一起急性胃肠炎暴发疫情的病原分子特征分析

目的 了解合肥市一起急性胃肠炎疫情的病原分子特征.方法 采用实时荧光PCR(Real-time PCR)对13份肛拭标本同时进行札如病毒、诺如病毒、星状病毒核酸检测,检出的札如病毒核酸阳性标本采用传统RT-PCR扩增VP1基因片段,并测定基因序列,构建系统进化树.结果 Real-time PCR检出8份札如病毒核酸PCR阳性标本,诺如病毒、星状病毒核酸结果均为阴性.1份RT-PCR扩增产物测序成功,基因序列比对和进化分析显示为札如病毒GⅡ.3基因亚型.结论 引起该起急性胃肠炎疫情的病原体为GⅡ.3型札如病毒.     

合肥市发热伴呼吸道症候群病原学检测结果分析

目的 掌握合肥市发热伴呼吸道症候群病原谱的构成,为发热伴呼吸道症候群的防控、诊断与治疗提供科学依据。方法 按照发热伴呼吸道症候群监测方案要求,采集哨点医院2019年2月至2020年11月符合发热伴呼吸道症候群病例定义患者的咽拭子或支气管灌洗液,采用呼吸道病原体PCR检测技术,定性检测22种呼吸道病原体,对流感病毒阳性标本采样荧光PCR法进行分型,对结果进行统计分析。结果 共收集251份呼吸道标本,检出阳性标本73份,阳性率为29.08%,有3份双重感染。单一阳性检出率前4位的病原体为呼吸道腺病毒、呼吸道合胞病毒、流感病毒和肺炎链球菌,阳性率分别为8.76%、5.98%、4.38%和3.58%。出现3个阳性检出峰：2019年夏季峰、2020年冬春季峰和2020年秋季峰。结论 合肥市发热呼吸道症候群病原体主要为呼吸道腺病毒、呼吸道合胞病毒、流感病毒和肺炎链球菌,同时存在混合感染情况。     

一起疱疹性咽峡炎疫情病原学分析

目的 了解2020年合肥地区一起幼儿园疱疹性咽峡炎(HA)聚集性疫情病原体型别及基因进化情况。方法采用实时荧光定量RT-PCR方法对11份咽拭子标本进行肠道病毒(EV)病原检测,柯萨奇病毒A6型(CVA6)核酸阳性的标本经传统RT-PCR扩增VP1基因,进行序列测定,用MEGA 6.0软件构建基因进化树。结果 11份咽拭子标本中6份CVA6核酸阳性,6条基因序列均为CVA6 D3亚型。结论 CVA6 D3型是引起本次幼儿园HA疫情的病原体,应加强对肠道病毒的监测,重视在幼托机构暴发的此类疫情。     

一起急性胃肠炎聚集性疫情的病原学诊断及基因型分析

目的 了解合肥市某工地一起急性胃肠炎聚集性疫情的病原及其基因型。方法 采用实时荧光PCR方法对16份肛拭子标本和7份水样标本进行诺如病毒、札如病毒和星状病毒核酸筛查,对诺如病毒核酸阳性标本采用RT-PCR扩增Rd Rp-VP1区基因,并进行基因序列测定,在线比对确定病毒基因亚型,运用MEGA软件构建基因进化树,进行基因比对和进化分析。结果 14份肛拭子和2份水样标本诺如病毒核酸阳性,札如病毒和星状病毒核酸均阴性,获得9条诺如病毒Rd Rp-VP1区基因序列,均为GⅡ. P17-GⅡ. 17型。结论 这是一起因饮用水污染GⅡ. P17-GⅡ. 17型诺如病毒引发的急性胃肠炎暴发疫情。