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《中国药房》2015,(31):4348-4350
目的:比较随机扩增多态性DNA分子标记技术(RAPD)和简单重复序列间区扩增技术(ISSR)两种标记方法,研究广西不同居群鸡血藤遗传多样性的优劣。方法:分别采用RAPD和ISSR标记方法,利用POPGENE 32软件、Ntsys软件、SPSS 17.0软件,对广西不同采集地的9份鸡血藤的遗传多样性进行研究。结果:筛选出的3条RAPD引物及4条ISSR引物扩增后,共得到198和315个位点,多态性位点37和80个,多态性位点比率为18.7%和25.4%,有效等位基因数为1.416 8、1.584 0,基因多样性指数为0.269 4、0.351 3,Shannon多样性指数为0.431 6、0.529 9。ISSR标记均高于RAPD标记,RAPD和ISSR的平均遗传相似系数为0.757 64、0.683 80,表明ISSR检测遗传多样性更灵敏。二者的聚类结果相近,相关系数r为0.847,说明其在0.001水平呈极显著正相关。结论:ISSR标记方法比RAPD标记反映出更多的遗传多样性信息,更适合于广西产不同居群鸡血藤的遗传多样性研究。 相似文献
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我国黄花蒿中青蒿素含量的气候适宜性等级划分 总被引:3,自引:0,他引:3
针对黄花蒿种植中适生地选择的迫切要求,本文通过实地调查和查阅文献,获得全国各地青蒿素的含量数据。应用统计分析方法研究青蒿素含量与气候因子和地理分布之间的关系,应用ArcGIS软件的空间计算方法进行青蒿素含量的气候适宜性等级划分。结果显示:①青蒿素含量在我国各地差异较大,青蒿素含量纬向变异明显,北部高纬度地区青蒿素含量较低,南部青蒿素含量较高。北纬34度以南,东经(100~120°E)之间地区适宜黄花蒿的生长,青蒿素含量相对较高。北纬34度以北高纬度地区不适宜黄花蒿的生长,而且青蒿素含量低于0.2%。②在我国,亚热带湿润气候区最适宜黄花蒿的生长,而且青蒿素含量平均值大于0.5%。③温度、日照时数和降雨量是影响青蒿素含量高低的主要气候因子。最适宜青蒿素积累的气候条件为:温度(13.9~22℃)、日照时数(853~1 507 h)、降雨量(814~1 518 mm)。最适宜黄花蒿生长的气候条件为:温度(13~29℃)、降雨量(600~1 300 mm)。④广西西北部,四川、贵州、云南东部,重庆南部和湖南西部的气候条件最适宜黄花蒿的人工种植;湖北、安徽和江苏的南部地区也有适宜黄花蒿人工种植的气候条件。 相似文献
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目的:结合ISSR分子标记与金钱草主要代谢产物标记对贵州省共21份野生金钱草资源的遗传多样性进行分析,为其驯化种植及遗传改良提供理论依据。方法:以金钱草基因组DNA为模板,以优化的PCR体系筛选出引物进行ISSR标记扩增,应用NTsys 2.10e软件,对所得数据进行分析处理,并采用高效液相色谱法测定了主要代谢产物槲皮素和山柰素的含量,使用SPSS 19.0软件对测定数据进行统计分析与绘制聚类图。结果:用筛选出的15条ISSR引物共扩增出105条多态性条带,多态性条带占比达98.1%,各金钱草种质资源之间的遗传相似性系数范围在0.598 1~0.953 3之间,地理位置相距越近,遗传相似性越高,不同资源的槲皮素和山柰素含量差异较大,ISSR标记的聚类将21份金钱草资源分为2大类群6个亚群,代谢产物标记的聚类将其分为2大类群5个亚群。结论:贵州野生金钱草具有丰富的遗传多样性,应用ISSR及代谢产物槲皮素和山柰素标记均能较好地对金钱草资源进行聚类,但聚类结果存在差异,其亲缘关系与地理位置呈现一定的关联性。 相似文献
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摘 要 目的:对广东省、广西壮族自治区共15个产地的广金钱草遗传多样性以及亲缘性关系进行分析。方法: 应用inter simple sequence repeat(ISSR)技术,对广东省、广西壮族自治区的样品进行遗传多样性分析;使用Popgene 1.32软件对扩增结果进行分析,并使用UPGMA软件绘制聚类图。结果: 7条ISSR引物扩增出的产物共有51条清晰的条带,其中多样性条带为41条;Shannon多样性指数(I)为0.3,Nei’s遗传多样性指数(H)为0.246 4,居群间的遗传分化系数(GST)为0.123 8,基因流(Nm)为3.539 7。结论:广东、广西两地栽培以及野生广金钱草具有较高的遗传多样性,其遗传距离跟地理距离有一定的关联性。 相似文献
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目的研究黄花蒿生长发育过程中青蒿素含量的动态变异特性。方法分别在2、3、4、5、7月移栽黄花蒿苗,采集生长发育至各时期的黄花蒿,以紫外分光光度法,在292 nm处,对黄花蒿中青蒿素含量进行测定。结果黄花蒿下部叶中青蒿素含量明显高于上、中部;黄花蒿上午采收叶中青蒿素含量明显高于下午;在黄花蒿的整个生长发育过程中,从营养生长末期到花蕾期,青蒿素含量有递增趋势,开花后青蒿素含量明显下降;黄花蒿生长时间越长,叶中青蒿素的含量越高。结论黄花蒿应该选择在4月以前下种并移栽完成,选择在营养生长末期至花蕾期采收,采收的时间可选择在上午气温较低的晴天。 相似文献
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《中国药房》2015,(19):2628-2631
目的:研究湘产蛇莓种质资源的遗传多样性。方法:建立不同地理分布的蛇莓种质资源随机扩增多态性DNA(RAPD)反应体系,RAPD-聚合酶链反应(PCR)法检测湘产24组蛇莓样本(21个野生品,3个栽培品),琼脂糖凝胶电泳分析结果,计算等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、多态性位点百分比(PPB)、Nei’s基因多样性指数(H)、Shannon’s信息指数(I)。结果:筛选出多态性引物14条,共扩增出90条电泳谱带,其中多态带为81条,Na为1.900 0,Ne为1.540 1,PPB为90.0%,H为0.312 8,I为0.467 5。结论:湘产蛇莓各区域样本间遗传多样性丰富,人工栽培品与野生品之间存在遗传背景上的差异,聚类结果与地理分布表现出明显相关性。 相似文献
