河南汉族6个STR基因座的遗传多态性研究

目的 对河南汉族人群6个STR基因座的等位基因频率进行研究并获得群体遗传学数据.方法 对121名无血缘关系河南汉族个体的EDTA抗凝血样用酚-氯仿法提取DNA,应用多重PCR扩增技术结合聚丙烯酰胺凝胶电泳对D2S1338、D4S2639、D7S3048、D8S1132、D14S306、D18S535共6个基因座在河南地区汉族人群中的基因型分布进行分析.结果 6个STR基因座的基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡,各基因座的观察杂合度分别为0.843、0.842、0.857、0.900、0.824、0.826.结论 6个基因座在河南汉族群体中具有较高的非父排除率和个体识别率,在法医学和群体遗传学研究中有一定的应用价值.     

X染色体短串联重复序列基因座的遗传多态性

目的研究DXS7424基因座在山西汉族人群中的遗传多态性。方法随机抽取山西汉族人群250名无关个体静脉血样,乙二胺四乙酸抗凝后用酚-氯仿法提取DNA,经聚合酶链反应扩增,扩增产物用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染法进行检测分型,对女性基因型频率分布进行Hardy-Weinberg平衡检验,并计算法医学常用参数。结果在山西汉族人群250名无关个体中共检出7个等位基因。等位基因频率分布在0.008～0.340。女性基因型频率分布符合Hardy-Weinberg平衡。个体识别率、多态性信息含量分别为0.7367、0.7039。结论DXS7424基因座在山西汉族人群中具有较高的遗传多态性,可用于法医学涉及女性的个人识别和亲权鉴定,并为X染色体短串联重复序列数据库的建立提供了山西汉族人群的遗传学数据。     

山西汉族Y-STR基因座DYS552遗传多态性调查

目的:调查Y染色体上的短串联重复序列DYS552基因座在山西汉族男性人群中的基因频率分布、多态性及群体分布情况,为法医学个体识别及亲子鉴定提供计算数据,对其在法医学上的应用进行可行性探讨.方法:随机抽取102例山西汉族男性无关个体静脉血500μL,用GDB中的引物进行PCR扩增,银染显色,对其选取的等位基因测序,构建等位基因分型标准物;按照ISFG原则命名各等位基因.结果:102例山西汉族人群DYS552基因座共检出7种不同的等位基因,分别为DYS552×23(0.0194)、DYS552×24(0.1105)、DYS552×25(0.3981)、DYS552×26(0.2427)、DYS552×27(0.1262)、DYS552×28(0.0874)、DYS552×29(0.0097),基因多样性为0.7523.其个人识别能力(DP)和非父排出率(PE)均为0.7523.结论:DYS552基因座具有较高的遗传多态性.在法医学及人类遗传学方面具有较高应用价值.     

应用荧光复合扩增技术对河南汉族群体9个STR基因座的多态性研究

目的：调查河南汉族群体的D3S1358、vWA、FGA、D8S1179、D21S11、D18S51、D5S818、D13S317、D7S820等9个STR基因座的基因频率分布,获得群体遗传学数据,研究其法医学应用。方法：用PCR复合扩增和四色荧光自动化检测技术分析9个STR位点的基因型,计算各等位基因的分布频率。结果：获得9个STR位点在河南汉族群体中的等位基因分布频率资料,共检出98个等位基因;家系调查,证明上述位点遗传稳定,符合孟德尔遗传规律。9个STR基因座总鉴别机率（TDP）达99.9999996%。结论：上述9个位点是较理想的遗传标记,可用于法庭科学实践中生物物证的个人识别及亲子鉴定。     

山西汉族Y-STR基因座DYS510遗传多态性调查

目的调查Y染色体上的短串联重复序列DYS510基因座在山西汉族人群中的基因频率分布、多态性及群体分布情况,为法医学个体识别及亲子鉴定提供计算数据,对其在法医学上的应用进行可行性探讨。方法随机抽取102名山西汉族男性和20名女性无关个体静脉血500μL,用基因组数据库(GDB)中的引物进行聚合酶链反应(PCR)扩增,银染显色,对其选取的等位基因测序,构建等位基因分型标准物;按照ISFG原则命名各等位基因。结果102名山西汉族人群DYS510基因座共检出7种不同的等位基因,分别为DYS510*14(0.0194)、DYS510*15(0.0485)、DYS510*16(0.0291)、DYS510*17(0.3204)、DYS510*18(0.4175)、DYS510*19(0.1456)、DYS510*20(0.0194),基因多样性为0.7047,其个人识别能力(DP)和非父排出率(PE)均为0.6139。结论DYS510基因座具有较高的遗传多态性,在法医学及人类遗传学方面具有较高应用价值。     

