无下尿路症状的女性2型糖尿病周围神经病变患者的尿液菌群特征

目的:探讨无下尿路症状的女性2型糖尿病周围神经病变(DPN)患者的尿液菌群特征。方法:采用横断面调查研究,收集南方医科大学南方医院2017年5月至2018年8月收治的2型糖尿病且无下尿路症状的女性患者30例,17例合并糖尿病周围神经病者为DPN组,13例未合并糖尿病周围神经病变者为nDPN组。两组患者均行神经传导功能检查和美国泌尿外科学会症状指数问卷(AUA-SI)。收集两组患者的清洁中段尿标本并进行DNA提取,采用Illumina测序平台进行扩增和高通量测序,原始数据导入QI-IME软件分析样本微生物的α和β多样性,采用LEfSe软件分析两组间具有显著差异的菌群。结果:DPN组糖尿病病程明显短于nDPN组[(4.12±3.28)年与(8.03±6.11)年,P=0.03]。DPN组视网膜病变例数明显多于nDPN组(6例与0例,P=0.03),两组间其余临床资料及生化指标差异均无统计学意义(P>0.05)。α多样性分析结果显示,与nDPN组相比,DPN组的尿液菌群丰富度显著下降(sobs指数67.24±40.25与108.69±57.18,P=0.03;chao指数81.36±47.99与122.55±55.70,P=0.04;ace指数88.58±55.03与125.78±53.03,P=0.04),但两组间群落多样性差异无统计学意义(shannon系数1.53±1.11与1.91±0.87,P=0.26;simpson指数0.48±0.34与0.34±0.20,P=0.41)。β多样性分析结果显示,DPN组与nDPN组的菌群结构差异无统计学意义(P>0.05)。LEfSe分析结果显示,在菌科水平,DPN组支原体科相对丰度显著高于nDPN组(Metastats值0.52±0.01与0.01±0.00001,P=0.02);在菌属水平,DPN组芽孢杆菌属、杜氏菌属、纤毛菌属、变形杆菌属、丙酸菌属、假黄色单胞菌属、蛭弧菌属、不可培养土壤细菌属等8个菌属相对丰度均降低(P<0.05)。结论:无下尿路症状的女性2型糖尿病周围神经病变患者的尿液菌群明显不同于无周围神经病变患者,其菌群丰富度降低,支原体科细菌可能为DPN患者的潜在生物标志物。     

喉癌术后疗效与长链非编码RNA LUCAT1的表达水平的关系

目的探讨喉癌组织中长链非编码RNA(lncRNA) LUCAT1的表达水平, 及其与患者临床病理特征、预后和新辅助化疗疗效的关系。方法选取2020年12月到2022年12月商丘市第一人民医院手术切除的73例喉癌标本作为研究对象, 取周围的癌旁组织作为对照样本。采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)分析肿瘤组织和癌旁组织中lncRNA LUCAT1表达水平;分析lncRNA LUCAT1与喉癌患者临床病理特征的关系;分析影响喉癌的预后因素;分析lncRNA LUCAT1与新辅助化疗疗效的关系。组间计量数据比较采用t检验。结果癌旁组织中lncRNA LUCAT1表达水平(1.10±0.15)明显低于喉癌组织中表达水平(2.18±0.32), 差异有统计学意义(t=26.510, P<0.05)。Ⅲ～Ⅳ期患者肿瘤组织lncRNA LUCAT1表达水平(2.39±0.24)明显高于Ⅰ～Ⅱ期患者(1.99±0.24), 差异有统计学意义(t=7.045, P>0.05)。低分化患者肿瘤组织lncRNA LUCAT1表达水平(2.39±0.25)明显高于中高分化患者(1.98±0.23),...     

