与rhGH促线性生长效应有关的候选基因及多态性位点筛选的研究进展

 目的 综述筛选可能影响基因重组人生长激素（recombinant human growth hormone,rhGH促线性生长效应的候选基因及其多态性位点,为rhGH的遗传药理学研究提供依据。方法 从rhGH的药理作用机制信号通路着手,选择其中重要的生物大分子,通过检索NCBI、Hapmap等网站提供的SNP位点,同时结合PubMed中相关文献报道,筛选与rhGH促线性生长效应相关的候选基因及其多态性位点。结果 rhGH的药理作用机制信号通路中2个主要的生物大分子,即生长激素受体（growth hormone receptor,GHR和胰岛素样生长因子结合蛋白-3（insulin-like growth factor binding protein-3,IGFBP-3,这2个生物大分子的编码基因上均有多个多态性位点,根据现有资料推测GHR外显子3上的fl/d3及IGFBP-3上的rs2854744（A/C、rs3110697（G/A、rs2132570（A/C和rs2854746（C/G等2个候选基因上的5个多态性位点可能与rhGH促线性生长效应有关。结论 本研究拟选择GHR和IGFBP-3作为rhGH遗传药理学研究的候选基因,考察以上5个多态性位点与rhGH促线性生长效应的相关性。     

供体CYP3A5和MDR1基因多态性与肝移植术后受体他克莫司的个体化用药相关性研究

 目的 研究肝移植供体CYP3A5基因MDR1基因多态性与受体术后他克莫司血药浓度/给药剂量的关系。方法 对39例肝移植患者受体术后他克莫司血药浓度检测。特异性等位基因扩增法和聚合酶链反应结合限制性片段长度多态性分析法分别检测供体CYP3A5和MDR1基因型,按基因型分组比较供体基因多态性与受体他克莫司用药关系。结果 39例肝移植患者供体基因型CYP3A5：*3/*3型12例, *1/*3型8例, *1/*1型19例;MDR1：T/T型13例,C/T型18例, C/C型8例。结论 肝移植病人供体的CYP3A5基因多态性与受体他克莫司血药浓度具有相关性。研究CYP3A5供体基因多态性,有利于移植病人术后他克莫司个体化用药方案的制定;但是供体MDR1基因对他克莫司的受体个体化用药影响不大。     

血浆蛋白C基因多态性与华法林剂量相关性的研究

 目的 探讨中国苏南地区心脏机械瓣膜置换术后汉族人群血浆蛋白C(PROC)基因rs5936多态性与华法林剂量的相关性,为利用基因多态性指导临床合理用药提供理论依据。方法 采用限制性片段长度多态性技术以及碱基淬灭探针技术分别检测188名心脏机械瓣膜置换术后患者VKORC1 -1639G>A,CYP2C9 1075A>C和PROC rs5936的基因型,分析与华法林剂量的相关性。结果 PROC rs5936等位基因频率T 54.78%,G 45.22%,华法林的平均稳定剂量GG型为（2.55±0.81） mg·d^-1, TG型（2.65±0.96） mg·d^-1,TT型为（2.64±0.74） mg·d^-1,各组间华法林剂量差异无统计学意义 (P>0.05);VKORC1 -1639G>A和CYP2C9 1075A>C基因多态性对华法林剂量的影响均有统计学意义（PA和CYP2C9 1075A>C基因多态性与华法林剂量有显著相关性,而PROC rs5936基因多态性与华法林剂量无相关性。     

年龄、体重及合并用药对丙戊酸清除率的影响

 目的探讨影响儿童体内丙戊酸清除率的因素。方法对156例接受丙戊酸单药或联合用药治疗的门诊癫痫患者进行血药浓度监测。分析不同年龄组、体重组及合并用药组稳态血药浓度ρ_ss与剂量的比值(ρ_ss/D)的变化趋势。结果随着年龄、体重的增加,丙戊酸清除率呈下降趋势,联合使用卡马西平和苯巴比妥可使丙戊酸清除率增加。结论年龄、体重及合并用药等因素显著影响丙戊酸的清除速率。     

