广东省发现三株新型沙门氏菌的分析

1998 - 1 999年间我们对饮食从业人员健康体检 ,自 2 3438份粪便标本中检出了诺威奇 (编号 :98- 2 892 )、胥莱士亥姆 (编号 :99- 32 1 8)、南班克 (编号 :99- 4533)三株沙门氏菌。现将分离鉴定结果报告如下。1 分离方法 :用棉拭子采集粪便置于肠道增菌肉汤中 37℃增菌过夜 ,转种ＳＳ平板 37℃分离培养 ,2 4小时后将可疑菌落接种于克氏双糖铁培养基上。2 菌落形态与镜检 :上述菌株在ＳＳ平板上均呈园形、光滑、湿润、半透明、中心带黑色的菌落。镜检为革兰氏阴性短杆状。3 生化反应结果 :见附表。 肠杆菌科噬菌体裂解试验 :使用珠海东大生…     

脊髓损伤患者肠道菌群属水平的特征及意义

目的 探讨脊髓损伤患者肠道菌群属水平变化特征及其在临床康复中的意义。方法 2018年1月至12月,纳入脊髓损伤患者23例(患者组)和健康受试者21例(对照组),采集粪便样本,应用16S rDNA高通量测序检测肠道菌群,并采用物种组成分析及随机森林机器学习等生物信息学方法分析两组间属水平的菌群分布及差异。结果 患者组丰度升高的重要标志性菌属分别是：瘤胃菌科的UBA1819、Ruminiclostridium 9、Ruminococcaceae NK4A214 group、Ruminococcus 2、Ruminococcaceae UCG-005、Ruminiclostridium 5、Flavonifractor;理研菌科的Alistipes、dgA-11 gut group、Rikenellaceae RC9 gut group;毛螺菌科的[Eubacterium] oxidoreducens group;消化链球菌科的Intestinibacter;肠杆菌科的Escherichia-Shigella (志贺菌属);以及Tannerellaceae的Parabacteroides (|U| > 1.962, P< 0.05)。患者组丰度降低的是梭杆菌科Fusobacterium菌属(|U| = -2.284, P< 0.05)。结论 脊髓损伤患者肠道菌群与健康对照组存在差异。脊髓损伤患者与抑郁相关的瘤胃菌科、与中枢神经系统疾病关系密切的瘤胃球菌,以及肠道内致病菌消化链球菌属、志贺菌属等的相对丰度增加;对肠道有益的产丁酸盐菌和抗炎性菌属的相对丰度降低。这些菌群变化可能有一定的临床意义。     

综合鉴定培养基在肠杆菌科细菌鉴定中的应用

在肠杆菌科细菌鉴定中 ,克氏双糖管已沿用了多年 ,由于其生化反应项目较少 ,在细菌鉴定中只能起到粗筛作用 ,为了减少肠杆菌科细菌鉴定的环节 ,缩短患者候检时间 ,我科采用了综合鉴定培养基 (又称多糖管 ) ,通过临床标本分离到的 94 5株菌株生化反应观察 ,认为该培养基可同时观察葡萄糖、乳糖、甘露醇的产酸与产气、硫化氢、动力及尿素的分解 ,根据以上生化结果 ,结合血清学凝集试验 ,具有快速筛选肠道致病菌的优点 ,对非发酵菌结合氧化酶试验亦能初步作出鉴别 ,现将其配制及反应结果报告如下 :1　材料和方法1 .1　培养基　 1底层成分 :蛋白…     

素食人群与非素食人群肠道菌群分布对比分析

目的通过比较素食人群与非素食人群肠道菌群分布,探讨饮食习惯与人体肠道菌群分布之间的关系。方法将50例素食者纳入研究组,50例非素食者纳入对照组,收集所有研究对象粪便标本,测定粪便标本pH值,使用经典的细菌分离培养和鉴定方法,比较两组研究对象粪便标本的细菌总数及肠杆菌、肠球菌、拟杆菌、乳酸杆菌和双歧杆菌的数量。结果研究组粪便标本pH值低于对照组粪便标本pH值,差异有统计学意义(P<0.05)。两组细菌总数差异无统计学意义(P>0.05),研究组的双歧杆菌与乳酸杆菌数量明显少于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论从肠道益生菌数量的角度来看,非素食饮食更有利于健康,素食人群可通过服用微生态活菌制剂或适量增加蛋奶制品的摄入来增加肠道益生菌的数量,以增强人体的抗病能力。     

