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1.
目的 利用网络药理学结合GEO基因芯片分析的方法,研究复方苦参注射液治疗宫颈癌的靶点和分子机制。方法 首先利用TCMSP、TCMID、SwisstargetpredicitionTCMIP等数据库筛选收集复方苦参注射液的化合物和靶点。然后利用GEODataset数据库获取宫颈癌芯片数据,再通过R软件获得其差异基因,同时绘制火山图和热图。再利用R软件对复方苦参注射液靶标基因与GEO差异基因取交集,作为复方苦参注射液治疗宫颈癌的潜在作用靶标,通过string数据库和Cytoscape3.7.2软件对交集基因进行蛋白相互作用网络富集分析并图示化,利用Cytoscape3.7.2软件制作药物-化合物-靶点-疾病网络图。最后利用R语言的clusterfiler程序包对复方苦参注射液治疗宫颈癌的潜在作用靶标进行GO富集分析和KEGG信号通路富集分析。结果 复方苦参注射液治疗宫颈癌候选活性成分共计178个,包括苦参碱、槐定碱、右旋异苦参碱等;118个潜在作用靶标,包括OPN、MMP-9、SIRT1、VEGFR-3等;135条通路,包括PI3K-Akt、apelin/APJ、P38MAPK、NF-kB、AMPK等信号通路。分子对接表明苦参碱与3个关键候选靶蛋白(CCND1、CDK1、MMP-9)有较好的结合性。结论 研究揭示了复方苦参注射液在治疗宫颈癌中化合物、作用靶标和作用机制,丰富其临床与实验应用的理论基础。  相似文献   
2.
目的分析胎儿外侧裂异常的超声图像特征及相关疾病, 探讨全基因组测序技术在胎儿外侧裂异常中的应用价值。方法前瞻性纳入2018年10月至2020年10月在南方医科大学附属深圳妇幼保健院被诊断为外侧裂异常的胎儿28例。对胎儿颅脑进行详细神经超声评估及MRI检查。采集羊水/脐血或出生后脐带组织用于全基因组测序。记录妊娠结局、产后MRI结果, 活产婴儿的神经发育随访需超出生后24个月。结果 28例外侧裂异常胎儿孕周21.3~30.0(24.8±2.0)周。28例胎儿中包括脑皮质发育畸形(15例, 53.6%)、可导致发育迟缓的染色体异常(3例, 10.7%)或单基因遗传综合征(3例, 10.7%)、脑积水或脑白质软化(4例, 14.2%)、胼胝体发育不全伴中线囊肿(1例, 3.6%)、良性蛛网膜下腔增宽( 1例, 3.6%)、多发畸形(1例, 3.6%)。在15例脑皮质发育畸形胎儿中, 无脑回/巨脑回畸形最常见, 其次是脑裂畸形、严重小头畸形、半侧巨脑畸形伴脑室旁灰质异位、多小脑回。28例外侧裂异常的胎儿中23例为双侧外侧裂异常, 5例为单侧外侧裂异常。根据其在丘脑横切面上的超声图像特征分为6型...  相似文献   
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