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相似文献
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1.
目的:检测小细胞肺癌(small cell lung cancer,SCLC)患者的血清蛋白多肽指纹图谱,分析SCLC患者与正常对照人群的蛋白表达差异,筛查其可作为潜在标记物的差异表达蛋白多肽.方法:应用液体蛋白芯片结合飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)技术对14例病理确诊的SCLC患者和32例正常对照人群进行血清蛋白组分析.采用Clin Pro Tools软件进行蛋白多肽的组间差异对比.结果:共获得57个蛋白多肽峰,其中18个蛋白多肽峰具有极显著差异(P<0.001),其中9个蛋白多肽在SCLC患者中表达下调,其余9个蛋白多肽在SCLC患者中表达上调.两组数据中最大差异的两个蛋白多肽峰分别是m/z:1451.43和m/z:4643.31.结论:利用液体芯片-飞行时间质谱技术可以从SCLC患者的血清中获得稳定丰富的蛋白多肽谱,且能够筛选出多个组间显著差异表达的蛋白多肽,可作为SCLC临床辅助诊断的潜在疾病标志物.  相似文献   

2.
 目的 运用弱阳离子磁珠(magnetic beads based weak cation exchange, MB-WCX)联合基质辅助激光解吸离子飞行时间质谱(matrix assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry, MALDI-TOF MS)建立结直肠癌血清蛋白组学诊断模型。方法 收集我院正常对照(健康体检者)、结直肠癌术前及术后患者血清标本各72例,弱阳离子磁珠分离血清多肽,MALDI-TOF MS建立正常对照、结直肠癌术前及术后患者血清蛋白表达谱,ClinProt Tools 2.0软件分析差异表达峰并建立诊断模型,液相色谱-电喷雾离子化质谱(liquid chromatography-eletronic spray ionization mass/mass, LC-ESIMS/MS)鉴定差异表达蛋白。结果 对比分析正常对照、结直肠癌术前及术后血清蛋白图谱,共发现80个差异表达峰,12个峰差异具有统计学意义(均P<0.01),与对照组相比,其中9个差异峰在结直肠癌术前的血清蛋白图谱中显示升高,术后显示降低,3个峰在结肠癌术前的血清蛋白图谱中显示降低,术后显示升高。遗传算法(genetic algorithm, GA)模型诊断结直肠癌的敏感度和特异性分别为99.31%和96.49%。GA模型中m/z: 2663.36、m/z: 4793.17和m/z: 5343.48的差异表达峰经鉴定分别为纤维蛋白原α前体亚型1(isoform 1 of Fibrinogen alpha chain precursor, FGA)、组蛋白赖氨酸甲基转移酶SETD7(histone-lysine N-methyltransferase SETD7, SETD7)和黏蛋白5AC(Mucin-5AC precursor, MUC5AC)。结论 血清蛋白质谱模型能够准确区分正常对照与结直肠癌患者,但尚需更进一步研究证实。  相似文献   

3.
目的:应用液体蛋白芯片-飞行时间质谱技术从胃癌患者血清中筛选潜在的标志蛋白.方法:采用液体蛋白芯片技术和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOF MS)对20例胃癌患者和20例正常人的血清蛋白谱进行检测,采用FlexAnalysis3.0和ClinProTools2.1软件进行图谱分析和统计学处理.结果:胃癌患者与正常人血清蛋白质谱比较,胃癌患者血清中有7个差异蛋白高表达,6个差异蛋白低表达,其中,差异最显著的两个蛋白的质荷比(m/z)分别是2863.71Da和4965.08Da.结论:利用液体蛋白芯片-飞行时间质谱技术可从血清中筛选出胃癌潜在的标志蛋白,此技术对于发现和筛选血清中的胃癌标志蛋白是一种很有前途的方法.  相似文献   