福州地区汉族群体15个STR基因座遗传多态性研究

目的调查福建福州地区汉族群体遗传15个STR基因座多态性参数,同时评估AmpFlmSTR IdentifilerTM体系应用于该地区汉族人群进行法医学个体识别及亲子鉴定的价值。方法应用AmpFlmSTR IdentifilerTM体系荧光标记复合扩增系统检测350名福建福州地区汉族无关个体15个STR基因座的多态性,统计计算群体遗传学参数。结果 15个STR基因座的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P0.05),发现4个稀有等位基因。15个STR遗传标记均具有高度多态性,杂合度0.12~0.405,匹配概率0.032~0.225,个体识别力0.775~0.968,多态性信息含量0.55~0.86,非父排除率0.285~0.761。结论 15个STR基因座在福建福州地区有较高的多态性。通过这份样本实验和等位基因频率总结,得到了福建福州人群更多法医学亲权鉴定和个人识别等位基因多样性的客观数据。     

山西省高平地区汉族人群19个短串联重复系列基因座遗传多态性调查

目的:调查19个短串联重复系列(STR)基因座在山西省高平市汉族人群中的遗传多态性,并对其法医学应用进行评价。方法:采用Goldeneye20A STR荧光标记复合扩增试剂盒,对山西省高平市汉族210份无关个体进行扩增,利用3130XL遗传分析仪对扩增产物进行电泳分型,统计D19S433等19个STR基因座的等位基因频率和法医遗传学数据。结果:获得19个STR基因座的等位基因频率分布,分别检出10,9,15,13,13,6,8,7,7,7,10,8,9,5,17,6,11,13,17个等位基因,并分别获得19个STR基因座的杂合度观察值(Ho)、杂合度期望值(He)、个人设别能力(DP)、偶合率(PM)、非父排除率(PE)及多态信息总量(PIC)等法医遗传学参数,累积个人识别率和累积非父排除率分别为1~1.49×10-22和0.999 999 993。结论:Goldeneye20A STR荧光标记复合扩增体系的19个STR基因座在山西省高平市汉族人群中具有较高的个体识别能力和遗传多态性,对于法医学个体识别和亲子鉴定具有重要的应用价值。     

川南地区汉族人群D1S80基因座多态性分析

目的了解川南地区汉族人群DIS80位点群体遗传多态性。方法采用PCR结合聚丙烯酰胺PAGE电泳及高灵敏度银染技术,即Amp—FLP方法对川南地区120名汉族无血缘关系个体D1S80位点进行多态性分析。结果在所调查的120名无关个体样本中,观察到D1S80基因座有18个等位基因,基因频率分布在0．004166667～0．1958333333之间,杂合度为0．7869,个体识别力为0．87,非父排除率为0．8152,其基因型频率分布符合Hardy—Weinberg平衡法则。结论D1S80基因座的PCR分型具有较好的准确性和灵敏度,为法医学个体识别和亲权鉴定、遗传病基因链锁分析等的研究及应用提供了川南地区有用的遗传信息。     

山西汉族人群Y染色体DYS630基因座遗传多态性调查

Y染色体遗传标记具有男性特有、父系遗传及单倍型遗传的独特属性[1],使其成为法医学父权鉴定和同一认定的一个有用工具.本文通过对Y染色体STR基因座DYS6 30在山西地区汉族群体中的群体遗传学研究,旨在揭示其遗传多态性,并对其在法医学中的应用进行可行性探讨.     