肠杆菌科中一个新的属和种——关岛特布尔西氏菌

1985至1988年间,美国疾病控制中心(CDC)收到7株生物化学相似的未定归属的肠杆菌科细菌,这7株菌与CDC 收集的第8株菌被称为第90肠道菌群(Enteric Group 90)。本群细菌的生物化学特性与沙门氏菌属相似,尤其是沙门氏菌属亚群4和5,然而它们与沙门氏菌标准血清O 或H 抗血清的任何一型均不发生凝集。经DNA/DNA 杂交试验结果表明:第90肠道菌群的7株菌与收集到的第1株菌(ATCC49490)的相关性为98%～100%(60℃)和94～100%(75℃),而它们与62株肠杆菌科的其它菌种的相关性仅为6～41%,其中与沙门氏菌属,克卢瓦氏     

应用Vitek—AMS细菌鉴定仪鉴定三株绿色气球菌

随着现代细菌鉴定技术的飞速发展,临床鉴定与识别罕见细菌的能力有了很大提高。现报道我院1999年2月从临床标本中分离的3株绿色气球菌的情况。方法和结果一、用Vitek-AMS鉴定及生化反应　2份标本取自颈静脉置管处或穿刺针处,另1份标本取自上肢创面分泌物。3份标本接种血平板培养后长出的菌落大小约1mm,灰白色,呈草绿色溶血。涂片革兰染色呈单个,成双,或四联状的阳性球菌,无芽胞,触酶试验呈阴性,故初步印象可能为“D-群链球菌”。取GPI鉴定卡进行鉴定,3株均于12h后报告为气球菌(99?rococcus)。3株菌在Vitek-AMS中呈阳性的生化反应有:…     

从膀胱造瘘患者尿中分离出多重耐药的栖冷克吕沃菌

克吕沃菌属(Kluyvera)1981年由Farmer等正式确认,属肠杆菌科,包括抗坏血酸克吕沃菌和栖冷克吕沃菌2个种.多从呼吸道、泌尿道、肠道标本中检出,是条件致病菌.国外相关报道较多,国内报道较少.2005年2月,我们从膀胱造瘘患者尿中检出1株革兰阴性杆菌,经MicroScan微生物分析仪鉴定为栖冷克吕沃菌(K. cryocrescens),鉴定率为99.9%,报道如下.     

MADLI-TOF MS 和PhoenixTM-100 两种分析仪鉴定肠杆菌科细菌一致性评价

目的　评价德国Bruker 公司的基质辅助激光解析电离飞行时间质谱（MALDI-TOF MS) 和美国BD 公司的菲尼克斯100(PhoenixTM-100) 细菌鉴定仪对临床分离肠杆菌科细菌鉴定的一致性。方法　回顾性分析2017 年1 月～ 2019年8 月苏州大学附属第三医院从临床各类标本中分离出的肠杆菌科细菌1 242 株,MALDI-TOF MS 和PhoenixTM-100 细菌鉴定仪对这些菌株进行鉴定,运用统计学方法分析并评估两种仪器的鉴定结果的一致性。结果　在两台仪器均能鉴定到属水平的1 242 株细菌中,鉴定到菌种水平的一致率达85.1％ (1 057 株)。在8 株肺克鼻臭亚种菌种的鉴定上,PhoenixTM-100 鉴定出6 株,MALDI-TOF MS 鉴定出2 株,两组间的鉴定比较差异有统计学意义(χ2=4.00,P=0.046),在其他种水平上的鉴定结果差异无统计学意义（χ2=0.207~4.000, 均P ＞ 0.05）。沙门菌属均未能鉴定到种水平。结论　两种仪器都能准确鉴定肠杆菌科细菌到属水平,可用于临床微生物实验室对临床标本的常规鉴定,但对肺克鼻臭亚种和沙门菌属并不能精准的鉴定到种水平。     

