应用形态学及DNA条形码技术鉴别广西横县地区两种豆螺

目的 目的 应用形态与DNA条形码技术鉴别广西横县两种形态相似、 栖息生境相同的豆螺——硬豆螺 （Bithynia ro? busta） 与赤豆螺 （Bithynia fuchsiana）。方法 方法 在广西横县的河流、 沟渠和池塘等生境采集赤豆螺和硬豆螺, 观察两种豆 螺的外部形态并测量其主要参数, 比较螺的雄性生殖系统形态。此外, 应用基于COI基因的DNA条形码技术进行螺种鉴 别, 并构建系统树。结果 结果 共采获两种豆螺29个, 包括19个赤豆螺和10个硬豆螺。两种豆螺的个体外形基本一致, 其 壳高、 壳宽及形状相近, 雄性生殖系统形态相似。COI基因序列变异较小, 22条序列共有11个变异位点。经序列的整理 和剪切后, 22个个体的COI基因片段均为517 bp, 无插入、 缺失位点。基于COI基因序列构建的系统树表明两类群的个 体明显聚为一支。结论 结论 根据形态学和COI基因序列证据, 采自广西横县的赤豆螺与硬豆螺可能为同种异名。     

DNA条形码技术用于原木携带蚊种的鉴定

目的对临沂口岸进境原木上截获的蚊种进行DNA条形码研究确定蚊种。方法使用双翅目COI基因国际通用引物对原木携带蚊种COI基因进行PCR扩增和序列测定,序列在NCBI网站上进行Blast,确定蚊种。结果待测蚊种COI序列与GenBank中编号为HQ398903.1的骚扰阿蚊(Armigeres subalbatus)序列相似性为99%。结论基于COI基因的DNA条形码技术可成功地对媒介蚊类进行分类鉴定,该技术可弥补蚊虫形态缺失和形态学鉴定知识不足对蚊类鉴定的影响。     

药用昆虫金环胡蜂及其混伪品DNA条形码鉴别研究

目的：以COI序列作为DNA条形码对药用昆虫金环胡蜂及其混伪品进行物种鉴别,探讨快速、准确鉴别金环胡蜂及其混伪品的方法。方法：以COI条形码序列为基础,对金环胡蜂及其近缘种混伪品黄纹大胡蜂进行总DNA提取、PCR扩增和双向测序,并比对GenBank中金环胡蜂及其混伪品的COI序列,继而用MEGA6.06软件对所有序列进行分析、计算种内及种间遗传距离,并用邻接（Neighbor-Joining,NJ）法构建出系统进化树。结果：金环胡蜂及黄纹大胡蜂COI序列扩增成功。金环胡蜂与其混伪品COI序列种间最小遗传距离为0.152±0.017,远大于金环胡蜂种内的最大遗传距离0.009±0.004。构建出的系统进化树图也明确显示,各物种都形成了独立的分支。结论：基于COI序列的DNA条形码技术可有效鉴别药用昆虫金环胡蜂及其混伪品,为其质量控制和市场监管提供了新的技术手段,保证金环胡蜂相关药材的安全性。     

广西地区家畜牛、羊体表硬蜱情况调查及种类鉴定

目的 掌握广西地区牛羊场硬蜱种类及其分子特征,了解该地区蜱类的分类地位,为养殖户防控硬蜱及蜱媒传染病提供参考依据。方法 本实验于2019年1月至2021年11月,采用动物体表法采集寄生的蜱类;提取蜱基因组,PCR扩增3种硬蜱的线粒体16S rDNA和COI基因片段,并进行同源性分析。基于邻接法,用MEGA6.0软件分别构建系统发生树,进行遗传进化分析。结果 牛羊体表上共采集蜱2 030只,隶属1科2属3种,其中微小扇头蜱1 968只,长角血蜱49只,具角血蜱13只。PCR扩增微小扇头蜱、长角血蜱和具角血蜱16S rDNA和COI基因片段长度分别是460 bp和710 bp左右,分别与GenBank中已登录的相应种类相似较高且在一个进化分支上。结论 广西地区牛羊场优势蜱种是微小扇头蜱且存在长角血蜱和具角血蜱。三蜱种16S rDNA和COI序列存在多样性和地域差异性。     

Lysenin family proteins in earthworm coelomocytes – Comparative approach

Sphingomyelin-binding proteins of the lysenin family were originally identified in earthworms belonging to the genus Eisenia comprised of at least two distinct species, E. andrei and E. fetida, until recently considered subspecies or morphotypes of E. foetida (sic). In the present study the presence of lysenin and lysenin-related protein 2 (LRP-2, known also as fetidin) was detected in coelomocytes retrieved from all investigated adult specimens of E. andrei, and E. fetida. They were accompanied by LRP-3 and LRP-1 in some specimens of E. andrei and E. fetida, respectively. Lysenins were not observed in a third composting lumbricid species, Dendrobaena veneta, which served as a convenient negative reference for techniques and procedures used in the study. The pore-forming potential of soluble and cellular fractions of coelomic fluid was studied towards sheep red blood cells and sphingomyelin-rich liposomes. After experimental depletion the potential was restored in parallel with restoration of chloragocyte-derived eleocytes in both E. andrei and E. fetida.     

