福建省非小细胞肺癌患者EGFR基因突变分析

 目的　检测福建省非小细胞肺癌（NSCLC）患者表皮生长因子受体（EGFR）基因突变情况。方法　提取50例NSCLC患者新鲜癌组织及其对应的正常组织标本的DNA，用EGFR基因巢式聚合酶链反应（PCR）及脱氧核糖核酸（DNA）测序技术分析NSCLC患者EGFR基因突变情况。结果　50例NSCLC患者的正常组织EGFR第19、21外显子均为野生型，而50例NSCLC患者的癌组织EGFR基因突变检出率为26 ％（13／50）。第19外显子缺失突变10例，第21外显子替代突变3例。结论　福建省NSCLC患者EGFR突变以19外显子突变为主。     

肺癌细胞学及血液标本表皮生长因子受体基因突变对比研究

目的:研究肺癌患者渗出液细胞学及血液标本中表皮生长因子受体(EGFR)第18、19、21外显子基因突变频率和类型以及与肿瘤组织学标本的关系。方法:收集肺癌患者渗出液细胞学标本53例及血液标本24例,提取DNA,聚合酶链反应扩增EGFR外显子18、19、21序列,用直接测序法检测基因序列,分析EGFR基因突变频率和类型以及与肿瘤组织学标本的关系。结果:53例细胞学标本检测到15例EGFR基因突变（28.3%,15/53）,18外显子突变1例,19外显子突变5例,21外显子突变9例,细胞学标本与肺腺癌组织学标本突变率（32.2%）相比,差异没有显著性（P=0.624）。24例血液标本中检测到1例突变（4.2%,1/24）,位于21外显子,血液标本与肿瘤组织学标本突变率相比,差异有显著性(P=0.006)。结论:肺癌患者渗出液细胞学标本适用于直接测序法检测EGFR突变,血液标本不适于用直接测序法检测肿瘤EGFR基因突变状态。     

变性高效液相色谱法检测多种途径获取的非小细胞肺癌组织表皮生长因子受体基因突变

背景与目的表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)是最重要的非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)治疗靶点,EGFR突变可预测酪氨酸激酶抑制剂(tyrosine kinase inhibitor,TKI)的疗效.DNA直接测序是检测EGFR突变最常用的方法,同时也作为突变检测的"金标准",但该方法耗时较长、所需组织量较多且敏感性较低.变性高效液相色谱法是一种快速、自动化、高敏感性的突变检测方法,本研究旨在探讨变性高效液相色谱法(denaturing high-performance liquid chromatography,DHPLC)快速检测NSCLC肿瘤组织EGFR基因突变的诊断价值.方法通过检测已知按不同比例混合的野生型及突变型EGFR质粒DNA,评价DHPLC法的准确性和敏感性.选取经多种途径获取的83例NSCLC患者的冻存肿瘤组织,提取DNA并PCR扩增EGFR外显子19、21,用DHPLC法检测并与直接测序法进行比较.结果当突变型质粒与野生型质粒按1:100混合时,仍可被DHPLC法显著检出,而直接测序法仅可检出1:10水平.83例NSCLC组织标本中,DHPLC法检出22例EGFR突变(突变率26.51%),3例直接测序法结果为野生型,余19例EGFR突变及61例野生型均与直接测序法结果相符.DHPLC法的敏感度为100%,特异度为95.31%,对经皮细针肺穿刺活检、淋巴结活检以及外科切除等途径获取的肿瘤样本均具有较高的敏感度、特异度.EGFR突变与性别、病理类型显著相关,与吸烟状态、年龄等无相关性.结论 DHPLC法可作为NSCLC患者EGFR基因型的初筛方法.     

