SEIQCR传染病模型的构建及在广州市新型冠状病毒肺炎公共卫生防控效果评估中的应用

目的 构建易感者(S)-潜伏者(E)-发病者(I)-隔离者(Q)-确诊者(C)-恢复者(R)模型(SEIQCR),并初步用于评价广州市新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情中公共卫生干预措施的效果。 方法 在SEIR传播动力学模型基础上,添加隔离模块和确诊模块,建立联合考虑潜伏期传播规律和追踪隔离干预措施的SEIQCR传播动力学模型。以2020年1月13日至2020年3月17日广州市疫情数据为基础,拟合得到SEIQCR模型的动力学参数。 结果 SEIQCR模型显示预测每日发病数与实际发病数高度吻合(R2=0.93)。启动一级响应之后,时变再生数(R_t)呈快速下降趋势,提示本地传播得到有效控制。 结论 广州市COVID-19疫情的防控措施是有效的,各地方政府应严格执行隔离制度,切断传播途径,全力遏制COVID-19 传播。SEIQCR模型的构建策略可为其他地区的干预措施评估提供方法学借鉴。     

河南省信阳市新型冠状病毒肺炎的流行动态

目的 探讨河南省信阳市新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的流行动态,为优化疫情防控策略、评估干预措施效果提供科学依据。 方法 收集信阳市官方报道的COVID-19病例数据和个案信息,确定感染日期,并由此估计潜伏期,构建SEIR的传染病动力学模型,分析疾病发生发展规律,同时模拟分析改变防控措施实施时间时疫情的动态变化。 结果 信阳市累计报告COVID-19确诊病例274例,罹患率为3.72/10万;潜伏期的中位数为6.00(4.00,7.25)d。模型分析显示,信阳市疫情的基本再生数R0=2.86,采取防控措施后有效再生数降至0.29;若提前3 d采取防控措施,病例数降低50.5%,而推迟3 d采取防控措施,病例数将增加1倍。 结论 信阳市COVID-19疫情快速扩散,但在国家强有力的防控措施下疫情很快得到控制。     

基于改进传染病动力学易感-暴露-感染-恢复（SEIR）模型预测新型冠状病毒肺炎疫情

目的 研究基于传染病动力学易感-暴露-感染-恢复（SEIR）模型对新型冠状病毒肺炎（COVID-19）疫情发展情况的预测效果,为有效应对疫情提供指导。方法 利用Python爬虫自动更新功能获取中华人民共和国国家卫生健康委员会公布的疫情数据,通过改进传染病动力学SEIR模型,自动修正COVID-19基本再生数（R₀）,对中国湖北省和韩国的COVID-19疫情发展趋势进行预测。结果 模型预测的湖北省COVID-19疫情顶点在2020年2月21日,现有确诊病例数约为50 000例（2月19日）,预计疫情将于3月4日回落至30 000例以下,并在5月10日左右结束。中华人民共和国国家卫生健康委员会公布的实际数据显示,确诊人数顶点为53 371例。模型预测的韩国疫情峰值在3月7日,将于4月底结束。结论 改进的传染病动力学SEIR模型在COVID-19疫情早期实现了较准确的数据预测,政府相关部门在疫情中及时、有效的强力干预明显影响了疫情的发展进程,东亚其他国家如韩国的疫情在3月仍处于上升期,提示中国需要提防输入性疫情风险。     

新冠肺炎临床一线人员心理管控探索与经验

医院隔离病区作为突发传染性疾病的主要诊疗场所,是提高疫情重症患者治愈率,降低死亡率的关键环节。这次新冠肺炎(COVID-19)疫情是新中国成立以来,传播速度最快、感染范围最广、防控难度最大的突发公共卫生事件。COVID-19作为新发的传染性极强的以呼吸道传播为主的传染性疾病,规范、严格的隔离病区建设与管理是其防治的关键。随着COVID-19疫情的进展,郑州人民医院从后备医院立即启动成为患者定点医院。医院快速完成隔离病区建立、人力资源调配、感染控制等各项工作,快速完成功能转换,统筹管理,科学规范,人员稳定,全体一线医护人员零感染,在这场新冠肺炎疫情防控阻击战中取得了初步成绩,防控经验值得大型综合医院推广应用。     