乙型肝炎失代偿期肝硬化患者肠道菌群特征

目的观察乙型肝炎失代偿期肝硬化患者肠道菌群特征。 方法收集首都医科大学附属北京地坛医院收治的符合入排标准的乙型肝炎失代偿期肝硬化患者及健康者粪便标本共82例，其中乙型肝炎失代偿期肝硬化且不合并其他感染者41例和健康对照者41例。所有标本均进行细菌16S rDNA高通量测序，并用Qiime软件、R软件以及LEfSe软件分析菌群构成、丰度和差异性等特征，同时分析两组研究对象肝硬化生态失调比值的差异。 结果乙型肝炎失代偿期肝硬化组患者粪便菌群丰度及多样性较健康对照组显著降低，Weighted Unifrac的Beta多样性分析显示两组研究对象肠道菌群结构差异有统计学意义（P = 0.004）。门水平方面，乙型肝炎失代偿期肝硬化组患者厚壁菌门丰度较健康对照组显著降低（Z =－2.57、P = 0.045）。属水平方面，乙型肝炎失代偿期肝硬化患者组链球菌属、梭杆菌属、韦荣球菌属和嗜血杆菌属丰度较健康对照组显著增加（P均< 0.05）；毛螺菌属、Dorea、Dialister、Subdoligranulum丰度较健康对照组显著降低（P均< 0.05）。使用LEfSe软件比较两组人群菌群差异及其功能，发现两组间具有显著差异的菌群生物学指标有乳杆菌目、梭菌目毛螺菌科及瘤胃菌科（LDA > 4）。 结论乙型肝炎失代偿期肝硬化且不合并感染者的肠道菌群多样性显著降低、厚壁菌门相对丰度显著降低，存在显著的肠道菌群失衡，但菌群失衡程度较轻，涉及显著变化的菌属较少。     

多囊卵巢综合征伴胰岛素抵抗患者肠道菌群分析

目的基于16S rRNA高通量测序技术对多囊卵巢综合征(PCOS)伴胰岛素抵抗(IR)患者肠道菌群的结构特征进行分析。方法选择2019年7月至2020年6月期间就诊于青岛大学附属烟台毓璜顶医院的新发PCOS女性,根据稳态模型胰岛素抵抗指数(HOMA-IR)分为IR-PCOS组(n=11)和NIR-PCOS组(n=10)。选择同期在毓璜顶医院体检中心行孕前检查的年龄匹配且排卵正常的女性为对照组(HC组,n=11)。对所有研究对象进行直肠拭子取样,扩增细菌的16S rRNA V3-V4片段然后对其进行测序,分析各组对象肠道菌群的组成特征及其与临床参数之间的相关性。结果相较于健康女性,PCOS患者肠道菌群结构发生了显著改变,表现为多样性降低(P<0.05),菌群中拟杆菌门相对丰度显著高于HC组(P<0.001),厚壁菌门显著减少(P<0.01);IR-PCOS组患者肠道菌群多样性降低程度显著大于NIR-PCOS组患者(P<0.05),拟杆菌门相对丰度也显著高于NIR-PCOS组患者(P<0.001)。菌群中弯曲杆菌、拟杆菌门、脱硫杆菌门和睾酮、黄体生成素、黄体生成素与卵泡刺激素之比、体质量指数、胰岛素抵抗指数、肿瘤坏死因子、血脂紊乱程度呈正相关,而变形菌门、放线菌门和绿弯菌门则与之呈负相关,其中弯曲杆菌和黄体生成素与卵泡刺激素之比、变形菌门和体质量指数、绿弯菌门和血清总胆固醇之间的相关性有统计学意义(P<0.05)。结论PCOS伴IR患者肠道菌群紊乱更加明显,肠道菌群失调可能是加重PCOS患者代谢异常的原因之一。     

上尿路尿路上皮癌患者尿液菌群特征分析

目的探讨上尿路尿路上皮癌(UTUC)患者的尿路菌群特征。方法收集皖南医学院第一附属医院弋矶山医院2021年7月至2022年7月收治的23例UTUC患者(UTUC组)和22例良性疾病患者(对照组)的尿液样本。UTUC组与对照组年龄[(60.9±5.7)岁与(61.4±8.8)岁]、性别(男/女:15/8与9/13)、体质量指数[(22.9±1.8) kg/m2与(23.4±1.7)kg/m2]差异均无统计学意义(P>0.05)。使用NovaSeq 6000测序平台对尿液样本微生物16S rRNA的V4区测序, 使用QLLME2软件处理所得数据。采用Shannon指数、辛普森指数和Chao1指数分析组间α多样性;使用非加权主坐标分析(PCoA)进行组间β多样性分析。线性判别分析(LEfSe)鉴定组间丰度存在差异的菌群, 以线性判别分析值(LDA)>2为有显著差异。结果 UTUC组较对照组的Chao1指数(703.12±265.54与506.20±214.02)和Shannon指数(5.61±1.85与5.07±1.34)均明显增高(P<0.05), UTUC组较对照组患者...     

