中国北方汉族人群HBV携带者和慢性乙肝患者TNF-α基因启动子区单核苷酸多态性分析

目的探讨在中国北方汉族人群中TNF-α基因启动子区单核苷酸多态性（SNPs）及其单倍型是否与HBV感染结局相关联。方法以212例无症状HBV携带者和207例慢性乙肝患者为研究对象,应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）和序列特异性引物-PCR（SSP-PCR）方法对TNF-α基因启动子区5个位点,进行基因分型,用EPI和EH等软件分析各位点等位基因、基因型、单倍型频率及其组间差异。结果TNF-α基因-238GG基因型和-863CC基因型是HBV感染后个体发生乙型肝炎慢性化的易感因素（P=0．05,P〈0．01）。5个位点组成的单倍型GGCCT在慢性肝炎组的频率显著低于无症状携带组（P〈0．05）,单倍型GGCAT和GGTAT在慢性肝炎组的频率显著高于无症状携带组（P〈0．05）。结论TNF-α基因启动子区多态性可能是影响HBV感染结局的重要宿主遗传因素之一。     

维生素D受体基因起始密码子和CDX2多态性与钙剂补充对绝经后妇女骨密度作用的关系

目的了解维生素D受体（vitamin D receptor，VDR）基因（VDR）起始密码子（Fok Ⅰ位点）和启动子区CDX2结合位点多态性与绝经后妇女钙剂补充对骨密度（bone mineral density，BMD）和骨转换指标作用的关系。方法200名受试对象（均为上海市汉族无亲缘关系的绝经后妇女）分为两组：高钙组（日服元素钙1000mg和维生素D400IU）和低钙组（日服元素钙300mg和维生素D300IU）各100名，期限1年。检测治疗前后BMD和骨转换指标，以及VDR基因Fok Ⅰ位点和CDX2结合位点多态性。结果其中171名完成整个研究。研究人群础Ⅰ基因型频率分布依次为Ff（48．0％）、FF（31．0％）和ff（21．0％）；CDX2基因型频率分布依次为AG（56．7％）、GG（25．7％）和AA（17．6％），上述等位基因频率分布在整个人群或2亚组中均符合Hardy-Weinberg定律。无论在整个人群组、或是2亚组中，Fok Ⅰ或CDX2各基因型间各部位BMD和各骨转换指标的基线值差异均无统计学意义；钙剂补充1年时，各部位BMD和骨转换指标的终点值和变化的百分数与Fok Ⅰ或CDX2多态性均无相关性。结论高钙或低钙的补充对上海市汉族绝经后妇女BMD或骨转换指标的影响与VDR基因Fok Ⅰ或CDX2多态性无相关性。     