基于COI条形码序列的珍珠母及其混伪品的DNA分子鉴定△

目的:探讨应用COI条形码序列对珍珠母及其混伪品进行物种鉴定的可行性。方法:用MEGA4.0等软件计算珍珠母及其混伪品种内及种间变异,构建珍珠母及其混伪品的NJ树。结果:珍珠母种内COI序列变异小,种间存在较多的变异位点,种间的遗传距离显著大于种内的遗传距离。通过构建的系统聚类树图可以看出,珍珠母不同来源个体均聚在一起,能够与其混伪品区分开。结论:基于COI序列的DNA条形码技术可以很好的鉴定珍珠母的正品来源及其混伪品。     

The cytochrome oxidase subunit I gene of Tetrahymena: a 57 amino acid NH2-terminal extension and a 108 amino acid insert

Summary The gene sequence for cytochrome oxidase subunit I (COI) in the ciliate Tetrahymena mitochondrial DNA has been determined and shown to be coded by the same strand as codes the genes (in order) for 14S rRNA, tRNA^trp tRNA^glu 21S rRNA, tRNA^leu and tRNA^met. The predicted protein has 698 amino acids, including an NH₂-terminal 57 amino acid extension and a 108 amino acid insert originally found in Paramecium COI. These extension and insert segments are not highly hydrophobic but are relatively rich in lysine, arginine and serine. In analogy with the presequence of nuclear-encoded mitochondrial proteins, they might function as a transmembrane signal. The remaining poly-peptide segments show a hydrophobicity characteristic of membrane spanning proteins. TCOI shows a 64% amino acid identity with Paramecium COI but less than a 38% amino acid conservation with human COI. The Tetrahymena mitochondrial code is analogous with the mammalian mitochondrial code; but differs from the Tetrahymena nuclear genetic code; TGA is exclusively translated as tryptophan; ATA is used as an initiation codon probably for methionine, and TAA as a stop codon; the arginine codons (CGN) are not used. The use of the leucine codon TTA in TCOI is contradictory to the codon recognition pattern previously obtained from the isolated tRNA^leu isoacceptors recognizing only the CUN codons, but consistent with the tRNA^leu (anticodon UAA) gene encoded in the genome. The reason for this inconsistency has not been resolved.     

克隆医学昆虫蚋COI全基因的引物设计方法研究

目的 借助专有软件设计蚋科COI基因的PCR引物,并且检验所设计引物的PCR扩增效率和特异性.方法 运用Primer Premier 5.0软件设计4对蚋科COI基因的PCR扩增引物,通过PCR扩增后进行琼脂糖凝胶电泳检测实验.结果 在所设计的4对引物中只有1对PCR扩增特异性好且效率高,包含COI基因全序列.结论 设计引物时应遵循一定原则,但有一定弹性,可根据模板特点进行设计方法的改良.     

DNA条形码技术在陕西省鼠形动物鉴定中的应用

目的 探究应用DNA条形码技术进行分子生物学鉴定的可行性,弥补形态学鉴定缺陷。方法 结合鼠疫监测工作,使用样方法、5 m夹笼法、夹夜法采集鼠形动物标本,所有标本形态学初步鉴定后基于线粒体细胞色素C氧化酶I亚基基因(COI基因)进行分子鉴定,计算遗传距离,构建系统发育树。结果 获得709只鼠形动物的COI基因序列,隶属于3目10科24属38种。COI基因序列显示种内遗传距离在3.6%以内, 平均为1.4%,种间遗传距离大于5.6%, 种间遗传距离显著大于种内遗传距离,属间、科间遗传距离界限不明显,对多只鼠形动物形态学鉴定结果进行了纠正。系统发育树显示同种个体聚为高支持度的单一分支,发现索氏仓鼠和中国仓鼠2个隐存种。结论 DNA条形码技术可对鼠形动物进行有效的鉴定,但因数据库的不完善,仍需将传统的分类学鉴定方法和现代分子生物学鉴定方法结合,以保证鉴定结果的准确性。     

云南省血吸虫病流行区一种拟钉螺及其寄生吸虫尾蚴的分子鉴定

目的对云南省血吸虫病流行区的一种拟钉螺及其寄生吸虫进行分子生物学鉴定,了解其种属分类地位。方法采集云南省祥云县拟钉螺和钉螺,压碎镜检采集螺软体腹足部组织,并观察其体内尾拗寄生情况。采用逸拗法采集拟钉螺寄生的不同形态尾拗,螺体组织和尾拗样本分别提取基因组DNA,采用PCR法扩增螺体内16S核糖体RNA(16S rRNA)、细胞色素c氧化酶I(COI)、28S核糖体DNA(28S rDNA)基因及其体内寄生吸虫尾拗的NADH脱氢酶亚基1(ND1)、28S rfNA基因,对扩增产物进行测序,并通过序列比对及系统进化分析鉴定样本螺和寄生吸虫种属。结果共检测拟钉螺样本382只,发现无叉形、双叉形、燕子形等3种形态吸虫尾拗,阳性率分别为20.94%(80/382)、3.40%(13/382)、7.07%(27/382)。基于16S rRNA、COI、28S rDNA基因的分子进化分析显示,该拟钉螺与滇池德拉维螺(Delavaya dianchiensis)同源性较高、聚在同一个分支。基于ND1、28S rDNA4基因的序列分析显示,无叉形尾拗吸虫属侧殖吸虫科,燕子形尾拗吸虫属孔肠科,双叉形尾拗吸虫可能为不同于中华血吸虫(Schistosoma sinensium)和勾形卵血吸虫(Schistosoma ovuncatum)的另一种血吸虫。结论初步了解了云南省血吸虫病流行区拟钉螺及其寄生吸虫种属分类,但更明确的分类关系和危害性等尚有待深入研究。