雷氏普罗威登斯菌耐药性及耐药基因的单中心研究

 目的 了解某院雷氏普罗威登斯菌耐药情况,分析耐碳青霉烯类雷氏普罗威登斯菌耐药基因遗传特征,为临床预防和感染治疗提供理论依据。方法 收集2017年1月—2019年12月该院分离的雷氏普罗威登斯菌的药敏结果,采用高通量测序技术测定3株耐碳青霉烯类雷氏普罗威登斯菌全基因组,利用生物信息学分析方法挖掘其遗传特征。结果 共分离雷氏普罗威登斯菌25株,其中对碳青霉烯类药物耐药株10株,占40.00%。神经外科检出最多（7株,占28.00%）,标本来源以尿为主（13株,52.00%）。25株菌对氨苄西林、阿莫西林均耐药,耐药率为100.00%。对亚胺培南、厄他培南、美洛培南的耐药率分别为36.00%、40.00%、28.00%。3株耐碳青霉烯雷氏普罗威登斯菌全基因组测序,结果分析显示均携带β-内酰胺类（bla_NDM-1、bla_OXA-10和bla_TEM-1B）、大环内酯类［mph（A）、mph（E）、msr（E）］、甲氧苄啶（dfrA1）、氨基糖苷类［aadA1、aadA5、aph（3″）-Ib、aph（4）-Ia、acc（6'）-Ib3、aadB］、磺胺类（sul1）和氯霉素类（catB8）6类耐药基因型,所携带耐药基因型bla_NDM-1、bla_OXA-10的遗传结构分别为：IS30-bla_NDM-1-ble_MBL-trpF-dsbC-orf-groES-groEL-IS91、aac（6’）-Ib3-dfrA1-aadA1-bla_OXA-10-catB8-aadB。结论 雷氏普罗威登菌多重耐药现象严重,携带耐药基因种类多,应加强医院感染防控,减少耐药菌株的传播。     

某三甲医院分离的耐碳青霉烯类肠杆菌目细菌的耐药基因及其同源性

目的 对某三甲医院分离的耐碳青霉烯肠杆菌目细菌(CRE)的耐药表型和耐药基因进行检测,并对其进行同源性分析,探讨产生耐药性的原因,为控制院内传播感染提供理论依据。方法 收集2019年1月-2021年9月淄博市第一医院临床标本分离的鉴定为CRE的菌株,通过改良碳青霉烯灭活试验(mCIM)和EDTA改良碳青霉烯灭活试验(eCIM)对CRE菌株进行耐碳青霉烯表型筛选,采用聚合酶链反应(PCR)法对菌株进行耐碳青霉烯相关耐药基因的检测并通过接合实验研究耐药基因的传播能力,多位点序列分型(MLST)分析菌株的同源性关系。结果 CRE菌株中,大肠埃希菌54株,肺炎克雷伯菌15株;耐碳青霉烯大肠埃希菌bla_NDM-1阳性38株、bla_OXA-23阳性9株、bla_OXA-48阳性7株,耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌bla_KPC-gp阳性3株、bla_KPC-qc阳性3株、bla_OXA-48阳性9株;接合实验结果证实bla_NDM-1和bla_KPC-gp...     

某教学医院耐碳青霉烯类高毒力肺炎克雷伯菌临床及分子特征

 目的 了解临床分离的耐碳青霉烯类高毒力肺炎克雷伯菌（CR-hvKP）的耐药、毒力及流行病学特征。方法 收集安徽省某教学医院2018年1月-2020年12月临床分离的耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌（CRKP）,并分析其临床特征。采用飞行时间质谱鉴定菌株,拉丝试验及检测毒力基因筛选出CR-hvKP,按1：1配比选取与CR-hvKP同病室或相近时间内分离的碳青霉烯耐药非高毒力肺炎克雷伯菌（CR-non-hvKP）作为对照组,采用全基因组测序检测分析CR-hvKP及对照组CR-non-hvKP的荚膜血清型、耐药、毒力基因及ST分型,比较两组菌株间的差异。结果 共分离512株CRKP,其中CR-hvKP 30株,CR-non-hvKP 482株。CR-hvKP感染患者多为老年（20例,66.67%）,存在呼吸系统疾病（29例,96.67%）、消化系统疾病（12例,40.00%）、感染性休克（10例,33.33%）、侵入性治疗（23例,76.67%）以及高病死率（20例,66.67%）。CR-hvKP对常用的大多数抗菌药物耐药率>90%,对替加环素的耐药率为3.33%,对多粘菌素B全部敏感,与CR-non-hvKP的耐药率比较,差异无统计学意义（P>0.05）。测序结果表明：CR-hvKP携带主要的碳青霉烯耐药基因为bla_KPC-2（28株,93.33%）,耐药基因SHV-11、mph（A）和armA检出率低于CR-non-hvKP菌株。30株CR-hvKP携带的毒力基因iucA、iutA、fimF、fimH、mrkD检出率均为100%,高于CR-non-hvKP菌株,差异均有统计学意义（均P<0.05）。CR-hvKP菌株中ST11-K64检出率（76.67%）高于CR-non-hvKP菌株（40.00%）,差异有统计学差异（P<0.05）。结论 该院主要流行株为ST11-K64产KPC-2酶的CR-hvKP,携带较多毒力和耐药基因,病死率高,临床应重点关注老年及重症监护病房患者。     

