淮南市新型冠状病毒核酸检测结果分析

目的建立新型冠状病毒SARS-CoV-2核酸检测方法,比较新型冠状病毒感染肺炎患者上下呼吸道标本核酸检测结果的差异,为临床诊断SARS-CoV-2感染,如何选择标本类型以及提高核酸阳性检出率提供参考。方法采集31例疑似新冠肺炎患者呼吸道标本,采用实时荧光定量RT-PCR方法对新型冠状病毒感染者的咽拭子和痰液标本进行双靶标(ORF1ab基因和N基因)核酸检测,应用卡方检验分析不同类型标本新型冠状病毒核酸阳性率的差异。结果 31份新型冠状病毒病例的咽拭子标本中,26份阳性,5份阴性,阳性率为83.8%;31份痰液标本中,29份阳性,2份阴性,阳性率为93.5%;两种标本检测结果差异无统计学意义(χ~2=1.449,P0.05)。不同发病时间患者咽拭子阳性率和痰液阳性检出率差异均无统计学意义(P=0.669)。比较咽拭子和痰液ORF1ab基因平均CT值(荧光信号达到设定的阈值时所经历的循环数),咽拭子较痰液高3.04; N基因CT值咽拭子较痰液高3.33。1例患者呼吸道标本阴性,肛拭子新冠病毒核酸阳性。结论咽拭子和痰液标本,均可用于SARS-CoV-2核酸检测。痰液ORF1ab基因和N基因CT均值低于咽拭子,更易检出,用于检测SARS-CoV-2更具优势。此外,呼吸道标本核酸检测阴性的患者,进一步检测消化道标本,对患者临床判断和疾病防控具有重要意义。     

入境人员集中隔离点房间新型冠状病毒污染状况分析

目的 了解入境人员集中隔离点房间新型冠状病毒污染状况,为集中隔离点规范管理提供科学依据。 方法 采集2021年12月18日—2022年1月16日入境人员集中隔离居住过的房间环境表面涂抹样本,用Real-Time PCR方法对新型冠状病毒核酸进行检测,并对房间污染状况进行分析。 结果 共采集房间环境标本21 150份,其中确诊病例房间35个,样本数为350份,检出新冠病毒核酸阳性25份,均在确诊病例房间内,检出率为7.14%(25/350),物品为马桶、门板、灯开关、地面、床头柜、洗漱台、桌面、遥控器等。81.81%(9/11)的奥密克戎变异株确诊病例房间内检出新冠病毒核酸阳性。 结论 新型冠状病毒肺炎(简称新冠肺炎)确诊病例隔离房间物体表面存在污染风险,尤其是奥密克戎变异株患者房间环境污染风险更高,应按相关要求落实闭环管理,采取严格隔离措施,规范做好消毒工作,才能切实阻断新冠肺炎交叉感染和外溢感染风险。     

82例新型冠状病毒肺炎确诊病例呼吸道和血液标本检测结果分析

目的 分析研究常德市82例新型冠状病毒肺炎(简称新冠肺炎)确诊病例呼吸道标本和血液标本检测结果,发现更多关于新型冠状病毒(简称新冠病毒)的特征和流行规律,为制定科学高效的防控策略提供依据。 方法 根据国家卫健委《新型冠状病毒感染的肺炎防控方案(第五版)》要求,收集常德市2020年1月24日—2月22日确诊的82例新冠肺炎确诊病例呼吸道标本和血液标本,进行新冠病毒和流感病毒核酸检测、血液常规及抗体检测,分析比较不同标本不同方法的检测结果,并进行统计分析。 结果 82例确诊病例标本中,呼吸道标本新冠病毒核酸检测阳性率为93.9%,流感病毒A/B核酸均为阴性,新冠病毒核酸阳性标本中,大部分标本Ct值分布在较高区间,病毒载量较低,重症病例Ct值与普通病例差异无统计学意义(P均＞0.05);血液标本新冠病毒IgM阳性率64.6%,IgG阳性率78.0%,阳性率明显低于核酸检测(χ²=24.059,P＜0.001);血液标本中C反应蛋白普遍偏高,白细胞总数正常或偏低,淋巴细胞总数正常或偏低,白细胞和淋巴细胞在不同性别间差异有统计学意义(χ² =7.165和χ² =3.998,P均＜0.05);血液标本中新冠病毒核酸检测结果均为阴性。 结论 新冠肺炎确诊病例发病早期呼吸道标本病毒载量不高,容易漏检,重症和普通病例标本病毒载量无差异,将呼吸道标本核酸检测和血液样本抗体检测及血常规分析等方法联合使用,可以相互补充,对疫情的有效防控和病例疗效观察具有重要作用。     

