Current status of MALDI-TOF mass spectrometry in clinical microbiology

Mass spectrometry (MS) is a type of analysis used to determine what molecules make up a sample, based on the mass spectrum that are created by the ions. Mass spectrometers are able to perform traditional target analyte identification and quantitation; however, they may also be used within a clinical setting for the rapid identification of bacteria. The causative agent in sepsis is changed over time, and clinical decisions affecting the management of infections are often based on the outcomes of bacterial identification. Therefore, it is essential that such identifications are performed quickly and interpreted correctly. Matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight (MALDI-TOF) mass spectrometer is one of the most popular MS instruments used in biology, due to its rapid and precise identification of genus and species of an extensive range of Gram-negative and -positive bacteria. Microorganism identification by Mass spectrometry is based on identifying a characteristic spectrum of each species and then matched with a large database within the instrument. The present review gives a contemporary perspective on the challenges and opportunities for bacterial identification as well as a written report of how technological innovation has advanced MS. Future clinical applications will also be addressed, particularly the use of MALDI-TOF MS in the field of microbiology for the identification and the analysis of antibiotic resistance.     

牙周洁治对人牙周炎袋底微生物和龈沟液量的影响

目的:探讨牙周洁治对人牙周炎袋底微生物和龈沟液量的影响,为研究牙周洁治机制提供依据。方法:选60例牙周炎患者,随机分为2组,每组30例,洁治组作牙周洁治,对照组用常规漱口液漱口,分别在治疗前、治疗后1周和治疗后1月用刚果红负性染色法观察袋底微生物的变化,并测定牙周探诊深度(PD)、龈指数(GI)和龈沟液量(GCF)的变化。结果:洁治组在洁治后1周时牙周袋底的球菌比率明显增加,杆菌和螺旋体比率及PD和GCF明显降低;对照组GI轻度降低,但PD和GCF以及袋底的球菌、杆菌、螺旋体比率无明显变化;洁治组和对照组的球菌、杆菌和螺旋体比率及PD、GI和GCF均有显著性差异。洁治后1月时PD、GI和GCF量及袋底的微生物比率与洁治1周时无显著性差异。结论:牙周洁治对人牙周炎袋底微生物有明显的改善作用,可通过减少袋底致病菌比率和降低PD以减轻牙周炎症和减少龈沟液的分泌。     

21所医院微生物室感染控制支持能力现状调查

目的 了解德州市二级及二级以上医院微生物室对感染管理工作的专业支持能力.方法 对德州市11个县市区,21所二级及二级以上医院进行现场检查及问卷调查.结果 全市17所医院设立了微生物室,12所医院参加了省级室间质量控制,5所医院既未参加室内质控也未开展室间质控；近95.0％的医院未落实三级报告等检验规程.结论 微生物室基本专业水平较低下,感染控制支持能力较差,制约了感染控制工作的深入开展；微生物室人员知识理念陈旧,亟待提高微生物学及医院感染管理知识技能.     

2012～2013年德州市医疗机构消毒效果监测分析

目的为了解德州市医疗机构消毒质量状况,有效预防和控制医院感染的发生。方法采用现场采样和微生物检测方法,对德州市41家医疗机构室内空气、物体表面、医务人员手、使用中消毒剂、消毒后内镜、压力蒸汽灭菌器、医院污水和紫外线灯进行监测。结果 2012～2013年共检测1 737份,合格1 572份,平均总合格率为90.50%,有3份医务人员手中检出金黄色葡萄球菌。不同类型医疗机构中,市级医疗机构合格率为92.54%,县区级医疗机构为90.92%,企业及私人医疗机构为72.84%（P〈0.01）;不同检测样品中,压力蒸汽灭菌器、使用中消毒剂、物体表面、空气、医务人员手、消毒后内镜、紫外线灯和医院污水合格率分别为100.00%、98.48%、98.33%、94.96%、88.07%、87.50%、78.43%和78.05%。结论德州市医疗机构消毒质量整体情况尚可,但医院污水和紫外线灯合格率较低。     

