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基于生态位模型的人感染H7N9禽流感病毒潜在风险区预测分析 总被引:1,自引:0,他引:1
目的利用Maxent生态位模型研究H7N9传染病与环境因素的关系,并在此基础上预测禽流感疫情的潜在风险区域。方法共选择254例江苏省范围内经过临床确诊的H7N9病例作为样本,构建生态位模型,利用ROC曲线下面积(AUC)来验证构建的生态位模型的有效性;同时,利用变量刀切法(Jackknife)来评价各环境变量对H7N9暴发的贡献;在此基础上,利用构建的生态位模型来预测江苏省12月份H7N9传染病暴发的潜在风险区。结果在江苏省境内,温度、日照强度、降水量和NDVI是影响H7N9禽流感疫情暴发的最主要的环境因素;通过分析12月份的潜在风险区预测图可以发现,江苏省苏南地区,尤其是苏州、无锡、常州3市是H7N9疫情暴发的高风险区。结论当江苏省境内出现持续的低温、日照时间短、气温潮湿的天气时,应密切关注禽流感疫情暴发的可能性。 相似文献
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流感疫苗接种始于20世纪40年代,在人群中长期和广泛的接种数据表明流感疫苗接种是防控流感最有效的手段.传统疫苗的存在形式包含全病毒灭活疫苗、裂解疫苗和亚单位疫苗.它们存在的局限性主要包括:(1)依赖于鸡胚生产,耗时较长;(2)不良反应较大;(3)匹配性依赖:若疫苗株与流行株不相匹配,会造成免疫逃脱,严重影响人群免疫效果;(4)监测干扰:机体会产生针对于病毒内部蛋白(如NP)的特异性抗体,所以全病毒疫苗的使用会干扰临床监测和检疫及流行病学调查. 相似文献
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目的:分析江苏省2013年甲型H1N1(09pdm)流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)变异情况,分析其遗传进化特征?方法:按照流感样病例定义,收集江苏省各哨点医院流感样病例标本,阳性样本经病毒分离培养及亚型鉴定?选取2013年不同时间段?不同地区具有代表性的14株甲型H1N1(09pdm)阳性毒株,利用特异性引物扩增HA?NA基因,测序并分析其遗传进化特征?结果:14株分离毒株与疫苗株A/California/07/2009(H1N1)的HA基因核苷酸和氨基酸同源性分别为97.6%~98.4%和96.5%~98.0%?NA基因核苷酸和氨基酸同源性分别为98.4%~98.9%和97.0%~98.5%?遗传进化分析表明,14株分离株HA和NA基因分属于不同的进化谱系?分子特征表现为HA氨基酸序列出现D114N?K300E?E516K的变异,NA分子特征表现为N44S位点变异?从2013年左右开始甲型H1N1(09pdm)流感基因多样性增加;通过FEL模型得到一个正向压力选择HA氨基酸位点310,一个正向压力选择NA氨基酸位点4,通过REL模型得到9个正向压力选择HA氨基酸位点179?180?239?301?303?310?311?312?313(含位点310),5个正向压力选择NA氨基酸位点4?23?52?287?374(含位点4)?HA蛋白具有9个潜在糖基化位点,7个位于HA1上,2个位于HA2上;NA蛋白共有9个潜在糖基化位点?14株分离毒株在NA蛋白酶活性中心及周围辅助位点上均未发现变异?结论:2013年江苏省甲型H1N1(09pdm)流感HA?NA基因变异加快,遗传多样性增加,未来的遗传进化值得进一步关注? 相似文献
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目的:调查H7N9流行初始江苏省职业暴露人群H5N1禽流感抗体水平及其影响因素?方法:分别使用香港株?广东株与安徽株抗原,用血清凝集抑制法(hemagglutination inhibition,HI)测定血清样本抗体滴度,计算几何平均滴度(geometric mean titer,GMT),统计分析影响抗体水平的因素?结果:检测职业暴露人群血清标本416份,性别与抗原株对职业暴露人群抗体滴度有显著影响?结论:江苏省职业暴露人群H5N1禽流感抗体滴度普遍较低?男性抗体滴度低于女性,广东株抗原与禽流感病毒现有流行株较为接近? 相似文献
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目的利用慢病毒载体构建新型H7N9禽流感病毒血凝素(HA)基因的快速真核表达体系,在人胚肾细胞(HEK293T)中表达并进行功能鉴定。方法提取H7N9禽流感病毒基因组RNA,采用反转录PCR技术扩增HA读码框全长基因,将HA基因连接pMD18-T载体构建pMD18-T-HA重组载体。设计含Kozak序列的引物从pMD18-T-HA质粒中扩增出平末端HA基因,采用Topo克隆构建表达载体pLenti-HA-V5。将表达载体转染HEK293T细胞,通过间接免疫荧光法(IFA)和Western blot法鉴定HA蛋白的表达,通过血凝实验鉴定重组蛋白的生物学活性。结果经反转录PCR获得1 683 bp的HA全长基因,完成真核表达载体的构建并表达出相对分子质量(Mr)为70 000的重组蛋白。IFA和Western blot法结果显示该蛋白与阳性血清具有良好的免疫反应,同时血凝实验证实其具有血凝活性。结论成功利用慢病毒载体建立了HA蛋白的快速真核表达系统,为研制H7N9病毒亚单位疫苗、中和表位研究、假病毒包装奠定基础。 相似文献
