黏病毒抗性蛋白A基因启动子区单核苷酸多态性与慢性丙型病毒性肝炎患者干扰素治疗反应的关系

目的探讨α-干扰素(IFN-α)诱导黏病毒抗性蛋白A(MxA)基因启动子区-88(G/T)及-123(C/A)位点的单核苷酸多态性(SNP)与慢性丙型病毒性肝炎患者干扰素治疗效果间的关系。方法应用聚合酶链反应(PCR)及限制性片段长度多态性(RFLP)方法检测123例慢性丙型肝炎患者和188名健康人群的MxA基因启动子-88(G/T)及-123(C/A)位点的基因型,并探讨了慢性丙型肝炎患者-88(G/T)及-123(C/A)位点的SNP与干扰素抗病毒治疗反应之间的关系。结果MxA基因启动子区-88/-123位点各基因型在慢性丙型肝炎患者组与健康对照组中的分布频率差异无统计学意义;MxA基因启动子区-88位点为GT基因型的慢性丙型肝炎患者经干扰素治疗后获得持续病毒学应答(SVR)率显著高于GG基因型患者(P=0.009);而MxA基因启动子区-123位点各基因型对慢性丙型肝炎患者的IFN治疗反应无显著影响(P=0.096)。结论MxA基因启动子区-88GT基因型的患者对IFN治疗反应性好于GG基因型,因此,MxA-88位点的基因型可作为预测慢性丙型肝炎患者IFN疗效的参考指标之一。而MxA-123位点基因型与慢性丙型肝炎患者IFN疗效无相关性。     

EGFR-216 G/T基因多态性与厄洛替尼治疗晚期非小细胞肺癌患者临床疗效的关系

目的:探索表皮生长因子受体(EGFR)-216 G/T基因多态性与厄洛替尼治疗晚期非小细胞肺癌(NSCLC)临床疗效间的关系。方法:利用Sequenom MassArrayiPLEX GOLD系统对135例晚期NSCLC患者外周血EGFR基因启动子-216 G/T(rs712829)基因多态性进行检测。分析EGFR-216G/T位点的基因多态性与客观缓解率(RR)、疾病控制率(DCR)和无进展生存时间(PFS)的关系。结果:EGFR-216G/T基因频率为GG 81.5%(112/135),GT 11.9%(16/135),TT 6.6%(9/135)。EGFR-216G/T GG和GT+TT基因型RR之间差异有统计学意义(18.2%vs.48.0%,P=0.002);EGFR-216G/T GG和GT+TT基因型DCR之间差异有统计学意义(53.6%vs.76.0%,P=0.042);GG和GT+TT基因型之间中位PFS差异有统计学意义(3.95个月vs.6.80个月,P=0.038)。结论:EGFR-216G/T多态性与厄洛替尼治疗晚期NSCLC患者的疗效有相关性。EGFR-216G/T多态性可用于预测厄洛替尼治疗NSCLC患者的疗效。     

ABCB1基因多态性对卡马西平血药浓度的影响

目的:探讨ABCB1基因多态性对卡马西平血药浓度的影响。方法:采用荧光偏振免疫法(FPIA)测定275例口服卡马西平癫痫患者的血药浓度,聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性方法(PCR-RFLP)或直接测序法检测ABCB1多态性位点C1236T、G2677T/A和C3435T的基因型。单因素方差分析计算各SNP位点不同基因型对应的卡马西平血药浓度是否有差异。结果:G2677T/A不同基因型对应的调整后血药浓度均值之间差别有显著性,TT基因型对应的调整后血药浓度显著高于GG型(P=0.001)。C1236T、C3435T各基因型对应的调整后血药浓度均值差别无统计学意义(P>0.05)。结论:ABCB1基因SNP位点G2677T/A的基因多态性对口服卡马西平癫痫患者的血药浓度有影响,提示TT基因型的患者可适当减少药物使用剂量。     