维生素D受体基因多态性与维生素D缺乏性佝偻病遗传关联性Meta分析

目的评价维生素D受体（VDR）基因多态性与维生素D缺乏性佝偻病（佝偻病）的遗传关联性。方法制定原始文献的纳入标准及检索策略,检索PubMed、Springer、Science Direct、Web of Science、中国期刊全文数据库、维普中文科技期刊数据库和万方数据库,收集VDR基因FokⅠ、ApaⅠ、BsmⅠ和TaqⅠ位点多态性与佝偻病相关性的病例对照研究,以佝偻病患儿为病例组。依据NHI-NHGRI研究工作组2007年制定的遗传关联性研究报告规范为基础,并依据相关文献选取其中的14条标准用于评价文献偏倚。以基因型频率为指标,提取数据后先确定最佳遗传模型,采用Stata 11.0软件进行Meta分析,计算合并的OR值及其95%CI。结果 19篇病例对照研究进入Meta分析。①FokⅠ位点采用共显性模型（FF基因型vsff基因型;FF基因型vsFf基因型）分析,病例组704例,对照组596例。Meta分析结果显示,亚洲人群FF基因型较ff基因型（OR=4.59,95%CI：2.98~7.07）和Ff基因型（OR=2.58,95%CI：1.79~3.73）患佝偻病的风险显著增加;高加索人群FokⅠ位点与佝偻病无显著关联性（FF基因型vsff基因型,OR=2.50,95%CI：0.76~8.19;FF基因型vsFf基因型,OR=1.18,95%CI：0.66~2.10）;非洲人群FF基因型较ff基因型患佝偻病的风险显著增加（OR=5.81,95%CI：1.21~27.98）。②ApaⅠ位点采用显性模型（AA＋Aa基因型vsaa基因型）分析,病例组338例,对照组459例。亚洲人群和非洲人群ApaⅠ位点与佝偻病均无显著关联性,OR分别为1.04（95%CI：0.72~1.49）和0.98（95%CI：0.57~1.71）;高加索人群AA＋Aa基因型患佝偻病的风险增高（OR=5.50,95%CI：1.22~24.75）。③BsmⅠ位点采用显性模型（bb基因型vsBb＋BB基因型）分析,病例组822例,对照组736例。亚洲人群BsmⅠ位点bb基因型较Bb＋BB基因型患佝偻病的风险降低（OR=0.46,95%CI：0.23~0.92）,非洲人群BsmⅠ位点与佝偻病无显著关联性（OR=1.65,95%CI：0.95~2.88）。④TaqⅠ位点采用隐性模型（TT基因型vsTt＋tt基因型）分析,病例组519例,对照组513例。亚洲人群（OR=1.22,95%CI：0.82~1.82）、高加索人群（OR=0.91,95%CI：0.35~2.35）和非洲人群（OR=1.18,95%CI：0.68~2.05）TaqⅠ位点与佝偻病无显著关联性。结论现有证据表明,亚洲人群FokⅠ位点FF基因型为患佝偻病的危险因素,而BsmⅠ位点bb基因型为佝偻病轻微的保护因素,尚不能认为ApaⅠ和TaqⅠ位点与佝偻病有关联性;由于高加索人群和非洲人群研究较少,VDR基因多态性与佝偻病的关联性尚不明确。     

维生素D受体基因启动子Fok I多态性与尿钙浓度的关系

目的 研究维生素D受体（VDR）基冈启动子Fok Ⅰ多态性与尿钙浓度之间的关系.方法 应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）对50例泌尿系结石（结石组）及50例非泌尿系结石患者（对照组）的外周血进行Fok I多态性检测,分析两组间基因型和等位基因的频率分布,并用常规尿生化分析仪比较两组的24 h尿钙浓度.结果 结石组基因型分布：FF 28%（14/50）,Ff 52%（26/50）,ff 20%（10/50）;对照组：FF 34%（17/50）,Ff 56%（28/50）,ff10%（5/50）,其中FF和ff基因型分布在两组中差异有统计学意义（P〈0.05）.结石组与对照组等位基因F分布频率分别为54%（54/100）和62%（62/100）（P〉O.05）;f分别为46%（461100）和38%（381100）（P〈0.05）.结石组FF、Ff、ff基因型的24 h尿钙浓度分别为（0.030±0.008）mmol/kg、（0.037±0.009）mmol/kg和（0.081±0.013）mmol/kg,对照组分别为（0.028±0.006）mmol/kg、（0.036±0.002）mmol/kg和（0.043＋0.003）mmol/kg,FF和Ff基因型在两组中尿钙浓度之间差异没有统计学意义（P〉0.05）,而ff基因型差异有统计学意义（P〈0.05）.结论 VDR基因起始密码子中Fok I多态性与泌尿系结石患者尿钙浓度升高有关系.     

青海省汉族妊娠期高血压疾病与维生素D受体基因FokⅠ多态性的关系

目的 探讨维生素D受体(VDR)基因单核苷酸多态性(SNP)FokⅠ(rs2228570/rs10735810)位点多态性与青海省汉族妇女妊娠期高血压疾病(HDCP)的相关性。方法 选择青海省汉族HDCP患者137例(HDCP组),正常汉族孕妇146例(对照组),使用聚合酶链式反应-限制性核酸内切酶片段长度多态性(PCR-RFLP)方法检测HDCP组和对照组FokⅠ位点的基因分型并测序验证,使用SPSS 19.0统计学软件检验两组一般临床资料、基因型及等位基因频率分布差异是否具有统计学意义。结果 HDCP组和对照组FokⅠ位点FF、Ff、ff基因型频率分别为51.82%、37.96%、10.22%和34.93%、43.15%和21.92%(χ²=11.099,P<0.05),HDCP组FF基因型(OR=2.004,95%CI=1.243～3.231)频率高于对照组;HDCP组和对照组FokⅠ位点F和f等位基因频率分布差异有统计学意义(χ²=12.454,P<0.001),HDCP组F等位基因(OR=1.253,95%CI=1.10...     