CACNA1A、APOE基因多态性与新疆维吾尔族人群剥脱综合征发病的相关性研究

目的探讨新疆维吾尔族人群剥脱综合征的发病率与CACNA1A、APOE基因的相关性。方法以2012年3月至2013年5月在新疆喀什地区、库车地区以及新疆医科大学第一附属医院就诊的新疆维吾尔族人群为研究对象进行研究,共纳入513例剥脱综合征者(研究组216例,对照组297例),提取基因组DNA,采用PCR产物测序技术对CACNA1A基因的rs4926244位点、APOE基因的rs429358、rs7412位点进行分型,采用χ2检验比较研究组和对照组间基因位点的差异性,并分析其与维吾尔族人群剥脱综合征的关系。结果 CACNA1A基因的rs492624位点在研究组和对照组中各型P0.05,OR=0.9468,研究组和对照组无统计学差异;APOE基因的rs429358、rs7412位点在研究组和对照组中各型P0.05,OR分别为0.999和1.555,研究组和对照组无统计学差异。结论 CACNA1A基因的rs4926244位点及APOE基因的rs429358、rs7412位点与维吾尔族人剥脱综合征发病无关。     

小剂量丙戊酸联合拉莫三嗪治疗癫痫的疗效

〔摘 要〕 目的：对小剂量丙戊酸联合拉莫三嗪治疗癫痫的治疗效果及安全性进行分析。方法：采集 2017 年 9 月至 2019 年 9 月于惠州市第三人民医院接受治疗的癫痫患者 130 例,通过随机法分为 65 例对照组（小剂量丙戊酸）与 65 例观察组 （小剂量丙戊酸联合拉莫三嗪）,比较不同治疗方法应用效果的差异性。结果：观察组临床治疗总有效率高于对照组;观 察组不良反应发生率低于对照组,差异均具有统计学意义（P ＜ 0.05）。结论：在癫痫临床治疗中,可通过小剂量丙戊酸 联合拉莫三嗪进行有效治疗,可确保临床治疗效果,进一步提高安全性。     

CYP2C9和VKORC1基因多态性对心房颤动患者华法林抗凝治疗的影响

目的分析CYP2C9和VKORC1基因多态性对心房颤动(房颤)患者华法林抗凝治疗的影响。方法随机选取222例持续性房颤患者,分别检测CYP2C9和VKORC1基因多态性rs12572351 G A,rs9332146 GA,rs4917639 G T,rs1057910 A C,rs1934967 G T,rs1934968 G A,rs9923231 C T,rs2359612 G A和rs10871454 C T位点。分析CYP2C9和VKORC1不同基因型患者的资料,对比不同基因型患者华法林起效剂量和起效时间。结果 CYP2C9 rs1057910 CA基因型患者年龄、血清肌酐(SCr)水平均显著高于AA基因型患者(P均0. 05),体质量指数(BMI)显著低于AA基因型患者(P 0. 05); VKORC1 rs9923231 CT和VKORC1 rs10871454 CT基因型患者年龄及SCr、脑钠肽(BNP)水平均显著高于TT基因型患者(P均0. 05),BMI显著低于TT基因型患者(P 0. 05)。CYP2C9rs1057910 CA基因型患者华法林起效剂量显著低于AA基因型患者(P 0. 05),VKORC1rs9923231和rs10871454 CT基因型患者华法林起效时间均显著短于TT基因型患者(P均0. 05)。结论 CYP2C9和VKORC1基因多态性检测结合患者临床情况可以为临床以基因类型指导华法林使用剂量提供参考依据,有助于华法林的合理应用,对华法林抗凝治疗的管理有一定的实用性。     

供体CYP3A5基因多态性影响肝移植术后FK506的个体化用药

 目的探讨肝移植术后口服免疫抑制剂FK506的剂量及其全血谷浓度的个体差异与供体的肝药酶P450 3A5(CYP3A5)基因多态性的关系。方法观察44例接受肝移植的受体在术后1,2周及1月的FK506服药剂量和全血药物谷浓度,并利用PCR-限制性片断长度多态性(PCR-RFLP)方法和DNA直接测序法检测对应供体CYP3A5基因内含子3第6 986位A/G单核苷酸多态性(CYP3A5*3),分析基因多态性与FK506服用剂量及全血谷浓度/剂量比值(C/D)的相关性。结果肝移植术后FK506的口服需药量在个体间存在极大差异,在术后2周及1月,CYP3A5*3/*3基因型患者需要的剂量最小,分别为(0.074±0.042)和(0.084±0.045)mg·kg^-1·d^-1,而C/D比值明显高于*1/*1基因型患者。结论肝移植术后受体FK506服用剂量的个体化差异与供体CYP3A5*1/*3基因多态性密切相关,分析供体CYP3A5*1/*3基因多态性可以为肝移植术后FK506的个体化用药提供可靠的参考指标。     

