代谢相关基因在先兆子痫胎盘中的表达情况分析

目的探讨细胞代谢相关基因在先兆子痫胎盘组织中的表达变化及其影响机制。方法使用含12000个与代谢、凋亡、细胞粘附、信号传导、转录因子等有关基因的cDNA表达谱芯片,检测4例重度妊娠高血压疾病子痫前期及正常的胎盘组织的基因表达谱差异,并差异表达的细胞代谢相关基因进行了Northern验证。结果4先兆子痫胎盘中同时有44种基因表达发生了变化,其中糖原磷酸化酶（GP—M）基因、瘦素（1eptin）基因、脂蛋白酯酶（LPL）基因及糖代谢相关基因（Glucose transporter）表达增强,核苷酸代谢基因（CD73）与能量代谢调节基因（Creatine kinase B）表达下降。结论多种基因表达异常与先兆子痫的病理发生有关,细胞代谢相关基因表达异常可能是血管内皮损伤的原因之一。     

凋亡及免疫激活相关基因在先兆子痫胎盘中的表达

目的：探讨细胞凋亡相关基因在先兆子痫胎盘组织中的表达谱及其影响机制。方法：采用分别包含220余种人类细胞因子相关基因或人类环境激素相关基因cDNA片段的基因芯片，检测严格配伍的先兆子痫和正常胎盘组织中基因表达谱的差异。结果：先兆子痫胎盘中与细胞增殖周期调控及凋亡相关的多种基因表达发生了变化，且大多数呈现表达增强。此外，与免疫系统激活有关的多条基因在先兆子痫胎盘中的表达也比正常胎盘高。结论：胎盘组织中多种与细胞凋亡调节有关的基因表达异常与先兆子痫的病理发生有关，而免疫系统激活也可能是其原因之一。     

应用基因芯片研究代谢相关基因在先兆子痫胎盘中的表达

目的:研究部分代谢相关基因在先兆子痫胎盘组织中的表达变化。方法:采用包含220余种人类环境激素相关基因cDNA片段的基因芯片,对经过严格配伍的正常和先兆子痫胎盘组织中基因表达谱的差异进行检测。结果:先兆子痫胎盘中与氧化还原代谢相关的基因(GenBank:U78168、X16699、D32143、AL035079、AF069668、X53463、J03746、X02317、X91247等)表达增高。另外,与激素等其它代谢相关的一些基因(如GenBank:NM_-001718、Z22535、M38180、M76665、X75252、J03258、U56725)在先兆子痫胎盘中的表达也增强。结论:胎盘内基因表达的变化与先兆子痫患者体内多种代谢改变有关。     

滋养层细胞侵入相关基因在先兆子痫胎盘中的表达

探讨与滋养层侵入有关的细胞外基质分子相关基因在先兆子痫胎盘中的表达，采用分别点样有220余种人细胞因子相关基因和人类激素相关基因cDNA片段的两款基因芯片，检测经过严格配伍的先兆子痫和正常胎盘组织的基因表达谱差异。结果显示：钙粘蛋白、胶原、整合素、选择蛋白等18种细胞外基质分子基因的表达在先兆子痫和正常胎盘组织间相差2倍以上，且全部表现为在先兆子痫胎盘中的表达增强。先兆子痫患者的胎盘组织中基质金属蛋白酶(MMP)-10、-13、-15和金属蛋白酶组织抑制因子(TIMP)-2、TIMP-3、纤溶酶原、纤溶酶原激活物等的表达均较正常者高。提示胎盘中细胞外基质分子及其降解酶基因表达异常可能与先兆子痫的病理发生关系密切。     

白细胞介素及肿瘤坏死因子基因超家族在先兆子痫胎盘中的表达

为探讨白细胞介素和肿瘤坏死因子 (受体 )超家族基因表达与先兆子痫病理发生的关系 ,以包含 2 4 3种人类细胞因子相关基因cDNA片段的基因芯片 ,检测严格配对的先兆子痫和正常胎盘组织中基因表达谱的差异。结果显示受检的白细胞介素和 (或 )白细胞介素受体基因共 2 2种 ,绝大多数基因在先兆子痫胎盘中的表达增强 ,而IL 2受体 (IL 2Rα )基因 (Gen Bank :X0 10 5 7)在先兆子痫胎盘中的表达低于正常胎盘。肿瘤坏死因子 (GenBank :X0 2 910 )及其配体 (GenBank :U0 3398、U375 18、AF0 5 3712、AF0 5 5 872 )、受体 (GenBank :X6 0 5 92、X6 3717、M835 5 4、AF0 16 2 6 6、AF0 16 2 6 7、U812 32 )等 10余种肿瘤坏死因子 (受体 )超家族基因在先兆子痫胎盘中的表达也较高。说明 ,白细胞介素及肿瘤坏死因子 (受体 )基因超家族的高表达可能与先兆子痫的病理发生关系密切     