2012年北京市丰台区公共场所集中空调通风系统卫生状况调查

目的调查分析2012年北京市丰台区公共场所集中空调通风系统卫生状况,探讨其影响因素并为卫生管理提供技术支持。方法依据《公共场所集中空调通风系统卫生规范》,检测集中空调送风中细菌总数、真菌、β-溶血性链球菌及PM10,风管内表面细菌总数、真菌总数、积尘量,冷却（凝）水中嗜肺军团菌。结果丰台区集中空调通风系统送风中细菌总数、真菌总数、β-溶血性链球菌、PM10合格率分别为61.42%、88.89%、100.00%、90.91%,风管内表面积尘量、细菌总数、真菌总数合格率分别为100.00%、100.00%、99.20%,冷却（凝）水中嗜肺军团菌合格率为98.20%,血清分型以LP1型为主。集中空调送风中细菌总数存在着明显的季节性差异（χ^2=12.338,P〈0.01）,而送风中真菌、PM10未见明显的季节性差异（χ^2=3.155,P〉0.05;χ^2=6.976,P〉0.05）。不同类型集中空调送风中细菌总数、真菌未见明显差异（χ^2=5.782,P〉0.05;χ^2=2.653,P〉0.05）。结论细菌总数、真菌总数、PM10是丰台区集中空调送风卫生质量的主要影响因素,应加强集中空调管理,定期清洗消毒,并主动开展卫生委托监测。     

2010-2012年天津市西青区生活饮用水微生物检测结果

目的了解西青区主要生活饮用水微生物污染状况,为提高饮用水卫生质量提供参考。方法按相关标准和检验方法对西青区2010-2012年末梢水、二次供水、桶装水3类生活饮用水进行检验和评价。结果2010-2012年共检测生活饮用水681份,合格630份,合格率92．5％;其中447份末梢水合格率97．3％,145份二次供水合格率84．1％,89份桶装水合格率82．0％。3类生活饮用水合格率间的差异有统计学意义（X^2=43．70,P〈0．01）,二次供水委托送检样品合格率高于日常监测采样,合格率间的差异有统计学意义（X^2=5．29,P〈0．05）。菌落总数占不合格数的94．1％。结论菌落总数是主要不合格指标,相关部门应加强监督监测力度,提高各类饮用水的质量,保证人民群众的饮水安全。     

2009—2012年灵川县公共场所公共用品微生物监测分析

目的研究并分析灵川县公共场所公共用品微生物卫生情况,以期为公共用品卫生质量的提高提供一定的参考与帮助。方法于2009—2012年对灵川县公共场所公共用品进行微生物检测,检测结果显示4年共监测1445家公共场所,对所检项目的卫生情况进行综合统计与分析。结果本次共检测微生物样品4226份,合格3814份,所检项目总合格率为90.25%,其中理发美容业合格率88.42%,旅店业合格率91.92%,娱乐场所合格率93.98%。理发美容业合格率明显低于旅店业合格率、以及娱乐场所合格率,数据对比差异显著（P〈0.05）,具有统计学意义。结论灵川县公共场所公共用品卫生状况良好,但是理发美容业的合格率较低。为此,卫生监督部门应加大对公共场所卫生状况的监督力度,不断提高公共场所卫生质量。     

传染病背后的科学——从“N个第一”的诞生到传染病的防治

现今世界上发达国家的人均寿命已经超过80岁,然而19世纪以前,人类的平均寿命仅有30~40岁,传染性疾病是当时占据首位的死亡原因。一个多世纪以来,人类寿命和健康水平的提高,得益于疫苗和药物的诞生,而在发现和发明这些具有里程碑式的“灵丹妙药”背后,是一场科学的革命。本文对从巴斯德革命性科学“微小生命体理论”的提出,到“细菌致病理论”的建立,到由此诞生的N个控制传染病的“灵丹妙药”发现和发明,进行了比较全面的文献梳理和阐述。旨在让读者在“身临其境”的COVID-19传染病大流行期间,能够重温一下在抗击“瘟疫”的历史长河中诞生的革命性的科学和伟大的科学家,并致敬各行各业为抗击疫情而努力的人们。     

遗体表面重要部位携带的微生物构成情况调查与分析

[目的]了解殡仪场所遗体表面重要部位的菌群构成情况,以加强殡仪场所传染性疾病感染的管理,控制殡仪场所传染性疾病的发生。[方法]共对殡仪馆内8具遗体的口、鼻部位进行微生物采样,采样结果进行细菌学检测鉴定。[结果]共分离霉菌136株,细菌5264株,其中革兰阳性菌为2906株,以葡萄球菌属为主;革兰阴性菌为2358株,以鞘氨醇单胞菌属为主,其次是不动杆菌属。共检出的致病菌(包括机会致病菌)1698株,致病菌的分离率为32.26%。[结论]从遗体口和鼻部携带分离了大量的微生物,其中致病菌(包括机会致病菌)检出率非常高,因此,殡仪职工在处理遗体的过程中应注意生物安全防护和消毒问题。