HRM方法检测肺腺癌患者癌性胸水上清液EGFR基因突变的临床意义

目的:探讨应用HRM方法检测肺腺癌患者癌性胸水上清液EGFR基因突变状况及EGFR酪氨酸激酶受体抑制剂治疗的可行性。方法:收集43例肺腺癌患者癌性胸水上清液标本,提取DNA,应用HRM方法检测EGFR基因第18、19、20、21外显子突变状况。统计分析HRM方法与基因测序法检测EGFR突变率的差异。结果:43例肺腺癌患者癌性胸水上清液中,HRM法检测EGFR基因突变共17例,总突变率为39.53%,其中第19外显子突变14例,第21外显子突变3例。基因测序结果显示:EGFR突变14例,总突变率为32.56%,均为第19外显子突变。HRM方法检测第21外显子突变阳性的患者其基因测序结果均为阴性。这可能与HRM方法检测的灵敏度优于测序方法有关。两者突变率差异无统计学意义（P>0.05）。结论:对难以获取组织标本的肺腺癌患者而言,应用HRM方法检测其癌性胸水上清液,是了解其EGFR基因突变状况的可靠途径,对临床筛查靶向治疗药物具有一定的参考价值。     

DNA直接测序技术检测EGFR基因突变指导厄洛替尼一线治疗晚期非小细胞肺癌的临床观察

目的：通过对晚期非小细胞肺癌（non-small cell lung cancer,NSCLC）患者表皮生长因子受体（epi-dermal growth factor receptor,EGFR）基因突变的检测,探讨厄洛替尼（Erlotinib）一线治疗晚期NSCLC的疗效与安全性。方法：从110例NSCLC患者的肿瘤组织提取DNA,用DNA直接测序技术检测EGFR基因19、21外显子突变情况,31例EGFR基因突变患者中,30例患者口服厄洛替尼150mg/d,持续至疾病进展或发生不能耐受的药物不良反应,评价客观有效率（RR）,疾病控制率（DCR）,总生存（OS）,无疾病进展时间（PFS）,一年生存率和药物不良反应。结果：110例NSCLC组织中EGFR基因突变31（28%）例,其中19外显子缺失18（58%）例,21外显子点突变13（42%）例。EGFR基因突变率女性40%、肺腺癌33%、不吸烟者46%,高于男性、非腺癌、吸烟的病人。30例口服厄洛替尼患者,完全缓解（CR）3例,部分缓解（PR）21例,疾病稳定（SD）5例和疾病进展（PD）1例,客观有效率为80%,疾病控制率为97%,截止随访结束,仍有20例患者生存,故中位总生存未获得结果,无疾病进展时间为11.4个月,1年生存率为78%,厄洛替尼治疗晚期NSCLC最常见的不良反应是腹泻和皮疹,多为I-II级。结论：DNA直接测序检测晚期NSCLC患者EGFR基因突变具有高度敏感性,以EGFR基因突变结果为依据,一线应用厄洛替尼治疗晚期NSCLC患者,疗效明显,耐受性好,是治疗晚期NSCLC的最佳选择之一。     

非小细胞肺癌患者血清EGFR基因突变循环DNA检测

目的:探讨循环DNA测定表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)突变的可行性;旨在提供更方便、快捷、无创的分子生物检测手段,指导晚期非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者靶向治疗。方法:收集石河子大学医学院第一附属医院2011-09-21-2012-09-30接受靶向治疗(吉非替尼或厄洛替尼)的48例晚期NSCLC患者血清及相应石蜡组织标本DNA,采用直接测序法检测EGFR基因19和21外显子的突变情况,应用SPSS17.0软件进行统计学分析。结果:48例患者循环DNA中EGFR基因突变检出率为14.583%(7/48),且与组织DNA检测出EGFR突变类型一致,即19外显子突变型为19DelK746~A750、19DelK745~E749和19DelK745~A750;21外显子突变类型分别为21L858R和21L861Q。EGFR突变主要发生在女性及不吸烟的患者中;且EGFR基因突变型者PFS明显优于野生型患者,χ2=11.287,P=0.001。以组织DNA检测为准,循环DNA中EGFR基因突变检测的特异性为97%,并且与组织DNA检测EGFR基因突变具有一定的一致性,Kappa=0.433。结论:血清循环DNA可用于EGFR基因突变检测,为肺癌靶向治疗提供实验依据。     

