广东省中山市2018-2019年沙门菌血清型分布、耐药性及分子分型

目的了解中山市沙门菌的血清型分布、分子分型特征以及对抗生素的耐药情况。方法对2018—2019年中山市哨点医院以及食物中毒事件采集检出的沙门菌进行血清型分型,采用微量肉汤稀释法(MIC)对15种药物进行药物敏感试验,应用脉冲场凝胶电泳法(pulse-field gel electrophoresis, PFGE)对3种优势血清型沙门菌进行分子分型。结果 509株沙门菌共鉴定出44种血清型,优势血清型为鼠伤寒沙门菌单相变种(173/509,34.0%)、鼠伤寒沙门菌(107/509,21.0%)、肠炎沙门菌(93/509,18.3%)和斯坦利沙门菌(21/509,4.1%)。179株沙门菌中耐药菌株占93.9%(168/179),多重耐药菌株占85.5%(153/179)。共产生82种耐药谱,最常见的耐药谱为AMP-AMS-TET-CHL-SXTCFZ-Sul和AMP-TET-CHL-SXT-Sul。暂未检出对亚胺培南耐药的菌株,对其余14种试验药物均存在耐药现象,其中对氨苄西林、四环素、磺胺异噁唑、氯霉素、复方新诺明耐药率均超过60%。耐受10种及以上抗生素的菌株有22株,占12.3%(22/179)。42株鼠伤寒沙门菌单相变种分出40个PFGE带型,各型别相似度为52.2%～100.0%;32株鼠伤寒沙门菌分出24个PFGE带型,各型别相似度为48.9%～100.0%;21株肠炎沙门菌分出9个PFGE带型,各型别相似度为55.5%～100.0%。结论中山市沙门菌血清型主要为鼠伤寒沙门菌单相变种、鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌,多重耐药现象严重,PFGE分子分型结果呈多样性。     

上海市宝山区2015—2018年腹泻病人沙门菌血清分型和分子分型

目的 揭示上海市宝山区腹泻病人分离沙门菌的血清型和分子分型分布特征。方法 对2015—2018年分离的118株沙门菌进行血清分型和脉冲场凝胶电泳（pulsed-field gel electrophoresis,PFGE）分型,通过构建聚类树揭示不同血清型菌株的分子分型特征。结果 118株沙门菌分为25种血清型,前三位为肠炎沙门菌（45株,38.1%）、鼠伤寒沙门菌（26株,22.0%）、伦敦沙门菌（11株,9.3%）。其余22种血清型分别只包含1~3株菌。118株沙门菌通过PFGE分为71个PFGE带型,每个带型分别包含1~19株菌。45株肠炎沙门菌分为8个PFGE带型,相似度为75.0%~100.0%,在聚类树上形成一个簇;26株鼠伤寒沙门菌分为21个PFGE带型,相似度为48.0%~100.0%,在聚类树上形成两个簇;11株伦敦沙门菌分为8个PFGE带型,相似度为80.0%~100.0%,在聚类树上形成一个簇。结论 肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌是上海市宝山区腹泻病人沙门菌优势血清型,但近年伦敦沙门菌有增多的趋势。肠炎沙门菌在本地区传播流行过程中的遗传变异相对比较保守,鼠伤寒沙门菌基因型多态性大,而且存在两个克隆。     

广东省中山市2017年沙门菌耐药菌谱及分子分型分析

目的 了解中山市2017年沙门菌的耐药特征及分子分型,为临床合理用药和食源性疾病的溯源提供科学依据。方法 对中山市2017年食源性疾病监测（3个哨点医院）的沙门菌分离株采用微量肉汤稀释法进行14种抗生素药敏试验,运用脉冲场凝胶电泳（PFGE）技术对肠炎沙门菌进行分子分型。 结果 中山市2017年食源性疾病监测检出的285株沙门菌对14种抗生素敏感性试验结果显示,237株（占83.16％）沙门菌对13种抗生素呈现不同程度的耐药性,未发现对亚胺培南（IPM）耐药菌株。耐药抗生素最多的种类达到11种,耐药率较高（40 %以上）的抗生素为氨苄西林（AMP）、四环素（TET）、氨苄西林/舒巴坦（SAM）、氯霉素（CHL）;共有87类耐药谱型,其中多重耐药谱型75类（86.21%）,多重耐药菌株数为176株（61.75%）。25株肠炎沙门菌的PFGE分为5种带型,相似度为63.9%~100.0%。结论 中山市2017年食源性疾病监测显示沙门菌耐药状况较为严重,呈多重性和多态性,应采取综合措施控制耐药性;肠炎沙门菌PFGE的相似度较高,存在优势带型。     