324份新冠病毒感染者咽拭子标本qRT-PCR检测结果分析

目的探讨新型冠状病毒(新冠病毒)感染后病毒载量变化规律,比较感染者不同种类标本核酸检测结果一致性。方法以2020年1月21日至2020年3月18日泉州市报告的48例新冠病毒感染者为对象,依据实时荧光定量反转录多聚酶链反应(qRT-PCR)咽拭子核酸检测结果,分为未复阳组29例和复阳组19例,回顾性分析所采集的324份咽拭子标本、55份深咳痰标本及36份肛拭子标本的核酸检测结果。结果未复阳组和复阳组发病到核酸检测CT值达峰值时间间隔分别为(7.1±4.8) d、(6.4±4.8) d,差异无统计学意义;未复阳组在CT值达峰值后病毒载量下降,发病后(20.7±5.7) d连续两次核酸检测阴性;复阳组病毒载量在CT值达峰值后病载下降中反跳出现第二峰,发病后(29.9±6.1) d连续两次核酸检测阴性,时间间隔比未复阳组长(t=-3.84,P0.01);不同种类标本(采集时间、对象相同)核酸检测结果比较显示,咽拭子标本与深咳痰标本检测结果Orf1ab基因一致性差、N基因一致性一般(Kappa值0.00、Kappa值=0.30);咽拭子标本与肛拭子标本检测结果Orf1ab基因一致性较差、N基因一致性一般(Kappa值=0.15、0.29);深咳痰标本两种基因检出率均高于咽拭子标本(配对χ~2值=6.50、15.43,P0.01)。结论新冠病毒感染者中未复阳组与复阳组病程中病毒载量变化峰型不同,且复阳组发病至连续两次核酸检测阴性时间间隔较长,原因有待探究;不同种类标本的核酸检测结果,以N基因结果一致性均略好,深咳痰、咽试子标本基因检出率前者高于后者。     

2010-2012年龙岗区手足口病标本病原学检测结果分析

目的了解不同情况下手足口病标本的病毒核酸检出情况,从而为手足口病疫情监测中标本的采集提供科学依据。方法利用SPSS13.0及Excel软件,通过描述性分析和χ2检验对龙岗区疾病预防控制中心实验室检测系统的手足口病检测信息进行统计分析。结果 2010年1月-2012年9月,共检测手足口病相关标本839份,共检出EV71和CoxA16病毒核酸342份(检出率为40.76%),其中EV71和CoxA16检出率分别为27.53%和13.23%;无标本检出EV71和CoxA16混合感染;不同年度手足口病标本的EV71检出率(χ2=16.63,P=0.00)和CoxA16检出率(χ2=14.45,P=0.00)之间差异有统计学意义;流行期送检标本的EV71检出率(30.72%,300/651)显著高于非流行期(16.49%,31/188)(χ2=14.81,P=0.00);发病3 d内采样标本的CoxA16阳性检出率(χ2=7.49,P=0.01)显著高于发病3 d后采样的标本;临床病例标本EV71病毒核酸检出率(χ2=9.31,P=0.00)显著高于暴发/聚集性疫情检出率;不同部位采集标本的EV71检出率(χ2=3.30,P=0.19)及CoxA16检出率(χ2=5.13,P=0.08)差异无统计学意义。结论 2010-2012年度龙岗区EV71和CoxA16均有流行,发病3 d内的咽拭子或肛拭子标本可较好的替代粪便标本用于手足口病疫情监测。     

从一起新冠病毒灭活疫苗成分污染标本案例分析新冠病毒核酸检测初筛阳性的快速复核

目的 对一起新冠肺炎防控重点单位人员标本新冠病毒核酸检测初筛阳性事件调查处置进行分析,为初筛阳性快速复核提供参考。 方法 制定初筛阳性定义,将复核内容划分为实验室检测复核和流行病学调查复核,并分析、探讨复核结果的判定。 结果 实验室检测复核结果:邵阳市疾病预防控制中心对原始标本的审查结果与初筛结果一致,CT值大于35;重新采集初筛阳性者的标本进行检测,全部为阴性。流行病学调查复核结果:标本在采集过程中使用的治疗推车15 d前曾被用于接种新冠病毒灭活疫苗,该治疗推车使用后未消毒,一直闲置至本次采样前;调查中对治疗推车表面采样进行新冠病毒核酸检测,结果为阳性(CT值为34.2);此外采样人员在采样过程中无菌操作不规范(剪刀剪断拭子后直接放置在治疗推车上),推测原始标本极可能被新冠病毒灭活疫苗成分污染。综合实验室检测复核和流行病学调查复核对本起初筛阳性事件予以排除。 结论 明确复核流程,实验室检测复核和流行病学调查复核同时开展,有利于加快初筛阳性复核速度;制定复核结果的判定依据,可为类似事件的处置和初筛阳性人员明确诊断提供参考。     

郴州市39例新型冠状病毒肺炎确诊病例病毒核酸检测结果分析

目的 分析郴州市39例新型冠状病毒肺炎(简称新冠肺炎)确诊病例不同时期不同标本的新型冠状病毒核酸检测情况,为新冠肺炎临床诊疗和管理提供科学依据。 方法 以郴州市新冠肺炎疫情期间确诊的39例新冠肺炎病例为研究对象,收集其从确诊、住院诊疗到院后康复管理过程中新型冠状病毒核酸检测的相关信息,描述不同阶段、不同标本的检测结果。 结果 新冠肺炎疫情期间,郴州市共完成了39例新冠肺炎确诊病例301人次核酸检测。新冠肺炎病例均以单独咽拭子标本核酸检测确诊,出院后随访复查采用同一病人不同种类标本联合检测为主。出院后病例新冠病毒核酸检测复阳率为12.82%。 结论 增加病例不同时期标本核酸检测次数和同一时期不同种类标本联合检测可提高阳性检出率,应对出院后病例“复阳”现象开展进一步研究并加强健康管理。     

