结直肠癌患者KRAS和BRAF基因突变检测及其临床意义

目的探讨结直肠癌患者组织中KRAS和BRAF基因突变情况,分析突变与临床病理特征的关系。方法应用荧光PCR-优化寡核苷酸探针法检测304例结直肠癌石蜡包埋标本中KRAS基因2号外显子的12和13密码子、BRAF基因的15号外显子的突变情况,分析KRAS和BRAF基因突变与临床病理特征的关系。结果 KRAS和BRAF基因在结直肠癌的突变率分别为38.8%(118/304)和4.3%(13/304)。KRAS基因突变阳性标本中12密码子的突变率为78.0%,其中p.G12D发生率最高,占总突变的45.3%;13密码子的突变率为22.0%。高年龄组(≥60岁)患者的KRAS基因突变率为47.2%(58/123),高于低年龄组(<60岁)的33.1%(60/181),差异有统计学意义(P<0.05)。转移性结直肠癌患者19例,其KRAS基因突变率为36.8%(7/19),与285例原发性结直肠癌患者的突变率(38.9%,111/285)差异无统计学意义(P>0.05)。BRAF基因在结肠、低分化、黏液腺癌患者中的突变率明显高于直肠、中或高分化和管状腺癌的患者。结论结直肠癌患者中KRAS基因突变的发生率较高,与年龄相关,而与性别、部位、病理类型和分化程度不相关。BRAF基因突变与肿瘤部位、病理类型和分化程度有关。原发性与转移性结直肠癌患者KRAS基因突变率无明显差异。     

高分辨率熔解曲线技术检测非小细胞肺癌患者胸水中EGFR基因突变

目的探讨高分辨率熔解曲线(HRM)技术对非小细胞肺癌(NSCLC)患者胸水标本EGFR基因突变进行检测的可行性及临床意义。方法采用高分辨率熔解曲线技术检测30例非小细胞肺癌患者胸水标本EGFR基因18-21外显子基因突变,并与Sanger测序法检测结果进行对比分析。结果HRM法检测胸水中EGFR基因18-21外显子突变总检出率为26.67%(8/30),Sanger测序法检测突变总检出率为23.33%(7/30)。HRM法与Sanger测序法相比,敏感性为100%,特异性为95.83%,阳性预测值为88.89%,阴性预测值为100%。结论运用HRM技术对非小细胞肺癌患者胸水进行EGFR基因突变检测方法可行,适宜推广。     

结直肠癌K-ras基因突变与临床病理特征的相关性分析

 【摘要】 目的：研究结直肠癌组织中K-ras基因的突变情况与临床病理特性之间的相关性。 目的　研究结直肠癌组织中K-ras基因的突变情况与临床病理特性之间的相关性。方法　采用直接测序法对90例结直肠癌石蜡标本进行K-ras基因突变检测,并对K-ras基因的突变情况及其与结直肠癌患者临床病理特征的关系进行统计学分析。结果　90例结直肠癌患者组织中,K-ras基因12、13密码子总突变者31例,总突变率为34.4 %。12密码子单突变21例,突变率为23.3 %;双突变1例。13密码子突变者9例,突变率为10.0 %。结直肠癌K-ras基因突变率与肿瘤部位有明显相关性（P＝0.042）。12密码子单突变和13密码子突变与临床病理参数均无明显相关性（P＞0.05）。结论　不同肿瘤部位患者的K-ras基因突变率存在明显不同。     

k-ras 基因突变与结直肠癌的关系

 目的　探讨k-ras 基因在结直肠癌患者中的突变状况,为k-ras基因突变检测提供理论依据。方法　提取基因组DNA,采用PCR扩增和双向直接测序法,检测56例结直肠癌k-ras基因的突变状况。结果　56例结直肠癌中k-ras基因的突变率为46.63 %（26／56）,其中20例（20／26,76.92 %）为密码子12的突变,6例（6／26,23.08 %）为密码子13的突变,未发现同时存在两个位点突变的样本。突变类型以G>A为主,密码子12的突变以GGT>GAT（G12D）为主。密码子13的突变以GGC>GAC为主。统计学分析发现,k-ras基因突变与患者的性别密切相关而与其他临床病理特征如：肿瘤发生部位、有无淋巴结转移等无关。结论　在结直肠癌患者中,k-ras基因突变主要发生于密码子12;突变类型以G>A为主;k-ras基因的突变可能与患者的性别相关。     

焦磷酸测序和双脱氧测序法检测结直肠癌患者K-ras基因突变的对比研究

[目的]探讨不同方法学对结直肠癌K-ras基因点突变检测结果的影响。[方法]对60例结直肠癌患者石蜡包埋组织样本进行K-ras基因第12、13位密码子突变检测,检测分别采用焦磷酸测序法及双脱氧测序法,并对结果进行对比分析。[结果]两种方法都能够检测到常见的突变类型,但由于两种方法的灵敏度不同,检出率焦磷酸测序法高于双脱氧测序,分别为33.3%(20/60)和25%(15/60)。经病理对肿瘤细胞比例分析发现,5例双脱氧测序法漏检标本中,肿瘤细胞比较少,不足20%。[结论]K-ras基因突变的检测过程中,标本肿瘤细胞的比例是影响结果的关键因素,检测前需要对标本进行病理评估,确保肿瘤细胞比例在50%以上。     