叉头框蛋白M1促进三阴性乳腺癌进展的分子机制

目的探讨叉头框蛋白M1(FOXM1)在乳腺组织表达水平及其对乳腺癌细胞进展的影响。方法选取2022年1月至2023年1月郑州大学第一附属医院择期手术的68例乳腺癌组织和癌旁组织作为研究对象, 采用蛋白质印迹法(Western blot)和荧光定量聚合酶链反应(PCR)分析FOXM1蛋白和mRNA表达水平;采用对照短发卡RNA(shRNA)和FOXM1 shRNA慢病毒感染乳腺癌细胞MDA-MB-231, 建立对照组和FOXM1 KD组细胞, 采用噻唑蓝(MTT)法测定两组细胞的活力;流式细胞术分析两组细胞的周期和凋亡水平;Transwell分析两组细胞迁移和侵袭能力, Western blot分析两组细胞上皮细胞和间质细胞标志物表达水平;采用荧光定量PCR分析肿瘤和细胞中FOXM1靶基因KIF4A、MYBL2和Integrin β1 mRNA表达水平。组间比较采用t检验。结果癌旁组织FOXM1蛋白表达水平(1.29±0.28)明显低于三阴性乳腺癌组织(1.90±0.26), 差异有统计学意义(t=12.890, P<0.05)。荧光定量PCR结果显示, 癌旁组织FOXM1 mRN...     

Zeste增强子同源物2对乳腺癌细胞增殖和转移能力的影响

目的探讨Zeste增强子同源物2(EZH2)对乳腺癌细胞增殖和转移能力的影响。方法选取2022年1月至2023年5月河南省人民医院收治切除的203例乳腺癌组织和癌旁组织作为研究对象, 采用免疫组织化学分析肿瘤组织EZH2表达水平。采用对照短发卡RNA(shRNA)和EZH2 shRNA慢病毒感染MDA-MB-231细胞, 建立对照组和EZH2 KD组细胞, 采用细胞计数试剂盒(CCK-8)、5-乙炔基-2’-脱氧尿苷(EdU)染色和体外移植瘤实验分析两组细胞的增殖能力;采用Transwell和蛋白质免疫印迹分析两组细胞的迁移和上皮-间充质转化能力;荧光定量分析EZH2下游基因表达情况。组间计量数据比较采用t检验。结果癌旁组织EZH2蛋白表达阳性率[(30.17±7.84)%]明显低于乳腺癌组织表达阳性率[(75.08±11.16)%], 差异有统计学意义(t=33.080, P<0.05)。对照组细胞CCK-8吸光度(A)值(2.01±0.09)明显高于EZH2 KD组(1.44±0.19), 差异有统计学意义(t=6.754, P<0.05)。对照组细胞EdU阳性率[(7...     

AJUBA通过磷酸果糖激酶PFKM影响糖酵解调控结直肠癌细胞生长

目的探讨AJUBA对结直肠癌(CRC)细胞的生长代谢功能影响以及引起改变的原因。方法通过使用免疫组织化学技术, 比较CRC组织和癌旁组织的AJUBA表达量。随后, 使用短发卡RNA(short hairpin RNA, shRNA)在人CRC细胞系SW480中敲低AJUBA, 并将其分成sh-AJUBA组和sh-NC组(阴性对照组)。使用EdU和细胞计数试剂盒(CCK-8)法, 观察敲低AJUBA对肿瘤细胞增殖影响, Seahorse检测其糖酵解水平。通过对RNA测序数据分析, 选择糖酵解关键基因磷酸果糖激酶(PFKM), 将其过表达后检测增殖能力和糖酵解能力的变化。分别采用t检验和方差分析比较两组或多组间差异。结果 CRC癌组织中, AJUBA表达显著升高(60.180±5.046比9.720±2.002, t=15.160, P<0.01)。与sh-NC比较, AJUBA敲低后(0.310±0.212比1.000±0.121, t=9.746, P<0.01), 细胞增殖能力出现明显抑制(9.040±1.351比58.470±3.940, t=20.560, P<...     