ecNOS基因多态性与2型糖尿病心血管危险因素集簇的关系

目的：探讨内皮固有型一氧化氮合酶（ecNOS）基因G894T多态性与天津市汉族成年2型糖尿病（T2DM）患者心血管危险因素集簇的关联性。方法：随机抽取无心血管病并发症且无血缘关系的天津市汉族成年T2DM患者80例，静脉血提取基因组DNA，用聚合酶链反应-限制片段长度多态性（PCR—RFLP）法检测ecNOS基因G894T多态性。结果：（1）ecNOS基因第7外显子894位点基因型分布为GG基因型63例（78．75％）、GT基因型17例（21．25％）和TT基因型0例；（2）GG与GT基因型患者的各项临床及实验室指标差异均无统计学意义。（3）随着T2DM患者存在心血管危险因素的增多，GT基因型患者的比例逐渐升高，差别具有统计学意义（x^2=7．544，P〈0．05）。结论：ecNOS基因G894T多态性与T2DM患者心血管危险因素的集簇存在关联性．     

HLA-DP基因多态性与HCV患者抗病毒治疗免疫应答的相关性分析

目的:研究HLA-DP基因多态性与丙型肝炎病毒(HCV)患者抗病毒治疗免疫应答的相关性。方法:选取2013年5月-2017年8月于我院就诊的HCV汉族患者106例,所有患者均接受为期48周的聚乙二醇化干扰素α(PEG IFNα)+利巴韦林(RBV)联合治疗,并于停药后接受为期24周的随访。记录其年龄、体质量、HCV-RNA基线水平等一般资料,并采用Taqman-MGB荧光探针实时定量聚合酶链反应法检测其HLA-DP基因rs3077、rs2395309位点的分型。根据治疗结局将患者分为持续病毒学应答组(SVR)和未持续病毒学应答组(N-SVR),采用Logistic回归模型对影响HCV患者抗病毒治疗免疫应答的相关因素(性别、年龄、体质量指数、HCV-RNA基线水平以及基因多态性)进行单因素和多因素分析。结果:106例患者中,rs3077位点CC、CT、TT型频率分别为40.6%、35.8%、23.6%,rs2395309位点GG、GA、AA型频率分别为50.0%、39.6%、10.4%,均符合Hardy-Weinberg遗传平衡(P>0.05)。SVR组患者80例,N-SVR组患者26例;SVR组患者的年龄、rs3077位点CT、TT型以及rs2395309位点GA、AA型比例均显著低于N-SVR组,rs3077位点CC型以及rs2395309位点GG型比例均显著高于N-SVR组(P<0.05);而两组患者的性别、体质量指数、HCV-RNA基线水平比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。单因素、多因素分析结果显示,患者性别,体质量指数,HCV-RNA基线水平,rs3077位点CC型、rs2395309位点GG型与其抗病毒治疗免疫应答不显著相关(P>0.05),而年龄、rs3077位点CT和TT型、rs2395309位点GA和AA型与其抗病毒治疗免疫应答显著相关[比值比(OR)分别为1.135、1.766、1.283、1.218、1.103,95%置信区间(CI)分别为(1.017,1.267)、(1.007,3.100)、(1.038,1.585)、(1.011,1.467)、(1.038,1.172),P<0.05]。结论:年龄以及HLA-DP基因rs3077、rs2395309位点多态性与HCV汉族患者PEG IFNα+RBV抗病毒治疗免疫应答相关,其中低龄患者可能获得较高的抗病毒免疫应答率,而T、A突变等位基因携带者则可能获得更低的抗病毒免疫应答率。     