环氧化物水解酶1基因多态性对华法林剂量影响的研究

 目的 探讨苏南地区心脏机械瓣膜置换术后汉族人群环氧化物水解酶1(EPHX1)基因rs4653436和rs2292566多态性对华法林剂量的影响,为以后利用基因多态性指导临床合理用药提供理论依据。方法 采用碱基淬灭探针技术,检测197名心脏机械瓣膜置换术后患者的EPHX1 rs4653436和EPHX1 rs2292566的基因型,分析对华法林剂量的影响。结果 EPHX1基因 rs4653436多态性检测有127例纯合子GG型,62例患者为AG型杂合子,8例突变纯合子AA型; GG型患者华法林的平均稳定剂量为（2.64±0.93） mg·d^-1, AG型为（2.52±0.68） mg·d^-1,AA型为（3.25±1.63） mg·d^-1,采用方差分析方法得到各组间华法林剂量差异P值大于0.05,无显著性差异;而EPHX1基因 rs2292566多态性检测有107例纯合子GG型,70例AG型杂合子,20例突变纯合子AA型; GG型患者华法林的平均稳定剂量为（2.47±0.85） mg·d^-1,AG型为（2.49±0.77）mg·d^-1,AA型为（2.81±0.96）mg·d^-1,方差分析方法得到各组间华法林剂量差异P值小于0.05,有显著性差异。结论 在苏南地区心脏机械瓣膜置换术后汉族人群中,EPHX1基因 rs4653436多态性与华法林剂量相关性无显著性差异,对华法林剂量影响较小;而rs2292566多态性与华法林剂量相关性有显著性差异,对华法林剂量有影响。     

ABCB1和CYP3A5基因多态性对环孢素血药浓度的影响

 目的 研究ABCB1基因和CYP3A5基因多态性与重症肌无力患者环孢素药物浓度的关系。方法 在129名重症肌无力(MG患者中,采用荧光PCR法测定ABCB1 C3435T基因型;RFLP法分析ABCB1 C1236T, ABCB1 G2677A/T;Mismatch RFLP(错配PCR+RFLP法分析CYP3A5*3基因型,并对这4个位点进行连锁分析。收集患者临床资料,对患者环孢素血药浓度进行检测,并对患者遗传学数据和血药浓度等进行分析。结果 连锁分析显示4个SNP中,ABCB1 C1236T,G2677A/T和C3435T之间紧密连锁,ABCB1中最常见的两个单倍体型分别是1236C-2677G-3435C和1236T-2677T-3435T。另外发现CYP3A5*1/*3位点、ABCB1 C1236T位点和ABCB1 G2677T位点的多态性变化对环孢素血药浓度有明显影响,突变型组的血药浓度明显比野生型组高。同时根据ABCB1单倍体型分组,各组之间药物浓度比较都是TT-TT-TT> CT-GT-CT > CC-GG-CC。结论 药物基因学研究对环孢素治疗重症肌无力患者的临床合理用药有指导意义。     

基于生物信息学方法的坤泰胶囊分子网络及生物功能初步探析

目的基于和颜?坤泰胶囊(以下简称坤泰胶囊)各组分对应靶点信息集,运用生物信息学方法探析其发挥疗效的潜在分子网络及生物功能。方法将坤泰胶囊6味组方药材逐一在中药系统药理学研究数据库(TCMSP)、TCM-mesh中检索获得每一种药材所对应的化学成分,并与经液相色谱-电喷雾质谱联用技术(LC-ESI-MS/MS)检测得到的坤泰胶囊活性成分进行比对,剔除重复成分,获得坤泰胶囊含有的活性成分,再将这些成分逐一在数据库中检索获得其对应的靶点信息,形成化合物-靶点信息集。利用DAVID、KEGG、COSMIC等数据库,对化合物-靶点信息集进行功能富集分析、靶标的组织特异性表达分析,以及蛋白-蛋白相互关系网络分析。结果结合数据库与LC-ESI-MS/MS检测,共获得29个成分,获得对应的靶基因186个。这些靶基因显著富集在神经中枢、乳腺、卵巢等组织中。经DAVID的基因本体(gene ontology,GO)分析结果显示,这些靶标显著集中于细胞质、线粒体、细胞外基质等细胞器,主要发挥脂肪酶、激酶以及氧化还原酶等活性,参与代谢、能量通路、凋亡等生物过程。KEGG通路富集分析表明这些靶标显著参与PI3K-Akt、m TOR、胰岛素等信号通路。结论通过坤泰胶囊活性成分-靶标信息集的建立,利用各生物信息数据库与分析手段,从分子水平为坤泰胶囊的临床疗效提供佐证,也为进一步拓展其临床应用提供依据。     