4.
李甜  谌宏鸣 《陕西肿瘤医学》2009,17(8):1513-1515
目的:应用液体蛋白芯片-飞行时间质谱技术从胃癌患者血清中筛选潜在的标志蛋白。方法:采用液体蛋白芯片技术和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术(MALDI—TOFMS)对20例胃癌患者和20例正常人的血清蛋白谱进行检测,采用FlexAnalysis3.0和ClinProTools2.1软件进行图谱分析和统计学处理。结果:胃癌患者与正常人血清蛋白质谱比较,胃癌患者血清中有7个差异蛋白高表达,6个差异蛋白低表达,其中,差异最显著的两个蛋白的质荷比(m/z)分别是2863.71Da和4965.08Da。结论:利用液体蛋白芯片-飞行时间质谱技术可从血清中筛选出胃癌潜在的标志蛋白,此技术对于发现和筛选血清中的胃癌标志蛋白是一种很有前途的方法。  相似文献   

5.
细胞因子诱导杀伤细胞对裸鼠胃癌移植瘤的靶向抑制作用   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的: 利用蛋白质组学基质辅助激光解析离子化飞行时间质谱(matrixassisted laser desorption/ionization timeofflight mass spectrometry, MALDITOF MS)技术检测食管癌患者血清蛋白指纹图谱,建立食管癌蛋白指纹图谱诊断模型,探讨其临床应用价值。方法: 收集河北医科大学第四医院2008年5月至9月间胸外科食管癌患者血清32例和健康志愿者血清28例,采用弱阳离子交换蛋白质芯片(WCX磁珠)提纯血清蛋白,MALDITOF MS技术进行血清蛋白质质谱检测,所得结果用ZUCI蛋白芯片数据分析系统进行分析。运用遗传算法结合支持向量机运算建立食管癌蛋白指纹图谱诊断模型;将60例标本随机分成训练组和盲法测试组,训练组为21名食管癌患者和19名健康人,盲法测试组为11名食管癌患者和9名健康人,验证诊断模型的特异性和敏感性。结果:采集食管癌患者和健康对照者的血清蛋白指纹图谱,经数据对比分析找到44个有显著性差异的质荷比峰(P<0.05);从中筛选出差异最显著的6个蛋白质荷比峰(m/z分别为2 210、2 864、6 634、4 068、2 083和8 131),并以此建立食管癌蛋白指纹图谱诊断预测模型;验证该模型诊断食管癌的特异性为88.9%、敏感度为100%。结论: 应用MALDITOF MS技术检测食管癌患者血清蛋白指纹图谱建立的食管癌蛋白指纹图谱诊断模型在食管癌的诊断中具有较高的敏感度和特异性。  相似文献   

6.
目的探索乳腺癌患者与健康人群的血清蛋白质谱差异,寻找能够帮助鉴别诊断乳腺癌的候选血清蛋白标志物。方法收集117例乳腺癌患者和56例健康人的血清标本,随机分为训练组(74例乳腺癌和36例健康人)与测试组(43例乳腺癌和20例健康对照)。采用表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI—TOFMS)技术检测所有血清标本的蛋白质谱。用Biomarker Wizard统计软件比较训练组乳腺癌与健康对照间的蛋白质谱差异,再用Biomarker Pattern软件筛选出一组差异蛋白构建决策分类树模型以鉴别乳腺癌病例和健康人群,最后用测试组对分类模型进行验证。结果乳腺癌组和健康对照组的血清蛋白质谱存在14个差异显著的蛋白峰,以质荷比分别为3958、4288、4974、5902、8518、8930、9282和11360的8个差异蛋白构建决策树分类模型,鉴别乳腺癌与健康对照组的敏感性为82.43%(61/74),特异性为83.33%(30/36),准确性为82.73%(91/110),用测试组进行验证的敏感性为86.05%(37/43),特异性为65.00%(13/20),准确性为79.37%(50/63)。结论乳腺癌与健康人群的血清蛋白质谱存在差异,SELDI—TOFMS技术筛选出的血清差异蛋白有助于乳腺癌的鉴别诊断。  相似文献   