非小细胞肺癌表皮生长因子受体基因主要突变类型快速简便的检测方法

背景与目的:肺癌组织中表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)基因突变是靶向药物EGFR酪氨酸激酶抑制剂(tyrosine kinase inhibitor,TKI)治疗有效的一个重要相关因素及预测指标.目前临床上需要一种简单、敏感、可靠的方法来检测EGFR基因的突变,从而指导TKI类药物的最佳应用.本研究旨在进一步了解中国非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者EGFR基因突变的特点,并针对常见的特异性突变,寻找一种方便、准确、快捷的检测方法.方法:手术切除的NSCLC冰冻组织标本50例,对照为正常肺组织16例.分别提取肿瘤组织、正常肺组织DNA,PCR法扩增肿瘤组织DNA中EGFR基因外显子18～21,提纯后测序,确定有无突变存在.针对常见特异性突变设计突变特异引物,应用该引物扩增肿瘤组织及正常对照肺组织DNA,观察有无特异条带出现,并与直接测序结果相比较,观察是否存在一致性.结果:50例NSCLC组织中共检出突变15例,突变率30%,均为杂合子突变,其中外显子19突变的6例(12%),外显子21突变的9例(18%);外显子19的突变类型均为缺失突变del E746-A750;外显子21的突变类型为替代突变,8例为L858R,1例为L861Q.应用特异引物扩增已在直接测序中验证的存在特异突变的肺癌组织DNA,均显示出阳性条带;相反,对于16个正常对照肺组织DNA和在直接测序中未发现有突变的肺癌组织DNA,应用该特异引物扩增后,均无阳性条带出现.结论:本研究结果表明中国NSCLC患者EGFR基因突变的主要类型为外显子19的缺失突变和外显子21的替代突变,应用突变特异PCR检测肺癌组织中的常见EGFR基因突变类型,是一种简单、特异、准确、经济、省时省力的方法,可在临床中推广应用.     

扩增耐突变系统对非小细胞肺癌表皮生长因子受体基因突变的检测

目的:探讨扩增耐突变系统检测非小细胞肺癌(NSCLC)患者肿瘤组织EGFR基因突变的应用价值.方法:选取70例NSCLC患者的病理切片,提取基因组DNA,分别使用EGFR外显子19和21突变检测试剂盒检测EGFR外显子19和21的突变情况,并结合临床资料进行分析.结果:70例肺癌组织中检出EGFR基因突变29例,基因突变检出率为41.4％,其中外显子19突变20例(69.0％),外显子21突变9例(31.0％);腺癌基因突变23例(79.3％),检出率为51.1％;鳞癌基因突变6例(20.7％),检出率为24.0％;肺泡癌基因突变4例(13.8％),检出率为66.7％.女性、不吸烟和肺腺癌患者的EGFR 2个外显子基因突变率均较高,P＜0.01.结论:NSCLC患者EGFR基因突变主要表现为外显子19和21的突变,女性、肺腺癌和不吸烟的患者多见.     

非小细胞肺癌原发灶与脑转移灶EGFR基因突变状况的一致性研究

目的 探讨非小细胞肺癌（NSCLC）原发灶与脑转移灶的表皮生长因子受体（EGFR）基因突变状况,分析两者之间是否存在一致性。方法 收集2003年1月至2011年12月31例NSCLC脑转移患者的肺原发灶和脑转移灶石蜡包埋组织标本,应用DNA直接测序法进行EGFR突变分析,如发现两者突变不一致则进一步采用增殖阻碍突变系统 （ARMS）验证。结果 31例NSCLC肺原发灶中,8例存在19外显子E746-A750缺失突变、4例为21外显子L858R点突变;在31例脑转移灶样本中,8例为19外显子E746-A750缺失突变,3例存在21外显子L858R点突变,EGFR突变类型在脑转移灶和肺原发灶的分布差异无统计学意义 （P=0.793）。共有16.1％ （5／31）的肺原发灶和脑转移灶EGFR突变状况不一致,其中男性4例,女性1例;3例腺癌 （2例脑转移灶19外显子缺失突变而肺原发灶阴性突变,1例肺原发灶21外显子点突变而脑转移灶阴性突变）,1例鳞癌和1例非典型类癌 （均为脑转移灶阴性突变而肺原发灶19外显子缺失突变）。结论 NSCLC原发病灶及脑转移灶EGFR基因突变存在不一致性。     

非小细胞肺癌患者表皮生长因子受体基因突变状态与临床特征及疗效的关系

目的:探讨表皮生长因子受体（EGFR）基因不同突变状态非小细胞肺癌（NSCLC）患者临床特征及疗效的差异。方法:回顾性分析2018年4月至2020年6月解放军联勤保障部队第九〇四医院收治的324例NSCLC患者的临床资料,采用基因测序法检测EGFR基因及其第19号和第21号外显子突变情况。将EGFR基因突变患者分为EG...     

