徐州地区乙型肝炎病毒基因型分布及其意义

选择我院门诊和住院病例HBVDNA阳性者共15 0例,其中无症状携带者、急性乙型肝炎、慢性乙型肝炎、肝炎后肝硬化和肝癌各30例。其诊断均符合2 0 0 0年第十次全国传染病与寄生虫病学会和肝病学分会联合修订的病毒型肝炎防治方案。15 0例采取静脉血,分离血清, 2 0℃保存。HBVDNA定量检查用RocheLightcycler荧光定量扩增仪,试剂由深圳匹基公司提供,以10 4 copy ml为阳性;HBV M用上海荣盛公司ELISA试剂;ALT的检验用英国朗道试剂。HBV基因分型方法采用微板核酸杂交ELISA技术,由广州蓝星公司提供,其所用引物为:prime 1:3′CCCTTCTT…     

Association of KIR Genotypes and Haplotypes with Susceptibility to Chronic Hepatitis B Virus Infection in Chinese Han Population

Killer immunoglobulin-like receptor （KIR） genes can regulate the activation of NK and T cells upon interaction with HLA class I molecules. Hepatitis B virus （HBV） infection has been regarded as a multi-factorial disorder disease. Previous studies revealed that KIRs were involved in HCV and HIV infection or clearance. The aim of this study was to explore the possibility of the inheritance of KIR genotypes and haplotypes as a candidate for susceptibility to persistent HBV infection or HBV clearance. The sequence specific primer polymerase chain reaction （SSP-PCR） was employed to identify the KIR genes and pseudogenes in 150 chronic hepatitis B （CHB） patients, 251 spontaneously recovered （SR） controls, and 412 healthy controls. The frequencies of genotype G7 M, FZ1 increased in CHB patients compared with healthy control subjects. The frequency of genotype AH was higher in SR controls than that in both CHB patients and healthy controls. The carriage frequencies of genotype G and AH were higher; while, the frequencies of AF and AJ were lower in SR controls than those in healthy control subjects. The frequency of A haplotype was lower, whereas, the frequency of B haplotype was higher in CHB patients and SR controls than those in healthy controls. In healthy controls, haplotype 4 was found lower compared with that in CHB patients and SR controls and the frequency of haplotype 5 was higher in SR controls than that in other two groups. Based on these findings, it seems that the genotypes M and FZ1 are HBV susceptive genotypes; AH, on the other hand, may be protective genotypes that facilitate the clearance of HBV. It appears that the haplotype 4 is HBV susceptive haplotype, whereas, haplotype 5 may be the protective haplotype that facilitates the clearance of HBV. Cellular ＆ Molecular Immunology. 2008;5（6）：457-463.     

表观遗传学的形成和发展

表观遗传学(epigenetics)是研究生物表观遗传变异(epigenetic variation)现象的一门遗传学分支学科。1概念表观遗传学是沃丁顿(Waddingtong)于1942年在Endeavour杂志上第1次提出的。他在研究生物体的基因型与表型之间的关系时指出,基因型的遗传(heredity)或传承(inheritance)是遗传学研究的主旨,而基因型产生表型的过程则属于表现遗传学研究的范畴。在当时,许多生物学家认为,细胞的分化是由于基因组的组成发生了改变。例如,参与生成肾细胞或肌肉细胞的那些基因中丢失了一部分非必需的基因,于是分化生成了肝细胞;也就是说,细胞表型的改变是…     

中国湖北地区汉族人群L-选择素基因P213S多态性研究

目的:了解中国湖北地区汉族人群L-选择素基因第六外显子P213S多态性分布,并与其它地区的分布进行比较。方法:应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术,检测206名健康者L-选择素基因P213S多态性基因型和等位基因频率分布。结果:L-选择素各基因型频率分别为PP型(45.63%)、PS型(49.03%)和SS型(5.34%)。P、S等位基因频率分别为70.15%和29.85%,这种基因多态性分布无性别差异(P>0.05)。湖北地区汉族人群L-选择素基因型和等位基因频率分布与英国及日本人有显著性差异(P<0.05)。结论:湖北地区汉族人群中存在L-选择素基因多态性,与其它地区分布比较有明显的差异。     

我国HIV-1 B''亚型毒株gag基因变异特征研究

目的研究我国人免疫缺陷病毒1型（HIV-1）B’亚型主要流行株在宿主免疫压力下的基因变异及抗原表位的变化特征，探讨选择压力、基因离散率和抗原表位变化之间的关系。方法从确诊的HIV-1感染者的全血样本中提取基因组DNA，经套式聚合酶链反应（PCR）扩增后，将扩增产物进行纯化和测序。然后将所得序列进行系统进化树和氨基酸变异分析，使用GCG软件包的Distance程序对P17和P24两个区段计算基因距离，用Diverge程序计算同义替换（1（s）和非同义替换（1（a）及二者之间的比值，并对我国人群中较常见的HLA型别限制的CTL表位的突变情况进行分析。结果HIV-1B’亚型毒株的P17区段的Ks／Ka值〈1，而P24区段的Ks／Ka值〉1；P24部分的基因离散率低于P17部分；P17区段抗原表位的保守率为34．94％，而P24区段抗原表位的保守率为67．38％；从基因离散率、所受的选择压力及抗原表位的突变率3个方面来看，HIV-1的P17区段均明显大于P24区段。结论HIV-1B’亚型毒株的P17区段的抗原表位变化较大，而P24区段的抗原表位相对较为保守。提示P24区段的CTL表位更适合于表位疫苗的研制。     

