人冠状病毒HKU1 N和S蛋白基因序列及进化分析

目的 了解人冠状病毒HCoV-HKU1在我国福州急性重症下呼吸道感染患儿中的感染情况以及病毒N基因和S基因的系统进化特征。方法 通过RT-PCR法对2007年11月至2015年1月因呼吸道感染住进医院儿科重症监护病房的266例小儿鼻咽抽取物标本进行4种人冠状病毒的检测和人冠状病毒HCoV-HKU1的确认检测,测序并BLAST比对分析8份人冠状病毒阳性产物。结果 在266例标本中检出2例HCoV-HKU1感染阳性病例,检出率为0.75%(2/266)。这两例患儿一例诊断为支气管炎、一例诊断为急性重症肺炎。通过检测都发现混合感染了人副流感病毒3型(HPIV-3)。对这两株病毒FZ90和FZ96的N和S蛋白基因进行序列测定、拼接和系统进化分析;结果表明这2株HCoV-HKU1都属于HKU1基因型A。结论 人冠状病毒HCoV-HKU1可能是儿童下呼吸道感染中较为重要的一种病原,混合感染导致儿童病情加重。     

小儿呼吸道感染病毒检测新进展

急性呼吸道感染是威胁儿童健康的主要因素,是儿科发病率最高的一类疾病,同时也是儿童主要的公共健康问题之一[1].多数急性呼吸道感染由病毒引起,儿童病毒感染率为46.6％ ～ 66.9％[2],其中下呼吸道感染病毒感染率32.3％～52.3％[3,4],而肺炎则是5岁以下儿童死亡的首位原因,随着抗生素的应用和生活水平提高,病毒感染率呈逐年相对上升趋势.儿童急性呼吸道感染常见病毒为呼吸道合胞病毒(RSV)、腺病毒(IDV)、流感病毒A、B型(IVA、B)、3型副流感病毒( PIV-1、2、3)和肠道病毒等[5].随着病毒的演变生物医学学科的发展,病毒检测方法也得到迅速发展,特别是近10年来分子生物技术的应用,不断在呼吸道感染标本中发现新的病原性病毒,如人偏肺病毒(hMPV)、SARS冠状病毒、冠状病毒NL63( HCoV-NL63)、冠状病毒HKU1( HCoV -HKU1)、人博卡病毒(HBoV)、C组鼻病毒(RHV-C)、KI多瘤病毒(KIPyV)、WU多瘤病毒(WUPyV)等.同时发展了多种简便实用的非分子生物学检测方法被广泛应用到临床,为疾病的诊断和治疗提供依据.     

人冠状病毒引起上海地区住院儿童下呼吸道感染的流行病学调查

目的：了解人冠状病毒（HCoV）在上海地区下呼吸道感染住院患儿中的流行情况及临床特点。方法回顾性分析2009年10月至2012年9月因急性下呼吸道感染住院的5岁以下患儿554例,采用 Seeplex RV12 ACE 试剂盒检测鼻咽分泌物标本中的 HCoV 以及其他呼吸道病毒。反转录PCR 进行 HCoV-229E、HCoV-OC43、严重急性呼吸综合征（SARS）-CoV、HCoV-NL63、HCoV-HKU1和 MERS-CoV 检测,采用2种实时定量 PCR 进一步筛查中东呼吸综合征（MERS）-CoV。应用MEGA5．0软件进行序列拼接比对及进化树分析。结果554份标本中,273份病毒检测阳性,占48．56％。HCoV 阳性18份,占3．25％,其中13份为 HCoV-OC43／HKU1阳性,5份为 HCoV-229E／NL63阳性,未检测到高致病性 MERS-CoV 和 SARS-CoV。18例感染 HCoV 患儿月龄为1～48个月,男12例,女6例。临床表现为发热17例,咳嗽11例,气促9例,需要接受氧疗7例,喘息1例。6例来自ICU,12例来自普通内科病房。2例来自普通内科病房患儿同时合并腺病毒和人鼻病毒感染。18例患儿均治愈、好转出院。6例于秋季感染,5例于冬季感染,3例于春季感染,4例于夏季感染。8份 HCoV阳性标本进行测序分析,分属于 HKU1和229E 亚型各3株,分属于 OC43和 NL63亚型各1株。结论上海地区5岁以下急性下呼吸道感染患儿鼻咽分泌物标本中可分离到 HCoV,未检测到高致病性MERS-CoV;感染患儿临床表现较重但预后良好。     

