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1.
目的 观察拉米夫定(LAM)耐药后单用或联合阿德福韦酯(ADV)治疗应答欠佳患者HBV耐药变异模式. 方法收集15例LAM耐药后采用ADV治疗病毒学应答欠佳患者的血清,对HBV聚合酶逆转录区进行聚合酶链反应、扩增、克隆、测序,分析与耐药相关的变异模式.组间HBV DNA水平比较采用t检验.结果 单用ADV组检测出A181T+N236T、A181V和A181T 等模式的ADV耐药变异,而联合治疗组中主要检测出M204V+L180M、M204V+L180M+L229V、M204I+L80I和M204V+L180M+V207I等LAM耐药变异模式.另外,在联合治疗组的3份血清中,20%的克隆上同时出现对LAM和恩替卡韦耐药的变异,分别为M204I+L80I+T184I(2/10)、M204V+L180M+T184S(2/10)和M204V+L180M+G173L+S202G(2/10).两组中各有1份未检测出已知耐药变异的血清,在它们的测序结果中发现所有克隆均出现1269L变异,且其中单用组中所有克隆均出现P109S变异.联合治疗组和单用ADV组患者血清HBV DNA水平分别为(3.86±0.85)log10拷贝/ml和(5.71±0.94)log10拷贝/ml,差异有统计学意义(t=3.947,P<0.01).结论 LAM耐药后ADV治疗病毒学应答欠佳的患者中,单用ADV治疗容易筛选出A181T+N236T和A181V/T等ADV耐药变异模式,而联合ADV治疗组仍以M204V+L180M、M204V+L180M+L229V、M204I+L80I和M204V+L180M+V207I等LAM耐药变异模式为主.联合治疗时由于LAM的持续使用可选择出恩替卡韦耐药变异模式T184I/S和S202G;对于部分患者,1269L和P109S变异可能影响ADV治疗应答.  相似文献   

2.
目的 研究HBV准种群体在拉米夫定(LAM)与恩替卡韦(ETV)序贯治疗过程中的动态演变及其临床意义. 方法 对2例采用LAM-ETV序贯治疗出现不同临床结果的患者进行了近4年的随访,用多聚酶链反应-克隆-测序的方法研究HBV准种组成的长程动态演变,用最大似然法建立遗传进化树分析代表序列的遗传进化关系,结合血清学和病毒学指标分析HBV准种演变与临床过程的关系. 结果 2例患者均出现了LAM耐药病毒学突破,采用ETV治疗后,1例患者获得了持续病毒学应答,另一例患者在ETV治疗72周时又出现病毒学突破.病毒学突破均发生在原有对药物敏感的优势准种被耐药株替代时,ETV耐药与rtL180M+S202G+M204V三联突变株成为优势准种密切相关,准种动力学和遗传进化分析结果提示LAM治疗筛选出的rtL180M合并M204V联合突变株在HBV种群中的累积与此三联突变株的出现有直接关系.结论 HBV准种组成与核苷类药物敏感性密切相关,LAM耐药株可进一步演化为ETV耐药株,对使用核苷类药物治疗的患者进行HBV准种监测具有重要临床意义.  相似文献   

3.
目的 研究HBV准种群体在拉米夫定(LAM)与恩替卡韦(ETV)序贯治疗过程中的动态演变及其临床意义. 方法 对2例采用LAM-ETV序贯治疗出现不同临床结果的患者进行了近4年的随访,用多聚酶链反应-克隆-测序的方法研究HBV准种组成的长程动态演变,用最大似然法建立遗传进化树分析代表序列的遗传进化关系,结合血清学和病毒学指标分析HBV准种演变与临床过程的关系. 结果 2例患者均出现了LAM耐药病毒学突破,采用ETV治疗后,1例患者获得了持续病毒学应答,另一例患者在ETV治疗72周时又出现病毒学突破.病毒学突破均发生在原有对药物敏感的优势准种被耐药株替代时,ETV耐药与rtL180M+S202G+M204V三联突变株成为优势准种密切相关,准种动力学和遗传进化分析结果提示LAM治疗筛选出的rtL180M合并M204V联合突变株在HBV种群中的累积与此三联突变株的出现有直接关系.结论 HBV准种组成与核苷类药物敏感性密切相关,LAM耐药株可进一步演化为ETV耐药株,对使用核苷类药物治疗的患者进行HBV准种监测具有重要临床意义.  相似文献   

