胆囊癌中PTEN基因异常表达及甲基化的研究

目的 探讨胆囊癌的发生、发展及转移与PTEN 基因异常表达及其基因启动子区异常甲基化的关系。方法 选取胆囊癌标本44 例（胆囊癌组）和胆囊炎标本20 例（对照组）,通过免疫组织化学染色、Western-blot、甲基化特异性PCR法分析两组患者胆囊组织中PTEN 基因表达及启动子区甲基化差异。结果 与对照组相比,胆囊癌组中PTEN 基因表达阳性率明显下降（P＜0.01）,而启动子区甲基化阳性率显著增高（P＜0.01）;胆囊癌组中有淋巴结转移者PTEN 基因表达阳性率较无淋巴结转移者降低（P＜0.05）,而启动子区甲基化阳性率增高（P＜0.05）;胆囊癌分期增高,PTEN 基因表达阳性率降低（P＜0.05）,而启动子区甲基化阳性率增高（P＜0.05）。结论 PTEN 基因低表达是胆囊癌的发生、发展及转移的重要原因之一,其低表达与启动子区过度甲基化有关。     

肺癌中结肠多发性腺瘤样息肉基因启动子1A序列甲基化模式的研究

目的 探寻结肠多发性腺瘤样息肉（APC）基因启动子1A序列中肺癌甲基化位点及其存在模式。方法 用甲基化序列特异性引物，对阳性控制样品（CB＋）、阴性控制样品（CB-）、13份正常肺组织及19份肺癌组织进行APC基因启动子1A序列甲基化特异性扩增（MSP），其扩增产物直接测序和进行克隆测序分析。结果 在19份肺癌组织中，APC基因启动子1A序列的707、714、719和726位点发生高甲基化，甲基化率分别为95％（18／19）、74％（14／19）、74％（14／19）和74％（14／19），与正常肺组织比较，差异均有统计学意义（P〈0．001）。而679和687位点甲基化发生率均为11％（2／19），与正常肺组织甲基化发生率（0／13）接近（P〉0．05）。结论 在APC基因启动子1A序列中存在CpG胞嘧啶二核苷酸特定甲基化模式，其对肺癌早期诊断可能有重要意义。     

三氧化二砷诱导人骨髓增生异常综合征细胞株MUTZ-1细胞p15INK4B基因表达的研究

目的 探讨三氧化二砷（As2O3)去甲基化作用的机制。方法 采用甲基化特异PCR（MSP）检测p15INK4B基因甲基化，RT－PCR方法检测p15，甲基转移酶（DNMT）1，DNMT3A，DNMT3B的表达，MTT法检测As2O3对MUTZ－1细胞的生长抑制。结果 MUTZ－1细胞有p15INK4B基因甲基化，p15基因弱表达，As2O3作用后p15INK4B基因甲基化程度明显下降，p15基因表达增强，DNMT3A，DNMT3B mRNA的表达下降并呈浓度依赖性。结论 As2O3可能通过抑制甲基转移酶DNMT3A，DNMT3B，或（和）直接对p15INK4B基因去甲基化，使p15基因表达上调，恢复共活性。     

儿童急性淋巴细胞白血病患者肝癌缺失基因1启动子的异常甲基化

目的 分别采用甲基化特异性PCR(MSP)检测儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)患者肝癌缺失基因1(deleted in liver cancer-1,DLC-1)启动子的甲基化水平,探讨DLC-1启动子甲基化用于判断儿童ALL预后的临床价值.方法 选择34例ALL患者骨髓,5例正常骨髓和T淋巴细胞白血病细胞系6T-CEM,分别采用MSP和焦磷酸测序法检测DLC-1启动子甲基化,并采用荧光定量PCR检测5-aza-2'-deoxycytidine处理6T-CEM细胞前后DLC-1的表达.结果 经MSP检测,21例ALL患者骨髓中存在DLC-1甲基化,而在正常骨髓中未发现该基因甲基化.采用焦磷酸测序法检测的结果与MSP法完全一致,而焦磷酸测序法能对DLC-1启动子上的CG位点甲基化进行定量,DLC-1基因的甲基化与年龄、性别、WBC计数、FAB分类、免疫学分型、临床分型等临床病理学参数无显著相关性(P＞0.05).DLC-1基因甲基化阳性的18例获得完全缓解的ALL患者中有14例在12个月内复发,而甲基化阴性的12例获得完全缓解的ALL患者仅4例复发.采用5-aza-2'-deoxycytidine在体外处理DLC-1甲基化细胞6T-CET后,可使DLC-1恢复表达,且呈剂量依赖性.结论 从儿童ALL患者中检测到DLC-1启动子存在高频率的异常甲基化,DLC-1甲基化对预测儿童ALL复发具有一定意义.同时证明焦磷酸测序法是一种敏感、简单,并能对DLC-1启动子甲基化进行定量检测的新方法.     