7.
目的 探讨应用蛋白质组学技术研究淋巴瘤血清蛋白标志物并建立淋巴瘤人工神经网络诊断模型。方法 利用表面激光解析电离飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)及弱阳离子交换表面(CM10)蛋白芯片检测47例初诊淋巴瘤患者和21例正常对照血清蛋白质谱,采用CiphergenProteinchip软件对蛋白质谱进行差异蛋白分析,再优选4种蛋白质建立淋巴瘤诊断模型。结果 (1)淋巴瘤与正常对照的血清蛋白质谱之间有77个差异表达的蛋白质荷比峰(<0.05),其中35个蛋白有明显差异(<0.001),有8个蛋白质峰在淋巴瘤血清中高表达,27个蛋白质峰低表达。(2)霍奇金淋巴瘤(HL)与非霍奇金淋巴瘤(NHL)患者的血清蛋白质指纹图谱之间有2个差异表达的蛋白质荷比峰(<0.05),均在NHL中高表达。(3)淋巴瘤诊断模型的灵敏度为82.98%,特异度90.48%,诊断指数(DI)173.46%,Youden指数73.46%,阳性预测值95.12%,阴性预测值70.37%,ROC曲线下面积AZ为0.941。结论 淋巴瘤患者和正常对照血清之间存在特征性差异蛋白,可能对淋巴瘤的诊断和鉴别有重要意义。  相似文献   

8.
应用IMAC3蛋白芯片分析食管鳞癌患者血清蛋白质谱的变化   总被引:1,自引:0,他引:1  
Liu CZ  Zhu PY  Shi MX  Liu JB  Liao P  Xiang CQ  Zhang YX  Wang WJ 《癌症》2008,27(3):272-278
背景与目的:血清蛋白指纹图谱技术有助于筛选与食管上皮癌变相关的分子变化。本研究通过比较食管鳞癌患者与正常对照血清蛋白表达谱的差异,筛选食管鳞癌相关血清蛋白标志物并建立诊断模型,同时探讨其在食管鳞癌血清学诊断中的意义。方法:收集68例食管鳞癌患者和44例正常对照的血清,其中建模型组90例(55例为食管鳞癌,35例为正常对照),盲法筛选组22例(13例为食管鳞癌,9例为正常对照)。采用固定金属亲和表面(immobilized metalaffinity capture,IMAC3)芯片,经表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(surface enhanced laser desorption/ionization-time of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)测定得到蛋白质谱,通过Biomarker Wizard软件比较两组人群的血清蛋白质谱的差异,经生物信息学分析得到决策树模型并进行盲法验证。结果:在质荷比(m/z)1.5~20ku范围内,共检测到78个有效蛋白峰,其中25个峰差异有统计学意义(P<0.001)。对建模型组的蛋白质谱数据,通过1000次随机抽样,得到1000个决策树。结合3倍交叉证实方法,构建了"食管鳞癌-正常对照"分组诊断的20个决策树模型。用这20个决策树来对22个盲法筛选样本进行归类预测,预测正确的样本为18个,盲法验证的灵敏度为92.31%,特异度为66.67%。结论:应用SELDI-TOF-MS技术可以筛选出食管鳞癌相关的血清蛋白标志,建立的决策树模型可以对食管鳞癌做出较为准确的预测判断。  相似文献   

9.
SELDI-TOF-MS技术检测肺腺癌血清生物标志物   总被引:6,自引:0,他引:6  
[目的]用表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术寻找肺腺癌病人血清蛋白标志物,探讨吸烟与肺腺癌血清中蛋白质组谱变化的关系。[方法]收信肺腺癌病人和正常对照人群血清各50例,按照年龄、性别、吸烟史进行一一配对,采用WCX2芯片技术对血清蛋白进行捕获,用蛋白芯片阅读器PBSⅡ对芯片进行扫描、分析。[结果]肺腺癌病人血清蛋白图谱与正常对照组相比,存在10个差异表达蛋白(P<10^5),其中包括6个高表达蛋白,分子量分别是4050Da、4205Da、5329Da、5899Da、7761Da、9285Da,4个低表达蛋白,分子量分别是2564Da、2932Da、3082Da、3442Da。肺腺癌病人有吸烟史的与不吸烟的进行比较,血清蛋白表达差异无显著性(P>0.01)。[结论]SELDI-TOF-MS技术能筛选出灵敏度和特异性较好的差异蛋白,为肺腺癌的早期发现提供了一种新的、无创实验方法。  相似文献   