新型冠状病毒肺炎防控中病原携带所带来的压力和挑战

新型冠状病毒肺炎（COVID-19）疫情已经形成了大流行,目前我国疫情虽然得到了有效控制,但防控仍然面临巨大的压力。作为潜在的传染源,健康携带者及潜伏期携带者在疫情蔓延中起到重要的作用。开展高质量的流行病学调查、特定人群病毒核酸检测,对COVID-19病例发生较为频繁的地点开展小规模的筛查工作,以及加强对不同聚集性疫情调查之间的横向交流等措施,对于聚集性疫情防控具有重要意义。明确COVID-19的感染谱、传染期、是否存在恢复期携带者、院内感染问题及潜伏期的长短,将有助于在今后防控工作中采取有针对性的措施。     

新型冠状病毒肺炎患者床旁血液净化治疗的感染防控

目的 探讨新型冠状病毒肺炎(corona virus disease 2019,COVID-19)患者隔离病区床旁血液净化治疗的感染防控策略,评价感染防控的效果。方法 通过回顾性分析2020年2月8日至2020年3月31日期间在武汉华中科技大学同济医学院附属同济医院中法新城院区COVID-19隔离病区床旁血液净化治疗患者的临床特征、感染情况和转归,总结所采取的感染防控措施,分析医护人员和患者COVID-19交叉感染情况以及患者之间血源性病原体交叉感染的情况,评估各项感染防控措施在控制交叉感染发生和传播中的作用。结果 研究期间该隔离病区累计收治101例COVID-19患者,其中10例(占9.90%)开展床旁血液净化治疗,采取的血液净化治疗方式均为连续性血液透析滤过(continuous venovenous hemodiafiltration, CVVHDF), 累计床旁血液净化治疗79例次。采取的感染防控管理措施包括病区隔离分区、患者行为隔离和患者安置、操作人员个人防护和手卫生,透析废液、空气、物体表面、医疗器械和医用织物等环境物品管理。无1例医护人员感染COVID-19,所有医护人员两次咽拭子COVID-19病毒核酸检测(两次采样间隔>1 d)均为阴性;开展床旁血液净化治疗的患者中2例COVID-19疑似病例在住院期间多次咽拭子病毒核酸检测及血清COVID-19病毒抗体IgG、IgM均阴性,胸部CT无病毒性肺炎表现;患者未发生血源性病原体的院内交叉传播。结论 在COVID-19隔离病区开展床旁血液净化治疗,通过采取有效的感染防控管理,能够有效控制院内交叉感染的发生和传播,可以为呼吸道传染病隔离病区患者诊治和感染防控提供一定的经验。     

西安市新型冠状病毒肺炎聚集性疫情流行特征

目的 分析西安市新型冠状病毒肺炎（COVID-19）典型聚集性疫情的传播特征,为优化疫情防控策略提供科学依据。方法 采用Excel、SPSS软件对西安市典型聚集性疫情进行描述性流行病学分析;并分析病例的代际传播和潜伏期。结果 西安市截至2020年3月31日累计报告COVID-19典型聚集性疫情8起,涉及确诊病例53例、无症状感染者15例,死亡1例;以聚餐聚会引起的疫情为主,占37.50%,总体罹患率为14.21%。疫情累计持续时间中位数 27 d,5个区的24个街道办事处/乡镇有聚集性病例,男性确诊病例和无症状感染者数均略多于女性,无症状感染者平均年龄（54岁）大于确诊病例（46岁）。疫情一代病例与二代病例的代际间隔平均为6.8 d（95%CI: 5.8~7.5）,中位数为 5.6 d。由3起疫情推算的潜伏期平均为7.9 d。结论 西安市典型聚集性疫情以聚会聚餐型为主,应做好重点地区、重点人群的自我防护和隔离,避免密切接触等措施,以减少COVID-19聚集性疫情的发生。     