佛山市沙门菌多重耐药及第Ⅰ类整合子携带情况分析

目的 了解佛山市沙门菌的多重耐药以及第I类整合子的携带情况,为研究沙门菌耐药机制提供参考。方法 收集2015—2017年佛山市食源性疾病监测中分离的390株沙门菌作为本研究的样本菌株,按照Kauffman-White的分类标准进行沙门菌血清分型,采用半定量药敏检测法测定沙门菌对14种抗生素的最小抑菌浓度（ MIC）,采用聚合酶链反应（PCR） 检测第I类整合子相关的整合酶intI基因。结果 390株沙门菌共分为9个血清群、43个血清型,其中以B群的鼠伤寒沙门菌变种（I4,5,12：i：-）检出数最多（136株,占34.87%）。药敏试验结果显示,耐药率最高的是氨苄西林,耐药率为69.23%,其次为四环素,耐药率为67.95%。390株沙门菌中共检出329株耐药菌株,耐药率为84.36%;其中多重耐药菌株252株,多重耐药率为64.62%（252/390）。37.95% （148/390） 的沙门菌检测出第Ⅰ类整合子,54.37%（137/252）多重耐药菌株检出第Ⅰ类整合子。结论 佛山市沙门菌血清型别多样,耐药率及整合子携带率均较高,提示应从基因水平对沙门菌耐药性及其传播机制进行监测 。     

耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌的耐药基因检测

目的了解耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌的耐药基因携带,以减少耐药菌的产生。方法对2009年1月-2012年2月耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌分离株进行筛选,鉴定和药敏采用VITEK-2Compact系统进行,引物特异性PCR法分别检测分离株的碳青霉烯酶耐药基因、ESBLs基因和AmpC等相关耐药基因的存在。结果共分离出6株碳青霉烯耐药或中介的肺炎克雷伯菌,其对青霉素类、青霉素/青霉素酶抑制剂、氨曲南、头孢菌素类、氨基糖苷类、氟喹诺酮类和碳青霉烯等抗菌药物表现为较高程度的耐药,但对替加环素有较高的敏感性;每一株菌均携带超广谱β-内酰胺酶基因,可检测到3⁵个耐药基因;其中,1株菌经测序证实为携带blaIMP-4,并同时携带blaSHV、blaTEM和blaCTXG9基因;5株菌扩增到Ⅰ类整合子(intⅠ);blaNDM及其他碳青霉烯类耐药基因筛查均为阴性。结论临床分离的碳青霉烯耐药或中介肺炎克雷伯菌的耐药表型和基因型基本相符,因而推测广泛耐药的肺炎克雷伯菌的主要类耐药机制与菌株同时携带产ESBLs、AmpC酶、碳青霉烯酶和Ⅰ类整合子(intⅠ)有关。     

