SOHLH1基因突变与原发性不孕不育的相关性

目的探讨SOHLH1基因突变与原发性不孕不育的相关性。方法运用聚合酶链反应(PCR)和基因测序等方法,对72对原发性男性不育及女性不孕患者及72名已婚育的对照男性和72名已生育的对照女性进行SOHLH1基因外显子区突变筛查及生物信息学分析。结果检索验证发现5处单核苷酸多态性(SNPs)改变和9处新发杂合突变,其中1处新发突变c.890 CA位于第7号外显子,突变的丝氨酸(Ser)位于DNA结合结构域上游,该改变可能影响其下游调控基因的转录活性,进而导致不孕不育的发生。结论 7号外显子的c.890 CA突变可能为不孕不育患者SOHLH1基因新发突变,该突变可能引起男性不育及女性不孕。     

PSMA6/PSMC6/PSMA3基因多态性与系统性红斑狼疮发病的相关性

目的:明确蛋白酶体(PSM)相关基因单核苷酸多态性与中国人群系统性红斑狼疮(SLE)的相关性。方法:PCR扩增101例SLE患者和143名正常对照者外周血目的基因片段,通过二代测序对目的基因片段进行测序检测蛋白酶体20 s亚单位和相关ATP酶基因的4个目标位点PSMA6(rs2277460),PSMA3(rs2348071),PSMC6(rs2295826,rs2295827)的基因型及等位基因频率。结果:SLE组及对照组中rs2277460(GG,GA、AA)基因型频率分别为97.22%,1.85%%,0.93%和96.5%,3.5%,0;rs2348071AA,AG,GG分别为30.56%、53.7%、15.74%和33.57%、50.35%、16.08%;rs2295826AA,AG,GG分别为75.93%、24.07%、0和69.23%、29.37%、1.4%;rs2295827CC、CT、TT分别为78.7%、19.45%、1.85%和76.22%、20.98%、2.8%,均无统计学差异(P0.05)。结论:PSMA6/PSMC6/PSMA3 SNPs可能与SLE的发病无关。     

维生素D受体基因启动子区CDX2多态性与儿童氟斑牙的关系

目的 了解维生素D受体(VDR)基因启动子区CDX2结合位点多态性与儿童氟斑牙易感性的关系.方法 Dean法检查8～12岁风台县关店乡儿童氟斑牙患病情况,收集氟斑牙患者102例及正常对照者107例,采集外周静脉血提取DNA,采用等位基因特异多重聚合酶链反应(ASM-PCR)测定两组儿童VDR基因CDX2结合位点多态性.结果 VDR基因CDX2结合位点多态性分布频率为:氟斑牙患者GG占48.0%、AG占25.5%、AA占26.5%;正常对照组GG占55.1%、AG占28.0%、AA占16.9%.两组基因型分布比较差异无统计学意义(P＞0.05).结论 VDR基因CDX2结合位点多态性与所调查儿童的氟斑牙发生无明显关系.     

单核苷酸多态性微阵列芯片技术检测Prader-Willi综合征患儿染色体微缺失

目的采用单核苷酸多态性微阵列芯片(single nucleotide polymorphism array,SNP-array)分析l例因生长发育迟缓而诊断为Prader-Willi综合征患儿的染色体微缺失,探讨其分子遗传发病机制。方法用SNP-array检测方法分析患儿及其父母的DNA拷贝数变异,并对缺失区段进行数据库比对和文献分析。结果 SNP-array检测结果示患儿父母结果未见异常。患儿的父源性15q11.2-q13.1区段23699701-28525460缺失了4.826 Mb,该缺失区段与Prader-Willi综合征相关。结论 SNP-array技术可以明确诊断Prader-Willi综合征。     