DNA羟甲基化酶十-十一易位蛋白与5-羟甲基胞嘧啶在食管鳞癌组织的表达及其临床意义

目的探讨十-十一易位蛋白(TETs)和5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)在食管鳞癌组织的表达及临床意义。方法随机选取2020年1月至2022年8月于郑州大学第一附属医院进行手术治疗的食管鳞癌患者癌组织和癌旁组织(距离癌组织2～3 cm)各10例, 采用高效液相-质谱联用法(LC-MS/MS)检测5hmC在食管鳞癌中的修饰水平;采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)技术检测TETs mRNA在食管鳞癌中的表达;采用蛋白质印迹法(Western blot)检测TETs在食管鳞癌中的蛋白表达水平, 组间比较采用t检验。结果食管鳞癌组织中5hmC修饰水平显著高于食管癌癌旁组织[(0.21±0.03)%比(0.05±0.01)%, t=3.095, P<0.01]。TCGA数据库分析, 食管癌组织中TET1表达水平显著高于食管癌癌旁组织(1.48±0.08比0.22±0.05, t=5.032, P<0.01);TET2表达水平显著高于食管癌癌旁组织(6.12±0.32比2.86±0.45, t=11.035, P<0.05);TET3表达水平显著高于食管癌癌旁组织(3.69...     

特异性蛋白1对肿瘤细胞增殖和转移的影响及其机制

目的探讨特异性蛋白1(Sp1)对肿瘤细胞增殖和转移的影响及其机制。方法选取2019年6月至2022年6月郑州大学第一附属医院收治的74例卵巢癌组织和癌旁组织作为研究对象, 采用蛋白质印迹法(Western blot)分析癌旁组织和肿瘤组织的表达水平。采用SP1短发卡RNA(shRNA)慢病毒感染SK-OV-3细胞, 建立SP KD1组和对照组细胞, 采用细胞计数试剂盒(CCK-8)和EdU染色分析两组细胞的增殖能力;采用划痕实验和Transwell实验分析两组细胞的迁移和侵袭能力, 采用蛋白质免疫印迹分析两组细胞上皮间质转化水平。组间资料比较采用t检验。结果癌旁组织中SP1蛋白表达水平(1.03±0.22)明显低于卵巢癌组织(1.93±0.39), 差异有统计学意义(t=17.570, P<0.05)。对照组细胞吸光度(A)值(1.98±0.09)明显高于SP KD1组(1.27±0.14), 差异有统计学意义(t=10.310, P<0.05)。对照组细胞EdU阳性率[(84.17±4.07)%]明显高于SP KD1组[(65.67±5.57)%], 差异有统计学意义(t...     

肿瘤坏死因子-α诱导蛋白8-1在结肠癌组织的表达及临床意义

目的探究肿瘤坏死因子-α诱导蛋白8-1(TNFAIP8L1, TIPE1)在结肠癌及癌旁正常组织的表达, 及其表达水平与结肠癌患者临床病理参数和预后生存的关系。方法收集青岛大学附属医院2013年1月至2014年12月间诊断为结肠癌的患者的癌和癌旁正常组织。采用免疫组织化学(IHC)染色法检测样本中TIPE1的表达以分析其与患者年龄、性别、肿瘤大小、TNM分期、淋巴结转移、远处转移、病理分期等的相关性。组间比较采用t检验, 患者预后生存采用Kaplan-Meier生存分析及单因素/多因素COX回归分析。结果 TIPE1在结肠癌组织中的表达低于正常结肠组织(57.2±31.1比86.9±35.6, t=8.304, P<0.01)。共纳入181例结肠癌患者, TIPE1高表达患者69例, 低表达112例。TIPE1高表达组患者平均生存期时间高于低表达组患者(80.9个月比59.0个月, Log-rank=14.615, P<0.01)。同时, COX回归分析提示, TIPE1表达水平为影响结肠癌患者预后的独立因素之一[风险比(HR)=0.538, 95%可信区间(CI):0.3...     