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目的:应用ISSR-PCR标记技术研究中药材西河柳基原植物柽柳及其近缘种的亲缘关系和遗传多样性,为西河柳药材鉴定和育种提供参考。方法:对柽柳7个居群以及甘蒙柽柳、多枝柽柳及购自药材市场西河柳共11个样本进行ISSR-PCR分析, 采用NTSYS-pc软件计算柽柳各居群及近缘种间的Jaccard遗传相似系数, 按非加权配对算术平均法(UPGMA) 建立所研究类群的系统聚类图。结果:14条引物扩增出106个条带,其中多态带为83条,占总扩增条带数的78.3%。从聚类分析图可以看出,柽柳不同居群样本首先聚在一起,表明是一自然物种;甘蒙柽柳与柽柳具有较近的亲缘关系。研究还表明目前商品市场西河柳药材来源较混乱。结论:ISSR标记可以为西河柳原植物及其近缘种的种质资源鉴定、遗传关系分析及栽培育种提供分子生物学依据。 相似文献
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Intersimple sequence repeats (ISSR) molecular fingerprinting markers for authenticating populations of Dendrobium officinale Kimura et Migo 总被引:9,自引:0,他引:9
Shen J Ding X Liu D Ding G He J Li X Tang F Chu B 《Biological & pharmaceutical bulletin》2006,29(3):420-422
Intersimple sequence repeats (ISSR) molecular fingerprinting markers have been employed to authenticate eight populations of Dendrobium officinale using 10 primers selected from 76 ISSR primers. A total of 127 DNA fragments were amplified, of which 115 were polymorphic (90.5% of all bands). Sixteen specific authentication markers have been found. To enhance the efficiency of authentication, ISSR fingerprinting codes have been constructed using six polymorphic bands for authenticating D. officinale populations. Eight wild populations of D. officinale have been authenticated accurately using ISSR. 相似文献
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目的 分析研究四倍体黄芩新品系D20和二倍体黄芩之间的遗传差异。方法 采用ISSR分子标记技术对四倍体黄芩及二倍体黄芩之间的遗传差异进行研究。结果 从100条引物中筛选得到9条ISSR引物用于正式扩增,多态性百分率为84.2%;遗传距离的变异范围是0.086 9~0.242 9,聚类分析结果将黄芩样本分为两大类,二倍体聚为一类,四倍体聚为另一类。结论 四倍体黄芩新品系D20和二倍体黄芩存在明显的遗传差异,ISSR分子标记能有效的揭示材料间的多态性。 相似文献
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目的:对莲不同品种的遗传多样性和亲缘关系进行分析。方法采用ISSR 标记技术对采自广东、湖南、江西、福建、湖北、浙江、江苏、北京、河北等地的22份不同品种莲的遗传多样性进行了研究。结果从引物库中的100条ISSR引物中筛选出18条多态性稳定、清晰的引物,共扩增出221条带,其中多态性条带数为181条,多态位点百分率为81.9%。 Nei-Li相似系数( GS)计算方法得到样品间的GS值在0.37~1.00之间。结论22份莲样品间的遗传多样性较高,而地域性差异不明显,此法可用于莲不同品种间的鉴别。 相似文献
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目的分析6个不同居群白芍的遗传多样性,为白芍的种质鉴定及遗传多样性分析提供依据。方法运用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术,对浙江磐安、四川中江、安徽亳州、上海崇明、江苏宿迁和山东荷泽居群白芍的基因组DNA进行随机扩增,利用NTsys2.10e软件计算遗传相似性,运用UPGMA法进行聚类分析并构建树状图。结果共筛选了70个随机引物,从中挑选出8条多态性强、重复性好的引物,共检测出215个位点,多态性位点137个,多态位点比率为63.7%,UPGMA聚类可以将不同来源的白芍很好地区分开。结论不同产地间的白芍存在丰富的遗传多样性,RAPD分子标记方法可以用来鉴定不同产地的白芍。 相似文献
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Genetic diversity of Paris polyphylla var. yunnanensis, a traditional Chinese medicinal herb, detected by ISSR markers 总被引:1,自引:0,他引:1