兰州地区成人急性呼吸道感染常见病毒IgM抗体检测

目的 了解冬春季节兰州地区成人急性呼吸道感染患者病毒病原学状况。方法2003年11月1日至2004年4月30日，对兰州地区3家三级甲等医院呼吸科年龄16岁以上急性呼吸道感染患者467例，采用间接酶联免疫吸附实验（ELISA，定量法）就流感病毒A（Flu A）、流感病毒B（Flu B）、呼吸道合胞病毒（RSV）、腺病毒（ADV）、副流感病毒（PIV）血清中病毒特异性IgM抗体进行检测。结果 ①174例（174／467，37．3％）检出病毒特异性抗体阳性。其中FluA132例（132／467，28．3％）；Flu B80例（80／467，17．1％）；RSV68例（68／467，14．6％）；ADV22例（22／467，4．7％）；PIV7例（7／467，1．5％）。②少数患者（58／467，12．4％）存在两种或两种以上病毒同时感染情况，其中有27例（15．5％）合并细菌感染，27例中有14例（14／27，51．9％）有基础疾病。结论 ①病毒是成人急性呼吸道感染的重要病原体之一。其中流感病毒（FluA、Flu B）是兰州地区成人冬春季节急性呼吸道感染最重要的病毒病原体，其次为呼吸道合胞病毒（RSV）。腺病毒（ADV）和副流感病毒（PIV）少见。②存在两种或两种以上呼吸道病毒同时感染的现象，少数病例有继发细菌感染。③有基础疾病者感染呼吸道病毒风险增加。     

114例疑似COVID-19患者呼吸道病毒感染分析

目的 分析114例COVID-19疑似患者呼吸道病毒感染情况, 探讨多种病毒同时检测在疫情防控中的价值。方法 利用Real Time RT-PCR技术检测发热门诊COVID-19疑似患者SARS-CoV-2核酸,利用基因芯片恒温扩增技术检测SARS-CoV-2核酸阴性患者其他常见的18种呼吸道病毒。结果 114例COVID-19疑似患者SARS-CoV-2核酸均为阴性,有21例感染了非其它呼吸道病毒,感染率达18.42%,21例患者中共检测出10种呼吸道病毒,包括冠状病毒NL63/229型、呼吸道合胞病毒、柯萨奇病毒A16型、乙型流感病毒、人副流感病毒1型、人副流感病毒3型、人偏肺病毒、甲型流感病毒、甲型流感病毒季节性H3亚型、肠道病毒/鼻病毒。其中乙型流感病毒感染患者最多,有6例,呼吸道合胞病毒有5例。有3例患者同时感染2种病毒:呼吸道合胞病毒与柯萨奇病毒A16型混合感染、冠状病毒NL63/229型与人副流感病毒1型混合感染、甲型流感病毒与甲型流感病毒季节性H3亚型混合感染。结论 在应对本次SARS-CoV-2疫情中,针对COVID-19疑似患者中,要注意鉴别SARS-CoV-2与其它呼吸道病毒,及时有效地排除疑似病例。     

沈阳地区儿童急性呼吸道感染常见病毒流行病学特征分析

目的 分析沈阳地区急性呼吸道感染患儿常见病毒流行特点。方法 选取2019-2022年本院接诊的782例急性呼吸道感染患儿为本次研究对象。在患儿未进行抗病毒药物治疗前采集患儿咽拭子标本。采用多重实时荧光PCR方法检测呼吸道合胞病毒(RSV)、副流感病毒(PIV)、人鼻病毒(HRV)、乙型流感病毒(IFVB)、甲型流感病毒(IFVA)、人腺病毒(HADV)、肠道病毒(EV)、冠状病毒(COV)、人偏肺病毒(HMPV)、人博卡病毒(HBOV)10种呼吸道感染常见病毒抗原。结果 782例急性呼吸道感染患儿中,281例患儿病毒核酸检测阳性,阳性率35.93%。234例患儿为单一病毒感染,阳性率29.92%,主要为RSV、PIV感染。47例患儿为混合病毒感染,阳性率6.01%,主要为RSV+PIV混合感染。对比单一病毒阳性患儿组与病毒阴性组患儿的临床症状,单一病毒阳性患儿组发生发热、咳嗽发生率高于病毒阴性组患儿,差异有统计学意义(P<0.05)。两组患儿咳痰、咽喉疼痛、呼吸困难、呕吐、腹泻的发生率对比差异无统计学意义。感染IFVB、IFVA、HADV、EV、COV、HBOV患儿均出现发热症状...     