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目的:通过江苏省流感监测数据,分析流感样病例(influenza-like illness,ILI)和流感病毒核酸检测阳性率的相关关系?方法:比较江苏省2011~2013年30周不同年龄组间ILI报告数?核酸检测阳性率有无差异,并分析ILI和核酸检测阳性率的相关性?结果:2011~2013年30周我省3个年龄组ILI数差异均有统计学意义,核酸检测阳性率差异也均有统计学意义,0~4岁和5~14岁年龄组ILI与核酸阳性率相关系数无统计学意义,但是15岁及以上年龄组两者相关系数有统计学意义?结论:通过提高ILI报告质量?标本采集质量及监测方案的适时调整,可以获得更加科学有效的流感监测工作效果? 相似文献
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目的:应用bootstrap方法估计流感样病例(influenza-like illnesses, ILI)发病水平95%置信区间(95%CI)作为预警阈值,评价该方法在ILI预警中的价值。方法:以2005—2014年(除2006、2009年)的周监测数据为基线,采用历史2年流感病毒最高阳性检出率的30%作为流感流行标准,确定2006年和2009年流感流行期金标准,通过回顾性分析,比较bootstrap法、移动平均法和金标流行期的一致性;并以2012—2015年的周监测数据为基线,探讨bootstrap法在实际预警工作中的应用。结果:江苏省ILI流行曲线有2个高峰,冬春季高峰分布于11月—次年2月,夏季高峰分布于6—8月;bootstrap法、移动平均法和金标流行期一致性均较好;与移动平均法相比,bootstrap法对2009年初的流感流行相对更敏感,与金标流行期的一致性相对更高(kappa=0.728)。采用bootstrap法对2016年ILI%开展预警,与金标准结果接近。结论:bootstrap法作为一种不依赖于ILI数据分布的计算密集型方法,可作为传统移动平均控制图预警方法的替代和补充,用于流感流行的监测和预警。 相似文献
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目的 对我国长三角地区首例人感染H5N6禽流感进行病毒分离、鉴定和进化分析.方法 通过荧光定量RT-PCR法进行流感病毒分型检测,阳性标本用SPF鸡胚进行病毒分离,对病毒分离物进行全基因组扩增测序,利用Blastn、ClustalX和Mega 6.1等软件进行序列比对和系统进化分析.结果 2019年11月禽流感患者标本中分离到1株H5N6禽流感病毒毒株,该病毒属于clade 2.3.4.4h,其HA蛋白裂解位点含有多个碱性氨基酸,为高致病性禽流感病毒.病毒HA蛋白的Q222和G224位氨基酸未发生突变,保留了禽类受体α2-3半乳糖苷唾液酸结合特性;AA158位点丧失糖基化,但AA124出现1个新的潜在糖基化位点.结论 长三角地区首例人感染的H5N6禽流感病毒是1株新基因重配的高致病性禽流感病毒,与近年来家禽中流行的病毒高度同源,提示应该加强对禽流感病毒的监测和跨种传播的研究. 相似文献
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目的 对2014-2018年江苏省涉禽外环境标本禽流感病毒检测结果进行分析,了解禽流感病毒时空流行性特征,为江苏省禽流感防控工作提供依据。方法 选取2014-2018年江苏省13个市的5类场所,6类禽类市场外环境标本,采用荧光定量PCR方法对标本进行A型、H5亚型、H7亚型、H9亚型流感病毒检测,采用描述性流行病学方法对检测结果进行统计分析。结果 江苏省全年均有禽流感阳性样本检出,其中以冬季和春季阳性检出率较高;2014-2018年,共检测出A型通用阳性标本3 867份,阳性率为13.84%,H5亚型阳性标本330份,阳性率为1.18%,H9亚型阳性标本1 905份,阳性率为6.82%,H7亚型阳性标本986份,阳性率为3.53%, H5和H9混合亚型标本157份,阳性率为0.56%,H9和H7混合亚型阳性标本293份,阳性率为1.05%,H5和H7混合亚型阳性标本116份,阳性率为0.42%,H5、H9、H7混合亚型阳性标本61份,阳性率为0.22%。不同检测场所和不同类型标本禽流感病毒检出率差异具有统计学意义,城乡活禽市场的禽流感病毒阳性率最高,宰杀或摆放禽肉案板表面擦拭标本和清洗禽类的污水标本阳性率最高;不同地区的禽流感病毒阳性检出率存在显著性差异。结论 江苏省外环境中禽流感病毒以H9亚型为主,应加强禽流感病毒的防控工作,加大每年春季和冬季的禽流感病毒监测力度,加强对城乡活禽市场的监管。 相似文献