CYP1B1 SNP rs1056827,rs1056836基因多态性与乳腺癌关联研究

目的：研究CYP1B1 SNP rs1056827,rs1056836基因多态性与乳腺癌的关联.方法：应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）检测CYP1B1 SNP rs1056827,rs1056836基因多态性,比较乳腺癌患者组与健康志愿者对照组CYP1B1 SNP rs1056827,rs1056836基因型的分布频率差异及等位基因频率差异.结果：120例乳腺癌患者组和127例健康志愿者对照组CYP1B1 SNP rs1056827基因型分布频率野生型GG为48.33/65.35％,杂合型GT为40.83/29.13％,突变型TT为10.83/5.51％,两组比较x2为7.71,0.01＜ P＜0.05,等位基因频率野生型G为68.75/79.92％,突变型T为31.25/20.08％,两组比较x2为8.11,P＜0.01;CYP1B1SNP rs1056836基因型分布频率野生型CC为49.17/66.93％,杂合型CG为37.50/26.77％,突变型GG为13.33/6.29％,两组比较x2为8.70,0.01＜P＜0.05,等位基因频率野生型C为67.92/80.31％,突变型G为32.08/19.68％,二组比较x2为8.73,P＜0.01.结论：乳腺癌患者组与健康志愿者对照组CYP1B1 SNP rs1056827,rs1056836基因型分布频率和等位基因频率差异有显著性,提示乳腺癌的发生可能与CYP1B1 SNP rs1056827,rs1056836基因多态性具有某种关联.     

UGT2B7 C802T和G211T基因多态性对癫痫患者丙戊酸代谢的影响

目的:检测尿苷二磷酸葡糖醛酰转移酶UGT2B7 C802T和G211T等位基因在癫痫患者中的分布和突变频率,探讨UGT2B7 C802T和G211T基因型对癫痫患者丙戊酸代谢的影响。方法:直接化学发光法测定丙戊酸血药浓度,PCR-RFLP技术检测UGT2B7 C802T和G211T基因多态性,PCR扩增产物直接测序验证基因型检测方法的可靠性。结果:102例癫痫患者中UGT2B7 C802T位点野生型CC14例,杂合突变型和纯合突变型CT、TT分别为46例和42例;UGT2B7 G211T位点的野生型GG78例,突变型GT、TT分别为23例和1例;位点802CC野生基因型患者服用单位剂量(mg·kg^-1)后的血药浓度为(3.02±1.32) μg·kg·ml^-1·mg^-1,CT基因型患者为(2.11±1.26) μg·kg·ml^-1·mg^-1,TT基因型患者为(2.31±1.25) μg·kg·ml^-1·mg^-1,CT、TT患者血药浓度较CC患者明显偏低,差异有统计学意义。位点211GG基因型患者服用单位剂量(mg·kg^-1)引起的血药浓度为(2.28±1.32) μg·kg·ml^-1·mg^-1,GT基因型患者为(2.30±1.38) μg·kg·ml^-1·mg^-1,GG型与GT型患者间无统计学差异。结论:UGT2B7 C802T基因多态性与丙戊酸的血药浓度有显著相关性,UGT2B7 G211T位点基因多态性与丙戊酸的血药浓度无显著相关性。临床上个体血药浓度的差异可能与UGT2B7 C802T基因多态性有关。     

白细胞介素-28B基因多态性与慢性丙型肝炎治疗应答的关系

目的 探讨IL-28B基因多态性对慢性丙型肝炎干扰素治疗应答的影响.方法 85例慢性丙型肝炎患者接受PEG-IFNa-2a联合利巴韦林抗病毒治疗48周,治疗结束后,随访24周.采用PCR产物直接测序法对85例患者的IL-28Brs12979860进行测序分型,分析rs12979860基因多态性与慢性HCV感染者PEG-IFNa-2a联合利巴韦林抗病毒疗效间的关系.结果 85例患者中IL-28B rs12979860位点CC型70例,CT型15例,未发现TT型;SVR获得率77.6％,rs12979860位点CC、CT两类基因型在SVR组及NSVR组中的分布差异具有统计学意义(x2=6.204,P=0.013);C、T等位基因在两组中分布差异亦具有统计学意义(x2 =5.603,P=0.018).结论 IL-28B rs12979860位点基因多态性对预测慢性丙型肝炎患者接受PEG-IFNa-2a联合利巴韦林抗病毒治疗的疗效具有一定的指导意义.     