华南地区质粒介导超广谱β-内酰胺酶的基因分型研究

目的：了解华南地区质粒介导超广谱β－内酰胺酶（ESBLs）的发生率及基因型特征。方法：收集2001年4月－9月革兰阴性菌临床分离无重复株共1184株，采用NCCLS表型筛选和确认试验进行了ESBLs产酶的识别，E-test法检测各亚型ESBLs的MICs值，质粒接合及电转化实验，耐药质粒提取及酶切指纹分析，等电聚焦电泳，PCR通用引物扩增TEM、SHV、CTX－M、VEB、PER、SFO基因及其克隆测序进行ESBLs基因分型和质粒定位。结果：革兰阴性苗ESBLs的检出率为14．6％（173／1184）；获得产ESBLs接合子67株，电转化子11株，其中产CTX－M－14型ESBLs为33．3％（26／78）、CTX－M－3为23．1％（18／78）、CTX－M－9为14．1％（11／78）及SHV-2a为2．6％（2／78），未定型为5．1％（4／78）；29．5％（23／78）野生株伴广谱酶TEM－1或SHV－1型；各型ESBLs基因约定位在35－190kb大小的可接合性低执行者拷贝数天然质粒上；CTX－M型ESBLs以对头孢噻肟高水平高耐为特征。结论：华南地区质粒介导的ESBLs以CTX－M型衍生酶为主，其次是SHV型酶。     

丙型肝炎病毒基因分型及其与疾病程度、感染途径和干扰素疗效的关系

为探讨广州地区丙型肝炎病毒（ＨＣＶ）感染的基因型及其与疾病程度、感染途径和干扰素疗效的关系，作者应用分型ＰＣＲ技术对１５６例抗－ＨＣＶ阳性患者血清ＨＣＶＲＮＡ进行分型检测，并分析不同程度肝病及不同感染途径ＨＣＶ基因型分布，且对５１例经干扰素治疗的慢性丙肝作分型评价。结果１２４例ＨＣＶＲＮＡ阳性中，Ⅱ型占９０．３％（１１２例），Ⅲ型占８．１％（１０例），Ⅱ／Ⅲ型混合感染占１．６％（２例），未检出Ⅰ、Ⅳ型，说明广州地区ＨＣＶ感染以Ⅱ型为主；不同程度肝病及不同感染途径之间ＨＣＶ基因型构成比无明显差异，表明基因型与疾病严重程度及感染途径关系不大；干扰素治疗病例，ＨＣＶ－Ⅱ、Ⅲ型感染的总应答数、完全应答数及部分应答数分别为１８／４１，１１／４１，７／４１和８／１０，６／１０，２／１０，提示Ⅲ型感染疗效较好，ＨＣＶ基因型似可作为选择干扰素治疗病例及判断疗效的参考指标，但是由于观察的Ⅲ型病例数较少，需积累更多的资料才能作出更客观的结论。     

儿童呼吸道腺病毒基因分型方法的建立及其应用

目的 利用PCR技术,建立引起儿童呼吸道感染的腺病毒的基因分型方法,便于推广和应用.方法 分析GenBank中不同型别腺病毒的六邻体基因序列特点,设计不同型腺病毒的特异性引物,以PCR方法进行基因分型,建立基因分型方法,并利用此方法对广州市2004年7月某幼儿园流行的腺病毒感染进行了基因分型.结果 建立了呼吸道腺病毒的基因分型方法.广州市2004年7月某幼儿园流行的腺病毒为3型腺病毒.结论 PCR方法可进行腺病毒的基因分型,且简便、结果可靠,便于推广应用.     

应用PCR—SSCP方法区分HLA DNA纯合基因型与杂合空…

在ＰＣＲ／ＳＳＯ分型的基础上，用一对ＰＣＲ引物扩增ＤＰＢ１基因后作ＳＳＣＰ分析，发现该方法能够确定那些用ＰＣＲ／ＳＳＯ方法只检出一个等位基因的样本为纯合基因或是含一个空白基因的杂合子，９个月用ＰＣＲ／ＳＳＯ方法只检出一个ＤＰＢ１等位基因的湖南汉族人样本中，用ＰＣＲ／ＳＳＣＰ方法发现１个样本表现为杂合子。     

耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的SCCmec基因型及耐药谱研究

耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（methicillin-resistant Staphylococcus aureus ，MRSA）常引起医院感染的暴发流行。MRSA由于获得了外源性甲氧西林耐药决定子A（methicillin resistance determinant A，mecA），该基因编码青霉素结合蛋白2a，造成对所有β内酰胺类药物耐药。mec基因存在于葡萄球菌盒式染色体（Staphylococcal cassene chromosome mec，SCCmec）中，SCCmec是一种新型的可移动元件，不同于噬菌体和转座子，而且该元件还携带除mecA基因外的其他抗生素耐药基因，造成多重耐药。