儿童抗幽门螺旋杆菌感染治疗对肠道菌群影响的研究

目的探讨抗幽门螺旋杆菌 (helicobacter pylori,Hp)感染治疗对患儿肠道菌群的影响,为预防抗生素所致肠道不良反应提供实验依据。方法收集2013年12月～2014年7月在陕西省人民医院消化内科、儿科共60例患儿,对Hp阳性患儿使用克拉霉素片、阿莫西林／克拉维酸钾片和奥美拉唑肠溶胶囊抗Hp菌治疗10天后,留取新鲜粪便标本进行肠道菌群分析。分别称取患儿治疗前后的新鲜粪便1.0 g,进行肠道菌群培养,鉴定肠道菌群的菌种,将其数量和检出率等观察指标进行统计学分析。结果肠杆菌、肠球菌、双歧杆菌、类杆菌和乳杆菌在抗Hp感染治疗前后患儿肠道的检出率均为100%。治疗后双歧杆菌、乳杆菌数量下降,差异有统计学意义(t=44.745～49.19,P<0.01),其余肠杆菌、肠球菌、类杆菌、产气荚膜梭菌和酵母菌五类菌种治疗前后的数量差异无统计学意义(P>0.05)。治疗后患儿肠道微生物定植抗力值(B/E值)0.69±0.33,较治疗前1.18±0.44降低(t=7.715,P<0.05)。结论抗Hp感染治疗易引起患儿双歧杆菌和乳杆菌菌群紊乱,患儿肠道定植抗力降低。故抗菌药物治疗Hp感染时须注意及时补充以双歧杆菌和乳杆菌为主要成分的益生菌制剂。     

失血性休克家兔肠道菌群生态学的变化及其意义

本研究采用家兔失血性休克模型,对回盲部肠道菌群生态学的变化及其在内源性感染发病中的作用进行了初步探讨。结果发现:1.休克组动物4天存活率为50.0%,对照组无一例死亡;2休克后早期菌群无异常改变,48小时肠杆菌明显增多。休克死亡者拟杆菌与肠杆菌比值显著低于休克存活者及对照组(P<0,01);3.休克死亡动物血液细菌培养伤后持续阳性,检出菌与肠道优势生长菌一致,而休克存活者48小时血培养转为阴性。本实验表明:创伤休克可引起肠道菌群发生生态平衡失调,肠道菌群紊乱能促进肠道细菌易位与肠源性感染的发展,加剧宿主的脓毒状态,在导致休克的不可逆中具有一定的意义。     

上海市检出一株B群eh单相变种沙门菌

20 0 0年 5月中旬 ,在对服务性行业从业人员预防性健康体检中 ,我们从一份肛拭标本检出 1株Ｂ群ｅｈ单相变种沙门菌 (血清型 ) ,该菌经形态观察、生化和血清学反应及ＯＩ噬菌体裂解试验确证为沙门菌 ,现将检定结果报道如下。一、材料和方法1.标本来源　健康体检者以无菌棉签肛拭采集标本 ,置ＳＦ增菌液中作选择培养及Ｓ .Ｓ平板分离培养。2 .方法　按沙门菌检验常规进行菌种鉴定[1] ;Ｈ抗原诱导采用软琼脂平板法[2 ] 。3.诊断血清　沙门菌属诊断血清 (15 9种 )为卫生部成都生物物品研究所生产 ,在有效期内使用。4.肠杆菌科分属诊断噬菌体　…     

志贺氏菌在邹城地区的菌型分布及耐药性分析

众所周知 ,细菌性痢疾是一种常见多发的重要肠道传染病。志贺氏菌菌型变迁的观察和耐药性监测 ,是细菌性痢疾监测的重要部分。为更好地搞好我市的细菌性痢疾防治工作 ,指导临床合理使用抗生素 ,我们将近几年来邹城地区志贺氏菌菌型分布和耐药性监测资料整理报告如下。1　材料和方法1.1　菌株来源　由本市饮食服务行业从业人员健康体检标本中检出 ,标本采集及培养按肠杆菌科检验方法进行。1.2　菌株鉴定分型　上述方法培养分离出的菌株经系统生化反应和血清学诊断鉴定为志贺氏菌。系统生化反应管自配 ,诊断血清由卫生部兰州生物制品研究所提…     

