2010-2012年南京市呼吸道冠状病毒流行病学特征分析

目的 分析2010年11月至2012年10月南京地区4个型别冠状病毒流行病学特征.方法 采集江苏省人民医院与南京医科大学第二附属医院流感样(influenza-like illness,ILI)病例咽拭子标本,并收集患者相关信息,利用RT-PCR方法进行检测,应用SPSS 17.0对数据进行统计分析.结果 1233例标本中,冠状病毒核酸阳性者共有115份(总阳性率9.33％),主要为229E型(36.52％,42/115)、OC43型(29.57％,34/115)与HKU1型(25.22％,29/115).2010-2012年不同年份间,冠状病毒229E型、HKU1型与NL63型阳性率有统计学差异(229E亚型:X2=18.072,P＜0.001;HKU1亚型:X2 =22.091,P＜0.001;NL63亚型:X2 =6.470,P=0.039).结论 南京地区冬季为冠状病毒流行高峰期,夏季为低谷期,春秋季小高峰趋势不明显.2010-2012年南京地区人呼吸道冠状病毒主要流行亚型为229E型、OC43型与HKU1型.不同年份冠状病毒主要流行亚型存在一定差异.     

江苏省新甲型H1N1流感疫苗免疫后抗体水平变化趋势研究

目的了解新甲型H1N1流感疫苗免疫前后人群抗体水平动态变化情况。方法随机选取部分疫苗接种人群为受试者,微量半加敏血凝抑制实验检测免疫前、免疫后1个月与免疫后3个月的血清抗体水平,计算抗体阳性率与抗体几何平均滴度(GMT),并进行统计学分析。结果免疫前、免疫后1个月与3个月抗体阳性率分别为13.64%(9.58%~18.61%)、83.63%(78.15%~88.20%)、77.06%(71.09%~82.32%),GMT分别为9.36(8.30~10.56)、122.53(100.29~149.70)、96.07(77.85~118.54)。免疫前与免疫后1个月、3个月后相比,抗体阳性率与GMT差异均有统计学意义。免疫后1个月与免疫后3个月两者差异均无统计学意义。结论本研究所用甲型H1N1流感病毒裂解疫苗免疫后抗体水平明显升高,且维持时间较长。     

江苏省甲型H1N1流感裂解疫苗的免疫效果分析

2009年甲型H1N1流感的流行引起了广泛重视,接种疫苗是预防流感流行、降低死亡率和病死率的最有效方法[1],本研究通过比较不同人群甲型H1N1抗体水平变化趋势,初步评估甲型H1N1流感裂解疫苗的免疫效果. 1.对象与方法: (1)研究对象:2009年11月、12月、2010年2月,在江苏省随机选择甲型H1N1流感疫苗接种人群(免疫人群),连续采集同一批人群(共281人)免疫前、免疫后1个月及3个月的血清标本(排除季节性流感疫苗接种者和接种前1个月内有流感样症状者);连续采集甲型H1N1流感确诊病例(发病时间为2009年10月15日至11月15日,经RT-PCR检测确诊为甲型H1N1流感病毒感染[1])同一组病例发病2周内(107例)、发病后1个月(77例)及3个月(52例)的血清标本(排除甲型H1N1流感疫苗和季节性流感疫苗接种者),选择同时期自然人群作为背景资料.     

江苏省近期急性胃肠炎暴发中诺如病毒分子特征分析

目的 了解江苏省胃肠炎暴发疫情中诺如病毒(NoV)感染状况,并对其病原分子流行病学特征进行初步研究.方法 收集江苏省2012年10月至2013年3月7起胃肠炎暴发疫情患者肛拭子标本共67份,采用实时荧光RT-PCR定性检测,NoV阳性标本用RT-PCR扩增其聚合酶区及VP1区基因片段进-步测序分型.结果 7起疫情均为NoV感染引起的暴发,检测阳性率为67.2％(45/67).全部45株阳性毒株序列分析表明7起疫情中除-起是由GⅡ.3型感染引起外,其余6起均由新GⅡ.4感染引起,其中38株毒株与2012年澳大利亚参考株GⅡ.4/Sydney株同源性均在99％以上.进-步对6株新型Sydney变异株的衣壳蛋白VP1区扩增测序,并与9株近年流行株的VP1区氨基酸序列比对,发现该6株毒株的VP1区部分氨基酸已出现突变,而氨基酸位点的突变是与病毒抗原性密切相关.结论 江苏省7起疫情暴发聚集且感染毒株型别单-,说明已出现新NoV变异株,其原型株GⅡ.4/Sydney已在国外多地引起暴发和流行,提示该毒株将是今后防控监测的重点.     

2014—2015年江苏省肠道病毒71型VP1基因特征分析

目的：探讨2014—2015年江苏省肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)分离株的病毒基因特征。方法：用RD细胞对RT?鄄PCR初筛EV71阳性的标本进行病毒分离,成功分离到的EV71分离株进行VP1区的序列测定和分析。序列分析结果用DNA Star和MEGA 6.0软件进行分析,并与各型参考株进行比较。结果：共分离到35株EV71型毒株,分离阳性率为29.17%。35株EV71分离株VP1区的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为93.3%～100.0%和96.6%～100.0%,与EV71的C4a亚型代表株安徽阜阳株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为95.6%～97.9%和97.9%～100.0%;在系统进化树上与C4a亚型代表株相聚在一起,并且存在2个进化分支。结论：2014—2015年江苏省分离的35株EV71毒株均属于C4a亚型;江苏省EV71流行株可能与国内其他省市流行的病毒有着共同的祖先,再各自进化。     