miR-34b基因启动子区甲基化与甲状腺乳头状癌的关系

目的探讨甲状腺乳头状癌（PTC）中微小RNA-34b（miR-34b）基因的表达及其启动子区的甲基化情况,并分析甲基化与其临床病理特征的关系。方法收集2008年9月至2010年10月期间南京医科大学附属淮安第一医院行手术切除的25例PTC患者的癌组织和癌旁组织。采用实时定量PCR法检测其miR-34b mRNA的表达,采用甲基化特异性（MSP）PCR法检测miR-34b基因启动子区的甲基化情况。结果 PTC癌组织中miR-34bmRNA的相对表达量为0.85±0.05,较癌旁组织的1.62±0.09低（P=0.030）。25例PTC癌组织中,有18例（72%）患者的miR-34b基因启动子区发生甲基化,癌旁组织组有10例（40%）,癌组织的甲基化比例较高（P=0.021）。甲基化与PTC患者的年龄、性别、肿瘤大小、TNM分期和包膜浸润均无关（P〉0.05）,而与淋巴结转移有关,发生淋巴结转移者的甲基化比例高于未发生淋巴结转移者（P〈0.05）。结论 PTC癌组织中miR-34b基因启动子区的异常甲基化可能是该基因失活的原因之一,并且可能与PTC的发生、发展以及转移均有关,其机理值得进一步研究。     

5-Aza-CdR对胃癌细胞系生长及Apaf-1基因异常甲基化的影响

目的:观察5-氮杂-2′-脱氧胞苷(5-aza-2′-deoxycitydine,5-Aza-CdR)对体外培养的胃癌SGC7901细胞和BGC823细胞增生、细胞周期和凋亡的影响及其对此两株细胞中Apaf-1基因的甲基化状态的影响.方法:不同浓度5-Aza-CdR处理体外培养的SGC7901细胞和BGC823细胞后,用MTT法检测处理24,48和72 h的细胞增殖活性;PI染色和流式细胞仪检测药物处理后72 h细胞周期分布和细胞凋亡率;MSP法检测用药前后细胞中Apaf-1基因的甲基化状态;RT-PCR法及Western blot法检测用药前后细胞中Apaf-1的mRNA及蛋白表达的变化.结果:1×10-7,5×10-7,1×10-6和5×10-6 mol/L5-Aza-CdR处理SGC7901和BGC823细胞24,48,72 h后,细胞增生受到抑制,有时间和剂量的依赖性.流式细胞仪分析表明,各药物浓度处理72 h后凋亡率增加明显:SGC7901细胞5×10-7,1×10-6和5×10-6 mol/L组分别为2.53%±1.19%,5.93%±0.86%,10.14%±1.51%,与对照组(0.12%±0.03%)相比差异显著(P＜0.05);BGC823细胞5×10-7,1×10-6和5×10-6 mol/L组分别为1.57%±0.26%,4.64%±1.05%,8.21%±1.46%,与对照组(0.57%±0.03%)相比差异显著(P＜0.05).在5-Aza-CdR处理前未检测到SGC7901细胞系及BGC823细胞系的Apaf-1基因的mRNA及蛋白表达,经过5-Aza-CdR处理后,Apaf-1基因在SGC7901细胞系及BGC823细胞系中甲基化状态得到了逆转,Apaf-1基因的mRNA及蛋白重新表达.结论:5-Aza-CdR对SGC7901细胞和BGC823细胞具有增生抑制作用;Apaf-1基因的表达情况与其甲基化状态的改变有关.     