低聚果糖对双歧杆菌增殖效果及肠道菌群的影响

目的　分析低聚果糖体外对双歧杆菌的增殖效果,及体内对肠道菌群的影响。方法　在厌氧菌液体 培养基中加入低聚果糖,观察双歧杆菌的增殖情况;用培养方法检测肠道菌群。结果　在厌氧菌液体培养基中 加入低聚果糖前后双歧杆菌菌数分别为1.5亿/ml和3亿/ml;服用低聚果糖后,35～50患者肠道内肠杆菌及类 杆菌显著减少,50岁以上者肠道内双歧杆菌显著增多。结论　低聚果糖对双歧杆菌有增殖效果,对人体肠道菌 群具有一定的调节作用。     

急性腹泻病原菌检测分析

为了摸清急性腹泻流行季节的病原菌分布状况,1998年夏季,我们对医院肠道门诊急性腹泻病人进行检测,结果报告如下。共检测148例急性腹泻患者的粪便标本,分离出各种肠道致病菌78株,其中志贺氏痢疾杆菌38株,占4872%,是本次检出的主要流行菌属,其它检出副溶血性弧菌21株,占2693%;检出致病性大肠埃希氏菌9株,占1154%;变形杆菌5株,占641%;金黄色葡萄球菌2株,占256%;伤寒沙门氏菌1株,占128%。经鉴定,被检出的38株志贺氏痢疾杆菌的菌群分布,见表1。从表1中看出38株志贺氏菌分布Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ四个群,8个血清型(亚型),其中福氏志贺氏菌(Ｂ群)30株,占7…     

重症监护室肺部感染患者肠道菌群特征分析

目的 探究重症监护室(ICU)肺部感染患者的肠道菌群特征,为肺部感染的危重症患者微生态靶向治疗提供借鉴。方法 收集2021年3-9月入住重庆高新区人民医院ICU的肺部感染患者粪便样本78例,ICU非肺部感染患者粪便样本22例,健康人群的粪便样本40例,采用16S rRNA测序技术对粪便菌群进行检测鉴定,通过生物信息学方法比较并分析ICU肺部感染患者肠道菌群结构特征。结果 ICU肺部感染患者的肠道微生物与健康人群相比,alpha多样性显著降低。ICU肺部感染患者肠道菌群以厚壁菌门、拟杆菌门、普雷沃菌属和拟杆菌属为主。处于极度失调(单一菌群丰度>50%)的ICU肺部感染患者的肠道菌群主要富集了普雷沃菌属、拟杆菌属、肠球菌和埃希菌等细菌。LEfSe分析提示,疣微菌科是ICU肺部感染患者肠道菌群中的标志性微生物。ICU肺部感染患者与健康人群相比,糖类和氨基酸代谢通路有所降低。另外,患者年龄结构、体质量指数、急性生理与慢性健康评分系统Ⅱ评分和住院时间与部分肠道菌群存在紧密联系。结论 ICU肺部感染患者与健康人群相比,肠道菌群多样性显著降低。ICU肺部感染患者中肠道菌群极度失调者,可能由于感...     

伤口分泌物分离培养出肠杆菌科细菌的耐药性分析

肠杆菌科细菌是兼性厌氧G- 杆菌群中最常见、成员最庞大、与疾病关系最密切的菌科 ,肠杆菌科细菌分布广泛 ,与人类的关系密切 ,肠杆菌科细菌大多数是肠道正常菌群 ,它们寄居人类和动物的肠道与机体呈共生状态。除沙门菌属、志贺菌属、耶尔森菌属、埃希菌属有明显致病作用外 ,肠杆菌科其他种属的细菌常常被认为是机会致病菌 ,常引起如菌血症 ,脑膜炎 ,泌尿系、呼吸道和伤口感染。约有5 0 %的医院内感染都是由这些机会致病菌引起。本文分析讨论了我院近年来从伤口分泌物中分离培养到的 97例次肠杆菌科细菌的药敏结果。1　材料与方法1.1　材料…     