新Y染色体DYS718在山西汉族人群中遗传多态性调查

目的:探讨新Y染色体DYS718基因座在山西汉族群体中遗传多态性的应用价值。方法:在Y染色体基因组DNA中查找候选的基因座,用GenBank中的引物序列进行PCR扩增,再用银染方法显带。对其筛选的等位基因测序,构建等位基因分型标准物;按照ISFG原则命名各等位基因。结果:本研究选择了Y染色体基因座DYS718。在116例山西汉族无关男性个体血样中共检出了4个等位基因。其基因多样性为0.6782,在法医学应用方面,其个人识别能力(DP)和非父排出率(PE)均为0.6782。结论:新Y染色体基因座DYS718具有较高的遗传多态性,在法医学及人类遗传学方面具有应用价值。     

急性脑梗死与6个miniSTR基因座多态性的相关研究

目的探讨急性脑梗死与6个miniSTR基因座的相关性。方法选取急性脑梗死患者100例,正常对照130例,应用荧光标记多重PCR扩增技术扩增6个基因座。310遗传分析仪进行毛细管电泳,用基因收集和分析软件进行数据信息的收集并确定基因型。用直接计数法计算等位基因频率,应用SPSS统计软件对病例组和对照组的各基因座的各个等位基因间进行卡方检验,计算OR值,并对有意义的OR值进行假设检验。结果基因座D10S1248和D22S1045的各个等位基因频率病例组与对照组间均无显著性差异。基因座D14S1434在病例组中的等位基因14、基因座D1S1677的等位基因11、基因座D2S441病例组的等位基因14和基因座D4S2346的等位基因7的基因频率在病例组和对照组间有显著性差异,并且OR值分别为0.433、28.71、2.303和6.828。结论基因座D14S1434的等位基因14可能是急性脑梗死发病的一个保护基因。D1S1677的等位基因11、基因座D2S441的等位基因14和基因座D4S2346的等位基因7可能是急性脑梗死发病的危险基因,与其他基因连锁致病。     

福建汉族人群STR位点遗传多态性分析及其在亲子鉴定中的应用

目的调查福建汉族人群的D5S818、FGA、D3S1358、THOI、D13S317、D16S539、D2S1338、D8S1179、D21S11、D7S820、CSF1PO、D19S433、vWA、TPOX、D18S51共15个STR位点多态性，探讨STR基因分析在亲子鉴定中的应用价值。方法应用PCR复合扩增和五色荧光Genescan技术对210个福建汉族个体和89例亲子鉴定案件的15个STR位点作基因分型。结果福建汉族人群15个STR位点的等位基因频率、基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡。D5S818、FGA、D13S317、D16S539、D2S1338、D8S1179、D21S11、D7S820、D19S433、vWA、D18S51位点属于高鉴别力、高杂合度、高信息含量的STR位点。15个STR位点的累积个体识别能力(DP)、非父排除率(PE)均为0．9999以上。89例亲子鉴定案例中，否定亲权的25个案例中均至少有3个位点不符；认定亲权的64例子中，亲子关系指数(RCP)大于99．73％。结论获得了福建汉族人群中15个STR位点的遗传多态性数据。应用这15个STR位点的等位基因分析，能成功进行亲子鉴定，显著提高亲子关系指数。     

Functional validation of the genetic polymorphisms of human ATP-binding cassette (ABC) transporter ABCG2: identification of alleles that are defective in porphyrin transport

The ATP-binding cassette (ABC) transporter ABCG2 has been implicated to play a significant role in the response of patients to medication and/or the risk of diseases. To clarify the possible physiological or pathological relevance of ABCG2 polymorphisms, we have functionally validated single nucleotide polymorphisms (SNP) of ABCG2. In the present study, based on the currently available data on SNPs and acquired mutations, we have created a total of 18 variant forms of ABCG2 (V12M, G51C, Q126stop, Q141K, T153M, Q166E, I206L, F208S, S248P, E334stop, F431L, S441N, R482G, R482T, F489L, F571I, N590Y, and D620N) by site-directed mutagenesis and expressed them in insect cells. Because porphyrins are considered to be endogenous substrates for ABCG2, we have investigated the porphyrin transport activity of those variant forms in vitro. We herein provide evidence that the variants Q126stop, F208S, S248P, E334stop, and S441N are defective in porphyrin transport, whereas F489L exhibited impaired transport, approximately 10% of the activity observed for the wild type. Furthermore, Flp-In-293 cells expressing those variants were photosensitive. Thus, among those genetic polymorphisms of ABCG2, at least the hitherto validated alleles of Q126stop, S441N, and F489L are suggested to be of clinical importance related to the potential risk of porphyria.     