新型冠状病毒肺炎患者床旁血液净化治疗的感染防控

目的 探讨新型冠状病毒肺炎(corona virus disease 2019,COVID-19)患者隔离病区床旁血液净化治疗的感染防控策略,评价感染防控的效果。方法 通过回顾性分析2020年2月8日至2020年3月31日期间在武汉华中科技大学同济医学院附属同济医院中法新城院区COVID-19隔离病区床旁血液净化治疗患者的临床特征、感染情况和转归,总结所采取的感染防控措施,分析医护人员和患者COVID-19交叉感染情况以及患者之间血源性病原体交叉感染的情况,评估各项感染防控措施在控制交叉感染发生和传播中的作用。结果 研究期间该隔离病区累计收治101例COVID-19患者,其中10例(占9.90%)开展床旁血液净化治疗,采取的血液净化治疗方式均为连续性血液透析滤过(continuous venovenous hemodiafiltration, CVVHDF), 累计床旁血液净化治疗79例次。采取的感染防控管理措施包括病区隔离分区、患者行为隔离和患者安置、操作人员个人防护和手卫生,透析废液、空气、物体表面、医疗器械和医用织物等环境物品管理。无1例医护人员感染COVID-19,所有医护人员两次咽拭子COVID-19病毒核酸检测(两次采样间隔>1 d)均为阴性;开展床旁血液净化治疗的患者中2例COVID-19疑似病例在住院期间多次咽拭子病毒核酸检测及血清COVID-19病毒抗体IgG、IgM均阴性,胸部CT无病毒性肺炎表现;患者未发生血源性病原体的院内交叉传播。结论 在COVID-19隔离病区开展床旁血液净化治疗,通过采取有效的感染防控管理,能够有效控制院内交叉感染的发生和传播,可以为呼吸道传染病隔离病区患者诊治和感染防控提供一定的经验。     

基于应急管理理论的新型冠状病毒肺炎聚集性疫情防控效果评价指标体系的构建

背景　在新型冠状病毒肺炎（COVID-19）疫情常态化防控阶段，我国陆续发生了多起聚集性疫情，均已得到控制。科学评估聚集性疫情防控效果，有助于及时总结经验与不足，更好地应对疫情。然而目前尚缺乏COVID-19聚集性疫情防控效果评价的工具。目的　构建COVID-19聚集性疫情防控效果评价指标体系，为评估聚集性疫情防控效果提供工具。方法　2020年11月-2021年2月，以应急管理理论为基础，构建理论框架。从应急管理的事前预防、事中处置和事后评估的角度，采用文献研究、多轮专家咨询法构建评价指标体系。结果　本研究构建了由5个一级指标（发现报告能力、精准防控能力、公众防护能力、医疗救治效果、疫情防控效果）、27个二级指标和107个三级指标组成的COVID-19聚集性疫情防控效果评价指标体系。专家一致性系数为0.710~0.912，该指标体系用于评价聚集性疫情防控效果满分赋值100分，分数越高防控效果越好。结论　本研究所构建COVID-19聚集性疫情防控效果评价指标体系可为评估疫情常态化防控阶段聚集性疫情防控效果提供参考。     

不同新型冠状病毒变异株感染的COVID-19潜伏期研究

从新型冠状病毒肺炎（COVID-19）疫情初始至今,COVID-19的病原体新型冠状病毒（SARS-CoV-2）不断进化和变异,产生传播力和毒力变化的变异株,如Alpha（B.1.1.7）、Beta（B.1.351）、Gamma（P.1）、Delta（B.1.617.2）以及Omicron（B.1.1.529）变异株。深入研究不同变异株感染所致的COVID-19潜伏期有助于追溯传染源,确定密切接触者的留验、检疫和医学观察期限,为及时调整COVID-19疫情防控措施提供依据。本文主要综述了国内外感染SARS-CoV-2野生株和不同变异株的COVID-19潜伏期的相关研究,研究发现,感染SARS-CoV-2野生株的潜伏期在4~8 d,中位潜伏期约为5.5 d。感染Beta、Gamma变异株的潜伏期与野生株基本类似,约为5 d。感染Alpha、Delta和Omicron变异株的潜伏期则低于其他毒株,分别为4 d、4 d和3 d。     

武汉交通管制和集中隔离对新型冠状病毒肺炎疫情影响的动力学模型研究

目的 定量评价武汉市采取交通管制和集中隔离措施对新型冠状病毒肺炎疫情的控制作用,为疫情防控提供科学依据。 方法 基于SEIR动力学模型,考虑无症状感染者和未确诊隔离患者的特征,构建SEIAHR模型。基于防控措施的实施时间,将疫情分为三阶段,并分别进行参数拟合和计算基本再生数,并对疫情的发展趋势进行预测。 结果 交通管制和集中隔离实施后,R0显著降低,三阶段的R0分别为3.684 1(95%CI:3.106 1~4.048 0)、2.178 8(95%CI: 1.725 8~3.577 6)、0.362 5(95%CI: 0.349 9~0.367 6),发病高峰也发生前移,从交通管制前的2020年4月19日前移至2020年3月14日,疫情规模也在防控措施的作用下减小。 结论 武汉交通管制和集中隔离措施对于疫情控制具有相当良好的作用,可以为其他国家疫情防控提供参考。     