脂蛋白脂酶基因在子痫前期胎盘中的变化及意义

目的研究脂蛋白脂酶(lipoproteinlipase,LPL)mRNA在于痫前期患者胎盘组织中的表达与定位,探讨其在子痫前期病理生理过程中的作用。方法利用cDNA表达谱芯片检查子痫前期胎盘组织与正常胎盘组织之间的差异表达基因;根据筛选结果,采用半定量RT-PCR检测子痫前期患者胎盘组织(研究组)和正常孕妇胎盘组织(对照组)中LPLmRNA的表达;以原位杂交方法进行定位。结果在4轮杂交过程中,共筛选出22条有差异表达的基因,其中LPL基因为表达降低基因之一;正常胎盘组织和子痫前期胎盘组织中均存在LPLmRNA,子痫前期胎盘组织中LPLmRNA表达明显低于正常胎盘组织(0.208±0.067vs0.524±0.139,P<0.05);LPLmRNA分布在胎盘绒毛滋养细胞胞浆。结论胎盘组织中LPL的低表达可能参与子痫前期的发病过程。     

基因芯片筛选妊娠高血压综合征胎盘差异表达基因

目的了解妊高征患者胎盘与正常胎盘在分子水平的差异,为研究妊高征病因提供新的线索.方法以混合的4例正常胎盘总RNA为对照,用cy5dUTP和cy3dUTP分别标记对照cDNA和妊高征胎盘cDNA.用4000点cDNA表达谱芯片检查4例妊高征患者胎盘基因表达的改变.结果在4次芯片杂交过程中,分别有58-131条不等的基因发生差异表达,其中出现2次以上重复一致的异常表达基因共22条:表达增高的有13条,表达降低的有9条.结论应用cDNA表达谱芯片可快捷、高通量地筛选出妊高征胎盘可能的致病基因,为研究妊高征的病因提供新的思路和线索.     

伤寒减毒活疫苗Ty21a免疫前后小鼠肠细胞差异表达的基因

以基因表达谱芯片对Ty2 1a免疫前后小鼠肠细胞 (包括肠粘膜上皮细胞和肠上皮间淋巴细胞 )基因表达的差异性进行研究比较。将 490条经抑制消减杂交法筛选出的与小鼠Ty2 1a免疫相关的cDNA制备成表达谱芯片 ;利用免疫前后小鼠肠细胞的mRNA通过逆转录方法 ,将Cy3和Cy5两种荧光分别标记到两种组织的cDNA上 ,制备成cDNA探针 ,并与表达谱芯片进行杂交及扫描 ,单点重复 2次实验 ,通过计算机数据处理判定基因是否在上述两种细胞群中有表达差异。筛选出差异表达基因共 98条 ,其中 92条为表达上调基因 ,6条为表达降低基因。提示 ,基因表达谱芯片技术是高通量进行基因表达模式研究的方法 ,可同时定量研究大量的基因表达水平 ,从而鉴定可能参与免疫的基因。     

实验性肺纤维化相关基因的表达谱研究

目的：通过研究小鼠肺纤维化组织和正常肺组织基因的差异表达，寻找与纤维化相关的基因。方法：以包含4 096个cDNA基因表达谱芯片研究不同时间肺纤维化的基因表达谱。结果：共筛选出差异表达基因271条，包括高表达的炎性基因43条和与细胞外基质代谢有关的基因46条，112条基因表达下降。结论：基于cDNA微矩阵技术的肺纤维化基因表达谱能够高通量筛选与肺纤维化发生密切相关的基因。     

转录因子XBP1S基因表达谱差异分析

目的 应用基因表达谱芯片技术了解XBP1S在肝细胞中可能上调或下调的基因,了解其可能的调节功能线索.方法 构建pcDNA3.1(-)-XBP1S真核表达载体,转染HepG2细胞,同时以空载体pcDNA3.1(-)处理相同细胞系作为对照.48 h后制备细胞裂解液,提取mRNA,应用基因表达谱芯片技术对差异表达mRNA进行检测和分析.结果 构建的表达载体经过限制性内切酶分析和DNA序列测定,证实准确无误,提取高质量的总mRNA并进行逆转录成为cDNA,进行基因表达谱芯片技术分析.经过差异基因表达谱的筛选,发现HepG2细胞转染XBP1S以后,有38个基因表达水平显著上调,30个基因表达水平显著下调.结论 成功构建XBP1S的真核表达载体pcDNA3.1(-)-XBP1S,运用基因表达谱芯片技术成功筛选了XBP1S转染细胞后的差异表达基因,这些差异表达基因包括细胞周期、蛋白质的翻译合成及运输、能量代谢、体内免疫调节、细胞凋亡及细胞内的信号转导等方面起重要作用及肿瘤发生相关的基因,为进一步阐明XBP1S可能存在的调控机制及XBP1S蛋白可能的生物学功能提供理论依据.     