10.
目的:应用SELDI-TOF-MS技术寻找食管鳞癌血清中相关差异表达蛋白。方法:应用表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术,用WCX2芯片分析了24对食管鳞癌和正常对照的血清蛋白表达谱。结果:与正常对照相比,发现其中6个血清蛋白在食管鳞癌和正常对照组的差异有统计学意义(P<0.05),其中在食管鳞组低表达的有M/Z为4623,5012,5809和9422,而高表达的有5910,11681。结论:SELDI-TOF-MS技术是一种快速、简便易行且高通量的分析方法,不仅能直接筛选出食管癌患者血清中差异表达的潜在标记物,而且可能具有较好的临床应用前景。  相似文献   

11.
目的:应用液体蛋白芯片飞行时间质谱系统分析胃癌患者血清蛋白质表达谱,寻找具有潜在诊断意义的血清标志物。方法:收集血清样本62 例,其中正常对照组(N 组)16 例,胃癌组(T 组)28 例,验证组18 例。经WCX磁珠纯化、MALDI-TOF-MS 及ClinproTools生物信息学方法研究其血清蛋白表达谱,并筛选出差异蛋白质峰,运用数据挖掘算法,构建胃癌的血清蛋白诊断模型,并在验证组中验证其准确性。结果:1)通过对比胃癌组和正常组的血清蛋白质谱图,分析得到 25 个具有显著差异的蛋白质峰,其中差异最显著的前两位质核比分别为 5 248.49 m/z和5 754.25 m/z,其灵敏度分别为 84 .61 %和73 .07 %,特异性分别为 100%和93 .75 %,能很好地区分胃癌组和正常组。2)通过 ANN 的数据挖掘的方法,在具有显著差别的 25 个蛋白质峰中,筛选了组合能力最强的6 个蛋白峰(分别为4 268.05 m/z、5 636.53 m/z、5 248.49 m/z、2 933.15 m/z、1 450.13 m/z和1 349.4m/z),建立了胃恶性肿瘤的诊断模型,其识别率为100%,预测能力为 90 .59 %,准确性为 100%。将已知信息的验证组 18 例分别代入已建立的模型,特异性和灵敏性分别为75 %和100%。结论:液体蛋白芯片飞行时间质谱系统作为研究蛋白表达谱的工具,能够用于筛选潜在的胃恶性肿瘤的血清标志物,利用其优点并结合统计学的方法,建立血清学胃癌的诊断模型,能为胃恶性肿瘤的筛查提供帮助。   相似文献   

12.
Objective: The present study aimed to determine peptidome patterns in breast cancer (BC). Methods: We analyzedthe plasma proteomic profiling of 80 BC patients and 50 healthy controls, using hydrophobic interaction chromatographymagnetic beads (MB-HIC8) separation followed by Matrix assisted laser desorption ionization/ time of flight massspectrometry (MALDI-TOF MS). Results: ClinProTools software identified 92 peaks that differed among the analyzedgroups, 33 peaks were significantly different (P < 0.05). Of those, 22 peaks were up-regulated while 11 peaks weredown-regulated in BC patients compared with the healthy controls. Three peptide ion signatures (m/z 1,570.31, 1,897.4and 2,568.17) were provided by the Quick Classifier model to discriminate BC patients from healthy control subjectswith 96.4% accuracy. External validation was performed by an independent group and this achieved a sensitivity of100% and a specificity of 76.9%. Conclusion: MALDI-TOF MS has good analytical performance in distinguishingBC patients from healthy controls.  相似文献   