维生素D受体基因起始密码和3‘端多态性与绝经后妇女骨密度的关系

目的：了解维生系D受体（vitamin d receptor,VDR)基因起始密码多态性和3'端多态性对北京地区汉族绝经后妇女骨密度（bone mineral density,BMD)值的影响是否具有协同作用。方法：应用聚合酶链反应－限制性片段长度多态性检测了110绝经后妇女VDR基因Fok 1和3'端多态性，同时用双能X线吸收法测定绝经后妇女腰椎2－4（L2－4）、股骨颈、Ward's三角和大转子区的BMD值。结果：被研究人群Fok I、Apa I、Bsm I和Taq I等位频率分布均符合Hardy-Weinberg定律。单独分析各基因型与绝经后妇女BMD值的关系，仅显示Bsm I基因型与BMD值有关联（P＜0．05）；协同分析Fok I基因型和Apa I、Bsm I、Taq I基因型与BMD值的关系，显示Fok I-Apa I基因型与绝经后妇女L2－4 BMD值显著相关（P＜0．001），而未见Fok I-Bsm I基因型与绝经后妇女各部位BMD值的关联，Fok I-Taq I基因型与股骨颈和大转子区部位BMD值有关联（P＜0．05）。此外，未发现VDR基因3'端多态性之间与各部位的BMD值有关联。结论：VDR基因Fok I多态性虽然与绝经后妇女BMD值无关联，但Fok I多态性和3'端多态性（Apa I和Taq I）对绝经后妇女BMD值的影响具有协同作用。     

HLA-DRBl＊04等位基因多态性与乙型肝炎病毒感染结局关联分析

目的从分子遗传学角度探讨乙型肝炎病毒（hepatitis B virus，HBv）感染结局与GLA—DRBl＊04等位基因的相关性。方法采用聚合酶链反应一序列特异性引物（polymerase chain reaction-sequence specific primers，PCR-SSP）技术检测HLA-DRBl＊04等位基因，并比较106例无症状HBV携带者（HBV携带组），93例慢性乙型肝炎患者、77例乙肝肝硬化者、102例HBV感染后自然恢复者（对照组）HIA-DRBl＊04等位基因频率及HBV不同复制状态下HLA-DRBl＊04等位基因频率。结果HBV携带组、慢性乙肝组、乙肝肝硬化组HLA-DRBl＊04等位基因频率高于对照组（分别为25．94％、26．34％、27．92％和14．22％，P〈0．01）；HLA—DRBl＊0401基因频率高于对照组（分别为20．91％、24．49％、22．09％和8．62％，P均〈0．05）；HLA-DRBl＊0405基因频率较对照组低（3．64％、2．04％、3．49％和15．52％，P〈0．01、0．01、0．05）。各病例组之间HLA—DRBl＊04等位基因频率差异无统计学意义（P〉0．05）。HBV不同复制状态HLA-DRBl＊04等位基因频率差异无统计学意义（P〉O．05）。结论HLA-DRBl＊04是决定HBV感染结局的因素之一，但不影响HBV在体内复制。     