常染色体显性多囊肾组织差异表达基因的初步研究

目的应用基因芯片技术及最新公共数据库，筛选常染色体显性多囊肾组织中差异表达的基因，对其进行功能分类，并对其中1条基因利用原位杂交技术进行验证。方法将代表8398条人类基因的PCR产物制成基因芯片。将等量的多囊肾组织和正常肾组织mRNA分别用Cy5、Cy3荧光标记，逆转录合成cDNA探针，混合后与上述基因芯片杂交。扫描杂交信号荧光强度，找出差异表达基因，对获得的基因进行分子生物信息学分析。并对其中的上调表达基因IGF1 mRNA进行原位杂交，验证基因芯片结果的准确性。结果（1）在进入研究的8398条基因中，共发现357条差异表达基因。94条基因在多囊肾组织中低表达，263条基因高表达；（2）上调表达基因主要属于原癌基因，细胞骨架蛋白和运动相关蛋白，凋亡相关蛋白，细胞信号和传递蛋白，细胞因子；下调表达基因主要属于抑癌基因，DNA结合、转录和转录因子，细胞信号和传递蛋白，参与代谢的基因；（3）IGF1 mRNA原位杂交结果与芯片结果一致。结论基因表达谱芯片可快速、高效地筛选差异表达基因；多囊肾病的发生、发展中存在着多种不同功能基因表达调控的改变。     

Global analysis of differentially expressed genes in early gestational decidua and chorionic villi using a 9600 human cDNA microarray

The global gene expression profiles of the decidua and chorionic villi of early human pregnancies were analysed by using cDNA microarray technology. Decidual and villous placental tissues were obtained from first trimester abortus and mRNA was extracted for cDNA microarray analysis. The human cDNA microarray [9600 clones, including known regulatory genes and expressed sequence tags (EST)] with colorimetric detection was used to identify differentially expressed genes between early gestational decidua and villi. According to cDNA microarray analysis, we have identified 641 genes with highly expressed mRNA in both decidua and villi, 49 genes with higher expressions in decidua, and 75 genes with higher expression in chorionic villi. These differentially expressed genes were further grouped into categories by their putative functions, including: cell growth-related factors, hormones/cytokines, cell adhesion molecules, signal transduction molecules, apoptosis-related factors, cytoskeleton/extracellular matrix proteins, and EST. Immunohistochemical stainings of cathepsin L, leukaemia inhibitory factor-receptor, and proliferative cell nuclear antigen showed results consistent with the microarray data. Identification of the differentially expressed genes between decidua and villi by microarray provide a global profiling of the gene expression pattern. This work adds to our understanding of placentation by reporting the gene expression profiles during first trimester human pregnancies using cDNA microarray.     

应用基因芯片技术对Graves病免疫相关基因的研究

应用基因芯片技术研究Graves病 (GD )和正常成人甲状腺组织免疫相关基因的差异表达。分别用Cy5和Cy3两种不同的荧光染料通过逆转录反应将GD组和对照组甲状腺组织的mRNA分别标记成探针 ,并与载有一组靶基因的基因表达谱芯片进行杂交。通过扫描荧光强度 ,计算机软件分析 ,寻找两组差异表达基因。GD组和正常对照组之间共筛选出 80条差异表达基因 ,其中表达增加的基因有 31条 (2 0倍以上 ) ,表达降低的基因有 4 9条 (0 5倍以下 )。基因表达谱芯片筛选GD与正常成人甲状腺组织差异表达基因具有样品用量少、高速度、高敏感、高通量等特性。通过筛选所得差异基因提示GD的发病涉及细胞因子、受体信号转导等多个方面 ,为进一步阐明GD的发病机制提供新线索。     

Lovastatin对肝癌HepG2细胞作用后基因差异表达的初步研究

目的： 用cDNA芯片观察lovastatin作用前后HepG2细胞的差异表达基因。 方法： 20 μmol/L的lovastatin作用于HepG2细胞18 h，各提取实验组与对照组细胞总RNA，用cDNA直接标记法制备探针，进行杂交，杂交信号经扫描后，用软件分析基因表达情况。应用RT-PCR验证部分差异表达基因。 结果： Lovastatin作用后表达上调的基因有30个，表达下调的基因有11个，涉及信号转导、肿瘤免疫、细胞周期等方面，RT-PCR结果符合基因芯片结果。 结论： 用基因芯片筛选出的lovastatin作用后的肝癌细胞差异表达基因为深入研究他汀类药物的抗肿瘤机制提供重要的理论依据。     