综合重症监护病房分离的耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌耐药性和同源性分析

目的 对综合重症监护病房分离的耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌（CRKP）耐药性和同源性进行分析,为临床抗菌治疗和监测提供参考。方法 收集2019年3月至2021年3月2家医院综合重症监护病房分离得到的260株CRKP菌（其中马鞍山某医院156株,苏州某医院104株）,并对CRKP菌株进行常规药敏试验、PCR扩增和测序检测耐药基因携带情况,利用脉冲场凝胶电泳（PFGE）技术和多位点序列分型技术（MLST）对CRKP菌株进行同源性分析。结果 260株CRKP菌株对17种临床常用抗菌药物高度耐药,多重耐药率100%。马鞍山某医院的CRKP菌株主要携带碳青霉烯酶及超广谱β内酰胺酶（ESBLs）基因共5种耐药基因,bla_KPC-2型、bla_NDM-1型、bla_SHV型、bla_TEM型和bla_CTX-M-1型的携带率分别为84.62%、3.21%、70.51%、71.79%和80.77%。苏州某医院的CRKP菌株共携带bla_KPC-2型、bla_NDM-1型、bla_SHV型、bla_TEM型和bla_CTX-M-9型共5种耐药基因,携带率分别为74.04%、23.08%、80.77%、76.92%和27.88%。PFGE分型结果显示2家医院CRKP菌株均以A型和C型为主,但亚型和数量有差异。MLST分型分出ST11、ST76、ST16、ST437、ST379、ST751、ST395和ST307共8种序列型,马鞍山某医院主要为ST11型,占83.97%,而苏州某医院以ST11型（65.38%）和ST76型（27.88%）为主。结论 2家医院综合重症监护病房的CRKP菌株存在一定差别,但均以携带KPC-2碳青霉烯酶基因的ST11型为主,针对性加强重症监护病房清洁和院感监测,有利于控制多重耐药菌的传播和流行。     

2016-2017年某院ICU多重耐药菌监测的调查分析

目的了解2016-2017年ICU多重耐药菌种类及分布、耐药情况,探讨ICU多重耐药菌的原因,便于临床采取干预措施,控制医院感染,减少耐药菌的发生。方法分析2016-2017年ICU送检标本检出的262例多重耐药菌检测资料。结果 ICU的多重耐药菌的主要分布:以产超广谱β-内酰胺酶的肺炎克雷伯菌和大肠埃希菌居多,占57.8%,耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌及短黄杆菌,占25.0%,其中分离出4例全耐鲍曼不动杆菌,应引起警示。其次为耐甲氧西林金黄色葡萄球菌占17.2%.多重耐药菌大多来源于肺泡灌洗液及痰标本,占66.8%,对多数常用抗生素耐药,耐药菌株呈增多趋势。侵入性操作、抗生素滥用、卧床时间长、抵抗力低等是易感因素。结论临床应合理使用抗生素,规范操作,加强多重耐药菌病人的管理和护理,才能有效延缓和减少耐药菌株的发生。     

1株同时携带mcr-1和NDM-5质粒介导耐药基因的泛耐药大肠埃希菌研究

目的对1株临床分离到的多黏菌素和碳青霉烯类均耐药的泛耐药大肠埃希菌的耐药机制进行研究。方法用梅里埃VITEK 2 Compact全自动微生物鉴定系统进行细菌鉴定;微量肉汤稀释法检测常见抗菌药物的最低抑菌浓度(MIC);对细菌全基因组进行测序,分析细菌耐药基因分布情况。结果该株大肠埃希菌除替加环素和阿米卡星敏感外,对β-内酰胺类、碳青霉烯类和喹诺酮类药物耐药且同时对多黏菌素类抗生素耐药。全基因组测序分析显示该菌株同时携带mcr-1和NDM-5耐药基因,其中mcr-1耐药基因位于大小为251.657 kb的质粒上,bla NDM-5基因位于大小为46.19 kb的质粒上。结论同时携带mcr-1和NDM-5质粒介导耐药基因的泛耐药大肠埃希菌已在临床出现,其来源可能与抗生素的选择相关,应引起高度重视,需加强抗生素的使用限制及耐药菌的监测力度。     

碳青霉烯类抗生素敏感性下降肺炎克雷伯菌耐药机制及分子流行病学研究

目的:研究临床分离对碳青霉烯类抗生素敏感性下降肺炎克雷伯菌的耐药机制及同源性分析。方法:收集对碳青霉烯类抗生素敏感性下降肺炎克雷伯菌25株。E test法测定10种抗菌药物的MIC值;脉冲场凝胶电泳分析菌株同源性;PCR及克隆测序分析耐药基因型。结果:25株菌株对β-内酰胺类抗生素呈多重耐药,但对多黏菌素E和替加环素敏感。PFGE分型除一株外均为同一克隆(暗示医院内感染)。25株菌株均产KPC-2碳青霉烯酶基因,并同时携带CTX-M、SHV、DHA等多种耐药基因。结论:携带KPC-2基因的肺炎克雷伯菌同时携带多种耐药基因。此类菌株对碳青霉烯类抗生素敏感性下降并对除多黏菌素E和替加环素外抗生素多重耐药。     