中国人内源性高甘油三酯血症患者胆固醇酯转运蛋白基因Taq IB和-629C/A多态性

目的研究胆固醇酯转运蛋白（cholesterol ester transfer protein，CETP）基因多态性是否与中国人内源性高甘油三酯血症（hypertriglyceridemia，HTG）有关联，为探讨本病的分子遗传基础提供依据。方法应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析法，对成都地区汉族214名正常人及135例HTG患者CETP基因Taq IB和-629C／A多态性位点进行分析。结果中国人CETP基因Taq IB多态位点B2等位基因频率为0．418，-629C／A多态位点A等位基因频率为0．479。HTG组和对照组Taq IB位点和-629C／A之间等位基因的频率差异无统计学意义（0．382 vs 0．418，P〉0．05；0．489 vs 0．479，P〉0．05）。两位点连锁关系分析提示其存在强的连锁不平衡（D＇=0．881）。对照组Taq IB位点B2B2基因型携带者其血清高密度脂蛋白水平较B1B1携带者高（P〈0．05），而低密度脂蛋白较B1B2者显著降低，按性别划分为亚组后，差异仅在对照组男性存在（P〈0．05）；对照组-629C／A位点CC基因型携带者其血清低密度脂蛋白水平较AC基因型者显著降低（P〈0．01），而载脂蛋白AⅡ则显著升高（P〈0．05）。两位点联合基因型的分析显示，对照组B2B2CC基因型携带者血清高密度脂蛋白较B1B1CC型者显著升高（P〈0．05），B2B2CC型者与B1B1CC型者比较，甘油三酯水平显著降低（P〈0．05）。结论中国成都地区汉族人CETP基因Taq IB多态性与血清高密度脂蛋白、低密度脂蛋白含量有一定关联，-629C／A多态性与血清低密度脂蛋白和载脂蛋白AⅡ有一定关联，但未见这些位点与内源性高甘油三酯血症有关。     

阿昌族与汉族维生素D受体基因FokⅠ多态性

目的 了解维生素D受体基因多态性在中国不同民族中的分布。方法 应用聚合酶链反应一限制性片段长度多态性分析、基因测序等技术检测68名阿昌族人和92名汉族人的维生素D受体基因Fok Ⅰ多态性，比较两组维生素D受体基因型和等位基因的分布频率。结果在68名阿昌族人中FF基因型占18％、Ff基因型占35％、ff基因型占47％，而在92名汉族人中FF基因型占22％、Ff基因型占52％、ff基因型占26％。两组维生素D受体基因型的分布频率差异有显著性(x^2=7．716，P=0．021)。结论 阿昌族与汉族维生素D受体基因Fok Ⅰ多态性分布频率差异有显著性。     

维生素D受体基因ApaⅠ多态性与维生素D缺乏性佝偻病易感性研究

目的研究维生素D受体(vitamin D receptor，VDR)基因多态性与维生素D缺乏性佝偻病易感性的相关性，探讨维生素D缺乏性佝偻病的遗传易感因素。方法应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析及基因测序等技术测定34例维生素D缺乏性佝偻病息儿和52名正常儿童的VDR基因多态性，比较两组VDR基因型和等位基因频率。结果在病例组和对照组中AA、Aa、aa基因型频率分别为17．6％、50．0％、32．4％和7．7％、28．8％、63．5％，A、a等位基因频率分别为42．6％、57．4％和22．1％、77．9％。两组AA、Aa、aa基因型频率差异有统计学意义(χ^2=8．113，P=0．017)，两组A和a等位基因频率的差异也有统计学意义(r=8．217，P=0．004)，佝偻病组中A等位基因频率高于对照组。结论VDR基因ApaⅠ酶切位点多态性与维生素D缺乏性佝偻病存在相关性，携带A等位基因的个体存在对佝偻病的易感性，提示VDR基因ApaⅠ酶切位点多态性可能在决定个体维生素D缺乏性佝偻病遗传易感性方面有重要作用。     

Analysis of HLA-DQB1 gene polymorphisms in asymptomatic HBV carriers and chronic hepatitis B patients in the Chinese Han population

Host genetic factors and environment factors including hepatitis B virus (HBV) genotype are widely viewed as common basis of the different outcomes of HBV infection. Human leucocyte antigen (HLA) plays an important role in immunological reaction to HBV infection. The study aimed to explore whether the HLA-DQB1 allele polymorphisms are associated with the outcomes of HBV infection in the Chinese Han population. One hundred and thirty-four asymptomatic HBV carriers and 139 chronic hepatitis B patients were recruited in this case-control study in Beijing, China. Sequence-specific primers-polymerase chain reaction was used to detect 13 alleles of HLA-DQB1 gene. The frequency distributions of alleles in two groups were analysed using sas 9.1.2 software. After adjustment of confounders the frequencies of HLA-DQB1*0503 allele and *0303 allele in chronic hepatitis B group were statistically significant lower than those in asymptomatic HBV carrier group (P = 0.04; P = 0.05), and the frequency of exposure to alcohol consumption in patients with chronic hepatitis B was clearly higher than that in asymptomatic HBV carrier group (P = 0.004). HLA-DQB1*0503 allele and *0303 allele are independently resistant genetic factors to chronic hepatitis B, and alcohol consumption is the risk factor of chronic hepatitis B.     