微小RNA-92a在结直肠癌患者血清、肿瘤组织和粪便中的表达及其临床意义

目的分析血清、肿瘤组织和粪便样本中微小RNA(miRNA, miR)-92a在结直肠癌患者中的表达及意义。方法选取45例结直肠癌患者作为实验组, 同期45例健康体检人群为对照组, 分别检测两组血清、肿瘤与癌旁组织、粪便样本中miR-92a的表达量, 通过实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)定量, 对表达量结果进行差异统计学分析, 临床特征与肿瘤样本的表达量的分析, 临床特征与miRNA表达量相关性。结果 miR-92a在肿瘤组与正常对照对比表达有统计学意义, 肿瘤组表达均高于正常组, 其中肿瘤组织中的miRNA表达量明显高于血液和粪便(血液样本中:t=28.88, P<0.001, 肿瘤组织样本:t=22.78, P<0.001, 粪便样本:t=15.97, P<0.001)。血清、肿瘤组织与淋巴结转移、浸润深度、TNM分期和分化程度表达呈正相关, 粪便样本仅与分化程度正相关, 血液样本比淋巴结转移(r=0.674), 血液样本比TMN分期(r=0.691), 血液样本比浸润深度(r=0.715), 血液样本比分化程度(r=0.648), 肿瘤组织比淋巴结转移...     

长链非编码核糖核酸ZNRD1-AS1在胃癌组织的表达及其临床意义

目的探讨长链非编码核糖核酸ZNRD1-AS1(lncRNA ZNRD1-AS1)在胃癌组织中的表达特点及其诊断学价值。方法选取嘉兴学院附属第二医院胃肠外科收治的96例经手术治疗、且留有手术样本的胃癌患者作为研究对象, 根据是否发生转移分为转移癌41例和原位癌55例。详细统计患者的临床病理和预后资料, 并采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)实验检测癌组织及癌旁健康组织的lncRNA ZNRD1-AS1和微小核糖核酸-375模拟物(miR-375 mimic)表达水平。两组之间的比较行配对设计或独立样本t检验, 多组间的比较行单因素方差分析。结果癌组织的lncRNA ZNRD1-AS1表达水平高于癌旁健康组织(1.051±0.205比0.645±0.145, t=15.845, P<0.001);癌组织的miR-375表达水平低于癌旁健康组织(1.014±0.197比1.365±0.245, t=10.965, P<0.001)。转移癌组织的lncRNA ZNRD1-AS1表达水平高于原位癌组织(1.201±0.165比0.953±0.148, t=3.604, P<0.0...     

环状RNA circLPAR1通过调节微小RNA-647促进骨肉瘤的进展

目的探讨环状RNA circLPAR1对骨肉瘤(OS)细胞增殖、迁移和凋亡的影响。方法通过实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)检测2018年1月至2019年6月在河南省人民医院骨科接受治疗的40例骨肉瘤患者的肿瘤组织和对应的瘤旁组织环状RNA溶血磷脂酸受体(circLPAR1)的表达水平。采用细胞计数试剂盒(CCK-8)实验、集落形成实验、细胞迁移和侵袭实验来探讨circLPAR1对骨肉瘤细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响。此外, 通过生物信息学分析、双荧光素酶报告实验和RNA下拉实验, 以阐明circLPAR1在骨肉瘤细胞中的潜在分子机制。组间比较采用配对t检验或独立样本t检验, 多组间比较采用单因素方差分析, 计数资料组间比较采用χ2检验。结果骨肉瘤组织中circLPAR1的水平高于瘤旁组织(3.546±1.624比1.654±0.832, t=19.734, P<0.01), circLPAR1表达水平高与年龄和性别无明显相关(χ2=3.194、0.530, P>0.05), 但与临床分期和远处转移有关(χ2=6.328、9.337, P<0.05), U-...     