河南省新型冠状病毒肺炎疫情防控效果分析

目的:通过构建河南省新型冠状病毒肺炎的SIR模型和基本再生数的变化趋势,分析评价河南省的防控效果,并针对疾病恢复期提供建议。方法:选取河南省2020年1月21日至2月19日的疫情资料进行分析研究。使用R(3.6.2)来构建SIR模型,ode函数用来求解微分方程,optim函数用来优化模型。最终建立了河南省新型冠状病毒肺炎的流行趋势SIR图,并将之与疾病实际流行过程对比。同时分析了SIR模型下和实际情况下的R0变化趋势,并利用指数平滑模型进行了预测。结果:SIR模型峰值的感染人数大大超过了实际情况,实际变化数据的R0趋势图也低于SIR模型得出的R0变化趋势图,这说明河南省的疫情防控措施起了很大的作用,有效避免了大量人群的感染。结论:河南省针对此次新型冠状病毒肺炎疫情的防控措施有效地限制了疫情的扩散,防治效果显著,应继续做好疫情的针对性防控措施。     

Coronavirus disease 2019 in India: Post-lockdown scenarios and provisioning for health care

BackgroundWith the rise of Coronavirus disease 2019 (COVID-19) cases in India, lockdown was imposed from March 25, 2020. We studied post-lockdown scenarios and evaluated health-care constraints. Our aim was to identify the scenarios in which health-care availability would not be overwhelmed.MethodsA modified compartmental SEIR stochastic model was used to calculate peak cases at various levels of effectiveness of prevention of transmission. Health-care constraints were evaluated using a Delphi study. We developed “q-metric” to evaluate the epidemic. Key constraints were matched against scenarios generated, and a monitoring mechanism was devised.ResultsContinuing lockdown (“q-metric” of >50) until mid-August was theoretically the most effective solution to end the epidemic. Lockdown might however be lifted earlier owing to various compulsions. The key constraints were identified as trained manpower and ventilators. It was estimated that shortfall of specialists to operate ventilators for COVID-19 intensive care units was approximately 40,000. This requires re-purposing of other specialists and short-term training to meet the surge. The shortage of ventilators is around 40,000–50,000. Procuring beyond those numbers would be infructuous owing to limits of training manpower. After lifting lockdown, the aim should be to contain the epidemic within the availability of key constraints. Our model suggests that this can be achieved by community containment and other non-pharmacological interventions at a “q-metric” of 19. An algorithm using “q-metric” was developed to monitor the epidemic.ConclusionVarious post-lockdown scenarios were simulated. Trained manpower and ventilators were identified as key health-care constraints. Partial community containment measures will require to be continued after the current lockdown is lifted.     

利用人口流动数据以及两阶段模型预测2019冠状病毒病流行趋势

目的：基于人口流动和疫情防控措施信息构建数学模型,预测2019冠状病毒病（COVID-19）疫情的发展趋势。 方法：获取截至2020年2月8日浙江省乐清市151例确诊病例的患病过程以及乐清和武汉之间的人口流动等信息,采用两阶段的方法构建数学模型,将人口流动数据与确诊病例症状开始时间以及输入性病例和本地病例的传播动力学特征整合起来,模拟并预测乐清的COVID-19疫情发展趋势。 结果：在疫情初期,每日从武汉来的输入性病例数（症状出现日）与当日、 6?d前和 9?d前从武汉到乐清的旅客数量成正相关。利用根据武汉到乐清的旅客数量估计的输入性病例数以及易感-暴露-感染-恢复模型预测乐清最终的病例数为170例。如果根据每日报告的输入性病例数来预测,预计最终病例数为165例。截至2020年4月27日,乐清实际监测到的病例数为170例,这两个预测值与实际值均接近。 结论：本研究建立的两阶段预测模型能够对COVID-19的流行趋势做出准确预测。     