人冠状病毒与SARS病毒

2003年4月16日世界卫生组织决定将引起传染性非典型肺炎(atypical pneumonia)的病原体,新发现的一种人冠状病毒称为SARS病毒。即严重急性呼吸道综合征冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus)。本文就已知人冠状病毒和SARS病毒的异同谈几点看法。 1 冠状病毒感染的症状和实验室诊断人冠状病毒曾是一种常见的上呼吸道感染的病原,引起成人的普通感冒和胃肠炎。根据血清流行病学调查,在不同人群中,5％～30％的普通感冒是由冠状病毒引起的。儿童重症冠状病毒感染不常见,但是隐性感染或亚临床感染很     

人类冠状病毒NL63的研究进展

人类冠状病毒NL63(human coronavirus NL63,HCoV-NL63)是2004年荷兰学者首先报道发现的一种与呼吸道疾病有关的新的人冠状病毒.感染后可以引起上、下呼吸道感染,在儿童及免疫力低下的人群中的感染率较高.     

东莞市急性下呼吸道感染患儿呼吸道病毒和肺炎支原体感染状况分析

目的 了解东莞地区住院急性下呼吸道感染患儿常见4种呼吸道病毒和肺炎支原体感染情况与流行特征。方法 选择2019年8月至2021年6月在东莞市儿童医院住院的急性下呼吸道感染患儿为研究对象，收集其临床资料作回顾性分析总结。收集急性下呼吸道感染患儿呼吸道合胞病毒(RSV)、腺病毒(ADV)、流感病毒INF(包括甲型流感病毒和乙型流感病毒)、副流感病毒PIV(包括PIV1型、PIV2型、PIV3型)常见4种呼吸道病毒抗原检测的结果，检测方法为采用直接免疫荧光法对鼻咽拭子标本进行检测。总结患儿肺炎支原体(MP)感染状况，采用临床诊断标准，判断是否为MP感染。结果 共纳入2662例患儿为研究对象。(1)呼吸道病毒抗原阳性率为30.31%,其中检出率最高的是RSV,其次分别为PIV、ADV、INF,不同年龄组病毒检出率不同，RSV阳性率在婴儿组最高；PIV阳性主要集中在小于6岁低龄儿童；ADV阳性主要在1～6岁儿童。观察2020年6月至2021年5月1整年期间，夏秋季节RSV检出率明显高于春冬季节，PIV感染主要发生在秋冬季节，一整年未检出IFN,ADV检出率也低。(2)临床诊断肺炎支原体(MP)感...     

提高对新型冠状病毒感染诊治的认识

新型冠状病毒(novel coronavirus,nCoV)是指此前未在人体中发现的冠状病毒,常有人类以外的哺乳动物作为其储存宿主和中间宿主.目前报道的nCoV包括严重急性呼吸综合征冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus,SARS-CoV)、中东呼吸综合征冠状病毒(Middle East respiratory syndrome coronavirus,MERS-CoV)和新近发现的2019新型冠状病毒(2019 novel coronavirus,2019-nCoV).nCoV可引起严重急性呼吸道感染(severe acute respiratory infection,SARI)、急性呼吸窘迫综合征、感染性休克、肾脏衰竭等危重疾病状态,提高临床医师对nCoV感染诊治的认识是当务之急.提高门诊分诊和早期识别能力、加强医院感染的防控、提高对重症患者的综合救治能力,以及加强临床研究是应对nCoV感染疫情的关键.     

鼻病毒感染可能导致儿童住院治疗

据Medscape．com2月23日报道（原载Clin Infect Dis2007；195：765—766，773—781），新的证据表明引起普通感冒的鼻病毒与严重急性呼吸道感染（ARIs）如肺炎和急性支气管炎之间具有相关性。[第一段]     