176例非小细胞肺癌的EGFR基因突变分析

目的 分析非小细胞肺癌（NSCLC）中上皮生长因子受体（EGFR）基因突变的发生率和突变类型。方法 收集123例正常肺组织和176例肺癌组织,采用PCR扩增和基因测序方法,对组织DNA中EGFR外显子19～21基因突变进行分析。结果 正常肺组织中EGFR基因均为野生型,肺癌组织中EGFR基因突变检测率为32．4％（57／176例）,其中,外显子19和21突变分别占突变总数的64．9％（37／57例）和31．6％（18／57例）,外显子20突变少见,仅占3．5％（2／57例）。外显子19突变发生在第746～753位密码子,均为碱基缺失突变,有7种不同类型。外显子20突变发生在第789—793位密码子,为碱基替换突变。外显子21突变全部是第858位密码子碱基替换突变。EGFR基因突变多见于女性,肺腺癌和腺鳞癌。结论 EGFR基因突变是一种肿瘤特异性的体细胞遗传改变,突变发生率约占肺癌总数的1／3,其中以外显子19和21为主。女性、肺腺癌和腺鳞癌中突变多见。     

变性高效液相色谱法分析中国人非小细胞肺癌、结直肠癌中表皮生长因子受体突变情况和临床意义

目的初步了解我国NSCLC和结直肠癌患者EGFR突变的发生率及与此相关的临床特征。方法利用含有野生型和突变型EGFR基因的质粒DNA,摸索条件,建立DHPLC最佳检测方法;收集北京协和医院近期NSCLC手术标本和结直肠癌的石蜡标本,通过PCR和DHPLC筛查突变,测序验证,并对结果进行统计学分析。结果在29例NSCLC标本中,8例发生突变,突变率为27·6%,其中6例为缺失突变、1例为点突变、1例为混合突变;8例女性中有7例发现突变,突变率为87·5%,而21例男性病人中只有1例发生突变,突变发生率为4·8%(P<0·001);8例无吸烟史的病人全部突变,突变发生率为100%,21例有吸烟史的病人无1例突变(P<0·001);20例腺癌病人中有8例突变,突变率为40·0%;9例鳞癌病人无一突变(P=0·026);肿瘤家族史和肿瘤分期则与突变无关。在37例结直肠癌标本中,未发现突变。结论中国人NSCLC的EGFR突变发生率明显高于欧美国家,且以19外显子上的缺失突变为主。突变发生与女性、无吸烟史和腺癌有相关性,与肿瘤家族史和肿瘤分期没有相关性。结直肠癌EGFR未发现突变。DHPLC可作为EGFR突变筛查方法。     

中国肺腺癌患者上皮生长因子受体基因突变的研究

目的:分析我国肺腺癌患者上皮生长因子受体(EGFR)基因突变的发生率和突变类型。方法:在上海、杭州和昆明等地收集61例肺腺癌及其正常肺组织,采用PCR扩增和基因测序方法对组织DNA中EGFR外显子19~21基因突变进行分析。结果:正常肺组织中EGFR基因均为野生型,肺腺癌组织中EGFR基因突变检测率为47.5%(29/61),其中外显子19和21突变分别占突变总数的55.2%(16/29)和44.8%(13/29),外显子20未检测到突变。外显子19突变发生在第746~752位密码子,均为碱基缺失突变,有6种不同类型。外显子21突变全部是第858位密码子碱基替换突变。EGFR基因突变与患者性别和年龄无显著相关性。但昆明和上海等地患者的基因突变存在明显差异。结论:EGFR基因突变是一种肿瘤特异性的体细胞遗传改变,突变发生率约占肺腺癌总数的一半,其中以外显子19和21突变为主。我国EGFR基因突变存在地域差异。     