13.
目的寻找高级别浆液性卵巢癌相关的血清标志,并评价其诊断价值。方法收集2006-07-17-2011-03-30浙江省肿瘤医院卵巢癌血清样本165例,均经病理确诊。采用纳米磁珠结合基质辅助激光解析离子化飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)技术,检测95例高级别浆液性卵巢癌患者、34例其他上皮性卵巢癌患者、36例卵巢良性肿瘤患者和70名健康志愿者血清样本,并获得血清多肽谱。采用Biomarker Wizard软件分析所获得的多肽谱找出差异蛋白,进一步采用SPSS 12.0中ROC曲线分析差异蛋白,评价其诊断灵敏度和特异性。结果通过34例高级别浆液性卵巢癌患者和34名年龄匹配的健康人群血清多肽谱比较筛选出8个差异峰,P〈0.0001。进一步扩大样本量,经分析ROC曲线面积〉0.9的有2 742、8 568和8 692m/z 3个差异峰;当差异峰2 742m/z取临界值24.31时,其诊断敏感性和特异性分别为90%和84.2%,其中早期卵巢癌诊断敏感性为82.35%。早期(Ⅰ、Ⅱ)与晚期(Ⅲ、Ⅳ)高级别浆液性卵巢癌比较有3 163、4 180和4 288m/z 3个差异峰,P〈0.01,其ROC曲线面积均〉0.7;其中3 163m/z鉴别早晚期高级别浆液性卵巢癌敏感性和特异性分别为52.9%和88.5%。高级别浆液性卵巢癌患者与其他上皮性卵巢癌患者比较无明显差异峰。高级别浆液性卵巢癌患者和卵巢良性肿瘤患者比较有13745、15930和28111m/z 3个差异峰,P〈0.01,ROC曲线面积〉0.7的差异峰有15930和28 111m/z;其中15930 m/z的鉴别诊断敏感性和特异性分别达到52.6%和80.6%。结论 2 742m/z差异蛋白对于早期高级别卵巢癌具有较高的诊断价值,3163m/z在早期和晚期高级别浆液性卵巢癌患者的鉴别诊断中有一定价值,15930m/z对于高级别浆液性卵巢癌和良性卵巢肿瘤鉴别诊断有一定的价值。  相似文献   

14.
Objective: To investigate discriminating protein patterns and potential biomarkers in serum samples betweenpre/postoperative pancreatic cancer patients and healthy controls. Methods: 23 serum samples from PC patients(12 preoperative and 11 postoperative) and 76 from healthy controls were analyzed using matrix-assisted laserdesorption and ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) technique combined with magneticbeads-based weak cation-exchange chromatography (MB-WCX). ClinProTools software selected several markersthat made a distinction between pancreatic cancer patients and healthy controls. Results: 49 m/z distinctive peakswere found among the three groups, of which 33 significant peaks with a P < 0.001 were detected. Two proteinscould distinguish the preoperative pancreatic cancer patients from the healthy controls. About 15 proteins maybe potential biomarkers in assessment of pancreatic cancer resection. Conclusion: MB-MALDI-TOF-MS methodcould generate serum peptidome profiles of pancreatic cancer and provide a new approach to identify potentialbiomarkers for diagnosis and prognosis of this malignancy.  相似文献   

