基于全基因组测序的耐碳青霉烯类抗生素鲍曼不动杆菌耐药基因、毒力因子及同源性分析

摘要：目的 通过应用全基因组测序(whole genome sequencing, WGS)技术分析某三级医疗机构耐碳青霉烯类抗生素鲍曼不 动杆菌(carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii, CRAB)的耐药基因、毒力因子及同源性。方法 收集该院2020年1月至3月 重症监护病房(Intensive care unit, ICU)、神经外科分离的11株医院感染CRAB菌株，通过二代测序平台进行全基因组测序, 应用 基因组流行病学中心(Center for genomic epidemiology, CGE)ResFinder 4. 0软件分析其耐药基因型，并应用MORPHEUS在线制作 热图，应用毒力因子数据库(virulence factors of pathogenic bacteria, VFDB)VFanalyzer软件筛选毒力因子，应用MLST软件检测菌 株的ST型，应用Kaptive软件检测荚膜型，应用CSI Phylogeny 1. 4软件及FigTree v1. 4. 4软件构建最大似然树(maximum likelihood tree, MLT)以分析其同源性。结果 11株CRAB对亚胺培南、美罗培南、头孢菌素、环丙沙星均呈现耐药，而对阿米卡星、左氧 氟沙星耐药的菌株株数较少。11株CRAB共检测出18种耐药基因，11株同时携带碳青霉烯酶耐药基因blaOXA-23和blaOXA-66，β-内酰 胺酶耐药基因以blaTEM-1D和blaADC-25为主，大部分菌株携带多种外排泵相关耐药基因及抗菌药物修饰酶耐药基因。11株CRAB均携 带多种毒力因子，包括外膜孔蛋白、脂多糖、生物膜、外排泵、磷脂酶和效应蛋白等，如OmpA、Lps、Csu、Pga、Ade、Plc、 Bas、Bau、Ent、Hem、Aba、Bfm、Pbp和Kat等。11株CRAB均为ST2-K22型，同源性分析结果显示C组内同源性关系相近，存 在院内传播的可能。结论 该院CRAB的耐药性、毒力特征复杂多样，同源性分析显示该院存在1种优势克隆株，该克隆株有医 院内传播的风险。     

论文中阿拉伯与汉字数字的使用规律

1阿拉伯数字使用规则:(1)凡是可以使用阿拉伯数字且很得体的地方,均应使用阿拉伯数字。(2)公历世纪、年代、年、月、日、时刻必须使用阿拉伯数字。年份不能简写。例如:2021年不能写成21年。日期的表示采用全数字式写法。例如:2020年2月18日写作2020-02-18或20200218或2020.02.18。日的时间表示:如下午3时9分38秒写作:15:09:38。(3)计量单位前的数字和统计表中的数值一律使用阿拉伯数字。(4)引文标注中的版次、卷号、期号、页码等使用阿拉伯数字。(5)多位数的阿拉伯数字不能拆开转行。(6)多位数和小数分节,从小数点起向左向右3位数空半个阿拉伯数字(1/4汉字)的空隙,不用千分撇","分节法。     

马华教授采用益气聪明汤联合“老十针”的异病同治经验

益气聪明汤具有补中益气、升举清阳、疏风散热的功效,善于治疗因中气不足、清阳不升所致风热上扰、眩晕、耳鸣、视物不清等症状;“老十针”是由王乐亭教授首创,具有健脾益气、理气和血、升清降浊、调理肠胃之功效。马华教授系山西医科大学第二医院主任医师、硕士生导师、山西省名中医,从事中医临床科教研工作40余年,山西省卫生健康委获准成立“山西省名中医马华工作室”。     

下一代诊断病理学

随着人类基因组测序、生物大数据信息分析、分子病理检测和人工智能辅助病理诊断等技术进步及其应用, 临床医学发展迈向精准诊疗时代。这一时代背景下, 传统诊断病理学迎来前所未有的历史机遇, 正在向"下一代诊断病理学(next-generation diagnostic pathology)"迈进。下一代诊断病理学以病理形态和临床信息为诊断基础, 以分子检测与生物信息分析、智慧制样与流程质控、智能诊断与远程会诊、病灶活体可视化与"无创"病理诊断等创新前沿交叉技术为主要特征, 以多组学和跨尺度整合诊断为病理报告内容, 实现对疾病的"最后诊断", 并预测疾病演进和结局、建议治疗方案和评估治疗反应, 形成新的疾病诊断"金标准"。未来, 需要激发病理学科创新活力, 加快下一代诊断病理学成熟和应用, 重塑病理学科理论和技术体系, 发挥诊断病理学在疾病"防、诊、治、养"等过程中的重要作用, 促进临床医学进一步发展, 服务健康中国战略。     

“互联网+医疗”背景下全生育周期服务体系构建研究△

“互联网+医疗”在实现改善人民群众就诊体验和提高优质资源利用效率等方面具有积极作用。作者介绍了某三级妇幼保健院在国家推进“互联网医院”政策的背景下，以互联网、大数据等技术为依托，自主更新业务体系、重构发展模式，加快内部流程的优化与再造，构建全生育周期服务体系的实践，分析了全生育周期服务体系的初步成效及存在不足，在此基础上提出关于进一步优化全生育周期服务体系的看法和建议。     

征订启事

《临床误诊误治》杂志为中国科技论文统计源期刊、中国科技核心期刊、中国生物医学核心期刊、美国化学文摘数据库来源期刊。本刊大16开全铜版纸彩印。专栏设置富有特色,内容丰富具可读性,丰富的病例报告为临床各专科医生提高临床诊疗实践水平极有帮助。欢迎您订阅2022年《临床误诊误治》杂志,可通过邮局订阅(邮发代号18-46)或邮局直接汇款订阅。每月22日出版,每期定价20元,每年定价240元。地址:河北省石家庄市中山西路398号;邮编:050082;电话:0311-80720899。     

外科转化医学研究进展

转化医学作为连接基础和临床的桥梁，促进了基础研究成果与临床诊疗手段之间的双向转化。30年间，转化医学飞速发展，而随着医学与多学科之间的交叉融合，转化医学也表现出新的发展趋势，尤其是在外科领域。医疗大数据为病人提供了更加精准化、个性化的治疗，医用人工智能也促进了诊疗技术的革新，还有各式医用机器人，推动手术微创化。把握转化医学的发展潮流，促进科研与临床的双向循环，是未来我国医学发展的重心。