广东省耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌耐药性及分子流行特征分析

目的 了解广东省耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌（CRAB）的耐药性及相关耐药基因和分子流行病学特征,为指导临床合理用药、有效控制耐药传播提供依据。方法 以广东省2019年收集的58株CRAB为研究对象,采用Vitek MS全自动微生物质谱仪和微量肉汤稀释法进行菌种鉴定及药物敏感性试验,利用全基因组测序技术对菌株进行耐药相关分子特征、菌株同源性及遗传进化关系分析。结果 58株CRAB对大多数抗菌药物耐药率均为100%,仅对替加环素和多粘菌素B表现敏感。共检测到26种耐药基因,所有菌株均同时携带bla_OXA-23和bla_OXA-66两种碳青霉烯酶基因。27.5%菌株检测到耐药基因元件ISAba1-OXA-23,由Tn2006携带并整合在AbaR4型耐药岛上;其中11株同时检测到由Tn2008VAR携带的耐药基因元件OXA-23-ISAba33。所有菌株均为ST2型。同源性分析显示58株CRAB菌群具有2个聚类（C1、C2群）和4个亚组（g1、2、3、4）,与全球CRAB流行株具有密切的亲缘关系。结论 广东地区CRAB均为泛耐药菌。OXA-23型碳青霉烯酶是CRAB的主要耐药机制,且存在ISAba1插入情况。ST2为本地区主要流行克隆,与全球流行的CRAB多重耐药克隆遗传关系密切,应加强CRAB耐药监测,防止多重耐药广泛流行与传播。     

血培养常见病原菌分布及耐药性分析

目的 了解血培养中常见病原菌构成及对抗菌药物的耐药性.方法 对2008-2010年血培养结果进行回顾性分析.结果 2308份送检血培养标本检出病原菌241株,阳性率为10.4％,其中革兰阳性菌96株占39.8％,革兰阴性菌145株占60.2％,未发现耐万古霉素葡萄球菌及耐碳青霉烯类肠杆菌科.结论 临床医师应根据药敏结果合理选用抗菌药物,对控制医院感染和减少多药耐药菌株的出现意义重大.     

神经外科病房多药耐药菌感染流行趋势及控制措施

目的 分析神经外科病房感染病原菌分布及多药耐药菌耐药特征,探讨多药耐药菌感染预防和控制策略.方法 对2010年1月-2010年12月神经外科病房分离出的病原菌及其药敏结果进行分析.结果 2010年神经外科病房医院感染发生率为12.0％,感染病原菌以革兰阴性菌为主,占88.7％;革兰阳性菌占11.3％;耐甲氧西林金黄色葡萄球菌11株,凝固酶阴性葡萄球菌6株,未检出耐万古霉素金黄色葡萄球菌及耐万古霉素肠球菌;肠杆菌科中大肠埃希菌产ESBLs株检出8株、肺炎克雷伯菌检出9株;多药耐药鲍氏不动杆菌18株、铜绿假单胞菌10株,多药耐药菌株分离率呈上升趋势.结论 神经外科病房分离的多药耐药菌出现的频率增加,加强耐药性监测,合理应用抗菌药物,并落实及时有效的消毒隔离措施,避免多药耐药菌在医院的暴发流行.     

Suboptimal chlorine treatment of drinking water leads to selection of multidrug-resistant Pseudomonas aeruginosa

The present study was undertaken to investigate the spectrum of bacteria present in the River Gomti water before and after chlorination for drinking purposes. We observed that the strains of Pseudomonas aeruginosa that survived chlorination on three out of seven occasions were resistant to almost all the antibiotics tested. The chlorine-resistant bacteria had mucoid colonies and grew better at 24 degrees C. All attempts to isolate the plasmid responsible for chlorine resistance were unsuccessful. Laboratory experiments using different strains of the P. aeruginosa in distilled water showed that only the resistant strain survived chlorine treatment at a dose of < or =500 microg/L. Similar results were obtained when water collected from seven different sites on the River Gomti was treated with graded doses of chlorine. At the higher dose of chlorine, all the bacteria died in 30 min, whereas with lower doses all the bacteria survived. The present study underscores the importance of measuring water chlorine concentrations to assure they are sufficiently high to remove pathogenic bacteria from drinking water. To our knowledge, this is the first report in the literature of the selection of multidrug-resistant bacteria by suboptimal chlorine treatment of water.     