5-杂氮脱氧胞嘧啶核苷联合吉西他滨对胰腺癌细胞株原钙黏蛋白8基因表达的影响

目的 研究5-杂氮脱氧胞嘧啶核苷(5-Aza-CdR)对胰腺癌细胞株Capan-2原钙黏蛋白8(protocadherin 8,PCDH8)基因DNA启动子甲基化的转录调控,以及联合吉西他滨对癌细胞生长抑制与凋亡的影响.方法 采用MTT法、流式细胞术检测5-Aza-CdR及联合吉西他滨对Capan-2细胞的抑制率与凋亡率.应用甲基化特异性PCR(MSP)、RT-PCR和Western blot的方法检测不同浓度5-Aza-CdR处理细胞前后PCDH8基因的甲基化状态、mRNA表达水平和蛋白表达水平.结果 5-Aza-CdR能使胰腺癌细胞Capan-2增长速度减慢,呈浓度依赖性,联合吉西他滨显著抑制细胞生长;5-Aza-CdR联合吉西他滨与单药组、对照组相比,可显著诱导细胞凋亡.不同浓度的5-Aza-CdR可逆转PCDH8基因在胰腺癌细胞Capan-2的甲基化,恢复mRNA表达水平和蛋白表达水平,并呈一定的浓度正相关.结论 5-Aza-CdR可有效逆转PCDH8基因在胰腺癌细胞株Capan-2的高甲基化状态,解除DNA高甲基化导致的基因沉默,重新诱导基因mRNA转录和蛋白表达,同时可抑制胰腺癌细胞生长,与吉西他滨有协同抗肿瘤作用.     

胃癌中p53蛋白K370位点甲基化在新辅助化疗的作用和临床意义

目的研究胃癌患者外周核细胞p53蛋白K370位点甲基化在新辅助化疗的判断的作用和临床意义。方法应用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)方法分别检测胃癌组织及外周血有核细胞p53蛋白K370位点甲基化和化疗疗效以及病理分期的相关性,并通过Pearson统计学方法分析其相关性。结果 110例胃癌患者中,K370的甲基化在胃癌组织及全血中的表达具有正相关性,K370的甲基化率随着病理分期增高而增高,胃癌外周血中p53蛋白K370甲基化表达情况与病理分期密切相关;胃癌患者经过新辅助化疗治疗后,甲基化平均敏感性阴性组为60.6%,阳性组为25.3%,甲基化阴性组的敏感性高于阳性组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论胃癌全血标本中p53蛋白K370位点甲基化状态有望作为胃癌新辅助化疗方案敏感性的依据。     

Aberrant hypomethylation of the cancer–testis antigen PRAME correlates with <Emphasis Type="Italic">PRAME</Emphasis> expression in acute myeloid leukemia

PRAME is a tumor-associated antigen, which belongs to the family of cancer-testis antigens (CTA). The expression of CTA is mainly restricted to the testis and various tumors. In contrast to other CTA, PRAME expression is also frequently detected in acute and chronic leukemias. Due to this expression pattern, PRAME has attracted great interest as a prognostic tumor marker that can be used for the detection of minimal residual disease and as a potential target for immunotherapy. In acute myeloid leukemia (AML), PRAME expression has been observed in 30-64% of cases. To evaluate whether epigenetic mechanisms contribute to PRAME activation in AML, we studied DNA methylation of 15 CpG dinucleotides within a CpG-rich region located in the intron 1 of the PRAME gene. DNA methylation was determined by sequence analysis of cloned PCR products generated from bisulfite-treated genomic DNA. Methylation patterns were correlated with PRAME mRNA levels as determined by microarray analysis and real-time PCR. We found almost complete methylation in mononuclear blood cells from two healthy donors and in bone marrow cells of four PRAME-negative AML patients. In contrast, the degree of PRAME methylation was clearly reduced in four PRAME-positive AML bone marrow samples. In particular, these samples were characterized by the presence of clones, which were completely devoid of methylation. The significant inverse correlation between the degree of methylation and PRAME expression suggests a causal role of DNA methylation in PRAME regulation. Such a role is further supported by the observation that treatment of PRAME-negative cell lines U-937 and THP-1 with the demethylating agent 5'-Aza-2'dC resulted in a dose-related upregulation of PRAME expression.