凉山州某县HIV合并HCV感染者HCV基因型及临床特征分析

目的 分析凉山州某县HIV合并HCV感染者HCV基因型及临床特征。方法 采用回顾性研究,收集并分析2021年04月至2021年12月在四川凉山州越西县抗病毒治疗中心随访的55例HIV合并HCV感染者的基本信息、HCV基因型、HCV RNA定量结果和肝功能结果。结果 55例感染者中,以男性感染者为主(70.91%);年龄主要分布在21～40岁(70.91%);感染途径以静脉吸毒传播为主(61.82%)。55例感染者中,32例完成了HCV基因分型,共发现3种基因型—1型(包括1b型)、3型和6型,其中以3型为主。HCV各基因型在不同性别、年龄及感染途径中的分布差异均无统计学意义(P=0.350; P=0.893; P=0.765)。55例感染者中,HCV基因6型感染者的HCV RNA定量结果高于其他组的感染者,但各组间差异均无统计学意义(P=0.111)。肝功能结果在各组间的差异均无统计学意义(P=0.165; P=0.321; P=0.905; P=0.104)。结论 凉山州某县HIV合并HCV感染者中HCV基因型以3型相对较多,不同基因型的HCV RNA定量结果和肝功能结果无明显差异。     

miR-137 基因 rs1625579 位点多态性与精神分裂症患者 认知功能的关联性研究

摘要： 目的 探讨微小 RNA-137 （miR-137） 单核苷酸多态性 （SNP） 位点 rs1625579 多态性与精神分裂症患者认 知功能的相关性。方法 选取 250 例精神分裂症患者, 采用阳性和阴性症状量表（PANSS）评估精神分裂症患者症 状, 简明精神分裂症认知评估测验量表 （BACS） 评估精神分裂症患者的认知功能。并收集患者外周血液, 采用 SNaP⁃ shot 技术对 rs1625579 位点进行基因分型。比较该位点不同基因型的症状及认知功能差异。结果 TT、 GT、 GG 基 因型分别为 221 例 （88.4%）、 28 例 （11.2%）、 1 例 （0.4%）。TT 基因型和 G 等位基因 （GG+GT） 携带者 PANSS 评分差异 无统计学意义。BACS 测验结果显示, 除数字序列测验 TT 基因型患者得分低于 G 等位基因 （GG+GT） 携带者外 （P < 0.05）, 语义流畅性测验、 字词流畅性测验、 言语记忆测验、 代币运动、 伦敦塔测验、 符号编码测验得分 TT 基因型与 G 等位基因（GG+GT）携带者间差异均无统计学意义。结论 miR-137 基因 rs1625579 位点多态性可能与中国汉族人 群精神分裂症工作记忆能力有关.     

广西地区汉族2型糖尿病患者脂联素基因多态性研究

目的：研究脂联素基因外显子2单核苷酸多态性（SNP）＋45T→G多态性与广西地区汉族2型糖尿病（T2DM）、肥胖及胰岛素抵抗（ IR）的关系。方法：运用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（ PCR-RFLP）的方法,对313例无亲缘关系的广西地区汉族人群的正常糖耐量（NGT95例）、糖耐量减低（IGT103例）和T2DM115例检测脂联素基因外显子2的多态性,并与代谢值进行相关性研究。结果：广西地区汉族人群中含脂联素基因外显子2的SNP＋45GG基因型的人群高密度脂蛋白（ HDL-C）水平低于TT、TG基因型的人群（P〈0.05）,HOMA-IR高组的GG基因型相对于TT基因型的OR为2.876（95%CI：1.141~7.248）,即GG基因型发生IR的相对危险度是TT基因型的2.876倍。结论：汉族人群中,脂联素基因SNPs＋45 TT基因型的HDL-C较GG基因型频率高;GG基因型较TT基因型人群易产生IR。但汉族人群SNPs＋45基因型与T2DM及肥胖无关。     