4.
目的 研究HBV准种群体在拉米夫定(LAM)与恩替卡韦(ETV)序贯治疗过程中的动态演变及其临床意义. 方法 对2例采用LAM-ETV序贯治疗出现不同临床结果的患者进行了近4年的随访,用多聚酶链反应-克隆-测序的方法研究HBV准种组成的长程动态演变,用最大似然法建立遗传进化树分析代表序列的遗传进化关系,结合血清学和病毒学指标分析HBV准种演变与临床过程的关系. 结果 2例患者均出现了LAM耐药病毒学突破,采用ETV治疗后,1例患者获得了持续病毒学应答,另一例患者在ETV治疗72周时又出现病毒学突破.病毒学突破均发生在原有对药物敏感的优势准种被耐药株替代时,ETV耐药与rtL180M+S202G+M204V三联突变株成为优势准种密切相关,准种动力学和遗传进化分析结果提示LAM治疗筛选出的rtL180M合并M204V联合突变株在HBV种群中的累积与此三联突变株的出现有直接关系.结论 HBV准种组成与核苷类药物敏感性密切相关,LAM耐药株可进一步演化为ETV耐药株,对使用核苷类药物治疗的患者进行HBV准种监测具有重要临床意义.  相似文献   

5.
目的分析拉米夫定(LAM)和恩替卡韦(ECV)联合用药及单独用LAM后老年乙肝患者乙肝病毒(HBV)耐药基因突变位点及与基因型的关系。方法选择治疗前未检测出HBV-YMDD变异的老年乙肝患者100例,随机分为两组,在患者治疗后24个月检测基因分型和反转录酶(RT)区位点变异。结果联合用药组中检出耐药突变类型分别为rt T184L+L180M+M204V、rt T184L+S202G+L180M+M204V、rt M250L+M204I;单用药组检出耐药基因突变类型分别为rt L180M+M204V、rt L180M+M204I、rt M204I。结论初期使用LAM联合ECV治疗老年乙肝患者24个月后耐药突变率仅为6%;联合用药在B和C两种基因型中的耐药检出率没有明显不同。  相似文献   

6.
目的建立以基因测序检测乙型肝炎病毒(HBV)多聚酶区基因突变的方法,并分析拉米夫定耐药者HBV多聚酶区基因主要耐药突变的分布情况。方法采用巢式PCR方法对174例拉米夫定耐药患者血清HBV多聚酶区进行扩增,对PCR产物进行直接测序,将YMDD突变阳性与阴性的病例分别进行HBV耐药基因突变的分析和比较。结果本研究154例YMDD突变阳性的患者中有10种突变类型,其中以rtM204I突变最多见,为46例(29.9%),其次为rtL180M/M204V(26.6%)、rtL180M/M204I(17.5%)、rtV173/L180M/M204V(13.0%)、rtM204V(2.6%)、rtL180M/M204V/M204I(5.8%)、rtV173L/L180M/M204V/M204I(1.3%)、rtV173L/M204IrtM204I/M204V(1.3%)、rtM204I/M204V(1.3%)。另外,rtM204V联合rtL180M或rtV173L的突变率较rtM204I联合rtL180M或rtV173L显著增高。从rtL180M突变角度来看,rtL180M与rtM204V的联合突变率最高,其次为rtL180M联合rtM204I突变,rtL180M与rtL173M的联合突变率最低。从rtV173L突变角度来看,rtV173L联合rtM204V或rtL180M突变的发生率均高于rtV173L联合rtM204I的突变率,且rtV173L突变多联合rtM204V和rtL180M突变同时发生。结论拉米夫定耐药株的氨基酸突变复杂多样,需要对拉米夫定耐药多个相关位点进行检测。  相似文献   

