κ阿片受体分子模拟及其与非肽类κ阿片激动剂的作用

目的：研究了κ阿片受体及其与非肽类激动剂的作用机制。方法;以细菌视紫红质为模板,模建κ阿片受体七个跨膜区的三维结构,将五个高活性非肽类激动剂对接以螺旋区内,研究作用机制。结果：（１）四氢吡咯环氮原子与Ａｓｐ１３８羧基成氢键;（２）乙酰胺羰基氧与受体Ｓｅｒ１８７间存在在氢键作用;（３）与乙酰胺相连的疏水基团处于由Ｖａｌ２３９,Ｖａｌ１２３６,Ｐｈｅ２３５,Ｖａｌ２３２,Ｌｅｕ１８６和Ｔｒｐ１８３构成     

屠呦呦教授获得诺奖的启示和中西医结合的发展

正自从2015年10月5日听到屠呦呦教授荣获诺贝尔奖的喜讯后,关于青蒿素类抗疟新药的研究有很多报道和会议介绍,但不少朋友还是觉得了解不够深入。我想利用此机会通过回顾这个过程,从中获得的一些重要启示。屠呦呦教授荣获诺奖,是我国在自然科学领域获得诺贝尔奖的一次突破,我们大家都倍感兴奋。李克强总理在贺信中指出:"屠呦呦获得诺贝尔生理学或医学奖,是中国科技繁荣进步的体现,是中医药对人类     

δ阿片受体与异硫氰基3-甲基芬太尼相互作用的分子模拟(英文)

目的:构建δ阿片受体(δOR)结构模型并研究它与异硫氰基3-甲基芬太尼(SuperFIT)的相互作用.方法:以细菌视紫红质为模板,模拟δOR的结构,并将SuperFIT对接于其内.结果:得到δOR-(3R,4S)-SuperFIT作用模型;其中,重要结合位点可能是Asp128,Ser106,Phe104,Tyr308及Pro315.Asp128与配基哌啶环上质子化氮原子形成强的静电和氢键相互作用;Ser106与配基异硫氰基N原子形成静电作用;Phe104,Tyr308及Pro315与异硫氰基S原子形成疏水作用.结论:Phe104,Tyr308,Pro315及Ser106对配基的δ选择性极重要,这将有利于设计新的δ选择性配基.     

Molecular modeling of voltage-gated potassium channel pore

目的：建立和验证电压门控型钾通道的结构模型．方法：（１）从实验和理论研究结果中提取结构约束条件；（２）建立满足这些约束条件的初始结构模型，并进一步用限制性分子力学优化；（３）根据模型能否成功地解释通道功能分子机制和许多实验事实来判断其合理性．结果：（１）建立了一个孔区模型，其中信号序列残基（对应Ｓｈａｋｅｒ４３９－４４６）以非周期性构象嵌入膜中并形成孔区比较窄的部分，而孔区域的其它残基构成孔区外口；（２）通道离子选择性在４４５，４４７位置处分别通过阳离子π轨道作用机理和氧笼机理来实现；（３）ＣＴＸ和ＡｇＴｘ２与孔区的不同结合方式导致了它们通道亲和力的差异；（４）孔区内侧静电势主要为负．结论：构建的模型与从实验结果导出的限制信息是相一致的．     

Interaction models of 3-methylfentanyl derivatives with μ opioid receptors

研究３-甲基芬太尼衍生物与μ阿片受体的作用模型．方法：经过系统构象搜寻，用比较分子力场分析法（ＣｏＭＦＡ）研究三维定量构效关系．结果：①６种ＣｏＭＦＡ模型具有良好的预测活性，且每种模型均对应于１３个被研究化合物的低能构象；②μ药效基团的几何参数ｄ１（），ｄ２（），ｄ３（），ｄ４（），ｄ５（）和ｄ６（）分别为模型Ａ：５２，５４，４９，１０．６，１０２和５８；模型Ｂ：５２，６５，３６，１０６，１１６和５８；模型Ｃ：５２，４６，４９，１１６，９２和６５；模型Ｄ：５２，５４，４９，１０５，１０３和５８；模型Ｅ：３６，５４，４９，５７，７５和５７；模型Ｆ：５２，４７，４９，１１２，９５和６４．结论：可能存在几种活性构象与μ受体相互作用，并且不一定是最低能量构象．     

奇情异想的绅士堂吉诃德

陀思妥耶夫斯基在评论塞万提斯的《堂吉诃德》时这样说：“到了地球的尽头问人们：‘你们可明白了你们在地球上的生活？你们该怎样总结这一生活呢？’那时,人们便可以默默地把《堂吉诃德》递过去,说：‘这就是我给生活做的总结。你们难道能因为这个而责备我吗？’”     

抗支原体喹诺酮的合成及其构效关系

目的：开发新型抗支原体药物。方法与结果：设计合成了一系列新型左旋氧氟沙星类似物(18～24)，测试其体外抗支原体活性(MIC值)，并讨论了他们的构效关系。结论：所合成的化合物有较好的抗支原体活性。哌嗪环或高哌嗪环4位氮原子有吸电子基团时，可能有利于提高喹诺酮的抗支原体活性。     

1－环丙基－5－取代－7－（4－甲基哌嗪基）－6，8－二氟－1，4－二氢－4－氧－3－喹啉羧酸定量构效关系的比较分子力场分析（CoMFA）研究

利用３Ｄ－ＱＳＡＲ中的ＣｏＭＦＡ方法研究了１－环丙基－５－取代－７－（４－甲基哌嗪基）－６，８－二氟－１，４－二氢－４－氧－３－喹啉羧酸定量构效关系。研究表明，从ＰＬＳ分析的ｒｃｖ，ｒ值看，模型有效强的预测能力；从立体与静电作用分数比可看出，５位取代基对活性的影响立体效应起主要作用，但静电效应亦十分重要。依据ＣｏＭＦＡ系数图设计了一些新化合物，预测结果表明，以５位氨基对抑制革兰氏阳性、阴性菌的活性为最高，与近几年实验研究的结果一致．     

Relationship between structure and anti-oxidation of tocopherol with molecular orbit theory

目的：探索不同分子结构的生育酚和一些酚类化合物所具抗氧化作用的构效关系．方法：采用分子力学和量子化学从头计算方法，研究分析不同分子的电子结构与抗氧化活性关系．结果：生育酚的抗氧化活性与易释放活泼氢有关，活性大小与ＯＨ间电子集居数、前线轨道能级及反应终态能量下降值有关，各种生育酚模型分子的羟基ＯＨ间电子集居数排列顺序α＜γ≤β＜δ，与文献报道抗氧化活性的结论相一致．结论：应用分子轨道理论和量子化学指数可以帮助分析具有不同结构的酚类化合物的抗氧化活性