广东地区丙型肝炎患者HCV基因亚型分析

目的 了解广东地区丙型肝炎患者HCV的基因亚型分布特征,为丙型肝炎的治疗与预防提供依据.方法 采用巢式逆转录-聚合酶链反应扩增广东省194例丙型肝炎患者HCVNS5B基因区域,特异性PCR产物测序后通过美国洛斯拉莫斯国家实验室HCV数据库的Blast程序进行HCV基因亚型分析.结果 194例丙型肝炎患者中有99例为单纯HCV感染者、95例为HIV/HCV共感染者.丙型肝炎患者HCV共有8种基因亚型,其中1b亚型占42.3％(82/194)、6a亚型占35.0％(68/194)、3a亚型占11.9％(23/194)、3b亚型占6.7％(13/194)、2a亚型占2.6％(5/194)、1a亚型占0.5％(1/194)、4a亚型与0.5％(1/194)、5a亚型占0.5％(1/194).丙型肝炎患者中的单纯HCV感染者HCV有7种基因亚型,以1b亚型为主,占67.7％(67/99);丙型肝炎患者中的HIV/HCV共感染者HCV有5种基因亚型,以6a亚型为主,占53.7％(51/95).结论 广东地区丙型肝炎患者HCV基因亚型呈现多样性,主要基因亚型为1b亚型和6a亚型;丙型肝炎患者中的单纯HCV感染者与HIV/HCV共感染者HCV主要基因亚型不同.     

Pharmacokinetics of efavirenz when co-administered with rifampin in TB/HIV co-infected patients: pharmacogenetic effect of CYP2B6 variation

The goal of this study was to determine the effect of CYP2B6 genetic variation on the steady-state pharmacokinetics of efavirenz (600 mg/d) in TB/HIV co-infected patients receiving concomitant rifampin, a potent CYP inducer. In the 26 patients studied, CYP2B6 c.516GG, GT, and TT genotype frequencies were 0.27, 0.50, and 0.23, respectively. Mean plasma efavirenz area under the curve was significantly higher in patients with CYP2B6 c.516TT than in those with GT (107 vs 27.6 microg x h/mL, P< .0001) or GG genotype (107 vs 23.0 microg x h/mL, P< .0001). Apparent oral clearance (CL/F) was significantly lower in patients with CYP2B6 c.516TT than in those with GT genotype (2.1 vs 8.4 mL/min/kg, P<0.0001) and GG genotype (2.1 vs 9.9 mL/min/kg, P< .0001). No differences in efavirenz exposure or CL/F existed between patients with CYP2B6 c.516GT and GG genotypes. Our results indicate that CYP2B6 c.516TT genotype can be used to identify efavirenz poor metabolizers in patients co-treated with rifampin.     

Effect of ABCB1 (MDR1) haplotypes derived from G2677T/C3435T on the pharmacokinetics of amlodipine in healthy subjects