某新冠定点救治医院新型冠状病毒奥密克戎变异株环境污染调查

 目的 评估新型冠状病毒奥密克戎变异株对病区公共环境及医务人员个人防护用品的污染情况。方法 对某新冠定点救治医院病区公共区域、脱卸区域和个人防护用品进行采样,采用实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)检测新型冠状病毒核酸并报告Ct值,分析个人防护用品新型冠状病毒阳性相关因素。结果 共采集病区公共区域环境标本100份,病区公共区域环境新型冠状病毒核酸检测总阳性率为30.00%,脱卸区电梯地面、走廊公共区域地面、脱卸电梯按钮新型冠状病毒核酸检测阳性率最高,分别为60.00%、60.00%、40.00%。一脱区和二脱区新型冠状病毒核酸检出率分别为18.33%、1.67%。48.33%的工作人员个人防护用品检出新型冠状病毒核酸,其中外层鞋套鞋底、外层手套和防护服检出率最高,分别为35.00%、21.67%、8.33%。单因素分析结果显示医生岗位和高风险操作医务人员个人防护用品新型冠状病毒核酸检测阳性率高(均P<0.05)。结论 新型冠状病毒奥密克戎变异株对病区公共环境、一脱区和个人防护用品可造成不同程度污染,做好个人防护和定期环境清洁消毒,可以降低医务人员感染风险。     

常熟市1例新型冠状病毒肺炎出院复阳病例的调查报告

目的 对常熟市1例新型冠状病毒肺炎(简称新冠肺炎)出院复阳病例的流行病学调查,为新冠肺炎病例出院后跟踪随访提供参考。 方法 按照国家卫生健康委员会《新型冠状病毒肺炎防控方案(试行)》要求对病例开展现场流行病学调查和接触者判定,采集病例、接触者等相关标本,采用荧光定量PCR法进行新型冠状病毒核酸检测,并对复阳再次入院至出院相关信息进行描述。 结果 该病例2020年1月7日自武汉坐高铁回常熟;1月20日,病例出现发热、肌肉酸痛和腹泻等症状,最高体温38.9 ℃;25日胸部CT报告显示两肺感染性病变;26日新型冠状病毒核酸检测阳性,27日省疾病预防控制中心复核阳性,经省专家组会诊确认为新冠肺炎确诊病例;2月15日治愈出院进行居家隔离观察;3月1日核酸复查阳性,即转至苏州定点医院进行观察治疗; 3月9日再次出院,进行集中隔离医学观察;24日核酸复查单靶阳性,29日、31日两次核酸检测阴性后解除集中隔离医学观察返回家中。 结论 该病例为一例新冠肺炎病例出院后复阳病例,提示在今后的疫情防控中,要进一步做好出院病例的跟踪随访和健康监测。     

738例新型冠状病毒肺炎病例密切接触者核酸筛查结果分析

 

目的 了解新型冠状病毒肺炎（简称新冠肺炎）病例密切接触者新型冠状病毒核酸检测及血常规结果。方法 选取2020年2月11-23日某定点隔离酒店内738例新冠肺炎病例密切接触且无明显临床症状的医学观察人员,采集其鼻咽拭子进行新型冠状病毒核酸检测,采集血标本进行血常规检测,并观察至隔离期结束。结果 738例医学观察人员新型冠状病毒核酸检测阳性70例（9.49%）,阴性664例（89.97%）,可疑4例（0.54%）,其中首次新型冠状病毒核酸检测阳性52例,可疑28例,阴性658例;对28例结果可疑者隔日重新采样检测,18例阳性,6例阴性,4例仍可疑（二次采样后观察期结束转至指定隔离观察点）。所有新型冠状病毒核酸检测阳性及可疑医学观察人员,血常规白细胞计数均正常,仅2例淋巴细胞计数减少。在第一个14 d观察期内,738例医学观察人员40例（5.42%）发病,其中70例新型冠状病毒核酸检测阳性者,42.86%（30例）出现发热、咳嗽、气促等临床症状;664例新型冠状病毒核酸检测阴性者,1.51%（10例）出现症状。所有确诊病例转至定点医院继续治疗;第一个观察期结束时,新型冠状病毒核酸检测未转阴者、结果仍可疑者送至指定隔离点继续观察。继续观察期中4.54%（2/44）出现症状被确诊,随即转至定点医院治疗;余下观察者新型冠状病毒核酸检测全部转阴。整个集中隔离期发病率为5.69%（42/738）。结论 新冠肺炎病例密切接触者新型冠状病毒核酸检测阳性人员中,潜伏期感染者所占比例较高,亦存在一定比例的无症状感染者,应尽早识别、诊断。