7.
目的研究拉米夫定(LAM)治疗后出现HBV病毒学突破患者HBVRT区变异位点和变异类型。方法研究对象选自2004年4月至2007年3月在苏州大学附属第一医院门诊或住院治疗的慢性乙型肝炎患者,用聚合酶链式反应(PCR)方法扩增LAM治疗后出现HBV病毒学突破患者的血清HBVRT区基因,对PCR产物直接测序,用Chromas2.0软件分析HBVRT区基因的核苷酸和氨基酸差异、变异类型。结果109例患者在拉米夫定耐药后出现病毒学突破,其中94例出现拉米夫定耐药相关性变异,包括YMDD变异93例,单独rtA181T变异1例。13例(11.93%)患者经测序分析未发现YMDD变异,但用限制性内切酶片段长度多态性(RFLP)方法检测,均发现有YMDD变异。测序结果发生变异位点和出现频率:rtM204V/I93例(85.3%)、rtL180M51例(46.9%)、rtV173L/M7例(6.4%)、rtV207M/L/I4例(3.7%)、rtA181T4例(3.7%)、rtT184I/S/M2例(1.8%)、rtM250L2例(1.8%)。变异类型:rtM204V/I、rtA181T、rtM204V/I rtL180M、rtM204V/I rtL180M rtV173M等。结论拉米夫定耐药主要变异类型为rtM204V/I变异,常伴随rtL180M和rtV173L/M变异;少数拉米夫定耐药患者在阿德福韦和恩替卡韦治疗前即已产生阿德福韦和恩替卡韦耐药相关性变异。  相似文献   

8.
目的 调查行核苷类似物治疗的慢乙肝患者HBV基因型及耐药位点的存在状况.方法 选择29例慢乙肝患者,均采用拉米夫定、阿德福韦、恩替卡韦、替比夫定等核苷类似物药物治疗6个月~2年.采用直接测序法检测患者血浆中的HBV基因分型及耐药位点,并对结果进行分析.结果 29例患者中,HBV基因C型26例、B型3例.HBV变异位点有6个,其中rtL180M 7例,rtM204I/V/S 11例,rtA181V/I/S 7例,rtN236T、rtT184A/G/I/S、rtM250V/L各1例.变异模式包括rtA181V/I/S 5例,rtM204L/V/S、rtL180M+rtM204I/V/S各4例,rtN236T、rtM204I/V/S+rtA181V/I/S、rtL180M+ rtA181V/I/S、rtL180M+ rtM204I/V/S+ rtM250V/L、rtL180M+ rtM204I/V/S+ rtT184A/G/I/S各1例.结论 29例慢乙肝患者的HBV基因多为C型,经核苷类似物治疗后,HBV的主要突变位点有rtM204L/V/S、rtL180M及rtA181V/I/S.除rtA181V/I/S、rtM204L/V/S单位点突变外,还存在rtL180M+rtM204L/V/S、rtL180M+ rtA181V/I/S、rtL180M+ rtM204I/V/S+rtT184A/G/I/S等突变模式,给治疗带来困难.  相似文献   

9.
目的分析拉米夫定(lamivudine,LAM)和阿德福韦酯(adefovir,ADV)双重耐药HBV株临床检出特点和表型特性,为临床优化抗病毒方案提供参考。方法回顾性分析26 553例慢性HBV感染者血清样本中HBV反转录酶区与LAM和ADV耐药相关的突变类型及频率,采用PCR产物直接测序法和克隆测序法(≥20个克隆/样本)对双重耐药HBV株进行鉴定,采用表型耐药方法分析强效核苷(酸)类似物[nucleos(t)ide analogues,NAs]对双重耐药HBV的抑制效果。结果 26 553例慢性HBV感染者的血清样本中,LAM/ADV双重耐药HBV突变株的检出率为0.6%(147/26 553),主要突变类型为rt L180M+A181V+M204V(65.3%)和rt A181V+M204I(10.2%)。多数患者经历了LAM→ADV(40.8%)或LAM→ADV→ETV(38.8%)单药序贯/联合治疗,平均抗病毒时间为63个月。其中2例代表性LAM和ADV双重耐药患者的动态血清样本克隆结果显示,在恩替卡韦(entecavir,ETV)+ADV联合挽救治疗期间,随着获得完全病毒学应答后维持时间的延长,病毒准种池中LAM/ADV双重耐药株逐渐消失,病毒株以单一NAs耐药株或野生株为主。体外表型结果显示,各种双重耐药HBV突变株的体外复制力均低于野生株,ETV+ADV联合、替诺福韦酯(tenofovir,TDF)单独或TDF+ETV联合可有效抑制野生株复制(抑制率为98.5%~99.5%),而对各种LAM/ADV双重耐药突变株的抑制率分别为80.6%~92.5%、86.1%~97.9%和89.2%~97.5%。结论长期LAM和ADV单一序贯治疗可促进LAM/ADV双重耐药HBV发生,ETV+ADV联合、TDF单独或TDF+ETV联合均可有效抑制LAM/ADV双重耐药HBV复制,而基于TDF的挽救治疗效果更佳。  相似文献   