严重急性呼吸综合征相关性冠状病毒抗体检测及分析

目的 了解发病期严重急性呼吸综合征(SARS)患者体内Urbani SARS相关性冠状病毒抗体产生的规律，探讨这些患者中肺炎衣原体、肺炎支原体、腺病毒、呼吸道合胞病毒感染情况。方法 采用免疫荧光技术检测43例SARS患者双份血清和10例非SARS患者血清中Urbani SARS冠状病毒抗体IgM／IgG，并采用酶联免疫法检测上述血清中肺炎衣原体、肺炎支原体、腺病毒、呼吸道合胞病毒IgM／IgG。结果 43例患者中新近感染Urbani SARS冠状病毒40例(93％)，3例未检出其感染；10例非SARS患者血清中Urbani SARS冠状病毒抗体IgM／IgG均为阴性。肺炎衣原体、肺炎支原体、腺病毒、呼吸道合胞病毒新近感染率分别为25．6％、163％、7％和4．7％，其既往感染率分别为39．5％、34．9％、27．9％和0。SARS病毒IgM抗体在起病开始便能检测到，其阳性率在起病8～14d和15～33d时分别为69．6％和63％，二者比较无统计学差异，但均显著高于起病1～7d时的阳性率(16．7％)；SARS病毒IgG抗体在起病6d时便能检测到，其阳性率在起病1～7d、8～14d和15～33d时分别为19．4％、65．2％和92．6％，三者之间比较均差异有显著性。结论 SARS患者发病初期即可出现Urbani SARS冠状病毒IgM和IgG抗体，发病2周至1个月时检测阳性率明显增加。部分SARS患者中存在肺炎衣原体、肺炎支原体、腺病毒、呼吸道合胞病毒新近感染和／或既往感染。免疫荧光技术榆测Urbani SARS冠状病毒抗体可用于SARS的早期诊断。     

人类偏肺病毒研究进展

研究表明,婴幼儿急性呼吸道感染（acute respiratory infection,ARI）的主要病原是人类呼吸道合胞病毒（hRSV）、流感病毒（甲、乙型）、副流感病毒（主要是Ⅰ、Ⅲ型）、肠道病毒和腺病毒,还有一部分病原尚未明了。     

兰州地区成人急性呼吸道感染常见病毒抗体检测

国内对呼吸道病毒的临床研究多集中在儿童，成人报道甚少。我们通过对兰州地区成人急性呼吸道感染患者常见5种病毒血清IgM的检测，了解该地区病毒感染的特点，为有效的防治成人急性呼吸道病毒感染提供依据。     

猪流感诊断技术研究进展

猪流感（swine influenza,S1）是由猪流感病毒（swine influenza virus,SIV）引起的猪的一种急性、热性和高度传染性呼吸道疾病,不仅引起病猪高热、食欲减退、咳嗽、流产及出栏时间延迟等,而且极易引起猪呼吸与繁殖障碍综合征病毒、猪伪狂犬病病毒和传染性胸膜肺炎放线杆菌等病原的继发或混合感染,对养猪业危害极大。更重要的是,猪呼吸道上皮细胞表面同时存在人流感病毒受体SA-α-2,     

人呼吸道合胞病毒感染致小鼠急性肺损伤动物模型的建立北大核心CSCD

目的筛选人呼吸道合胞病毒高毒株并经下呼吸道感染BALB/c小鼠,建立小鼠急性肺损伤动物模型。方法将呼吸道合胞病毒野生株HRSV-A-GZ08-0在8月龄BALB/c雌鼠中进行连续传代,筛选得到高毒株R96-5。分别经下呼吸道攻毒野生株HRSV-A-GZ08-0和高毒株R96-5感染BALB/c小鼠,建立急性肺损伤动物模型,通过对小鼠体重变化、存活情况、肺灌洗液病毒滴度、肺切片免疫荧光检测,以及肺组织病理损伤、炎性反应和肺气血屏障损伤等方面对模型进行评价。结果与野生株HRSV-A-GZ08-0感染组小鼠比较,同等剂量高毒株R96-5感染组小鼠存活率显著下降,攻毒后6日R96-5感染组小鼠存活率降至0,而野生株HRSV-A-GZ08-0感染组存活率为100%,且R96-5感染组肺灌洗液中病毒滴度显著升高,在感染后第2、3天病毒基因拷贝数显著升高,且肺切片免疫荧光检测同样验证此结果,hRSV F蛋白平均荧光强度明显增高。高毒株R96-5感染组小鼠炎症反应显著,TNF-α、IFN-γ和CCL-3相对表达水平均有所升高,肺气血屏障破坏明显,白蛋白浓度及肺指数均升高,肺组织病理损伤显著。结论高毒株R96-5感染小鼠具有典型的重症呼吸道病毒感染致急性肺损伤病理特征,重症呼吸道病毒感染致急性肺损伤动物模型构建成功,此模型可用于该类型感染致急性肺损伤进展为急性呼吸窘迫综合征的病理生理机制及药物干预研究。     