细菌性痢疾粪便的培养及分析

目的：分析近年细菌性痢疾的临床特点和药物敏感性。了解本地志贺菌菌群的分布及耐药性，指导临床用药。方法：对56例上高县人民医院就诊的腹泻患者粪便标本进行痢疾杆菌分离，以生化试验和血清学试验进行菌株分型和对药物敏感测试。结果：共分离56株痢疾杆菌，生化及血清分型鉴定，福氏志贺氏菌为绝对优势菌，占68％。宋内氏志贺氏菌占23％，痢疾志贺氏菌占9％；药敏显示对头孢曲松、头孢噻肟、头孢哌酮的敏感率较高分别为90.5％、95.7％、97.5％。环丙沙星、哌拉西林次之，分别为83．5％、60．5％，氨苄青霉素、氯霉素、SXT有较低的敏感率，分别为1．3％、2.5％、1.9％。结论：分离的痢疾杆菌对头孢曲松、头孢噻肟、头孢哌酮等敏感性较高，可为临床合理使用抗生素提供参考。     

Microflex~(TM) MALDI-TOF MS和Vitek 2 Compact全自动微生物分析系统对肠杆菌科细菌鉴定能力的比较

目的比较MicroflexTM基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)和Vitek 2 Compact全自动微生物分析系统(简称Vitek 2 Compact)对肠杆菌科细菌的鉴定能力。方法采用MicroflexTMMALDI-TOF MS和Vitek 2 Compact同时对545株肠杆菌科质控菌株和临床分离菌株进行鉴定,鉴定结果不一致者采用沙门菌血清凝集试验或细菌16S r DNA基因测序予以确证。结果 MicroflexTMMALDI-TOF MS对545株细菌的种和属的鉴定率分别为97.1%、2.9%。Vitek 2 Compact对545株细菌的种、群、属的鉴定率分别为83.3%、13.9%和2.2%,鉴定错误率为0.2%,未鉴定率为0.4%。结论 MicroflexTMMALDI-TOF MS对肠杆菌科细菌的鉴定符合率高于Vitek 2 Compact,且操作快速、简便,成本低,可用于临床肠杆菌科细菌的常规快速鉴定。     

蔗糖发酵型伤寒杆菌生化变异的鉴定

根据国际微生物学会对沙门菌属细菌的定义 ,沙门菌属细菌的生化反应特点之一 ,是对蔗糖不发酵和硫化氢试验一般为阳性。我们自 1996～ 1998年先后检出 12株蔗糖发酵迅速而硫化氢试验阴性的伤寒沙门菌 ,经生化鉴定及血清凝集鉴定试验 ,符合伤寒沙门菌 ,按伤寒沙门菌感染治疗 ,患者在短期内治愈出院。现报告如下。一、材料和方法1 标本来源 :12株蔗糖发酵型伤塞沙门菌 ,均来自我院住院患者的血液 (7株 )、骨髓 (3株 )、粪便 (2株 )标本。2 培养与鉴定 :将上述标本按常规方法进行培养后 ,取无色透明或半透明的菌落按肠杆菌科生化试验进行鉴定…     

同种不同株型阴沟肠杆菌引起的肺部感染

阴沟肠杆菌是临床感染的常见菌 ,属于耐药性较强的菌。我们从一例肺部感染住院患者痰中分离到 2株同种不同株型的阴沟肠杆菌 ,其生化表型及耐药表型均显示差异 ,报道如下。一、材料和方法1 标本分离 :患者清晨痰标本 ,分别接种血琼脂和嗜血杆菌巧克力琼脂 ,置ＣＯ2 孵箱 35℃培养 2 4ｈ ,长出灰白色扁平菌落 ,为革兰阴性杆菌。2 方法 :生物梅里埃ＶＩＴＥＫ 32微生物自动分析仪进行细菌鉴定和药敏试验 ,并用纸片扩散法补充部分药敏试验。二、结果生化鉴定 (ＧＮＩ 卡 )为阴沟肠杆菌 (6 46 4772 6 32 ) ,药敏(ＧＮＳ ＧＡ卡 ) :氨苄西林、头…