10.
目的:观察阿德福韦酯(ADV)单药序贯治疗拉米夫定(LAM)耐药慢性乙型肝炎(CHB)出现再耐药患者HBV变异株的动态变化.方法:28例初始LAM治疗的CHB患者, 出现LAM耐药后换用ADV单药序贯治疗再次出现不充分病毒学应答或病毒学突破. 采用实时荧光定量PCR检测DNA, 分析HBV DNA动态变化; 采用直接PCR产物测序法检测耐药变异,分析变异模式变化. 对其中2例患者系列血清进行基因克隆分析其HBV耐药株动态变化.结果:28例入选患者HBV DNA载量随耐药变异株的消长而波动: 基线为(7.65±1.04)Log10copies/mL, LAM疗程中最低值中位数为3.68 Log10copies/mL; 出现病毒学突破或/和耐药变异时为(6.87±1.16) Log10copies/mL, 患者换用ADV后最低值中位数为3.78 Log10copies/mL; 患者出现耐药变异模式改变或再次病毒学突破时为(6.04±0.93) Log10copies/mL. 治疗基线及两次病毒突破3个时点HBV DNA载量均数逐渐下降, 且两两之间差异均有统计学意义. 28例患者LAM治疗后24例发生rtM204I/V伴或不伴rtL180M等变异, 4例无耐药变异; 换用ADV单药序贯治疗出现病毒学突破后, 进行测序检测耐药发现: LAM耐药变异13例(包括3例多重耐药), ADV耐药变异11例(包括3例多重耐药), 无耐药变异7例. 其中11例ADV耐药患者: rtA181V变异6例、rtA181T变异3例、rtN236T变异和rtA181V+rtN236T联合变异各1例. 对2例患者血清TA克隆发现ADV耐药准种出现和LAM耐药准种消失的过程, 同时发现对ADV耐药的rtI233M变异和对替诺福韦耐药的rtA194T变异.结论:ADV单药序贯治疗LAM耐药CHB出现再耐药患者HBV变异株动态变化存在5种形式, 且克隆分析可观察耐药株动态变化过程和发现预存的耐药准种.  相似文献   

11.
慢性乙型肝炎患者抗病毒治疗中的病毒准种演变   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的 探讨拉米夫定耐药后换用恩替卡韦补救治疗的慢性乙型肝炎患者的病毒准种演变.方法 提取1例慢性乙型肝炎患者治疗中的7个不同时间点(0、24、48、60、72、96、152周)血清中的HBV DNA,巢式聚合酶链反应法扩增HBV DNA聚合酶基因逆转录酶区,克隆测序法对逆转录酶区氨基酸替换形式及准种分布进行分析,并采用扩增耐药突变系统聚合酶链反应法对患者病毒种群中野毒株与病毒总量进行定量检测.结果 患者在治疗过程中主要存在rtM204V、rtL180M+rtM204V和rtM204I 3种拉米夫定耐药相关的病毒株变异形式,各病毒株所占比例不断发生变化,基线时HBV野毒株为优势病毒株,在病毒学突破时,种群中全部为耐药突变株;换用恩替卡韦治疗后,随着病毒载量的下降,拉米夫定耐药突变株被抑制,野毒株在种群中比例逐渐上升,并成为优势病毒株(79.3%).扩增耐药突变系统聚合酶链反应检测结果显示,在基线和发生病毒学突破时,野毒株在种群中的比例分别为68.55%和0.21%,换药治疗后24周,野毒株比例开始上升,此后野毒株占种群的比例波动于16.01%~26.93%.结论 慢性乙型肝炎患者在核苷(酸)类药物序贯治疗过程中,HBV种群的准种分布一直处于动态变化中.不同的HBV准种演变模式可能在恩替卡韦补救治疗中对恩替卡韦耐药发生的作用也不相同.
Abstract:
Objective To investigate the evolution of hepatitis B virus (HB V) quasispecies in one patient during lamivudine (LAM) monotherapy and switching to entecavir (ETV) rescue treatment. Methods Serum samples were taken at seven different time points during antiviral therapy (0, 24, 48, 60, 72, 96,152 weeks, respectively), the HBV DNA polymerase gene was amplified, cloned and sequenced to analyze the amino acid substitutions within HBV DNA polymerase gene and distribution of virus quasispecies. Quantitative detection of the HBV wild strains and total virus was performed by amplification refractory mutation system real-time PCR (ARMS-PCR). Results Three mutation patterns detected during antiviral therapy in the patient: rtM204V, rtM204V+rtL180M and rtM204I. The HBV quasispecies were found always in dynamic variation. The HBV populations were completely replaced with the LAM-resistant variants when the viral breakthrough was encountered during LAM monotherapy. Interestingly, the wild-type variants presented gradually dominant (79.3%) with the decline of HBV DNA load after switching to ETV rescue administration. ARMS-PCR results showed that the wild-type variants account ed for 68.55% of the HBV populations at baseline and this proportion declined to 0.21% when the viral breakthrough emerged under LAM therapy. The wild-type variants gradually increased from week 24 after switching to ETV rescue therapy and the proportion of HBV wild-type variants in the population fluctuated between 16.01% to 26.93%. Conclusions The distribution of virus quasispecies were always in dynamic variation during sequential therapy with nucleotide analogs in chronic hepatitis B patients. Different patterns of dynamic HBV quasispecies may have different contribution in ETV resistance in LMV refractory patients with ETV administration.  相似文献   