医院感染多药耐药菌的临床调查与药敏分析

目的 了解医院感染多药耐药菌的分布及耐药性,提高预防感染水平,指导临床合理使用抗菌药物.方法 对2011年1-7月临床标本按常规进行病原菌分离,采用VITEK IMS全自动细菌鉴定与药敏分析仪,对病原菌进行鉴定.结果 共检出病原菌230株,其中多药耐药菌129株,检出率为56.1％;革兰阳性多药耐药菌检出率为4.8％,主要为金黄色葡萄球菌占0,9％,屎肠球菌占3.9％;革兰阴性多药耐药菌检出率为45.0％,主要为大肠埃希菌占16,9％、肺炎克雷伯菌占13.0％.结论 医院分离的多药耐药菌分布与卫生部公布的主要多药耐药目标菌有一定差异,提示临床医师在使用抗菌药物时应根据病原菌的分离株种类、耐药性特点及药敏试验,合理选用抗菌药物.     

南方某省5城市水厂供水中抗生素分布特征与健康风险评估

目的 建立饮用水中典型抗生素测定方法, 并应用于城市供水中抗生素浓度水平测定与健康风险评估。
方法 选择南方某省5个城市监测水厂作为研究对象, 采用固相萃取和超高效液相色谱串联质谱法测定水源水、出厂水、末梢水中48种抗生素分布情况, 并利用风险商法评价抗生素通过饮用水途径所致人体健康风险。
结果 水源水检出15种抗生素, 水样抗生素总质量浓度为63.31~114.74 ng/L (平均85.27 ng/L)。各水厂供水中检出6种抗生素, 其中出厂水抗生素总质量浓度为0.86~7.15 ng/L (平均2.96 ng/L); 末梢水中抗生素总质量浓度为0~8.08 ng/L (平均3.28 ng/L)。经过氯化、消毒等水处理工艺, 水源水中抗生素去除率为96.52%, 其中β-内酰胺类、林可酰胺类和磺胺类完全去除。各水厂供水健康风险商处于较低水平。
结论 监测点水厂供水中仅检出痕量抗生素, 不会对人体产生健康危害。
     

多药耐药菌的耐药性监测与分析

目的监测多药耐药菌(MDROs)耐药性,为临床合理用药、有效控制MDROs感染提供依据。方法用法国生物梅里埃公司生产的细菌自动鉴定仪分离鉴定菌株,药敏监测采用珠海迪尔生物工程有限公司生产的DL系产品进行最低抑菌浓度的检测。结果两年中临床科室病原学送检率由2009年的45.39%升至2010年的61.87%(P<0.05),MDROs在病原菌中的构成比由26.83%降至23.56%(P<0.05);检出的746株MDROs,其中革兰阳性菌占49.87%,革兰阴性菌占50.13%;大部分耐>7种常用抗菌药物;常见革兰阳性菌为肺炎链球菌、溶血性葡萄球菌及表皮葡萄球菌,对阿莫西林/克拉维酸、头孢唑林、磺胺甲噁唑/甲氧苄啶等抗菌药物耐药率均>80.00%;主要革兰阴性菌为产ESBLs的大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌,多药耐药铜绿假单胞菌,对哌拉西林、头孢噻肟等抗菌药物的耐药率均>50.00%。结论 MDROs对大部分常用抗菌药物耐药,应重视抗菌药物的合理应用,减缓细菌耐药性的增长。     