江苏省2009—2013年汉坦病毒分离株全基因序列测定及分析

目的:从分子水平分析2009—2013年江苏省分离汉坦病毒(Hantavirus,HV)的型别及变化,为疾病的预防控制提供实验依据?方法:采集2009—2013年江苏省肾综合征出血热(hemorrhagic fever with renal syndrome,HFRS)急性期患者血清及监测点鼠肺标本?采用胶体金法检测血清样本中汉坦病毒的IgM?IgG抗体,采用免疫荧光检测鼠肺样本中汉坦病毒抗原,并用VERO E6细胞分离病毒,RT-PCR检测标本培养物中病毒M片段以鉴定HV病毒,采用高通量测序技术对分离株进行全基因组测序,MEGA6.0软件对其进行序列比对和进化分析?结果:分离到的11株病毒与陕西分离株LR1?四川分离株S85-46以及汉坦病毒原型株76-118遗传距离最为接近,属于汉滩(Hantean,HTN)型病毒?分离株与2002年分离的江苏(A9?HTN型)株以及浙江株?安徽株处于不同的进化分支上,表明遗传关系较远?结论:江苏的汉坦病毒优势株发生了变化,而且发生了宿主转换?目前疫苗仍具有保护效力,但需加强监测?     

江苏省苏州及南京地区2010年婴幼儿腹泻中诺如病毒分子流行病学研究

目的 了解江苏地区婴幼儿腹泻患者中诺如病毒的感染情况,明确该地区诺如病毒的主要基因型别和流行病学特征.方法 收集2010年江苏省苏州市婴幼儿医院及南京市婴幼儿医院疑似病毒性腹泻粪便标本498例,采用荧光定量PCR方法检测粪便中诺如病毒RNA及其基因组别,并对部分阳性标本测序以明确基因型.结果 498份粪便标本中,GⅠ组诺如病毒阳性标本为2例,阳性率为0.4％,GⅡ组诺如病毒为190例,阳性率为38％,对本地区部分诺如病毒阳性标本进行测序,2份GⅠ标本中,一株为GⅠ1型,另一株为GⅠ3型;测序的23份GⅡ标本中21株为GⅡ4型,2株为GⅡ3型.结论 诺如病毒是本省婴幼儿病毒性腹泻的重要病原体,以诺如病毒GⅡ4型为主,同时也存在其他型别的感染流行.     

2010-2012年南京流感样病例部分呼吸道病毒流行特征分析

目的了解南京流感样病例9种呼吸道病毒流行特征。方法 2010-2012年采集两个流感哨点医院流感样病例(ILI)咽拭子标本1 367份,荧光定量PCR检测流感病毒(甲型、乙型、丙型)、副流感病毒(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型)、鼻病毒与人博卡病毒等9种常见呼吸道病毒。结果 1 367份ILI咽拭子标本中,检测出374份阳性,检出率为27.36%。以乙型流感病毒检出率最高(8.49%),其次是甲型流感病毒(7.53%),Ⅳ型副流感检出率最低(0.22%)。不同季节中,以夏季病毒检出率最高(31.50%),秋季最低(22.10%)。检出混合感染19例,以鼻病毒与其他病毒混合感染最多,共15例,占所有混合感染的78.95%。结论南京市2010-2012年流行呼吸道病毒以甲、乙型流感病毒、鼻病毒为主,间或有丙型流感流行,偶有个别4型副流感病毒与人博卡病毒感染病例出现。     

江苏省肠道病毒71型分离株的分子遗传演化特征

肠道病毒71型(EV71)是小RNA病毒科肠道病毒属成员,其感染主要引起患者手足口病(handfoot-mouth disease,HFMD),个别患者可引起无菌性脑膜脑炎等并发症.自1998年EV71在中国台湾暴发以来,EV71病毒在亚洲的流行呈上升趋势.流行病学资料表明,不同地区不同症状的EV71病毒性疾病的暴发可能与毒株间的差异等因素有关[1].为了解EV71病毒的遗传和变异特征,本实验室对2009年在江苏手足口病流行地区分离到的一株EV71型病毒株(Jiangsu01,GenBank:FJ600325.1)的基因组核苷酸序列进行了遗传进化分析,从分子水平为EV71病毒的流行以及所致疾病的防控提供理论基础.     

江苏省一起胃肠炎暴发疫情中分离的诺如病毒基因特征分析

目的 分析江苏省一起胃肠炎暴发疫情中分离的诺如病毒基因特征。方法 对2016年12月16－27日江苏省一起急性胃肠炎暴发疫情中病例的肛拭子标本进行核酸提取,利用诺如病毒特异性引物对部分RNA依赖的RNA聚合酶序列及完整衣壳蛋白序列（VP1）进行RT-PCR扩增,扩增产物测序后进行基因特征分析。结果 序列比对结果显示,PCR产物在诺如病毒RNA依赖的RNA聚合酶区与GⅡ.g型别的西班牙株及芬兰株处于同一分支,同源性为98.7%,在VP1区与GⅡ.1型别的美国株同源性更高（99.4%）,初步推断为重组病毒。进一步通过重组分析软件Simplot分析,其可能重组位点在VP1的5 106位点,定位在ORF1/2交叠区。VP1氨基酸变异位点分析显示,其假定的抗原表位及受体结合表位均未出现变异,仅在132位氨基酸位点由N突变为S。结论 江苏省胃肠炎暴发疫情中分离的诺如病毒为GⅡ.g-GⅡ.1重组变异株。