冠状病毒检测新方法及其在其他病原体检测中的应用前景

冠状病毒与人和动物的许多疾病有关。迄今至少已发现了13个种属多个抗原表型的冠状病毒，其中人冠状病毒包括HCoV OC43和HCoV 229E两个抗原型，是引起人类上呼吸道感染的重要病原体。2003年严重急性呼吸系统综合症(Severe Acute Respiratory Syndrome，SARS)在中国和世界上其他国家爆发流行，其病原体SARS相关冠状病毒(SARS-CoV)作为新的病毒亚种引起了社会的广泛关注。     

人肺间病毒相关性非典型肺炎与SARS

人肺间病毒(HMPV)是一种新近鉴别出的副粘病毒科家族成员。HMPV感染已在呼吸道受累的所有年龄组中均被发现，包括流感样综合征、支气管炎、细支气管炎以及肺炎。本报道了一例死于急性社区获得性肺炎的病人，其感染的HMPV被确认为是唯一的病原体。     

儿童呼吸道病毒感染病原学特征分析北大核心CSCD

目的分析河南南阳地区儿童呼吸道病毒感染的病原学特征。方法回顾南阳市中心医院患儿的性别、年龄、入院时间、临床症状、病原学检测结果等病史,分析不同呼吸道疾病的病毒检出情况。采集患儿鼻咽抽吸物,进行标本处理、核酸提取、逆转录,采用巢式PCR检测呼吸道合胞病毒、副流感病毒、人博卡病毒、偏肺病毒,采用荧光定量PCR检测流感病毒、人鼻病毒、人肠道病毒,采用单轮PCR方法检测人腺病毒、人冠状病毒。结果1156例标本中,542例检出呼吸道病毒,阳性率为46.89%,32.79%为单一感染,14.10%为两种病毒混合感染。单一病毒感染患儿中,27.44%为呼吸道合胞病毒感染,占比最高。混合感染中,23.31%为呼吸道合胞病毒+副流感病毒混合感染,占比最高。对比每种病毒单一感染与混合感染的阳性率,副流感病毒在混合感染中的检出率高于单一感染,人腺病毒、人鼻病毒、人博卡病毒、人肠道病毒、偏肺病毒、人冠状病毒在单一感染中的检出率高于混合感染。1156例患儿中,肺炎565例,上呼吸道感染295例,哮喘158例,急性支气管炎72例,喘息性支气管炎35例,毛细支气管炎31例。其中肺炎患儿病毒检出率最高为66.55%(376/565),不同疾病分组病毒检出率差异有统计学意义(χ^(2)=202.132,P<0.05)。163例混合感染中,春季71例,夏季17例,秋季28例,冬季47例。新生儿组79例,婴儿组43例,幼儿组28例,儿童组13例。呼吸道合胞病毒单一感染患儿中,52.88%患儿为呼吸道合胞病毒A型阳性,47.12%患儿为呼吸道合胞病毒B型阳性,呼吸道合胞病毒A型阳性组主要以男性为主,两组对比差异具有统计学意义。结论本地区儿童呼吸道感染病毒主要为呼吸道合胞病毒,不同疾病分组病毒检出率不同,混合感染多发生于春季与新生儿组,呼吸道合胞病毒A型感染男性占比较高。     

人禽流行性感冒的研究进展

人禽流行性感冒（以下称“人禽流感”）是由禽甲型流感病毒某些亚型的毒株引起的急性呼吸道传染病。禽流行性感冒（简称“禽流感”，avianinfluenza）是由禽流感病毒引起的一种烈性禽类传染病。国际兽疫局（OIE）将其定为A类传染病，并列入国际生物武器公约动物类传染病名单。我国农业部1999年颁布的《一、二、三类动物疫病病种名录》也将其列为一类传染病。禽流感于1878年首次报道于意大利，1901年证实其病原体为病毒，1955年经血清学鉴定为A型流感病毒。历史上禽流感病毒主要感染家禽及野生鸟类等低等脊椎动物。1997年5月，我国香港特别行政区1例3岁儿童死于原因不明的多脏器功能衰竭，同年8月经美国疾病预防和控制中心（CDC）以及世界卫生组织（WHO）荷兰鹿特丹国家流感中心鉴定为禽甲型流感病毒H5N1。这是世界上首次证实禽甲型流感病毒H5N1感染人类…。之后相继有H9N2、H7N7亚型感染人类和H5N1再次感染人类的报道。至2006年7月26日出现人感染高致病性禽流感暴发的国家和地区有13个，成为人类面临的又一挑战，严重威胁着全球公共卫生安全。本文就人感染高致病性禽流感的一些研究进展进行综述。