一起由两种型别沙门菌混合感染引起暴发疫情的病原特征

目的 对一起由科瓦利斯沙门菌和鼠伤寒沙门菌混合感染引起的食源性暴发的病原体进行耐药分析和分子分型。方法 参照 GB4789.4-2010标准对可疑菌落进行生化鉴定、血清学分型及药敏试验后,进行脉冲场凝胶电泳（PFGE）分子分型。结果 从两份暴发病例粪便样品中同时检出科瓦利斯沙门菌（8,20∶z4,z23∶-）2株和鼠伤寒沙门菌（4,5,12∶i∶1,2）2株。选择13种常用的抗生素进行药敏试验, 4株沙门菌均对阿米卡星和庆大霉素耐药,其中2株科瓦利斯沙门菌还同时表现出对莫西沙星和四环素耐药。2株科瓦利斯沙门菌和2株鼠伤寒沙门菌的PFGE指纹图谱分别完全一致。结论 这是一起由科瓦利斯沙门菌和鼠伤寒沙门菌混合感染所致的食源性暴发,PFGE分子分型可有效应用于食物中毒的溯源分析。     

瑞安市腹泻患者沙门菌耐药性和分子分型研究

目的了解瑞安市腹泻患者沙门菌的血清型、耐药性和分子分型特征。方法收集2016—2019年从瑞安市人民医院收治的腹泻患者中分离的沙门菌进行血清学分型,采用K-B纸片法进行药物敏感性试验,利用脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行分子分型。结果共收集到134株沙门菌,分为24个血清型,其中鼠伤寒沙门菌52株（38.8%）,肠炎沙门菌31株（23.1%）,伦敦沙门菌13株（9.7%）。沙门菌血清型分布在12岁以下组和21~60岁组患者间存在统计学差异（P＜0.05）。沙门菌对氨苄西林的耐药率最高,达73.1%;肠炎沙门菌对萘啶酸耐药率达到100%;鼠伤寒沙门菌对萘啶酸的耐药率为48.1%;相比肠炎沙门菌,鼠伤寒沙门菌对复方新诺明、氯霉素、甲氧苄啶、四环素的耐药率更高。随机抽取40株沙门菌进行PFGE,结果得到29种带型,菌株相似度为63%~100%。结论不同年龄组患者分离的沙门菌血清型构成不同。沙门菌多重耐药形势严峻,鼠伤寒沙门菌的耐药性普遍高于其他血清型;对阿莫西林/克拉维酸、头孢他啶、亚胺培南、氨曲南具有较高敏感性。鼠伤寒沙门菌在分子水平存在一定程度的分化,而肠炎沙门菌分化程度不高。     

2019—2020年桂林市食源性沙门菌耐药分析及PFGE分型研究

目的 了解2019—2020年桂林市沙门菌耐药情况及分子分型特征，以期了解桂林市食源性沙门菌的流行变化规律。方法 对2019—2020年食源性风险监测及突发公共卫生事件检出的69株沙门菌进行血清分型，根据CLSI 2020推荐标准，采用微量肉汤稀释法测定最低抑菌浓度(MIC),分析耐药性，以脉冲场凝胶电泳法(PFGE)进行分子分型。结果 69株沙门菌分属20个血清型，优势血清型为鼠伤寒沙门菌(27.54%)和肠炎沙门菌(14.49%);2019年的32株菌共产生17个耐药谱，其中9株鼠伤寒沙门菌对四环素100%耐药；2020年的37株菌共产生24个耐药谱，其中10株鼠伤寒沙门菌对磺胺异噁唑100%耐药。69株沙门菌呈现出多个不同的基因型别。相同血清型的基因型比较相近，具有同源性，不同血清型的PFGE结果具有多态性。结论 2019—2020年桂林市沙门菌的优势菌株为肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌，检出的沙门菌存在耐药现象，不同沙门菌菌株之间可能具有亲缘性关系。     