15.
目的 分析食管鳞状细胞癌(ESCC)患者血清蛋白表达谱的改变;比较有无淋巴结转移(LM)的患者血清蛋白指纹图谱,筛选与LM相关的蛋白峰.方法 术前收集64例ESCC患者和60名性别、年龄相匹配的健康成年人的血清.采用弱阳离子交换型(WCX-2)蛋白芯片为检查介质,经SELDI-TOF-MS测定蛋白指纹图谱.行有癌和无癌的对照研究;ESCC患者组内分别按性别、年龄、肿瘤位置、肿瘤大小、浸润程度和有无LM分别进行对照,得到蛋白指纹图谱并用Biomarker Wizard软件分析比较.结果 在质量/电荷(m/z)0~50000范围内,ESCC与健康成年人血清检测出120个蛋白峰,其中31个蛋白峰差异有统计学意义(P<0.05);不同浸润程度分组对比,T1与T3、T4比较有1个m/z是4174的差异蛋白峰(P<0.05);有无LM组间,3个蛋白峰差异有统计学意义(P<0.05),m/z分别为3970、4174、和4277.其中m/z为4174的蛋白峰是浸润组和LM组所共有的;年龄、性别、肿瘤位置、肿瘤大小分组未发现差异蛋白峰.结论 ESCC患者组和健康成年人组比较,血清蛋白有显著差异;ESCC浸润程度的不同和有无LM血清蛋白指纹存在一定差异,但远较ESCC与健康成年人之间差异小;浸润程度严重和LM在血清蛋白指纹中存在着一定的共性.  相似文献   

16.
宫颈癌患者血清蛋白指纹图谱的检测及其意义   总被引:1,自引:0,他引:1  
Xia T  Zheng ZG  Gao Y  Mou HZ  Xu SH  Zhang P  Zhu JQ 《癌症》2008,27(3):279-282
背景与目的:目前针对宫颈癌没有特异性的肿瘤标志物。表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(surface-enhanced laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)是最新应用的一项检测肿瘤标志物的技术。本研究应用SELDI-TOF-MS检测宫颈癌患者血清蛋白指纹图谱,筛选候选肿瘤标志物并建立诊断模型,初步探讨其在宫颈癌早期诊断中的价值。方法:取91例早期宫颈鳞癌患者和15例宫颈上皮内瘤变Ⅲ级(cervical intraepithelialneoplasia,CINⅢ)患者的血清标本进行实验,同时用55名健康人血清作为对照。用弱阳离子交换芯片(weak cation exchange,WCX2)检测各血清标本获得血清蛋白指纹图谱。用Biomarker Patterns软件分析宫颈癌差异蛋白并建立诊断模型。通过盲法分析进一步验证诊断模型的可靠性,并对结果进行统计学分析。结果:在分子量1.5~20ku范围内,共检测到122个蛋白峰,其中19个差异峰有统计学意义(P<0.001)。建立了由分子量为3977和5807的两个差异蛋白组成的宫颈癌诊断模型,其敏感性为97.29%(36/37),特异性为83.78%(31/37)。扩大样本盲法验证结果,其敏感性为94.44%(51/54),特异性为94.44%(17/18)。结论:由3977和5807两个差异蛋白组成的宫颈癌诊断模型有助于区分宫颈癌和健康人群。  相似文献   

17.
陈兵  何健  曾昭冲  杜世锁  杨平 《肿瘤》2012,32(8):643-649
目的:应用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)系统分析原发性肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)骨转移患者血清多肽差异谱,寻找具有潜在诊断意义的血清分子标志物.方法:收集50例HCC骨转移患者和50例HCC未骨转移患者的血清,分成训练组(76例)和验证组(24例).所有样本分别经ClinProt磁珠纯化、MALDI-TOF-MS检测及ClinProTools软件进行血清多肽差异谱分析.应用液相色谱质谱联用的方法对差异多肽进行序列鉴定.应用径向基神经网络(radial basis function neural network,RBFNN)算法建立诊断模型,并对诊断模型进行单盲法实验验证.结果:HCC骨转移患者中,共获得10条差异有统计学意义[P (Wilcoxon-test)<0.001]的多肽峰,并成功鉴定了其中7条肽段(质荷比分别为1 780.7、1 866.5、2 131.6、2 880.4、1 532.4、2 489.8和2 234.3)的氨基酸序列,这些肽段的来源蛋白分别为甲胎蛋白(alpha-fetoprotein)、凝血酶原(prothrombin)、丝甘蛋白聚糖(serglycin)、交联-α-胰蛋白酶抑制物H4重链异构体2(isoform 2 of inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H4)、自噬相关蛋白16-2异构体1(isoform 1 of autophagy-related protein 16-2)、转甲状腺素蛋白(transthyretin)和纤维蛋白β链(fibrinogen beta chain).选取2组间统计学差异最显著的6条多肽峰(质荷比分别为1 535.4、1 780.7、1 866.5、2 131.6、2 880.4和2 901.9)建立的诊断模型的识别率为89.47%,预测率为82.89%;单盲法验证模型的灵敏度为83%,特异度为92%.结论:筛选获得的差异血清多肽可能成为潜在的诊断HCC骨转移的分子标志物.  相似文献   