新型冠状病毒肺炎疫情防控措施对重庆市流行性感冒传播和流行的影响

目的 分析新冠肺炎疫情的防控措施对重庆市流感传播和流行的影响,为制定有针对性的流感防控措施提供重要参考。方法 通过国家流感哨点监测系统收集重庆市2018—2020年流感监测资料,分析流感流行的季节性特征,比较2020年与2018—2019年各年同期流感样病例百分比（ILI%）和流感病毒核酸阳性率,评价新冠肺炎疫情防控对流感流行特征的影响。结果 流感监测资料和实验室检测结果显示,2018—2020年度重庆市报告ILI%依次为3.53%、2.23%和1.20%;流感病毒核酸阳性检出率分别为13.97%、23.81%和2.65%。2018—2019年ILI%分布相似,2020年2月开始,ILI%骤降并维持在较低水平。流感病毒核酸阳性率在2018—2019年每年12月至次年3月达到高峰,2020年2月后迅速下降,3月降为0。ILI%与流感病毒核酸阳性率呈正相关（r=0.404 8,P<0.05）。2020年与2018—2019年各年同期相比,ILI%增长率分别为-66.09%和-46.32%,流感病毒核酸阳性率分别下降81.03%和88.87%,其中1月降幅较小,下降率为39.87%;2...     

新型冠状病毒肺炎防控措施对疫情时空演变的影响

目的 分析新型冠状病毒肺炎(COVID-19)在不同时期的地理空间分布、空间聚集性特征,评价综合防控措施对疫情发展的影响。方法 根据我国各地区采取I级响应措施及复工复产时间将疫情流行分为三个时间段。收集我国内地各省、直辖市COVID-19动态确诊数据,计算每个时间段的周确诊病例数;运用空间自相关法对COVID-19确诊情况进行统计分析。结果 在第一阶段,疫情呈现以湖北为中心的典型空间正相关(Morans’I=0.144,Z=2.517,P=0.016);局部聚集表现为湖北与周边省份的高-高型和与湖北相距较远省份的低-低型分布。自各地区启动I级响应措施以后,疫情在第二阶段呈现随机分布(Morans’I=-0.017,Z=0.597,P=0.251),局部聚集表现为湖北与周边省份的高-低型和与湖北相距较远省份的低-低型分布。自各地区复工复产后,疫情在第三阶段仍呈现随机分布(Morans’I=-0.055,Z=-0.857,P=0.131);局部聚集表现为广东与江西的高-低型及四川地区的低-低型分布。结论 我国采取的综合防控措施有效地控制了全国疫情蔓延,目前疫情总体处于散发流行状态,应防止疫情反弹。     

新型冠状病毒肺炎流行病学特点 和治疗药物研究进展

严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）于2019 年12 月在中国武汉被发现。由 于该病毒具有较强的传染性,爆发了以湖北省为中心,借助春运快速波及至全国的新型冠状病毒肺炎 (COVID-19）疫情。认清疫情变化规律和了解临床针对性的药物研发进展,对疫情控制具有重要意义。该文 从SARS-CoV-2 的特性、COVID-19 疫情的流行病学表现、治疗药物研发和应用等进行综述。     

云南省新型冠状病毒肺炎疫情空间分析

目的 分析云南省新型冠状病毒肺炎疫情的空间分布特征,为制定云南省疫情防治措施和疫情的有效控制提供有效参考。方法 2020年1月23日至2月22日期间,基于全云南省通过疫情信息报告管理系统进行网络报告的新型冠状病毒肺炎疫情数据和云南省统计局统计的云南省常驻人口信息,导入GeoDa1.14.0和Mapinfo15.0软件,进行云南省新型冠状病毒肺炎疫情的描述和空间自相关分析。结果 全省16州（市）除迪庆州和怒江州无病例报告外,其他14个州（市）均有病例报告,其中确诊报告数主要集中在经济较发达的地区和旅游业较发达地区,云南省新型冠状病毒肺炎疫情出现先急剧升高后缓慢下降的趋势,发病率全局的空间自相关无统计学差异,但局部有一定的聚集,局部地区聚集情况仅出现在疫情较早期,疫情早期存在3个L-L聚集区（德宏州、版纳州和昭通市）,1个H-L区（昆明市）,4个L-H 区（玉溪市、曲靖市、楚雄州和红河州）,随着时间的推移,空间聚集情况逐渐消失。结论 目前疫情可防可控,无空间聚集性,但是在疫情完全扑灭前,仍然需要我们提高警觉性,科学防控,避免疫情的再燃和空间的聚集。