AIM: We aimed to investigate the effect of the ABCB1 gene on the pharmacokinetics of amlodipine. METHODS: Based on polymorphisms of the ABCB1 gene at positions 2677 and 3435, 26 healthy male participants were divided into three groups: subjects with 2677GG/3435CC (n = 9), 2677GT/3435CT (n = 9) and 2677TT/3435TT (n = 8). After a single-dose administration of 5 mg amlodipine, plasma concentrations of amlodipine were measured and its pharmacokinetic characteristics were compared according to ABCB1 genotype. RESULTS: The area under the plasma concentration-time curve was significantly lower in subjects with 2677TT/3435TT (140.8 +/- 35.6 ng h(-1) ml(-1)) and 2677GT/3435CT (149.8 +/- 40.1 ng h(-1) ml(-1)) than in those with 2677GG/3435CC (208.6 +/- 39.2 ng h(-1) ml(-1)) [95% confidence interval (CI) on the difference, 2677GG/3435CC vs. 2677GT/3435CT 12.0, 105.6, P < 0.01; 2677GG/3435CC vs. 2677TT/3435TT 19.6, 116.0, P < 0.01; 2677GT/3435CT vs. 2677TT/3435TT - 39.2, 57.2, P > 0.05]. The peak plasma concentrations were highest in subjects with 2677GG/3435CC (3.8 +/- 0.5 ng ml(-1)), lower in subjects with 2677GT/3435CT (3.2 +/- 0.5 ng ml(-1)) and 2677TT/3435TT (2.7 +/- 0.5 ng ml(-1)) in rank and showed a significant difference between those with 2677GG/3435CC and with 2677TT/3435TT (95% CI on the difference 0.4, 2.0, P < 0.01). However, the oral clearance was higher in subjects with 2677TT/3435TT (37.7 +/- 10.2 l h(-1)) than in those with 2677GT/3435CT (35.7 +/- 9.9 l h(-1)) and with 2677GG/3435CC (24.8 +/- 5.4 l h(-1)) and exhibited a significant difference between ABCB1 genotype groups (95% CI on the difference, 2677GG/3435CC vs. 2677GT/3435CT - 21.5, - 0.3, P < 0.05; 2677GG/3435CC vs. 2677TT/3435TT - 23.8, - 2.0, P < 0.05). CONCLUSION: Amlodipine pharmacokinetics was affected by the genetic polymorphisms of the ABCB1 gene in humans. These findings may provide a plausible explanation for interindividual variation in the disposition of amlodipine, although our study could not explain the exact mechanism(s) by which the polymorphic ABCB1 gene paradoxically reduces the plasma levels of amlodipine. Further evaluation is thus warranted.     

脂联素受体1基因-102T/G多态位点与山西省汉族人2型糖尿病的关系

目的研究脂联素受体1(AdipoR1)基因-102T/G多态位点与山西汉族人2型糖尿病的关系。方法应用序列特异性引物-聚合酶链反应技术(PCR-SSP)检测50例2型糖尿病患者和50名健康对照者AdipoR1-102T/G单核苷酸多态性位点基因型,并测定所选人群的临床指标。结果①基因型及等位基因频率分布在2型糖尿病患者和健康对照组人群中差异无统计学意义(P>0.05)。②健康对照组人群中,G等位基因携带者空腹血糖较TT基因型者低(P<0.01)。③2型糖尿病患者中,G等位基因携带者空腹胰岛素(P<0.01)、胰岛素抵抗指数(P<0.05)及空腹血糖(P<0.05)较TT基因型者低。结论AdipoR1基因与山西汉族人群糖代谢及胰岛素抵抗相关,与2型糖尿病无关。     

CDKN2A／B基因三个单核苷酸多态性位点与冠心病的相关性研究

目的研究CDKN2A／B基因邻近的rs2383206、rs10757274、rs10757278三个位点的单核苷酸多态性（SNP）,探讨其与冠心病的发病及冠状动脉病变程度的相关性。方法采用聚合酶链式反应（PCR）扩增CDKN2A／B基因邻近rs2383206、rs10757274、rs10757278三个SNP位点的核苷酸片段,进行多态性分型并分析其与冠心病发病的相关性,对冠心病患者冠脉造影结果进行Gensini积分评定,分析单核苷酸多态性分型与Gensini积分的关系。结果CDKN2A／B基因邻近的3个SNP位点rs2383206、rs10757274、rs10757278的AG／GG基因型分布频率均高于对照组（P〈0．05）,G等位基因分布频率高于对照组（P〈0．05）。经校正混杂因素的影响后,与AA纯合子相比rs2383206、rs10757274、rs10757278的AG／GG基因型具有显著增加冠心病风险的效应校正比值比（OR）分别为1．492,1．915,1．866。冠心病组3个SNP位点AG／GG基因型冠脉Gensini积分均高于AA基因型（P〈0．05）。结论CDKN2A／B基因的rs2383206、rs10757274、rs10757278三个单核苷酸多态性位点是昆明地区汉族冠心病发生的易感位点,且与冠状动脉病变的严重程度呈正相关。