结直肠癌原发灶与转移灶K-ras基因突变的比较分析

背景与目的：K-ras基因突变是抗表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)靶向治疗的重要负性预测因子。本研究拟对结直肠癌原发灶与转移灶中K-ras基因状态的一致性进行比较,以探讨目前临床K-ras检测的科学性与严谨性。方法：收集复旦大学附属肿瘤医院手术切除的结直肠癌原发灶及转移灶石蜡包埋组织76对,提取DNA,经过PCR扩增后,对产物进行基因序列分析,检测结直肠癌中K-ras基因外显子2基因序列。结果：76例患者中有15例结直肠癌原发灶与转移灶的K-ras基因突变情况不一致。76例结直肠癌原发灶有31例发生突变,突变率为40.8%,其中第13号密码子突变16例,第12号密码子突变15例;76例结直肠癌转移灶有31例发生突变,突变率为40.8%,其中第13号密码子突变15例,第12号密码子突变16例。结论：结直肠癌原发灶和转移灶中K-ras基因状态并不一致,且存在19.7%的表达差异率,提示通过检测原发灶K-ras基因表达状态来确定针对转移灶的西妥昔单克隆抗体药物选择存在不严谨性,需要进一步完善。     

HRM方法检测肺腺癌患者癌性胸水上清液EGFR基因突变的临床意义

目的:探讨应用HRM方法检测肺腺癌患者癌性胸水上清液EGFR基因突变状况及EGFR酪氨酸激酶受体抑制剂治疗的可行性。方法:收集43例肺腺癌患者癌性胸水上清液标本,提取DNA,应用HRM方法检测EGFR基因第18、19、20、21外显子突变状况。统计分析HRM方法与基因测序法检测EGFR突变率的差异。结果:43例肺腺癌患者癌性胸水上清液中,HRM法检测EGFR基因突变共17例,总突变率为39.53%,其中第19外显子突变14例,第21外显子突变3例。基因测序结果显示:EGFR突变14例,总突变率为32.56%,均为第19外显子突变。HRM方法检测第21外显子突变阳性的患者其基因测序结果均为阴性。这可能与HRM方法检测的灵敏度优于测序方法有关。两者突变率差异无统计学意义（P>0.05）。结论:对难以获取组织标本的肺腺癌患者而言,应用HRM方法检测其癌性胸水上清液,是了解其EGFR基因突变状况的可靠途径,对临床筛查靶向治疗药物具有一定的参考价值。     

COLD-PCR-HRM 检测结直肠癌患者外周血KRAS基因突变

目的  评价COLD-PCR-HRM 检测结直肠癌患者外周血KRAS 基因突变的临床应用价值。方法  将已知突变型 KRAS 组织DNA 与野生型DNA 做系列稀释,突变DNA 所占比例分别为50%、25%、10%、5%、3%、2% 和 1%。分别应 用常规PCR-HRM 法和COLD-PCR-HRM 法对不同比例KRAS 突变DNA 样本进行检测,验证两种检测方法的灵敏度;同 时应用 COLD-PCR-HRM 法对 62 例外周血和肿瘤组织配对样本进行一致性验证。结果  PCR-HRM 法最低检测浓度为 3%; COLD-PCR-HRM 法最低检测浓度为1%,两种方法的检测灵敏度均明显高于直接测序法（P ＜ 0.05）。应用COLD-PCRHRM 法检测两种样本中KRAS 基因突变状态,其中血清样本中检测出13 例突变（突变率21.0%,13/62）,组织中检测出 12 例突变（突变率 19.4%,12/62）,两种标本同时存在突变的有 9 例,以组织中检测的 KRAS 状态为准,两者突变一致性 为 75.0%（9/12）。KRAS 基因突变在组织与外周血中存在一致性（κ=0.649;P ＜ 0.001）。结论  COLD-PCR 结合 HRM 明 显提高了 KRAS 突变检测灵敏度,为其应用于低丰度突变样本检测提供了有利条件。     

高分辨率熔解曲线分析技术检测EGFR基因突变方法的建立及其初步临床应用

目的建立高分辨率熔解曲线(high resolution melting,HRM)分析技术检测表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)基因突变的方法,并探讨其的临床应用价值。方法建立HRM技术检测EGFR基因突变方法,并用其检测200例非小细胞肺癌患者肿瘤石蜡包埋标本,并与测序法的结果进行比较。结果所建HRM检测方法 Tm与ct值的CV值均较小,重复性好。HRM法检测标本EGFR基因突变的结果与测序法相比,突变总检出率分别为40.0%和37.0%,敏感性为100%,特异性>95%。结论 HRM法检测EGFR基因突变,敏感性高,特异性强,重复性好,操作简便,节约时间,成本低,适用于临床。     

特异引物双扩增实时PCR法和Sanger DNA测序法检测肺癌组织中表皮生长因子受体基因突变

目的 探讨特异引物双环探针扩增实时PCR技术表皮生长因子受体(EGFR)检测方法(ADx-EGFR实时PCR法)和Sanger DNA测序法在肺癌EGFR基因体细胞突变检测中的临床价值.方法 收集肺癌组织石蜡切片208例,分别采用ADx-EGFR实时PCR法和Sanger DNA测序法检测肺癌组织中EGFR基因外显子18、19、20、21的突变类型,计算其突变率,分析两种检测方法检测EGFR基因突变的一致性.结果 208例肺癌组织中,ADx-EGFR实时PCR法成功检测208例,检出EGFR基因突变40例,突变检出率为19.2％;Sanger DNA测序法成功检测196例,检出突变22例,突变检出率为11.2％.肺癌组织中主要以外显子19缺失和外显子21上的L858R的点突变为主,分别占4.8％ (10/208)和11.6％ (23/208),其余的突变类型少见.结论 对于甲醛固定石蜡包埋组织而言,ADx-EGFR实时PCR法检测EGFR基因成功率和突变检出率均高于Sanger DNA测序法,可成为临床上检测肿瘤EGFR基因突变的方法.