郑州市汉族女性 MTHFR 和 MTRR 基因多态性分布

目的：探讨郑州市汉族女性5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)、甲硫氨酸合成酶还原酶(MTRR)基因 多态性的频率特征。方法：以郑州市1 253例汉族女性为研究对象,检测MTHFR C677T,A1298C和MTRR A66G的基 因分型。分析基因多态性的频率特征,并与已报道的其他地区汉族女性的数据进行比较。结果：郑州市汉族女性的 MTHFR 1298CC纯合突变基因型频率(1.3%)低于湘潭(4.8%)、延边(3.8%)、镇江(3.5%)、荆州(3.2%)、昆明(2.7%)、德 阳(6.3%)、惠州(7.2%)和乌鲁木齐(3.4%)等地(均P<0.05),等位基因与烟台、延边、乌鲁木齐、镇江、荆州、昆明、德 州、湘潭、惠州等地差异有统计学意义(均P<0.05)。MTRR 66GG纯合突变基因型频率(5.4%)低于德阳(8.2%)(P<0.01), 等位基因与德阳差异有统计学意义(P<0.05)。结论：郑州市汉族女性MTHFR A1298C和MTRR A66G基因多态性频率不 同于其他地区,具有地域特异性。     

贵州地区汉族人群GDF5基因单核苷酸多态性与成人终身高的关系

目的 探讨生长分化因子5(GDF5)基因rs143383、rs143384、rs6060369和rs224331位点单核苷酸多态性(SNPs)与贵州地区汉族人群成人终身高的相关性.方法 对贵州地区1 069例汉族健康体检者进行体格检查及问卷调查,收集抗凝血标本并提取DNA.用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)方法检测GDF5基因的SNPs,并分析其与身高的相关性.结果 成年女性中,GDF5基因rs143383、rs143384、rs6060369和rs224331基因型分布可分别解释身高变异的1.4％、0.9％、1.1％和1.0％(P＜0.05);在GDF5基因rs143383和rs143384位点,携带GG基因型的个体平均身高均为最高,分别比AG和AA基因型个体高1.7 cm (P＜0.01)、2.3 cm (P＜0.05)和1.6 cm (P＜0.05)、2.1 cm(P＜0.01);在GDF5基因rs6060369位点,携带CC基因型的个体平均身高分别比CT和TT基因型个体高1.7 cm (P＜0.05)和2.2 cm (P＜0.01).但是在成年男性中未发现GDF5基因上述SNPs位点与身高的相关性.结论 GDF5基因单核苷酸多态性与贵州地区成年汉族女性身高有关,GDF5基因可能是影响中国汉族成人女性身高个体差异的基因.     

全基因组关联分析确认食管鳞癌中SLC39A6基因常见变体与生存期长短有关

本实验团队第一阶段对1 331例食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)进行全基因组单核苷酸多态性(SNP)研究发现其变体与生存期长短相关,并在第二阶段1 962例食管鳞状细胞癌患者中进行确认变体与生存期长短相关,本组发现食管鳞状细胞癌中SLC39A6基因5’端非编码区上rs1050631位点与个人生存时间相关,合     

糖皮质激素受体遗传多态性与2型糖尿病相关性研究

目的 探讨糖皮质激素受体(GR)单核苷酸多态性与2型糖尿病(T2MD)易感性及人体体型的相关性.方法 采用病例-对照研究设计,从解放军总医院健康体检中心的体检患者中,募集40例T2MD患者和127例对照.结合三种不同的SNP位点选择方法,采用上海天昊生物科技有限公司的iMLDRTM多重SNP分型技术对入选SNP位点进行基因分型.采用非条件Logistic回归,校正年龄、性别、吸烟、饮酒后,分析基因型与T2MD易感性的关系.得到的阳性位点,进一步采用协方差分析,校正年龄、性别、吸烟、饮酒后,评价其与体重指数(BMI)和腰臀比(WHR)的相关性.结果 共选取14个SNP位点,其中rs10052957突变型在病例组中频率为零,故未纳入统计分析.所有的13个SNP位点在病例和对照组中的基因分型均符合Hardy-Weinberg平衡.rs9324924 TT基因型(OR [95％CI]=3.12[1.06 ～9.17],P=0.039)和rs9324921 AA基因型(OR [95％CI]=14.92[1.39～160.60],P=0.026)发生T2DM的风险较野生型增高,且两基因型的BMI[P=0.023 (rs9324924);P=0.002(rs9324921)]、WHR[P=0.033 (rs9324924);P=0.003(rs9324921)]也较野生型明显增高.结论 在本研究中,GR基因rs9324924、rs9324921与T2DM易感性和体型有关,其中纯和突变型T2DM发病风险明显增加,且更具有肥胖倾向.     