江苏省张家港市2017年人源沙门菌血清型特征及分子分型

目的 分析2017年张家港检出的92株人源沙门菌的血清学特征,用脉冲场凝胶电泳（PFGE）技术对优势血清群进行分子分型研究,为该地区沙门菌菌型库积累数据。方法 收集和提取2017年张家港地区人源沙门菌患者血清学特征,对优势群B群沙门菌进行PFGE分子分型检测,利用PulseNet China网络获得相关性指纹图谱并进行聚类分析。结果 92株沙门菌分离株分布7个血清群和16个血清型,以B群为主（33.70％）,30株B群沙门菌PFGE指纹图谱可分为26个基因型（相似值100% 为同一PFGE 型别）,19个克隆系（相似度在0.85~1.00的为同一PFGE的克隆系）。其中9株德尔卑沙门菌可分为5个克隆系7个基因型,7个基因型相似度60.92％~100％;7株阿贡那沙门菌PFGE指纹图谱5个克隆系6个基因型,6个基因型相似度0~100%;6株鼠伤寒沙门菌可分为3个克隆系5个基因型,5个基因型相似度48.51％~100％。结论 张家港市人源沙门菌血清型多样化分布,B群沙门菌为优势血清群。沙门菌PFGE带型较多,基因多态性较高,同一血清型可获得不同PFGE指纹图谱。其中德尔卑沙门菌亲缘关系近,鼠伤寒部分菌株存在较近的亲缘关系,阿贡那沙门菌各克隆系存在明显差异,亲缘关系较远。     

沙门菌基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱与血清学分型比较及药敏结果

目的 研究血清学试验和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF-MS）在沙门菌分型检测中的应用和药敏试验结果,比较鼠伤寒沙门菌和其他所有沙门菌的耐药差异,为临床用药提供依据。方法 收集腹泻儿童粪便标本中分离非重复沙门菌属40株;采用BD phoenix M50全自动细菌鉴定药敏分析系统进行细菌鉴定和药敏试验,再进行沙门菌血清型分型;利用WHONET 5.6软件及SPSS13.0软件对细菌耐药性进行统计分析;采用MALDI-TOF-MS法对沙门菌进行质谱鉴定。结果 40株经仪器鉴定为沙门菌株,血清学试验分为10个血清型,分属5个血清群,优势血清型为鼠伤寒沙门菌,占65.0%;其次为肠炎沙门菌和斯坦利沙门菌,各占7.5%,未检出伤寒和副伤寒沙门菌;MALDI-TOF-MS鉴定结果均能鉴定到种属水平,且匹配分数均>2.300。当差异水平为200时,可分为20个型别,其中14株为单株菌。血清学分型与MALDI-TOF-MS鉴定结果相比：28株鉴定结果与血清型一致,主要为鼠伤寒沙门菌、肠炎沙门菌和斯坦利沙门菌;12株鉴定结果与血清型不一致。血清学分型与MALDI-TOF-MS法关系密切,但两者不完全对应。沙门菌药敏试验结果显示,耐药率较高的抗菌药物依次为氨苄西林、哌拉西林、四环素,耐药率均大于70.0%;对阿米卡星、美洛培南、哌拉西林/他唑巴坦、头孢他啶、亚胺培南均敏感。结论 两种方法均能快速准确鉴定出沙门菌,MALDI-TOF-MS法和血清学分型配合使用,对沙门菌的快速鉴定有重要意义。     