乐山地区多重耐药菌感染的临床分析与耐药性监测

目的 探讨乐山地区多重耐药菌(multidrug-resistant organism,MDRO)感染情况与耐药性。 方法 选择2017年1月—2018年12月在乐山市3家三甲医院住院患者送检的各类标本分离出的耐药菌为研究对象,进行细菌鉴定和药敏试验,分析MDRO的来源、临床分布和耐药性特征。 结果 2017年1月—2018年12月乐山市3家三甲医院共分离出非重复菌株13 287株,其中MDRO3 257株(占24.51%),MDRO主要为产超广谱β内酰胺酶(extended-spectrum β-lactamases,ESBLs)大肠埃希菌、产ESBLs肺炎克雷伯菌和多重耐药鲍曼不动杆菌(multi-drug resistance Acinetobacter baumannii,MDR-AB),MDRO标本主要来源为痰标本(44.67%)和尿液(19.25%);MDRO标本主要临床来源为重症监护室(intensive care unit,ICU)(19.19%),其次为新生儿科(15.23%)和神经外科(14.15%)。产ESBLs大肠埃希菌、产ESBLs肺炎克雷伯菌对美罗培南和亚胺培南敏感,MDR-AB对氨苄西林/舒巴坦敏感,多重耐药/泛耐药铜绿假单胞菌(MDR-PA/ PDR-PA)仅对左氧氟沙星敏感,耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌对替加霉素敏感,耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)对万古霉素、替加霉素敏感。 结论 乐山地区多重耐药菌以产ESBLs大肠埃希菌最多,其次为产ESBLs肺炎克雷伯菌和MDR-AB,临床治疗时应结合MDRO药敏结果合理使用抗菌药,严格掌握药物指征,同时积极采取预防措施,减少医院感染暴发流行。     

Occurrence of antibiotic resistance genes in reclaimed water and river water in the Werribee Basin, Australia

The purpose of this study was to investigate the occurrence of antibiotic resistance genes (ARGs) in water used for irrigation in the Werribee River Basin, Australia, including river water and reclaimed effluent water (reclaimed water). Samples of reclaimed water, collected over a one-year period, were screened for the occurrence of ARGs using PCR detection assays. The presence of ARGs in the reclaimed water samples were contrasted with that of water samples taken from the Werribee River Basin, collected over the same time period, from five points selected for varying levels of urban and agricultural impact. Of the 54 river water samples collected, 2 (4%), 2 (4%), 0 and 0 were positive for methicillin, sulfonamide, gentamicin and vancomycin-resistant genes, respectively, while 6 of 11 reclaimed water samples were positive for methicillin (9%) and sulfonamide (45%). The presence/absence of ARGs did not appear to correlate with other measured water quality parameters. The low detection of ARGs in river water indicates that, regardless of its poor quality, the river has not yet been severely contaminated with ARGs. The greater prevalence of ARGs in reclaimed water indicates that this important agricultural water source will need to be monitored into the future.     

肺结核患者下呼吸道医院感染病原菌的分布及耐药性分析

目的 探讨肺结核患者下呼吸道医院感染病原菌的分布及耐药现状,为临床选择抗菌药物提供参考依据.方法 病原菌培养与鉴定按照《全国临床检验操作规程》进行;药敏试验采用CLSI推荐的K-B法.结果 223株下呼吸道病原菌中,革兰阴性杆菌占78.5％,革兰阳性球菌占16.1％,真菌占5.4％;分离出的病原菌为多药耐药菌,对常用抗菌药物产生了严重的耐药性;MRSA的检出率为57.7％.结论 应采取有效的干预措施,降低肺结核患者医院感染的发病率.     

First investigations into the prevalence of Cryptosporidium and Giardia spp. in Hungarian drinking water

Safe drinking water is a top priority in preventing disease outbreaks and is of general concern to everyone. This study examines the occurrence of Cryptosporidium and Giardia in Hungarian drinking water supplies for the first time. A total of 76 raw and drinking water samples were examined using the U.S. EPA Method 1623. From these 15 of 34 (48.4%) raw water samples tested positive for Giardia and 7 (26.6%) for Cryptosporidium. Twelve of 45 (26.7%) drinking water samples were positive for Giardia and 6 (13.3%) for Cryptosporidium. Overall, Giardia cysts and/or Cryptosporidium oocysts were detected in 48% of the raw water samples and 35% of the drinking water samples. The highest levels in drinking water were found to be 3 oocysts/100 litres of Cryptosporidium and 63.6 cysts/100 litres for Giardia, enough to cause giardiasis. The highest levels in raw water were 1,030 cysts/100 litres for Giardia and 50 oocysts/100 litres for Cryptosporidium and higher oocyst densities were associated with source water receiving effluents from sewage treatment plants or originating from a forest environment. In addition to this monitoring, riverbank filtrated water and raw water from the River Danube in Budapest were monitored in order to ascertain protozoan removal efficiency of riverbank filtration (RBF). A total of 157 samples, including 87 samples from the River Danube and 70 samples post RBF, were examined. Cryptosporidium and Giardia were detected regularly in the river water but never in riverbank filtered water suggesting the effectiveness of RBF as a purification method.