人胰腺导管腺癌组织及癌旁组织双向电泳图谱的差异分析

目的:探讨人胰腺导管腺癌组织和癌旁组织之间差异的表达蛋白。方法:利用双向凝胶电泳（2-DE）对8例胰腺导管腺癌组织和癌旁组织的总蛋白进行分离,并用质谱仪对两组间差异蛋白质点进行肽指纹谱和串联质谱鉴定。利用蛋白质印迹分析和免疫组化法检测差异蛋白在胰腺癌和癌旁组织的表达。结果:2-DE显示,肿瘤组织中有28个蛋白质点表达上调,17个表达下调。上述蛋白质点经质谱鉴定得到30个蛋白质,包括酶类、抗氧化蛋白、信号转导蛋白、钙结合蛋白、结构蛋白及分子伴侣等。Western blot和免疫组化结果显示差异表达蛋白annexin II在胰腺癌组织中表达上调,与2-DE结果一致。结论:以2-DE为基础的蛋白质组学技术是研究肿瘤的一种重要手段。本实验所得的annexin II等差异表达蛋白可能成为潜在的诊断胰腺癌的分子标志或控制肿瘤生长的治疗靶点。     

肿瘤蛋白质组学在信号传导通路、肿瘤标志物等方面的研究

肿瘤是一个多因素的疾病 ,在其的发生、发展过程中 ,分子生物学事件的复杂性日益受到人们的重视。随着基因组全序列测定的完成 ,蛋白质组学的研究得到了广泛的关注。应用蛋白质组学的方法 ,可以对细胞生长、分化过程中的蛋白质与细胞信号传导通路上的蛋白质之间的相互作用进行更为深入的研究 ,因而有希望发现控制肿瘤生物学行为的诸多蛋白质和信号分子。     

人晶状体上皮细胞蛋白质组的双向电泳和质谱鉴定

目的： 建立人晶状体上皮细胞蛋白质组研究体系，探讨双向电泳和质谱鉴定技术在人晶状体上皮细胞蛋白质组研究中的作用。 方法: 体外培养人晶状体上皮细胞株，用两种不同方法提取总蛋白，进行固相pH梯度(IPG)等电聚焦双向凝胶电泳，凝胶通过GS-800扫描仪（Bio-Rad）获取图像并使用PDQuest专业图像分析软件分析。在此基础之上，胰酶消化蛋白质斑点并进行质谱分析。 结果: 获得了重复性较好的人晶状体上皮细胞蛋白质组电泳图谱。晶状体蛋白质斑点在等电点pH值为4-7、相对分子质量为17-72 kD之间均有分布。其中高丰度蛋白点主要分布于分子量19-50 kD、PI 5-7范围内。2个蛋白点通过质谱分析和数据库的检索得到了初步的鉴定。 结论: 建立起了一个稳定的分析人晶状体上皮细胞蛋白质组学实验体系；为进一步研究人类晶状体在生理状态及白内障等病理条件下的改变提供了蛋白质组学的研究方法和途径。     

皮肤角朊细胞与表皮干细胞双向电泳图谱的建立及差异分析

目的 建立皮肤角朊细胞与表皮干细胞的双向电泳图谱,并分析二者表达蛋白质的差异,为进一步研究体外调控表皮十细胞的增殖、分化提供线索.方法酶消化法获取单个表皮细胞悬液.Ⅳ型胶原快速贴壁法分选表皮干细胞.利用舣向电泳技术(2-DE)建立两种细胞的蛋白质表达图谱,并用Imagemaster 2D elite 5.0软件分析两种细胞的差异表达蛋一点.结果两种细胞的2-DE蛋白表达谱具有良好的重复性和可比性.皮肤角朊细胞与表皮干细胞的电泳图谱平均蛋白质点数分别为(982 ±18)个和(930 ±15)个,匹配点数为(850±13)个和(798±11)个,匹配率是86.56%和85.81%;两种细胞蛋白质间匹配点数是(886 ±8)个,匹配率是76.98%.找到差异蛋白点11个,其中只在表皮下细胞中表达或高表达的有8个;只在皮肤角朊细胞中表达或高表达的有3个.结论利用双向电泳法得到了分辨率较高儿重复性好的皮肤角朊细胞与表皮干细胞蛋白质组图谱,且二者存在有一定的差异.     

生物信息学技术在生殖领域中的研究进展

生物信息学（bioinformatics）在生殖系统的研究中被广泛应用于各个技术层面,包括基因组、转录组、蛋白组和代谢组。通过数据的系统化采集和可视化处理,生殖过程中各种关键分子的作用机制正逐步被发现并阐明。生物信息学技术在生殖系统研究中的应用,既在保障严谨性和科学性的基础上有效地推动了生殖系统研究的发展与创新,如从基因组、转录组、蛋白组和代谢组等不同层次水平上分析生殖系统中不同器官的正常功能或其异常病理现象;同时也促进了生殖系统相关疾病临床诊断和治疗的进展,如在对疾病诊治中,新的临床疾病标志物及药物靶点的发现等。综述近年生殖医学前沿研究的最新生物信息学技术并总结现有生殖医学相关生物信息学研究的主要进展,这也为后续的各类研究提供了重要的方向和思路。     