Paris polyphylla Smith var. yunnanensis (Franch.) Hand.-Mazz. is an important Chinese medicinal herb. Because of overharvesting, the wild populations of this herb have greatly declined and become fragmentized. In this paper, ISSR markers were used to determine the genetic diversity and genetic structure of this variety represented by a total of 153 individuals from three natural populations and three cultivated populations. Fourteen primers produced a total of 251 bands, of which 227 were polymorphic (PPB=90.44%). For the natural populations, the results showed that genetic differentiation was mainly within populations (GST=0.1952), with low genetic diversity at the population level. At the population level, genetic diversity of the cultivated populations was relatively higher than that of the natural populations (PPB=57.24% vs. 53.38%, HE=0.153 vs. 0.151, HO=0.241 vs. 0.235). This pattern can be explained by the recent introduction and artificial selection of cultivars from comparatively wide areas of origin, and subsequent gene flow among populations in cultivation. Although the neighbour-joining cluster analysis seemed to suggest that there was conspicuous genetic differentiation between the natural and cultivated populations, the AMOVA showed that only 4.84% of the total variance existed between groups of natural and cultivated populations, while 67.51% of the variance occurred within populations. In the end, some suggestions for conservation of this important herb are proposed. 相似文献
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Utilization of RAPD markers to assess genetic diversity of wild populations of North American ginseng (Panax quinquefolium) 总被引:3,自引:0,他引:3
The Catskill Mountains of New York State are an important source of wild-collected American ginseng (Panax quinquefolium) and, increasingly, of woods-cultivated ginseng. The objective of this study was to assess genetic diversity among 9 different wild ginseng populations in and adjacent to the Catskill Mountain region of New York State and to compare these to wild populations from other states including Kentucky, Tennessee, North Carolina, Pennsylvania, and Virginia, and one cultivated population from Wisconsin. Randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) markers were used to estimate the genetic distance among samples from the 15 populations. Pooled DNA from 10 plants of each of 8 New York populations was initially screened with 64 random primers; subsequently, the 15 primers that exhibited the greatest number of reproducible polymorphic markers were selected for further experimentation. Gel electrophoresis with the selected 15 primers produced 124 highly reproducible polymorphic bands. The ratio of discordant bands to total bands scored was used to estimate the genetic distance within and among populations. Multidimensional scaling (MDS) of the relation matrix showed distinctly separate clusters between New York and non-New York populations, indicating separation between these two groupings. The MDS analysis was confirmed using pooled chi-square tests for fragment homogeneity. This study shows that RAPD markers can be used as population-specific markers for Panax quinquefolium, and may eventually be utilized as markers for ginsenoside assessment. 相似文献