HLA-DQA1基因多态性与HBV感染结局相关

目的探讨中国汉族人群人类白细胞抗原(HLA)-DQA1基因多态性是否与乙型肝炎病毒(HBV)感染结局相关联。方法以213例HBV自限性感染者和420例慢性乙肝患者为研究对象,应用聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-SSP)技术进行HLA-DQA1基因分型,用EPI和SPSS软件分析DQA1多态性的分布频率及其组间差异。结果DQA1*0102在慢性乙肝组的分布频率显著低于HBV自限性感染组(15.47%比较20.42%,P<0.05),而DQA1*0201在慢性乙肝组的分布频率显著高于HBV自限性感染组(10.48%比较6.10%,P<0.05)。调整性别、年龄等混杂因素影响的非条件logistic回归分析结果显示,与HLA-DQA1其他等位基因相比,携带DQA1*0102者降低慢性乙肝发生的风险(P<0.05,OR=0.69,95%C I:0.49-0.96),而携带DQA1*0201者增加慢性乙肝发生的风险(P<0.05,OR=1.77,95%C I:1.09-2.87)。结论HLA-DQA1基因多态性可能是影响HBV感染结局的重要宿主遗传因素。     

白细胞介素10基因启动子区多态性与乙型肝炎病毒感染预后的关联研究

目的探讨中国汉族人白细胞介素10基因(interleukin10gene,IL10)启动子区单核苷酸多态性与乙型肝炎病毒(hepatitisBvirus,HBV)感染、转归的关联。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析方法,检测231例HBV感染者,165例HBV感染康复者和135名正常对照者IL10基因启动子-1082G/A、-819T/C、-592A/C位点基因型。结果IL10基因启动子-1082G/A、-819T/C、-592A/C位点基因型和等位基因在HBV感染组、HBV感染康复组和正常对照组之间的分布频率比较差异无统计学意义(P>0.05),在血清HBV-DNA<1×103拷贝/mL的HBV感染者组和HBV-DNA≥1×103拷贝/mL组之间的分布频率比较差异亦无统计学意义(P>0.05);但IL10基因启动子-819T/C和-592A/C位点基因型和等位基因在HBV无症状携带组和慢性乙型肝炎组之间的分布差异有统计学意义(P<0.05),-819T/C位点TT型和-592A/C位点AA型在慢性乙型肝炎组的频率明显较高。结论汉族人IL10基因启动子多态性可能与人群对HBV易感性及感染后的病毒血症水平无显著相关性;但IL10启动子-819T/C和-592A/C位点基因多态性与HBV感染后的肝脏炎症反应有关。     

HLA-DQA1基因多态性和HBV感染结局的关联

目的 探讨人类白细胞抗原(HLA)DQA1基因多态性与乙型肝炎病毒(HBV)感染临床结局的关联.方法 临床收集慢性乙型肝炎(120例)、慢性HBV携带者(60例)、自限性HBV感染者(60例)三组病例,前两组诊断均经肝活检证实.聚合酶链反应序列特异性引物(PCR-SSP)法检测HLA-DQA1基因型,比较组间基因频率的差异.结果 (1)HLA-DQA1*0201在慢性乙型肝炎组的分布频率显著高于自限性HBV感染组(38.3% vs 5.8%,P<0.001,A=10.04,95% CI:4.48～22.48);HLA-DQA1*0102的分布频率显著低于自限性HBV感染组(9.6% vs 36.7%,P<0.001,A=0.183,95%CI:0.10～0.32).(2)HLA-DQA1*0201在慢性乙型肝炎组的分布频率显著高于慢性HBV携带者组(38.3% vs 7.5%,P<0.01,A=7.667,95% CI:3.7～15.87);HLA-DQA1*0102的分布频率显著低于慢性HBV携带者(20% vs 9.6%.P<0.01,A=0.424,95% CI:0.23～0.79).结论 HLA-DQAI基因多态性影响HBV感染临床结局,其中DQA1*0102呈保护作用,DQA1*0201可能促进HBV感染的慢性化和肝炎的发生.     