Detection and comparison of peptide nucleic acid-mediated real-time polymerase chain reaction clamping and direct gene sequencing for epidermal growth factor receptor mutations in patients with non-small cell lung cancer

EGFR tyrosine kinase inhibitors (EGFR-TKIs) are recommended as first-line therapy in patients with advanced, recurrent, or metastatic non-squamous non-small cell lung cancer (NSCLC) that have active EGFR mutations. The importance of rapid and sensitive methods for the detection of EGFR mutations is emphasized. The aim of this study is to examine the EGFR mutational status by both direct DNA sequencing and peptide nucleic acid (PNA)-mediated real-time PCR clamping and to evaluate the correlation between the EGFR mutational status and the clinical response to EGFR-tyrosine kinase inhibitors. Clinical specimens from 240 NSCLC patients were analyzed for EGFR mutations in exons 18, 19, 20 and 21. All clinical data and tumor specimens were obtained from 8 centers of the Korean Molecular Lung Cancer Group (KMLCG). After genomic DNA was extracted from paraffin-embedded tissue specimens, we performed PNA-mediated real-time PCR clamping and direct DNA sequencing for the detection of EGFR mutations. Of 240 tumor samples, PNA-mediated PCR clamping was used to detect genomic alterations in 83 (34.6%) samples, including 61 identified by sequencing and 22 additional samples (10 in exon 19, 9 in exon 21, and 3 in both exons); direct DNA sequencing was used to identify a total of 63 (26.3%) mutations that contained 40 deletion mutations in exon 19 (63.5%) and 18 substitution mutations (28.6%) in exon 21. PNA-mediated PCR clamping was used to identify more mutations than clinical direct sequencing, whereas clinical outcomes were not significantly different between the groups harboring activating mutations detected by each method. These data suggest that PNA-mediated real-time PCR clamping exhibits high sensitivity and is a simple procedure relative to direct DNA sequencing that is a useful screening tool for the detection of EGFR mutations in clinical settings.     

高通量基因测序技术检测外周血循环肿瘤DNA基因突变在非小细胞肺癌中的应用

目的:探究高通量基因测序技术检测非小细胞肺癌外周血循环肿瘤DNA基因突变的应用价值。方法:临床纳入2017年1月至2018年9月在我院就诊的40例晚期非小细胞肺癌患者作为研究对象,所有患者入院后均经肺组织活检或气管镜检查确诊为晚期非小细胞肺癌。对患者进行病理组织石蜡切片DNA（tDNA）检测,并采集患者肘静脉血使用高通量基因测序技术检测患者外周血循环肿瘤ctDNA基因情况。对比分析tDNA与ctDNA检测对患者DNA基因突变的准确性,探讨非小细胞肺癌患者进行高通量基因测序技术检测外周血循环肿瘤DNA基因突变的应用价值。结果:40例非小细胞肺癌的外周血循环肿瘤DNA基因突变检测与组织石蜡切片比较,两种方法检测率差异无统计学意义（P>0.05）。在高通量基因测序技术检查外周血循环肿瘤DNA中,21外显子测序结果:61号替代突变2573G→T,62/63/68号替代突变L858R（2573T→G）。19外显子测序结果:50号样品突变为del E746→A750+2235G→A,60号样品突变为del E746→A750,70号样品突变为del L747→T751,80号样品突变为del L747→S752＋2257C→T。结论:非小细胞肺癌外周血循环肿瘤DNA基因突变进行高通量基因测序技术对具体的基因突变或缺失具有较高准确性,可实时监测肿瘤DNA基因突变情况,且具有无创性、可重复应用等优点。     

Evaluation of denaturing high-performance liquid chromatography as a rapid detection method for identification of epidermal growth factor receptor mutations in nonsmall-cell lung cancer