4例多重耐药非伤寒沙门菌的耐药基因和分子分型

目的 研究中山市多重耐药非伤寒沙门菌株的耐药基因和分子分型特征。 方法 分析2015年7月中山市博爱医院培养出的4例多重耐药NTS菌株的药敏结果,并且对该4例菌株进行脉冲场凝胶电泳分型（PFGE）多位点序列分型技术（MLST）和全基因组测序分析（WGS）,并在此基础上对4例菌株进行差异性分析,量化菌株之间的遗传发育距离,确定病例菌株之间的关系。 结果 4例菌株均为鼠伤寒沙门菌变种,并且均为多重耐药菌株,菌株S2、S3和S4药敏结果几乎相同,与S1差异较大。PFGE可将4例菌株分为两个大组（组A和组B）,菌株S2、S3、S4落到同一个大组B中,菌株S2、S3、S4抗原式相同并均与S1有差异;MLST发现菌株S1为ST19型,菌株S2、S3、S4为ST34型。菌株S1抗药基因谱与菌株S2、S3、S4差异大,菌株S2、S3和S4 均有blaCTX-M-55基因。菌株S2、S3和S4的WGS形似度非常高,几乎可确定为同一来源。 结论 4例多重耐药菌株均为鼠伤寒沙门菌变种,菌株S2、S3和S4为同一来源。 blaCTX-M-55基因可能是造成本次中山市NTS多重耐药的主要原因之一。     

天津市2018—2020年腹泻症候群病原菌检测结果分析

目的 为了解天津市细菌性腹泻病原谱构成,探讨近年来天津市主要病原菌的变异和流行变迁规律,为细菌性腹泻诊断和防控提供科学依据。方法 采集2018—2020年天津市哨点医院细菌性腹泻症候群患者标本826份,开展多种肠道致病菌检测,并对优势菌进行PFGE（pulsed-field gel electrophoresis）分子分型分析。结果 天津市细菌性腹泻病病原谱前三位的分别为：沙门菌（5.69%）、致泻性弧菌（2.66%）、嗜水气单胞菌（1.09%）。沙门菌可分为14个血清型,其中肠炎沙门菌为优势血清型（占44.68%）,其次为鼠伤寒沙门菌（占19.15%）。2018—2019年的沙门菌流行趋势较为平缓,2020年则呈双峰分布。2018—2019年7—8月为副溶血性弧菌检出阳性高峰期,2020年全年均未检出副溶血性弧菌。46株沙门菌成功分型,得到33种PFGE带型,菌株间相似度在51.7%~100.0%,其中PT22、PT24、PT25为优势型。结论 沙门菌是天津市2018—2020年细菌性腹泻病的主要致病菌。分子分型结果呈现多样性。为有效防控细菌感染性腹泻,应针对重点区域、重点人群和高发季节采取有效防控措施。     

沙门菌携带者分离株血清学及PFGE分型研究

目的建立在健康携带者分离的沙门菌的血清型及PFGE分子型别图谱库,探讨其多态相关性关系。方法将预防性健康体检分离获得的21株沙门菌鉴定培养,进行血清分型;将确定后的菌株用限制性内切酶Xba I消化酶切其基因组DNA,在脉冲场凝胶电泳仪进行DNA电泳,所得的分子型别图谱用Bionumerics5.1软件建立图谱数据库,并进行聚类分析。结果21株沙门菌分属于O：4（B）、O：9（D1）和O：3,10（E1）3个菌群,8种血清型;以德尔卑沙门菌为主,共7株占所有分离株的占33.3%,其次为阿贡纳沙门菌19.1%（4/21）,鼠伤寒沙门菌14.3%（3/21）。经比对分析,18株沙门菌分为15个PFGE型别,菌株间的相似值在53.9%～100%之间,同一血清型别的沙门菌可对应多个PFGE型别。结论沙门菌的PFGE型别呈现多样性,脉冲场凝胶电泳对从业人员体检沙门菌有较高的分型能力,可为沙门菌的日常监测和相关疫情的处理提供重要的技术支撑。     