基于紫外光谱-惩罚岭型线性判别对STR基因座分型研究

目的:结合紫外光谱(UV-s)和惩罚岭型线性判别(PRLDA)模式识别方法建立短串联重复序列(STR)的基因分型方法。方法:以D16S539基因座的9-9,12-13两种基因型为研究对象,研究包含该多态性位点的DNA片段的聚合酶链反应(PCR)扩增条件和紫外检测条件,建立标准化扩增条件和检测条件,以此获得基因分型的标准物及其标准UV-s。以标准光谱为识别变量,建立了9-9与12-13基因型的PRLDA判别模型。结果:所建立的PRLDA模型有较大的类间距和较小的类内距,表明模型具有良好的稳健性,且预测样本均分布在校正样本集的范围之内,对预测样本也表现出了极强的判别能力。结论:该方法不需任何检测前处理,而只需一步PCR扩增和UV-s检测即可实现STR的基因分型,具有简单、快速、低成本等优点。     

维生素D受体基因多态性与特发性癫痫的相关性

目的：探讨维生素D受体基因多态性与特发性癫痫的相关性。方法：通过病例对照研究方法，选取91例特发性癫痫患者作为病例组，另选取同期105例健康者作为对照组，抽取所有研究对象外周静脉血提取DNA，采用PCR直接测序法进行维生素D受体基因BsmI（rs1544410）、FokI（rs2228570）、Cdx2（rs11568820）位点多态性检测。结果：病例组与对照组的BsmI与FokI位点基因型频率和等位基因频率无显著差异（P>0.05）；Cdx2位点基因型频率存在显著差异（χ²=6.67，P=0.036），等位基因频率无显著差异，该位点发生A/G变异，分布不处于Hardy-Weinberg遗传平衡。在Cdx2位点基因型与特发性癫痫关联性分析中，病例组中Cdx2位点AG基因型是特发性癫痫发病的危险因素（OR=2.222，95% CI：1.190~4.150，P=0.027）。结论：维生素D受体基因Cdx2位点多态性与特发性癫痫具有关联性。     

江苏汉族群体15个STR基因座遗传多态性分析

目的分析15个短串联重复序列(STR)基因座在江苏汉族群体中的基因多态性和基因频率。方法取2010年-2011年来自江苏省的1000例无血缘关系的汉族个体。用Sinofiler 16荧光标记复合扩增系统15个STR位点进行扩增,自动基因分析仪片段分析并进行基因分型。结果累积STR等位基因共发现211个,其中罕见等位基因36个。基因型频率超过0.1的基因座型22个,其中D3S1358基因座的15/16等位基因型频率最高达到0.2225。杂合度达到了0.802±0.051,随机个体相同表型偶合率值为0.068±0.031,多态信息总量值为0.778±0.060,个体识别能力和非父排除率值分别为0.932±0.032和0.607±0.091。FGA、D12S391基因座在发生24次突变的11个基因座中有较高的突变率。结论通过大量的样本实验和等位基因频率总结,得到了江苏人群更多法医学亲权鉴定和个人识别等位基因多样性的客观数据。     

A natural variant of the heme-binding signature (R441C) resulting in complete loss of function of CYP2D6.

A new variant allele CYP2D6*62 (g.4044C>T; R441C) of the drug-metabolizing cytochrome P450 (P450) CYP2D6 was identified in a person with reduced sparteine oxidation phenotype, which was unexpected based on a genetic CYP2D6*1A/*41 background. The recombinantly expressed variant protein had no activity toward propafenone as a result of missing heme incorporation. Sequence alignment revealed that the positively charged R441 residue is part of the heme-binding signature but not strictly conserved among all the P450s. A compilation of described P450 monooxygenase variants revealed that other enzymes can functionally tolerate even nonconservative amino acid changes at the corresponding position (i.e., the invariant cysteine 2). This suggests that heme binding in mammalian P450s depends not only on the integrity of the heme-binding signature but also on other family- and subfamily-specific sequence determinants.     

武汉汉族人群DYS446基因座的遗传多态性

为研究 Y染色体上 DYS44 6基因座多态性 ,应用 PCR扩增 DYS44 6基因座、变性聚丙烯酰胺凝胶电泳、银染的方法检测了 10 7份汉族男性无关个体血样本、10份女性血样本和 2例已确认亲子关系的父子血样本。结果显示 ,10 7例男性血样本有相应的PCR产物 ,共检测到 8个等位基因 ,GD值为 0 .764 9;在 10例女性中 ,无相应的 PCR产物 ;2例已确认父子关系的基因型一致。提示DYS44 6基因座是个人识别和亲子鉴定的较好遗传标记。