Membrane transporters in salivary exosomes and microvesicles as biomarkers of systemic or oral disease

Backgroundsaliva is useful to assess health or disease states. Recently, proteomic technologies have allowed rapid progress in saliva analysis.Highlight(1) saliva contains three main types of extracellular vesicles; (2) the vesicles are exosomes, microvesicles, and apoptotic bodies; (3) proteome is analyzed in saliva, salivary exosomes, and salivary microvesicles; (4) membrane transporters are in saliva, and salivary exosomes and/or microvesicles; (5) biomarker discovery in exosomes and microvesicles of saliva is progressing.Conclusionmembrane transporters such as aquaporin, ion channels, carriers in saliva, and salivary exosomes or microvesicles, might be valuable biomarkers of systemic or oral health.     

Proteomic characterization of venom of the medically important Southeast Asian Naja sumatrana (Equatorial spitting cobra)

The proteome of Naja sumatrana (Equatorial spitting cobra) venom was investigated by shotgun analysis and a combination of ion-exchange chromatography and reverse phase HPLC. Shotgun analysis revealed the presence of 39 proteins in the venom while the chromatographic approach identified 37 venom proteins. The results indicated that, like other Asiatic cobra venoms, N. sumatrana contains large number of three finger toxins and phospholipases A₂, which together constitute 92.1% by weight of venom protein. However, only eight of the toxins can be considered as major venom toxins. These include two phospholipases A₂, three neurotoxins (two long neurotoxins and a short neurotoxin) and three cardiotoxins. The eight major toxins have relative abundance of 1.6–27.2% venom proteins and together account for 89.8% (by weight) of total venom protein. Other venom proteins identified include Zn-metalloproteinase-disintegrin, Thaicobrin, CRISP, natriuretic peptide, complement depleting factors, cobra venom factors, venom nerve growth factor and cobra serum albumin. The proteome of N. sumatrana venom is similar to proteome of other Asiatic cobra venoms but differs from that of African spitting cobra venom. Our results confirm that the main toxic action of N. sumatrana venom is neurotoxic but the large amount of cardiotoxins and phospholipases A₂ are likely to contribute significantly to the overall pathophysiological action of the venom. The differences in toxin distribution between N. sumatrana venom and African spitting cobra venoms suggest possible differences in the pathophysiological actions of N. sumatrana venom and the African spitting cobra venoms, and explain why antivenom raised against Asiatic cobra venom is not effective against African spitting cobra venoms.     

肝细胞癌门静脉癌栓相关血清小分子量蛋白质标志物的筛选

目的筛选肝细胞癌门静脉癌栓相关的血清小分子量蛋白质标志物。方法收集健康志愿者、肝细胞癌无癌栓患者和肝细胞癌门静脉癌栓患者3组血清各l2份，用16％SDS-PAGE进行双向电泳，得到3组血清小分子量蛋白质表达图谱；经Image Master软件比对分析后，用基质辅助激光解析飞行时间质谱对差异点进行鉴定。结果在16％SDS-PAGE凝胶中，3×10^3～20×10^3区域内蛋白质条带间距较12．5％SDS-PAGE明显增宽，条带数目明显增多，且3组血清小分子量蛋白质表达图谱中均可清晰显示〈20×10^3的小分子量蛋白质斑点。组间比较显示，3组血清共有15个小分子量差异蛋白质点，经鉴定为5种蛋白质。与健康组比较，无癌栓组中载脂蛋白A-I、脂蛋白CⅢ、转甲状腺素蛋白和DNA拓扑异构酶Ⅱ表达降低，而结合珠蛋白-2表达增高；门静脉癌栓组5种蛋白质表达均较无癌栓组降低。结论在肝细胞癌的发生和发展过程中，血清小分子量蛋白质表达谱发生明显变化，差异表达的小分子量蛋白质有可能为肝细胞癌和门静脉癌栓早期预测及治疗监测提供参考。     

用蛋白质芯片技术筛选非小细胞肺癌患者血清中标志蛋白

目的 探讨用蛋白质芯片技术检测血清非小细胞肺癌（NSCLC）标志蛋白筛查肺癌患者的可行性。方法 用蛋白质芯片表面增强激光解吸电离飞行时间质谱仪（SELDI-TOF-MS）技术检测123例肺癌患者和40名正常人血清蛋白质质谱。用数字表法随机抽取94份标本（53例NSCLC，21例小细胞肺癌和20名正常人）作为训练组进行系统训练，将筛选出来的相对分子质量为11493、6429、8245、5336及2536的5个蛋白峰作为一个标志物组合模式，建立分类树模型（即系统训练过程）；用69份未知血清标本（49例NSCLC，20名正常人）作为盲筛组验证该模型。结果 系统显示，在训练组该模式检测NCLC的敏感性和特异性分别为95．9％（71／74）、90．0％（18／20），盲筛组分别为83．7％（41／49）及80．0％（16／20）。结论 蛋白质芯片SELDI-TOF-MS技术能较准确的区分NSCLC患者与健康对照者，该技术为NSCLC的筛查提供了新的有效工具。