可手术的非小细胞肺癌患者TUBB3基因mRNA表达与预后相关性

 目的 探讨可手术的非小细胞肺癌人群中TUBB3基因mRNA表达水平和预后的相关性。方法 通过分支-DNA液相芯片技术定量检测92例非小细胞肺癌患者TUBB3基因mRNA表达,持续随访60个月,用Kaplan-Meier法绘制生存曲线,进行多因素分析。结果 在92例肺癌患者中,与不吸烟者相比,吸烟者的TUBB3基因mRNA表达水平明显更高(P=0.017)。随访结果显示:TUBB3 mRNA低表达的患者中位总生存期为48.7个月,长于高表达患者的生存期(35.8个月),差异有统计学意义(P=0.011,HR=1.56,95% CL:1.45~2.56)。TUBB3 mRNA低表达患者中位PFS为35.7个月,长于高表达患者中位PFS(23.5个月),差异有统计学意义(P=0.001,HR=1.33,95% CL:1.06~2.32)。结论 TUBB3 mRNA表达是可手术的非小细胞肺癌的预后因子。     

hsa-miR-221调控非小细胞肺癌分子网络的生物信息学分析

目的应用生物信息学的方法研究hsa-miR-221在非小细胞肺癌（non-small cell lung carcinoma,NSCLC）中的分子调控网络。方法运用UCSC基因组浏览器、人类miRNA疾病数据库、TF-miRNA结合数据库、miRNA靶基因预测数据库、GeneCards数据库、肺癌相关因子整合数据库和转录因子结合谱数据库等,研究hsa-miR-221上游转录因子、下游靶基因及与其有相互作用的lncRNA的多个调控途径,绘制hsa-miR-221在NSCLC中分子调控网络。利用GEO数据库验证关键基因。结果UCSC数据库显示hsa-miR-221位于X染色体,在多个物种中保守。hsa-miR-221与多种癌症包括NSCLC相关。分析表明hsa-miR-221受6个与NSCLC相关的转录因子如MYC、MYCN等的调控,同时又调控下游基因PTEN、RB1和BCL2等26个基因。另外,lncRNA基因GAS5、HOTAIR和TUG1及其转录因子Snail、n-MYC、ARNT和SOX5等也可能参与调控hsa-miR-221,从而构成一个以hsa-miR-221为核心的调控网络,在NSCLC的发生和发展中起重要作用。通过对GEO数据库hsa-miR-221高表达NSCLC细胞系差异基因分析,最终验证了5个基因。结论用生物信息学的方法预测hsa-miR-221的分子调控网络,为阐明其调控NSCLC的发病机制提供指导。     

miR-200c通过下调TUBB3基因表达逆转老年肺癌患者顺铂耐药性的机制

目的探讨miR-200c逆转肺癌细胞顺铂耐药性的作用机制。方法 miR-200c模拟物转染肺癌A549细胞后,采用实时定量PCR法检测miR-200c的表达;采用细胞活力测定(MTS)法检测miR-200c对肺癌A549细胞顺铂耐受性的影响。采用流式细胞术(FCM)检测肿瘤细胞凋亡率的变化。采用Western blotting检测肿瘤细胞耐药蛋白survivin和Bcl-2蛋白的表达。通过生物信息学分析发现miR-200c下游靶分子TUBB3表达存在差异后,构建TUBB3 3′UTR的野生型和突变型荧光素酶报告载体,然后利用双荧光素酶活性分析miR-200c对TUBB3基因表达的结合位点和调控作用。通过Western blotting检测miR-200c对TUBB3蛋白表达的调控作用以及Bcl-2蛋白和肿瘤细胞耐药蛋白survivin的表达。采用SPSS 19.0统计软件分析实验数据。结果与对照组相比,miR-200c转染肺癌细胞株后,肺癌细胞对顺铂的敏感性呈明显增加趋势[IC_(50)分别为(37.3±3.1)和(15.3±3.3)μmol/L,P0.01]。过表达miR-200c的A549/DDP组的细胞凋亡率明显高于NC组(P0.01)。而肿瘤耐药相关基因Bcl-2和survivin蛋白表达降低。转染miR-200c mimics的A549/DDP细胞中TUBB3蛋白和mRNA的表达均下调(P0.01)。双荧光素酶活性分析显示miR-200c对TUBB3基因表达具有调控作用(P0.01)。这些结果均证实TUBB3为miR-200c的下游靶基因。pcDNA-TUBB3质粒转染后,过表达miR-200c的A549/DDP细胞株survivin和Bcl-2蛋白表达较miR-200c mimics组上调。结论 miR-200c可通过下调TUBB3基因的表达逆转肺癌顺铂耐药细胞的耐药性。     

miR-223-3p通过靶向TGFBR3促进LncRNA ADAMTS9-AS2表达上调抑制肺癌细胞的增殖和迁移作用

目的：探讨miR-223-3p通过靶向转化生长因子-βⅢ型受体(TGFBR3)促进长链非编码RNA(LncRNA)ADAMTS9-AS2表达上调抑制肺癌细胞增殖和迁移的作用及可能机制。方法：采用RT-PCR检测肺癌H1299细胞中miR-223-3p和TGFBR3 mRNA表达水平,Western blotting检测TGFBR3的蛋白表达水平,RT-qPCR检测LncRNA ADAMTS9-AS2的表达水平,CCK-8检测细胞增殖能力,Transwell细胞迁移实验和划痕实验检测细胞迁移能力。采用脂质体转染miR-223-3p模拟物(过表达组)、抑制剂(抑制组)、对照质粒(对照组)于H1299细胞中,比较各组转染前后miR-223-3p、TGFBR3、LncRNA ADAMTS9-AS2表达水平、细胞增殖能力、细胞迁移能力。结果：与转染前比较,过表达组转染后的H1299细胞中miR-223-3p、LncRNA ADAMTS9-AS2表达水平均升高(P<0.05),TGFBR3蛋白和mRNA表达水平均降低(P<0.01和P<0.05),细胞增殖和迁移能力下降(P<...