18.
目的探索乳腺癌与乳腺良性疾病和健康人血清蛋白质谱表达差异,寻找具有鉴别诊断意义的血清蛋白标志物。方法实验分为两大组:(1)决策树模型组共293例标本,包括3个亚组,分别为乳腺癌组110例标本、乳腺良性疾病组113例和健康组70例,建立决策树(乳腺癌诊断)模型;(2)盲法验证组共34例标本,包括3个亚组分别为乳腺癌组7例标本、乳腺良性疾病组13例及健康组14例,进行盲筛验证决策树模型。采用弱阳离子磁珠捕获乳腺癌患者血清中的蛋白,使用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI—TOF—MS)仪检测绘制蛋白峰。应用Biomarker Wizard TM3.1软件和Biomarker Patterns TM5.0软件分析数据。统计分析采用方差分析法和秩和检验法。计算决策树模型诊断的准确率以及盲法验证模型诊断乳腺癌的敏感性和特异性。结果在决策树模型组中检测到了47个差异有统计学意义的蛋白峰(P〈0.050)。应用BPS5.0软件,以相对损失最小的原则从这47个蛋白峰中选取了4个蛋白峰,分别为相对分子质量(Mr,本文中相当于质荷比m/z)9292.5、Mr11707.2、Mr15504.5和Mr16107.9,用其建立决策树模型(乳腺癌诊断模型)。该模型判断乳腺癌、乳腺良性疾病及健康人的准确率分别为99.09%、95.58%、92.86%。盲法验证该模型诊断乳腺癌的敏感性为71.43%,特异性为88.89%。结论应用MALDI—TOF—MS联合磁珠技术可以检测乳腺癌血清中差异蛋白峰并可以建立决策树(乳腺癌诊断)模型。选择的4个差异蛋白蜂建立的决策树模型诊断乳腺癌具有好的准确性和较好的敏感性及特异性。决策树模型能将乳腺癌与乳腺良性疾病及健康人相鉴别。寻找到的Mr9292.54、Mr11707.2、Mr15504.5以及Mr16107.9的蛋白峰有望成为鉴别乳腺癌与乳腺良性疾病和健康人的有效的肿瘤血清蛋白标记物。  相似文献   

19.
目的研究原发性肝癌患者与健康人血清蛋白质表达的差异性,寻找对原发性肝癌更有效的肿瘤诊断标志物。方法应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI—TOF—MS)技术检测50例原发性肝癌患者、50名健康对照者血清中的蛋白质谱,寻找有意义的蛋白质谱。同时采用双抗体夹心法检测血清甲胎蛋白(AFP)。结果原发性肝癌患者血清4个蛋白质峰与健康对照组比较差异有统计学意义。分别为:3354.71,8825.80(高表达),4345.08,13715.01(低表达)。从中筛选出质荷比(M/z)分别为3354.71、8825.80差别最显著的蛋白质峰,使用这两个蛋白质峰作为原发性肝癌的诊断模式,其灵敏度、特异度分别为90%(45/50),94%(47/50)。100例患者中,AFP阳性27例,灵敏度为54%(27/50),特异度为100%(30/30)。结论SELDI—TOF—MS蛋白质芯片技术在原发性肝癌的诊断及肿瘤特异性蛋白质生物标志的筛选中具有一定的价值,灵敏度和特异度较高,操作简单,正确诊断指数(r=83)优于AFP(r=53)。  相似文献   

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