女性Ⅱ型糖尿病患者尿液菌群特征与非感染性下尿路症状的关系

目的:比较出现非感染性下尿路症状(non-infectious lower urinary tract symptoms,non-iLUTS)对女性Ⅱ型糖尿病(diabetes mellitus,DM)患者尿液菌群的影响,探讨该类患者潜在的菌属标志物。方法:确诊为Ⅱ型DM的女性患者纳入DM组,同期健康女性纳入对照组。两组均完成美国泌尿科协会症状指数问卷(American Urological Association Symptom Index Questionnaire,AUA-SI)。样本通过清洁中段尿的方法留取并进行DNA提取。Illumina测序平台进行扩增和高通量测序。原始数据导入QIIME分析样本微生物的α和β多样性。LEfSe分析不同分组间属水平上具有显著差异的细菌。结果:DM组和对照组剔除序列数过少的参与者后分别为19例和20例,除了体重指数外,两组的人口学特征差异无统计学意义(P>0.05)。DM组尿液菌群的Chao1指数和Observed species低于对照组(P<0.01),提示DM组菌群丰富度低于对照组;香农和辛普森指数提示两组菌群多样性差异无统计学意义(P>0.05);β多样性提示两组菌群结构差异有统计学意义(P<0.01);LEfSe提示DM组有3个菌属的相对丰度升高,9个菌属的相对丰度下降。DM伴下尿路症状组尿液菌群中有6个菌属相对丰度显著高于不伴下尿路症状组,两组的α和β多样性差异均无统计学意义(P>0.05)。结论:女性DM患者与健康女性的尿液菌群结构存在显著差异,当女性DM患者出现non-iLUTS时,尿液菌群进一步发生改变。     

骨质疏松症患者肠道菌群多样性分析

目的探讨原发性骨质疏松患者肠道菌群的多样性变化。方法收集原发性骨质疏松患者7例与健康对照组7例的粪便样本,提取肠道菌群DNA,16S rRNA基因扩增,Illumina平台测序。对测序结果进行物种注释、多样性分析、物种差异分析。结果原发性骨质疏松患者肠道菌群在纲、目、科、属、种、分类操作单位水平的菌群种类要多于对照组,且两组人群在纲、目、科、属、种、分类操作单位水平的肠道菌群种类有一定的重叠性;Alpha多样性指标中的赵氏指数及艾森指数在两组间差异具有统计学意义(P0.05),香农指数及辛普森指数在两组间差异无统计学意义(P0.05);Beta多样性中的层级聚类能够将两组样本进行鉴别区分;骨质疏松组与对照组样本在门、科、种分类水平的部分肠道菌群含量存在差异(P0.05),芽单胞菌门、绿弯菌门、酸杆菌门、芽单胞菌科、丛毛单胞菌科、厌氧绳菌科、毛螺菌、优杆菌等肠道菌群在骨质疏松患者中所占比例要大于正常对照组(P0.05)。结论 16S rRNA测序有助于分析原发性骨质疏松患者的肠道菌群多样性变化,为研究肠道菌群与骨质代谢的关系提供理论依据。     

多嘧啶序列结合蛋白2通过调控Slug促进乳腺癌细胞上皮-间充质转化的机制

目的探讨多嘧啶序列结合蛋白2(PTBP2)在乳腺癌组织及细胞中的表达, 探讨PTBP2通过调控上皮-间充质转化(EMT)影响乳腺癌细胞的侵袭和迁移的具体分子机制。方法利用蛋白质印迹法(Western blot)和实时荧光定量聚合酶链反应(RT-PCR)检测PTBP2在乳腺癌细胞中的表达水平。并利用Transwell实验、侵袭实验检测PTBP2对乳腺癌细胞迁移侵袭能力的影响。两组之间的比较采用独立样本t检验。结果 Western blot及RT-PCR结果表明PTBP2在乳腺癌组织中的表达水平明显高于正常组织(7.22±0.27比3.02±0.16, t=13.33, P<0.01);敲低PTBP2表达后, MDA-MB-231细胞迁移能力、侵袭能力明显弱于对照组(30.20±1.56比113.80±4.23, t=18.52, P<0.01;9.60±1.60比29.20±4.28, t=4.29, P<0.01);并导致乳腺癌细胞发生MET转变。过表达PTBP2表达后, MCF7细胞迁移能力、侵袭能力明显强于对照组(136.00±5.33比63.40±4.32, t...     

