上海市2013-2018年成年人诺如病毒引发感染性腹泻的流行特征研究

目的 了解上海市成年人感染性腹泻患者中诺如病毒的流行特征,为上海市诺如病毒感染性腹泻防控策略的制定提供科学依据。方法 在上海市22家监测点医院的肠道门诊中开展腹泻症状监测,收集患者人口学信息、流行病学资料和主要症状,同时采集患者粪便标本,送至医院所在区CDC检测诺如病毒,分析2013-2018年不同人群和季节的诺如病毒检出率,利用logistic回归分析探讨人群感染诺如病毒的影响因素。结果 在12 083例感染性腹泻患者中,诺如病毒阳性检出率为19.28%（2 330/12 083）,主要型别为GⅡ群（83.63%）。其中男性检出率（20.78%）高于女性（17.73%）,30~44岁组人群诺如病毒检出率最高（21.51%）,2015年检出率最高（23.60%）,以上差异均有统计学意义（P<0.05）。诺如病毒感染以10月至次年4月为高发季节。诺如病毒阳性患者以水样便居多（75.94%）,35.84%患者伴有呕吐症状。多因素logistic回归分析显示,男性、30~44岁组、干部职员、冬季及外出史是感染诺如病毒的危险因素。结论 上海市成年人腹泻患者诺如病毒感染率高,引起的感染性腹泻全年均可发生,冬、春季高发,在诺如病毒引发的感染性腹泻的防控工作中应针对不同年龄、性别、季节采取特异性防控措施。     

常温常压下等离子体灭活病毒效果的研究

目的观察常温常压下等离子体对流感病毒和脊髓灰质炎病毒的灭活效果。方法采用细胞培养法和基因扩增法,对常温常压下等离子体灭活悬液内病毒的效果进行了检测。结果该等离子体发生器置于本试验柜内启动运行4 h,对悬液内H3N2流感病毒灭活对数值为2.71;对悬液内脊髓灰质炎病毒Ⅰ型疫苗株灭活对数值为1.2。流感病毒和脊髓灰质炎病毒经等离子体作用至最长时间为4 h后,其核酸浓度均无明显变化。结论常温常压下等离子体对流感病毒和脊髓灰质炎病毒具不同程度的灭活效果,但其对两种病毒的核酸无破坏作用。     

上海市2014-2017年5岁以下住院儿童病毒性腹泻病原学特征分析

目的 了解目标人群中病毒病原谱及其分子流行病学特征,为病毒性腹泻的防控、用药和疫苗的研发及使用提供科学依据。方法 采集2014-2017年上海市某儿科医院<5岁腹泻住院患儿的粪便标本,并收集患儿的人口学、临床和流行病学信息。采用ELISA、荧光PCR以及巢式PCR方法对轮状病毒、杯状病毒、星状病毒和肠道腺病毒进行核酸检测和分子分型。结果 共采集粪便标本1 018份（男性患儿671份,女性患儿347份）,病毒阳性检出率高达40.57%,每年秋、冬季节达到检出高峰,检出率较高为杯状病毒（24.75%）和A组轮状病毒（13.95%）。在0~6月龄的婴幼儿中病毒检出率最低（32.20%）。约有65%的病毒感染患儿曾使用抗生素治疗,且抗生素的入院前使用率在病毒感染和病毒阴性人群中差异无统计学意义（P>0.05）。G9P[8]基因型为轮状病毒的主导流行株,且轮状病毒在<5岁各年龄组中普遍易感。结论 上海市<5岁腹泻住院患儿中杯状病毒的阳性检出率高于轮状病毒,提示需要密切关注婴幼儿腹泻的病原谱及病毒型别的变迁,在治疗中应合理使用抗生素,并加强疫苗研发用于疾病防控。     