12.
Hepatitis delta virus(HDV) seems to strongly suppress hepatitis B virus(HBV)replication, although little is known about the mechanism of this interaction. Both these viruses show a dynamic distribution of mutants, resulting in viral quasispecies. Next-generation sequencing is a viable approach for analyzing the composition of these mutant spectra. As the regulatory hepatitis B X protein(HBx) is essential for HBV replication, determination of HBV X gene(HBX)quasispecies complexity in HBV/HDV infection compared to HBV monoinfection may provide information on the interactions between these two viruses.AIM To compare HBV quasispecies complexity in the HBX 5' region between chronic hepatitis delta(CHD) and chronic HBV mono-infected patients.METHODS Twenty-four untreated patients were included: 7/24(29.2%) with HBeAgnegative chronic HBV infection(CI, previously termed inactive carriers), 8/24(33.3%) with HBeAg-negative chronic hepatitis B(CHB) and 9/24(37.5%) with CHD. A serum sample from each patient was first tested for HBV DNA levels.The HBX 5' region [nucleotides(nt) 1255-1611] was then PCR-amplified for subsequent next-generation sequencing(MiSeq, Illumina, United States). HBV quasispecies complexity in the region analyzed was evaluated using incidencebased indices(number of haplotypes and number of mutations), abundancebased indices(Hill numbers of order 1 and 2), and functional indices(mutation frequency and nucleotide diversity). We also evaluated the pattern of nucleotide changes to investigate which of them could be the cause of the quasispecies complexity.RESULTS CHB patients showed higher median HBV-DNA levels [5.4 logIU/mL,interquartile range(IQR) 3.5-7.9] than CHD(3.4 logIU/mL, IQR 3-7.6)(P = n.s.)or CI(3.2 logIU/mL, IQR 2.3-3.5)(P < 0.01) patients. The incidence and abundance indices indicated that HBV quasispecies complexity was significantly greater in CI than CHB. A similar trend was observed in CHD patients, although only Hill numbers of order 2 showed statistically significant differences(CHB2.81, IQR 1.11-4.57 vs CHD 8.87, 6.56-11.18, P = 0.038). There were no significant differences in the functional indices, but CI and CHD patients also showed a trend towards greater complexity than CHB. No differences were found for any HBV quasispecies complexity indices between CHD and CI patients. G-to-A and C-to-T nucleotide changes, characteristic of APOBEC3 G, were higher in CHD and CI than in CHB in genotype A haplotypes, but not in genotype D. The proportion of nt G-to-A vs A-to-G changes and C-to-T vs T-to-C changes in genotype A and D haplotypes in CHD patients showed no significant differences. In CHB and CI the results of these comparisons were dependent on HBV genotype.CONCLUSION The lower-replication CHD and CI groups show a trend to higher quasispecies complexity than the higher-replication CHB group. The mechanisms associated with this greater complexity require elucidation.  相似文献   