街道饮食及服务行业从业人员携带沙门菌的病原学特征研究

目的分析龙岗街道饮食及服务行业从业人员健康体检分离的沙门菌的耐药性及分子分型。方法对分离到的11株沙门菌进行血清学分型鉴定,并采用脉冲场凝胶电泳（PFGE）和改良K．B法分别进行分子分型和药敏试验。结果11株沙门菌鉴定出B群5株,E1群6株。对四环素的耐药率最高（63．64％）,其次为氨苄西林（54．55％）、链霉素（54．55％）,5株菌有多重耐药的现象（45．5％）。PFGE分子分型菌株之间的相似度在51．8％。96％之间．同一血清型的沙门菌相互间的相似度均低于85％。结论从业人员携带的沙门菌耐药比较严重,PFGE分型、血清型与耐药谱无直接关联。     

儿童感染沙门菌耐药特点及鉴定方法的研究

目的 研究引起儿童感染的沙门菌耐药特点及快速鉴定方法。方法 选择沙门菌75株,使用标准生物化学和血清学试验对所有菌株进行鉴定;使用16S rRNA基因测序法鉴定;使用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(matrix assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry, MALDI-TOF-MS)法鉴定,以上两种方法结果与传统培养方法结果进行比对分析。使用Kerby-Bauer纸片扩散法对常用抗生素进行敏感性试验,使用聚合酶链反应 (polymerase chain reaction, PCR)测定对广谱β-内酰胺类药物耐药的基因。结果 75株沙门菌中,鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌检出率最高,分别为32株和26株。16S rRNA基因测序法与传统培养法的符合率为100%。MALDI-TOF-MS法的属符合率为100%,其中鉴定率在99.9%以上的为17株,90%以上的为32株,80%以上的为26株,结果均可信,但其对具体血清型的符合率不高。75株沙门菌中,耐药率最高的是氨苄西林(69.3%,52/75),其次是氨苄西林/舒巴坦(44.0%,33/75),第三是萘啶酸(42.7%,32/75)。75株沙门菌中共检出19株对广谱β-内酰胺类药物耐药,占25.3%。19株中有15株携带blaCTX-M基因(8株为blaCTX-M-14,2株为blaCTX-M-9,1株为blaCTX-M-34,2株为blaCTX-M-3,2株为blaCTX-M-15),8株携带blaTEM-1基因,4株携带blaOXA-1基因。结论 16S rRNA基因测序法作为细菌鉴定的金标准,以其快速准确著称,可作为传统鉴定法的补充方法。MALDI-TOF-MS法可以快速鉴定沙门菌,但仅在科研模式下指向性地提示血清型,因此需采用其他辅助技术进行鉴定。引起儿童腹泻的沙门菌对多种抗生素耐药,对3代头孢菌素类的耐药主要由blaCTX-M型引起。     

广东省茂名市儿童食源性沙门菌感染的血清型分型和耐药特征

目的 分析茂名市儿童食源性腹泻中沙门菌感染的血清型分型情况和耐药性特征,了解茂名市儿童沙门菌感染的流行趋势,为防控儿童食源性疾病和临床治疗提供参考数据。方法 收集茂名市2018—2019年从儿童食源性腹泻病例监测医院中分离的沙门菌366株进行血清型分型,采用微量肉汤稀释法进行耐药性检测。结果 5 279例儿童食源性腹泻病例中沙门菌检出率为366例,检出阳性率为6.93%,3岁以下儿童病例检出率占94.54%,男女病例比例为1.63∶1,发病时间集中在6—11月份,存在双高峰的特点。血清型分为33个型别,优势血清型分别为1,4,[5],12:i:-（33.33%）、鼠伤寒沙门菌（26.23%）和斯坦利沙门菌（12.84%）。366株沙门菌有80.32%菌株存在不同程度的耐药,分成为62种耐药谱且多重耐药菌株达70.49%。其中对四环素类、磺胺类、青霉素类和氯霉素类抗生素耐药严重,耐药率达50.0%~70.0%;碳青霉烯类、多粘菌素类和三代以上的头孢菌素类抗生素敏感率均>90.0%。结论 茂名市儿童食源性沙门菌感染以3岁以下幼儿感染为主且男童多见,呈现夏秋季流行特点。茂名市沙门菌的主要血清型构成发生变化,以1,4,[5],12:i:-为优势型,同时耐药谱多样且耐药情况严重。需持续加强对儿童食源性沙门菌,特别是1,4,[5],12:i:-型别感染的监测并合理使用抗生素。