2018－2020年上海市5岁以下住院儿童病毒性腹泻病原学特征分析

  目的  对2018 — 2020年上海市5岁以下感染性肠胃炎住院患儿进行主要病毒病原学检测,了解目标人群中病毒的分子流行病学迁移变化特征,为病毒性腹泻的防控和疫苗研发及应用提供数据支撑。   方法  采集上海市某儿科医院5岁以下腹泻住院患儿的粪便标本,并收集相关流行病学资料。 采用ELISA、荧光PCR以及巢式PCR方法对轮状病毒、杯状病毒（包括诺如病毒和札如病毒）、星状病毒和肠道腺病毒进行检测和分子分型。   结果  共采集粪便标本805份（男性543份,女性262份）,病毒检出率为47.33%,检出率最高的病毒为杯状病毒（31.18%）,其次为A组轮状病毒（17.64%）;杯状病毒中诺如病毒GⅡ型的占比最高（95.62%）。 轮状病毒以G9P［8］为主要流行型别（占比90.85%）。 诺如病毒GⅡ型以GⅡ.4［P31］和GⅡ.3［P12］为主要流行株（占比分别为32.08% 和19.58%）;但2020年以来,新兴亚型GⅡ.4［P16］和GⅡ.2［P16］检出率明显高于2018和2019年（χ2=17.337,P＜0.001; χ2=11.044,P=0.001）。 此外本地首次从1名4月龄患儿粪便中发现1株乐儿德轮状病毒疫苗株。   结论  杯状病毒检出率高于轮状病毒的趋势加剧,使杯状病毒（主要是诺如病毒）疫苗的研发和上市需求愈发迫切。研究首次揭示了住院儿童中诺如病毒GⅡ型的主要流行和新兴亚型,为多效价的诺如疫苗研发提供了参考依据。轮状病毒G9型别近年检出率升高,需要对轮状病毒型别变化保持警戒、追踪和深究。     

上海市2014-2017年成年人感染性腹泻门诊病例的季节分布及病原学特征分析

目的 了解上海市成年人感染性腹泻病例的季节分布等流行特征及病原学特征。方法 对2014-2017年22家上海市成人腹泻病监测点医院肠道门诊的腹泻病例进行主动监测,通过访谈形式开展流行病学调查,并间隔抽样采集病例的粪便标本。由监测点医院所在区CDC开展12种细菌和5种病毒的病原学检测。分析感染性腹泻的病原谱特征,采用集中度值及圆分布方法分析不同病原感染性腹泻的季节分布特征。结果 2014-2017年,上海市腹泻病综合监测系统共监测≥ 18岁成年人腹泻病例96 067例,共采集9 573例病例的粪便标本,标本检测阳性率46.44%。流行特征上,成年人感染性腹泻共有夏、冬季2个发病高峰,夏季以致泻性大肠埃希菌和副溶血性弧菌等细菌感染为主,冬季以诺如病毒等病毒感染为主。细菌感染和病毒感染均有季节集中倾向（雷氏检验P<0.001）,细菌感染季节性强于病毒感染。病原学检测显示病毒感染占比达60.19%,病原谱分析显示前5位优势病原依次为诺如病毒、轮状病毒、致泻性大肠埃希菌、副溶血性弧菌和沙门菌。结论 上海市成年人感染性腹泻门诊病例以病毒感染为主,主要为诺如病毒,发病具有季节性,呈现夏季的细菌感染高峰和冬季的病毒感染高峰。对腹泻病开展持续监测可掌握流行特征和病原学特征及流行趋势,进而采取针对性防控措施。     

上海市类流感监测病例中肠道病毒病原特征研究

目的:了解上海地区类流感病例中肠道病毒病原特征。方法:应用RD、Vero、Hep2细胞对2008年1月-12月收集的567份类流感咽拭子标本进行肠道病毒分离培养,并对分离的毒株进行肠道病毒Vp1区域扩增和测序,通过NC-BI BLAST服务器在线比对进行肠道病毒型别鉴定。结果:从567份咽拭子标本中分离到39株肠道病毒,全年阳性分离率占总分离标本数的6.88%。4月-7月期间获得分离毒株28株,阳性分离率占同期收集标本的21.05%。对所有分离到的肠道毒株进行测序比对,29株为COXB3型病毒、5株为COXA4型病毒、3株为COXA10型病毒,1株为COXA5型病毒和1株为COXA6型病毒。所有COXB3型毒株序列与GenBank网上当年公布的北京株、安徽株、广东株、广州株和日本株同源性达94%以上。结论:在上海地区2008年肠道病毒是引起上呼吸道感染的常见病原体之一,并以COXB3型病毒感染为主,还存在其他肠道病毒病原体感染。应用分子分型技术加强引起呼吸道感染的肠道病毒病原体监测可为相关疾病的流行或暴发提供预警信号,也为临床医生的正确诊断提供依据。