医学语言与临床数据标准化概述简

医学语言丰富多样,临床数据范围广泛且种类繁多。在信息技术已成为被普遍采用的医疗服务辅助工具的今天,如果缺乏标准化的数据定义,就会导致计算机数据调用、分析过程和结果出现混乱。面对临床过程产生的大量叙述性文本数据,自然语言处理技术的应用面临巨大挑战,因此,需要以统一、标准化的形式表达医学概念,即通过构建和应用临床信息模型、标准医学术语、编码系统,形成计算机可识别和处理的结构化、代码化数据,支持信息技术在临床决策中发挥作用,同时促进临床信息的二次利用。     

基于文本挖掘的DNA微阵列表达数据方法研究

DNA微阵列技术是近年来发展起来的一种功能基因组学研究技术.利用DNA微阵列技术,可以从基因组水平上鉴定出相关的功能基因及其表达调控网络,有助于阐明这些基因的生物学功能及其机理.结合文本挖掘的相关研究结果.探讨了DNA微阵列技术的原理和特点,数据的分析和解释,基因的聚类方法和基于文献的DNA微阵列分析.通过基于文献的微阵列分析方法,找出隐舍的、具有语义关联的生物概念,并进行推理,发现隐性的新知识.具体阐述了基于统计、基于自然语言处理、基于关联规则挖掘,基于模式识别的4种分析方法.基于文本挖掘的DNA微阵列技术,有利于发现基因或蛋白质之间的相互作用关系,自动识别生物学名词,提高数据分析效率等.     

SNOMED CT与OpenEHR的整合探究

详细介绍SNOMED CT与OpenEHR的发展历史、主要内容、主要架构,通过数据类型转换、原型中的临床术语与SNOMED CT的映射、候选术语集等方法进行SNOMED CT与OpenEHR的整合,从而使原型中的术语更加规范,也为互操作提供可能。     

泌尿系结石CT征象与手术方式的相关性：NLP研究

目的:以自然语言处理(NLP)方法研究泌尿系结石CT报告征象与临床手术方式的相关性.方法:回顾性选取HIS中因泌尿系结石行CT检查、并在本院行外科处理的住院患者资料,包括CT报告、出院小结中记录的诊疗经过,形成记录文档.使用不同NLP模型研究CT报告中结石的影像特征与手术方式的相关性.结果:共纳入371例连续患者的资料用于分析,其中行经皮肾镜碎石取石术(PNL) 142例,输尿镜碎石术(URL) 190例,输尿管软镜碎石术(IRS) 39例.NLP提取“结石”、“炎症”、“输尿管形态”为关键CT特征,十折交叉验证结果显示,经优化后的NLP对结石手术(URL和PNL)分类符合率为0.730,ROC曲线下面积为0.741.结论:NLP用于CT结石特征分析是可行的,可为临床决策提供一定的帮助.     

电子病历自然语言处理测评发展

分析自然语言处理在医学领域应用存在障碍的原因,提出电子病历自然语言处理测评的方法,介绍历年来有关电子病历自然语言处理测评内容及其发展情况,包括文本检索会议、医学自然语言处理测评、SHARe/CLEF测评、I2B2测评等。     

儿童先天性心脏病超声心动图报告与个体风险的相关性分析

 目的 分析儿童先天性心脏病超声心动图检查报告中文字描述信息与临床风险评估结果的相关性,并验证文本挖掘方法在此类分析中的可行性和应用价值。方法 回顾性分析1 042例先天性心脏病患儿的彩色超声心动图报告,通过自然语言处理(natural language processing, NLP)技术进行特征提取与筛选,以患儿的风险等级为预测目标,借助机器学习算法构建决策树,推测出临床医师解读心脏超声报告时可能的决策路径。通过50次基于分层抽样的10折交叉验证评价模型的风险等级预测能力,进而评估报告在临床决策中的作用和价值。结果 使用自动生成的全部三元语法(3-gram)或基于领域知识筛选后的特征,所训练的风险等级预测模型分别达到32.82%和48.57%的分类准确率,平均绝对误差(normalized mean absolute error,NMAE)分别为0.33和0.25。结论 超声心动图报告中的文字部分,尤其是描述疾病征象的常用术语,能够在约75%的水平上反映先天性心脏病患儿的严重程度,为临床医师诊疗决策提供重要依据。     

自然语言处理工具分析180天复合环境因素对1名志愿者情绪影响的个案研究

目的探讨在180天受控生态生保系统集成试验中复合环境因素对志愿者情绪的影响。方法采用百度自然语言处理客户端工具Aip Nlp对《飞舟日记—"太空180"试验》中的168篇日记进行情绪分析,评估1名志愿者在不同试验阶段的情绪变化。结果在模拟火星日期间,正向情绪分值有所降低,低于整体均值,并且低于整体均值的日记篇数的比例也有所增高,但不具显著性(P0.05)。在模拟火星日期间及后期,日记平均字数明显减少。而模拟火星日阶段中期的正向情绪分值和日记字数相对于前期和后期均有提升,低于均值的日记篇数也较少。鼓励及与外界沟通具有改善情绪的显著作用,并具有持续性。不同因素对负向情绪的影响不同,其中由设备故障或操作失误引起的情绪低落具有持续性。结论火星的非24小时周期可能会影响人的情绪;正向和负向因素对于情绪的影响存在差异。     

基于融合模型的中文病历文本智能纠错研究

目的 针对中文医学病历文本,进行错别字智能纠错,以改善中文病历质量,减少诊疗文书差错产生的概率。方法 将统计语言模型和基于神经网的预训练模型相融合,进行中文病历文本错别字纠错的训练和验证,最终通过综合指标F1进行模型效果的评估。结果 实验结果显示,融合模型的中文病历错别字纠错F1为0.6254,优于单统计语言模型和单预训练模型的F1值0.4813和0.5970。结论 基于统计语言模型和预训练模型的融合方法,在中文病历文本错别字纠错方面有较好的效果,对临床病历书写质量的保障有一定的现实辅助意义。