Microarray analysis using amplified mRNA from laser capture microdissection of microscopic hepatocellular precancerous lesions and frozen hepatocellular carcinomas reveals unique and consistent gene expression profiles

The indirect labeling cDNA microarray technique was used to evaluate gene expression profiles of pure cell populations from frozen sections of carcinomas and adenomas harvested from precancerous hepatocellular lesions by using laser capture microdissection (LCM). The levels of differentially expressed genes were investigated using a cDNA microarray with 9,984 features with only 2 ug of two-round amplified aRNA, equivalent to 35 cells from LCM-adenomas and frozen samples of carcinomas from simian virus 40 (SV40) large T antigen transgenic rats. A total of 855 genes were identified as being 3-fold or more differentially expressed in carcinomas or adenomas as compared to normal tissue controls. Among these 855 genes, 71 genes were differentially expressed in both carcinomas and adenomas. Commonly up-regulated genes in both carcinoma and adenomas were 28 while 41 of the 71 genes were commonly down-regulated. Two genes, Igh1 (immunoglobulin heavy chain 1(Serum IgG2a), Image clone ID: 875880) and EST clone (AI893585, Image clone ID: 596604) were more than 7-fold up-regulated in carcinomas and 6-fold down-regulated in adenomas. In Cy5 and Cy3 reciprocal experiments for screening out false positive signals, the amplified carcinomas showed higher Pearson Correlation Coefficient values (-0.94 and -0.92) than the LCM-amplified adenoma samples (-0.79 and -0.84). LCM-amplified samples provided higher signal intensities over backgrounds and a greater average of Cy5:Cy3 ratios. Expression levels of mRNAs from selected genes, determined by using traditional dot blot analysis, revealed that 36 of 40 tested expression profiles were consistent with the microarray data. Thus, amplified aRNA harvested from homogeneous cell types using LCM can be applied to study gene expression profiles by use of microarray analysis.     

胰腺癌相关基因寡核苷酸芯片的制备和初步应用(英文)

目的：研究胰腺癌相关基因寡核苷酸芯片的构建及其在检测胰腺癌基因表达谱方面的应用。方法：有目的地筛选胰腺癌相关基因，采用合成后点样的方法将合成的寡核苷酸探针点于同型双功能偶联剂（APS-PDC）包被的基片上，制成寡核苷酸基因芯片。Trizol法抽提组织总RNA，并用Qiagen Rneasy kit 进一步纯化。在cDNA第1链合成过程中，通过反转录酶将CyDye标记核苷酸直接渗入到cDNA中制备荧光探针，其中用Cy3-dCTP标记胰腺癌组织，Cy5-dCTP标记正常胰腺组织。将荧光标记探针定量后与芯片杂交16-18 h。用Agilent 扫描仪进行扫描，Imagene3.0软件（Biodiscovery,Inc.）图像分析，计算2种荧光Cy3 与Cy5信号强度的比值。挑选差异基因CDC25B和TUSC3进行荧光定量PUR（Sybrgreen方法）验证，以B-actin基因为内参照基因，PCR产物的定量方法采用比较Ct法。结果：芯片杂交扫描图像信号清晰，具有较低的整体背景和较高的信噪比，各阳性质控点信号均匀一致，阴性质控点和空白点信号低。与正常组织相比，胰腺癌组织中差异表达基因24条，占全部基因的25.5%，其中上调基因17条（占18.1%），下调基因7条（占7.4%）。荧光定量PCR验证，CDC25B和TUSC3基因在胰腺癌中的表达分别为上调和下调，其表达趋势与芯片实验的结果一致。结论：制备的胰腺癌相关基因芯片，可同时、并行检测多种胰腺癌相关基因的表达改变，具有一定的特异性和灵敏性。胰腺癌组织与正常胰腺组织相比，基因表达谱具有明显的差异，为进一步研究胰腺癌的发病机理和早期诊断提供了有用的信息。     

重型乙型肝炎与无症状HBsAg携带者免疫相关基因表达差异的研究

目的：应用基因芯片研究重型乙型肝炎（FHB）与无症状HBsAg携带者（ASC）外周血单个核细胞（PBMC）免疫相关基因表达差异，方法：应用含8192条人cDNA的微阵列芯片和来自外周血单个核细胞标记的cDNA，分析了10例重型乙肝和10例无症状HBsAg携带者基因表达谱。通过应用GenePix4000扫描仪和ImaGene3.0分析软件比较Cy5标记的FHB来源cDNA与Cy3标记的ASC来源cDNA的杂交结果，获得个体基因的相对表达比值。结果：在8192个基因中，初筛出21个（0．25％）表达差异2倍以上的免疫相关基因。结论：在乙型肝炎病毒（HBV）感染机体致慢性重型肝炎过程中，全面改变了宿主细胞内免疫相关基因表达，这些差异表达基因可能与慢性重型肝炎的发生有关。