年甘肃省职业暴露人群禽流感病毒接触感染状况及活禽市场外环境中禽流感病毒的分布,为防控禽流感疫情提供科学依据.方法 采集活禽市场笼具表面擦拭物及粪便等环境标本,采用实时荧光RT-PCR法检测标本中甲型通用流感病毒核酸,阳性标本再检测H5、H7和H9亚型禽流感病毒核酸.同时采集禽流感职业暴露人群...     

甘肃省两例人感染欧亚类禽H1N1猪流感病毒的HA、NA基因特性和抗原性分析

目的:分析甘肃省发现的2例人感染欧亚类禽H1N1猪流感病毒(EAS-H1N1)的抗原性和基因特性,为疾病预防控制提供科学参考。方法:对甘肃省2021年2月以来发现的2例人感染EAS-H1N1进行抗原性和基因组对比分析,并使用Mega7.0等软件分析其基因组特征。结果:2例人感染EAS-H1N1病例,均有相关环境暴露史,...     

2011—2020年兰州市住院严重急性呼吸道感染病例常见呼吸道病毒监测结果分析

目的:了解兰州市住院严重急性呼吸道感染(severe acute respiratory infection, SARI)病例常见呼吸道病毒病原谱及流行病学特征,为兰州市SARI病例的防控和治疗提供参考依据。方法:收集2011年1月至2020年12月兰州大学第一医院SARI病例的咽拭子、痰液及少量肺泡灌洗液样本2 57...     

甘肃省人感染和外环境来源的H9N2禽流感病毒基因特征分析

目的 分析甘肃省发现的人感染H9N2禽流感病毒分离株全基因组特征。方法 对甘肃省2016年流感样病例中发现并确诊的1例人感染H9N2禽流感病毒病例进行病原学分析,并使用MEGA 7.0等软件解析该毒株全基因组特征。结果 该毒株HA、NA、MP、NP、NS、PA、PB1和PB2各个基因片段与甘肃省2014-2019年外环境中分离获得的H9N2禽流感病毒各基因片段高度相似,且均>90%;其HA基因属于BJ/94-like支系,PB2和MP属于G1/97-like支系,PB1、PA、NS和NP基因属于F/98-like支系,MP和PB2与H7N9、H10N8和H5N6亲缘关系较近;氨基酸序列比对发现HA裂解位点呈PSRSSR↓GLF排列,发生H183N和Q226L突变,有7个HA糖基化位点;NA茎部62～64位均缺失ITE 3个氨基酸;M2-31N、NS1-42S、PA-356R和PA-409N突变。结论 人感染H9N2禽流感病毒为偶发感染,但甘肃省外环境中分离的H9N2禽流感病毒具有一系列哺乳动物适应性分子标记,提示人群感染风险较高,需多部门加强监测,共同应对流感大流行。     

2017—2018 年甘肃省外环境禽流感病毒监测分析

目的 了解 2017—2018 年甘肃省活禽市场外环境中禽流感病毒的分布情况,为禽流感疫情防控提供科学依据。 方法 采集全省 14 个市(州)的活禽批发市场、城乡农贸市场或菜市场、家禽规模养殖场(户)和家禽散养户等禽流感监测点的笼具表面擦拭物、粪便等环境样本,采用实时荧光 RT-PCR 法检测样本中甲型流感病毒核酸(FluA),阳性样本再检测 H5、H7 和 H9 亚型禽流感病毒核酸。 结果 共采集外环境样本 7 038 份,检出 FluA 核酸阳性 1 510 份,总阳性率为 21. 45%。 H5、H7 和 H9 亚型禽流感病毒核酸的阳性率依次为 0. 06%(4 / 7 038)、1. 19%(84 / 7 038)和 20. 52%(1 444 / 7 038)。 共检出 H5、H9 混合感染样本 2 份,H7、H9 混合感染样本 20 份。 不同类型样本中 FluA 核酸阳性率差异有统计学意义( χ2 = 50. 232,P<0. 01),宰杀或摆放禽肉案板表面的擦拭样本阳性率最高 (36. 04%),禽类饮水样本阳性率最低(13. 27%)。 FluA 阳性率在 2018 年 1 月最高( 36. 64%),2017 年 6 月最低(5. 60%)。 定西市 FluA 核酸阳性率最高(63. 32%)。 结论 2017—2018 年甘肃省涉禽外环境中存在禽流感病毒污染,主要为 H9 亚型,同时检出 H7 和 H5 亚型,混合型占一定比例,需持续加强主动监测,防止禽流感暴发流行。     

甘肃省人感染H7N9禽流感病毒基因组对比分析

  目的  分析甘肃省发现的人感染H7N9禽流感病毒序列,对比高致病性禽流感（HPAI）和低致病性禽流感（LPAI）H7N9病毒的基因变异及分子进化特征,为疾病预防控制提供参考。  方法  对甘肃省2017年以来发现的人感染H7N9禽流感病毒进行基因组对比,并使用MEGA 7.0等软件分析其全基因组特征。  结果  6例人感染H7N9病例,均有活禽或其环境暴露史,共获得3株毒株:GS/19545、GS/27151和GS/23275。 GS/19545和GS/27151为LPAI,GS/23275为HPAI。 3株毒株的HA、NA基因均来自欧亚系的长三角支系。 GS/23275的NP基因和广东省2017年分离的HPAI处于同一进化分支上,与GS/19545、GS/27151形成两个明显的分支。 GS/23275的PB2基因与安徽省2015年从禽类体内分离的H9N2病毒亲缘关系较近。 3株毒株的HA受体结合位点均发生G186V、S138A突变,NA蛋白茎部均发生68～72位点氨基酸缺失,在PA、PB1、PB2、M1、M2、NS1、NS2等蛋白中均发生相同氨基酸突变。  结论  甘肃省人感染H7N9禽流感病毒基因组发生了部分重要分子突变,可能导致其毒力增强,并具备潜在的人际传播能力。 加强禽流感病毒基因特征研究分析,有助于从分子水平上监测病毒变异突变并对疫情进行科学防控。