HLA-DRB1及HLA-DQA1单倍型与乙型肝炎病毒感染结局的关联研究

目的探讨中国北方汉族人群HLA-DRB1、DQA1单倍型与乙型肝炎病毒（hepatitis B virus，HBV）感染不同结局的关系。方法采用序列特异性引物聚合酶链反应（sequence specific primers polymerase chain reaction，PCR-SSP）技术检测HLA-DRB1、DQA1等位基因，并比较207例慢性乙型肝炎患者，212名无症状HBV慢性携带者（HBV携带者），148例自限性HBV感染者的单倍型频率。结果自限性HBV感染组单倍型DRB1＊04-DQA1＊0301的频率为10．03％，显著高于慢性乙肝组的3．66％（P=0．0005）：DRB1＊15／＊16-DQA1＊0102的频率为6．80％，显著高于慢性乙肝组的1．94％（P=0．0012）和无症状HBV慢性携带者组的1．65％（P=0．004）；DRB1＊04-DQA1＊0302单倍型在慢性乙型肝炎组的频率为3．10％，明显高于自限性HBV感染组的0．39％（P=0．0077）。结论HLA-DRB1、DQA1单倍型与个体感染HBV后的不同结局存在显著关联。     

Heterogeneity of vitamin D receptor gene association with celiac disease and type 1 diabetes mellitus

OBJECTIVE: Vitamin D has been shown to exert multiple immunomodulatory effects and is known to suppress T-cell activation by binding to the vitamin D receptor (VDR). To determine whether VDR gene polymorphisms are related to the susceptibility to celiac disease, we investigated its implication as a candidate gene in the Basque population. Because celiac disease and type 1 diabetes share common susceptibility loci, we also analyzed families with type 1 diabetes mellitus. METHODS: A total of 37 families with celiac disease and 64 type 1 diabetic families of Basque origin with at least one affected offspring were genotyped for four VDR restriction-site polymorphisms (Fok I, Bsm I, Apa I and Taq I). The AFBAC approach was used to test for association. RESULTS: Comparison of VDR genotypes of the patients with those of 88 healthy individuals identified "ff" as a risk genotype for celiac disease [p = 0.01; OR = 3.45 (1.12-10.79)]. On the other hand, a significantly higher frequency of haplotype "fBAt" was observed in the type 1 diabetic group [p(c) = 0.02; OR = 4.4 (1.5-15.3)]. CONCLUSION: Our findings suggest that polymorphisms within the vitamin D receptor gene are markers of susceptibility to or protection from autoimmune diseases, although, at least in the Basque population, association of VDR variants with celiac disease and type 1 diabetes seems to be heterogeneous.     

Correlation of interleukin-10 gene haplotype with hepatocellular carcinoma in Taiwan

Polymorphisms in cytokine genes can influence immune responses, inflammation and tissue injury, and may affect the outcome of hepatitis B virus (HBV) infection. We analyzed single nucleotide polymorphisms (SNP) in the interleukin (IL)-10 gene among 344 HBV carriers and 208 patients with hepatocellular carcinoma (HCC). Genotypes and haplotypes were tested for association with HCC. IL-10/-592 C/C genotype was associated with a higher risk for HCC compared with IL-10/-592 A/C and A/A genotypes [odds ratio (OR): 2.1, 95% confidence interval (CI): 1.2-3.6]. IL-10/1927 A/A genotype was also associated with a higher risk for HCC compared with IL-10/1927 A/C and C/C genotypes (OR: 1.5, 95% CI: 1.0-2.2). Haplotype analysis revealed that the homozygosity of the C-A haplotype (defined by SNPs at positions -592 and 1927) of IL-10 gene conveys the highest risk for HCC among HBV carriers compared with the homozygosity for the A-C haplotype (OR: 2.6, 95% CI: 1.3-4.9). The results demonstrate that IL-10 gene polymorphism can affect the outcome of chronic HBV infection. Further studies are necessary to clarify how variation in the IL-10 gene affects IL-10 function and risk of HCC.