BACKGROUND: Somatic mutations of the epidermal growth factor receptor (EGFR) gene in nonsmall-cell lung cancer (NSCLC) may predict responsiveness to tyrosine kinase inhibitors. These mutations are commonly identified using DNA sequencing methods. Although considered the gold standard, this approach is time-consuming. In addition, this approach requires large diagnostic specimens and a high ratio of tumor-to-normal-tissue DNA for optimal results. The use of denaturing high-performance liquid chromatography (dHPLC) as a method to screen for the 2 predominant EGFR mutations is reported. METHODS: Clinical specimens from 104 NSCLC patients were analyzed for EGFR mutations in exons 19 and 21. After DNA extraction and polymerase chain reaction (PCR), both direct sequencing and dHPLC were performed and the results were compared. RESULTS: Sequencing revealed a total of 7 mutations: 3 deletion mutations in exon 19 and 4 missense mutations in exon 21. dHPLC showed the presence of genomic alterations in 23 samples, including the 7 identified by sequencing plus 16 additional samples (10 in exon 19 and 1 in exon 21). dHPLC fractions were isolated, reamplified, and sequenced to confirm the results. In serial dilution studies, dHPLC was able to detect mutations in samples containing as little as 1.6% to 6.25% mutated DNA, whereas direct sequencing required at least 30%. CONCLUSIONS: dHPLC is an efficient and more sensitive method for screening for genomic alterations in exons 19 and 21 of the EGFR gene compared with direct sequence analysis. These data suggest that dHPLC should be implemented as a screening tool for detection of EGFR mutations.     

TaqMan-MGB探针实时荧光聚合酶链反应快速检测非小细胞肺癌表皮生长因子受体基因突变

目的探讨非小细胞肺癌(NSCLC)瘤组织表皮生长因子受体(EGFR)基因突变及TaqMan MGB探针实时荧光PCR快速检测EGFR突变的诊断价值。方法应用聚合酶链(PCR)反应,对80例手术切除NSCLC瘤组织EGFR基因的第18、19和21外显子片段进行扩增和测序, Chromas软件分析基因突变。设计EGFR突变位点的TaqMan MGB探针,采用实时PCR检测瘤组织EGFR突变,并与测序结果比较。实时PCR的敏感性与特异性评价,用不同混合数量的PC-9细胞(19外显子缺失)为阳性参照。结果21例NSCLC瘤组织存在EGFR基因突变,总体突变率为26.3%。其中13例为EGFR第19外显子阅读框内多核苷酸的缺失,8例为第21外显子2573位核苷酸点突变。诊断的特异性与敏感性均为100%。当PC-9突变型细胞仅占10%时或PC-9细胞数低达50只时,PCR仍然检测到EGFR基因突变的存在。女性、不吸烟和肺腺癌患者EGFR基因突变率显著高于男性、吸烟和非腺癌患者(P<0.05)。EGFR基因突变与患者年龄、TNM分期等因素无关。结论NSCLC存在EGFR基因的突变或缺失,其中以女性、腺癌和不吸烟患者突变率较高。TaqMan MGB探针联合实时PCR可有效地检测出EGFR基因突变,操作简便,易于临床推广。     

中国人非小细胞肺癌EGFR和K-ras基因突变与临床病理特征及厄洛替尼治疗效果的关系

目的 研究中国小细胞肺癌(NSCLC)患者表皮生长因与受体(EGFR)和K-ras基因突变情况,探讨其与NSCLC临床病理学特征及厄洛替尼治疗效果的关系.方法 利用PCR扩增和基因测序的方法检测301例中国NSCLC患者EGFR基因第18、19、20和21外显子及K-ras基因第1213密码子的突变情况,并分析其与NSCLC临床病理学特征及厄洛替尼治疗效果的关系.结果 301例患者中,99例(32.9%)有EGFR基因突变,其中第18外显子上发生突变3例,第19外显子上发生突变59例,第20外显子上发生突变2 例,第21外显子上发生突变35例.14例(4.7%)有K-ras基因突变,其中13例位于第12密码子.无同时存在EGFR和K-ras基因突变者.腺癌、无吸烟史和女性患者EGFR基因突变率较高,分别为45.7%、48.4%和49.6%.10例服用厄洛替尼有效的患者中7例携带有EGFR基因突变.结论 中国NSCLC患者EGFR基因突变率显著高于西方人群,而K-ras基因突变率则较西方人群低.联合检测EGFR和K-ras基因的突变情况可以筛选EGFR酪氨酸激酶抑制剂治疗的获益人群,并较好地预测厄洛替尼治疗晚期NSCLC的疗效.