13.
14.
乙型肝炎病毒前S2序列异质性的初步研究   总被引:7,自引:0,他引:7  
Huangfu J  Dong J  Deng H  Cheng J  Shi S  Hong Y  Ren X  Li L 《中华内科杂志》2002,41(4):233-236
目的 通过对乙型肝炎病毒(HBV)前S2基因序列的研究,证实HBV在慢性感染者中以准种状态存在,并对前S2序列异质性进行初步的阐明。方法 以中国株HBV基因序列为依据,设计特异性PCR引物,自51例慢性HBV感染患者血清中扩增HBV前S2基因序列,采用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术展示缺失突变,随机选择克隆测序,确定病毒的变异程度。结果 聚丙烯酰胺凝胶电泳结果发现,52.9%(27/51)患者血清中可获得2或3条扩增条带;测序结果发现前S2基因序列存在缺失突变高发区,氨基酸序列分析示缺失突变主要位于前S2编码蛋白的氨基端。结论 HBV前S2序列内有一缺失高变区,并在患者体内表现为多种变异形式;氨基端附近的变异可能影响中和抗体的识别作用。结果提示HBV慢性携带者体内有HBV准种共存。  相似文献   

15.
拉米夫定与乙型肝炎病毒准种及变异特点的关系   总被引:2,自引:0,他引:2  
目的 研究拉米夫定治疗前后慢性乙型肝炎患者体内乙型肝炎病毒聚合酶(HBV P)基因序列的准种组成及变异特点。 方法 目的片段经聚合酶链反应扩增后克隆,每份标本选择3 3个克隆,用单链构象多态性/异源双链分析法对准种复杂性及变异特点进行分析。 结果 拉米夫定治疗前患者体内HBV P基因序列准种数为7~14(平均9.8),高于治疗后准种数4~8(平均5.7),t=3.98,P<0.05。6例患者治疗前的准种分布中有一种或两种优势准种,但比例较低(33.3%~81.8%);治疗后显著升高(78.8%~90.9%),t=3.42,P<0.05。选择优势克隆测序,6例患者经拉米夫定治疗后2例出现M550V/L526M变异,3例为M550I变异,1例无YMDD变异。此外为个体化的点突变,无明显趋势。 结论在拉米夫定的药物筛选作用下HBV准种的组成改变,同时出现YMDD序列变异。  相似文献   

16.
熔点曲线法研究乙型肝炎病毒准种和临床表现的关系   总被引:4,自引:0,他引:4  
目的研究乙型肝炎病毒(HBV)准种与临床的关系,从HBV准种这个角度阐述相同基因型HBV导致不同病情的机制。方法选取B基因型HBV感染的慢性携带者血清32份和慢性乙型肝炎重度患者血清28份作为检测对象,采用熔点曲线法比较两组血清波峰数量的差异。结果慢性乙型肝炎重度患者血清的波峰数量明显多于慢性携带者血清(P〈0.05),提示前者所携带HBV的准种数量多于后者。结论HBV准种与乙型肝炎临床表现存在一定关系,在HBV基因型相同时,病情较重的乙型肝炎与HBV准种数量多有关,可在一定程度上解释同一基因型的不同患者出现不同临床表现的现象。  相似文献   

17.
慢性乙型肝炎急性发作患者血清病毒准种动力学研究   总被引:2,自引:0,他引:2  
目的揭示慢性乙型肝炎急性发作及重型化过程中血清乙型肝炎病毒(HBV)基因组前C/C 及基本核心启动子(BCP)区准种的动态变化规律。方法选取1例慢性乙型肝炎两次急性发作伴重型化患者病程中5份血清样本,采用聚合酶链反应-TA克隆-构象敏感凝胶电泳-测序的方法,研究慢性乙型肝炎重型化过程中血清HBV准种的动态变化。结果血清HBV准种复杂性在慢性乙型肝炎急性发作时为10~ 12,在好转时为14~17(t=3.133,P<0.05),且随时间推移有逐渐升高的趋势;在此过程中优势准种组成及比例亦发生了变化(t=3.295,P相似文献   

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