贵州省地方性氟中毒地区人群GSTP1基因Ile105Val位点多态性分析

Objective To investigate plasma glutathione S-transferase(GSTs) activity and GSTP1 gene Ile105Val polymorphism in Bijie City, Guizhou Province, a coal-burning fluorosis endemic area. Methods One hundred and sixty villagers from Yachi Twon using non-improved cooking stoves were selected as the non-intervened group in Bijie City, Guizhou Province where coal-burning fluorosis was prevailing; 153 villagers as the intervented group were chosen from Changchun Twon, where cooking stoves were improved; 151 villagers were served as the control group from Baiyunshan Twon, Changshun County without endemic fluorosis. The activity of GSTs was tested by colorimetric analysis with spectrophotometer. The genotype of the GSTP1 gene Ile105Val polymorphism, presenting as either homozygous wild-type (AA), or heterozygous mutation type (AG), or homozygous mutation type (GG), was detected through the PCR-RFLP procedure. Results The activity of GSTs in plasma of non-intervened group [(12.44±4.97) kU/L]was significantly lower than that of intervened group (P < 0.05), and that of intervened group[(20.78±6.20)kU/L]was significantly lower than that of control group[(24.30±6.27)kU/L, P< 0.05]. The difference of the enzyme activity of three groups were statistically significant (F = 51.71, P < 0.05), but this enzyme activity did not vary significantly in each sex of each grnup(P > 0.05). Compared intervened group [AA:67.3%(103/153), AG:29.4%(45/153),GG:3.3%(5/153)]and non-intervened group[AA:66.9%(107/160), AG:30%(48/160), GG:3.1%(5/160)]with control group[AA:74.8%(113/151), AG:25.2%(38/151), GG:0 (0/151)], the Ile105Val polymorphism site of GSTP1 gene had significant difference(χ2= 6.04,6.07, both P< 0.05), but not significant between intervened and non-intervened groups(χ2 = 0.02, P>0.05). Conclusions Fluorosis can decrease the activity of GSTs and introduce the GSTP1 gene Ile105Val polymorphism, intervention with the fluorine intake will improve the effect of fluoride on the body.     

南京地区2型糖尿病患者解偶联蛋白2基因-866G/A多态性与胰岛功能相关性研究

目的研究南京地区汉族人群2型糖尿病解偶联蛋白2(UCP2)基因启动子区-866G/A多态性与胰岛功能的相关性。方法对2006年1～9月在南京大学医学院附属鼓楼医院收集的229例2型糖尿病患者以及196例正常对照者UCP2基因-866G/A位点进行基因分型,并行口服葡萄糖耐量加同步胰岛素释放试验检测胰岛B细胞分泌功能及胰岛素敏感性。结果UCP2基因-866G/A位点的基因型频率和等位基因频率在2型糖尿病与对照组中分布差异有显著性意义(分别为χ2=6.555,P=0.038;χ2=6.363,P=0.012),2型糖尿病组中A/A基因型和A等位基因频率显著高于正常对照(分别为OR=1.99,OR=1.42,均P<0.05);2型糖尿病组中G/A、A/A基因型携带者的早期相胰岛素分泌均低于G/G基因型携带者[1.55(0.77,2.40)对2.46(1.44,4.70),1.23(0.43,2.71)对2.46(1.44,4.70),均P<0.01]。结论UCP2基因启动子区-866G/A多态性与南京地区汉族人群2型糖尿病及胰岛功能存在相关性,UCP2基因可能是2型糖尿病的易患基因之一。