微管相关蛋白1轻链3β在胃癌组织的表达及其临床意义

目的基于单细胞测序技术解析微管相关蛋白1轻链3β(LC3B)在胃癌中的表达及其与患者预后的关系。方法选用3对胃癌及配对的癌旁组织样本行单细胞转录组测序(scRNA-seq)。CellTypist对过滤后的单细胞表达数据进行亚群分类, 使用Wilcoxon rank-sum对测序数据进行拟时序分析, 探究不同细胞簇中LC3B的差异表达。通过癌症基因组图谱(TCGA)及免疫组织化学技术(IHC)分析LC3B在胃癌组织中的表达。采用单因素和多因素Cox比例风险回归模型确定影响胃癌患者预后的独立因素。实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)技术分析胃癌细胞中LC3B的表达水平, 采用细胞计数试剂盒(CCK-8)、克隆形成、Transwell检测LC3B表达改变后, 胃癌细胞增殖、迁移、侵袭能力的变化。两组间比较采用两独立样本t检验。结果 scRNA-seq分析结果显示, LC3B在胃癌组织中的表达量高于癌旁组织(2.001±2.706比1.010±1.634, t=44.094, P<0.01)且LC3B在内皮细胞、单核细胞中表达量高于其余细胞亚群(3.610±3.294, 3.21...     

MLH1蛋白与近端散发性结肠癌瘤内菌群特征关系的生物信息学分析

背景与目的：mutL同源物1 (MLH1)基因的突变会导致DNA错配修复（MMR）系统失活,从而增加结直肠癌的发生风险。此外,越来越多的研究表明,肠道菌群的组成和功能异常与结直肠癌的发生和发展密切相关。然而,MLH1蛋白表达与肠道菌群是否有关联目前尚不十分明确。因此,本研究通过分析中国东北地区不同MLH1蛋白表型近端散发性结肠癌（SCC）患者的肿瘤组织中微生物组的差异,探讨两者之间的潜在关系。方法：收集黑龙江省哈尔滨市第一医院和黑龙江省医院2020—2021年407例近端SCC肿瘤组织样本与临床资料,用免疫组化法筛选出其中MLH1蛋白缺失病例（缺失组）与MLH1蛋白完整病例（对照组）。采用16S rRNA基因测序技术,对提取的肠道肿瘤组织内微生物DNA,进行生物信息学分析,并分析临床病理特征以及特定类群的物种与菌群多样性的关系。结果：共筛选出缺失组病例20例,对照组18例,初步临床数据分析显示,肿瘤越大,MLH1蛋白缺失的风险越高（P<0.05）。不同MLH1状态下肿瘤组织内菌群的α多样性除Shannon指数外（P=0.042）,其他指数差异均无统计学意义（均P>0.05）...     

微小RNA-4317通过锌指蛋白322调控结肠癌细胞增殖和转移的分子机制

目的探讨微小RNA(miR)-4317通过锌指蛋白322(ZNF322)调控结肠癌细胞增殖和转移的分子机制。方法选取2019年6月至2022年6月河南省人民医院收集的68例结肠癌组织和癌旁组织作为研究对象。采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)分析分析肿瘤组织和癌旁组织中miR-4317表达水平。人结肠癌细胞系SW1116分为miR对照组和miR-4317组, 分别采用miRNA对照慢病毒和miR-4317过表达慢病毒感染建立稳转细胞系, 采用细胞计数试剂盒(CCK-8)、克隆形成实验、划痕实验和Transwell分析两组细胞的增殖、迁移和侵袭能力。采用生物信息学和双荧光素酶报告基因分析miR-4317的靶蛋白;蛋白质免疫印迹分析肿瘤组织和细胞靶蛋白表达水平。组间比较采用t检验。结果癌旁组织中miR-4317表达水平(1.13±0.14)明显高于结肠癌组织(0.67±0.11), 差异有统计学意义(t=21.120, P<0.05)。miR对照组细胞吸光度(A)值(2.00±0.08)明显高于miR-4317组(1.13±0.14), 差异有统计学意义(t=15.780, P<...