CYP2C19基因多态性对奥美拉唑药动学影响的系统评价

 目的 系统评价CYP2C19基因多态性对奥美拉唑药物代谢动力学的影响。方法 计算机检索截止至2012年2月的Cochrane、PubMed、Embase、CNKI等数据库,收集有关CYP2C19基因多态性对奥美拉唑药动学影响的研究。用RevMan5.1软件对符合纳入标准的研究进行Meta分析。结果 共纳入12篇回顾性研究。其中英文8篇,中文4篇。Meta分析结果表明,CYP2C19基因多态性显著影响ρ_max、AUC、t_1/2和CL/F。PM基因型组的ρ_max、AUC和t_1/2的值均大于HEM基因型组,且HEM基因型组均显著大于EM基因型组;基因型为EM人群的CL/F显著大于HEM基因型组,HEM人群的CL/F也显著大于HM基因型组。结论 CYP2C19基因多态性显著影响奥美拉唑的体内代谢,但其代谢还受多种其他因素影响,尚需高质量大样本量的前瞻性研究来证实。     

丹红注射液治疗冠心病心绞痛基因网络的模块划分与生物学机制分析

目的:运用模块药理学分析框架,从功能模块水平探索丹红注射液治疗冠心病心绞痛的药理作用机制。方法:融合中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)中药物成分对应的靶点和疾病靶点数据库(DisGeNET,OMIM和CTD)的心绞痛相关基因,利用STRING version 11. 0构建丹红注射液治疗心绞痛的靶点网络;MCODE,MCL和GLay算法识别功能模块,通过最小网络结构熵优化模块识别结果。利用DAVID version 6. 8生物信息分析平台对模块进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:整合丹红注射液相关的262个基因与心绞痛相关的192个基因,构建丹红注射液治疗心绞痛靶点网络,包含414个节点和6 621条边。经最小网络结构熵优化后,用MCODE算法识别出12个功能模块(节点数3个),其中最大模块(模块1)有47个节点和962条边,MCODE评分41. 826分。对丹红注射液治疗心绞痛的基因网络和MCODE划分的模块进行KEGG通路富集分析,分别得到37条和58条KEGG通路,且有86. 5%的覆盖率。12个模块富集到的通路大致可分为十一类,其中人类疾病(45%),信号转导(17%),氨基酸代谢(14%)相关的通路所占比例较大。模块1富集到的通路数量最多,有39条,主要功能为信号转导相关模块。模块3是氨基酸代谢相关模块。结论:丹红注射液治疗冠心病心绞痛的治疗效应是通过多模块、多通路、多功能作用实现的,其主要通过调节与信号转导,氨基酸代谢,神经活性配体-受体相互作用,Ca2+和p53信号相关的模块发挥治疗作用。     

子宫颈癌关键生物标记物的生物信息学探索及对中药抗肿瘤治疗的启示

目的:从生物信息学角度探索与子宫颈癌(CC)相关的生物标记物,为早期诊断提供依据;同时为中医药治疗提供生物信息学证据并为中药治疗的靶点探索提供方向。方法:从基因表达综合数据库(GEO)中检索和下载CC微阵列数据集,鉴定差异表达基因(DEGs)。采用STRING数据库构建宫颈癌DEGs蛋白-蛋白相互作用网络图(PPI网络)。利用Cytoscape中的MCODE识别PPI网络中最显著模块获得hub基因,并使用DAVID数据库对其进行GO分析和KEGG分析。此外,复习当今中医药治疗CC的机制研究,与生物信息学预测的生物标记物进行对比分析,从生物信息学角度验证其有效性。结果:共得到3个微阵列数据集(GSE63514、GSE7410、GSE7803),与非癌组织比较,CC组织中有65个DEGs,其中hub基因15个(degree>10)。GO分析和KEGG分析显示,这些基因的生物学功能主要富集于细胞分裂、细胞周期和DNA复制等。复习当今文献发现许多中药能作用于上述标记物,可从细胞周期阻滞、干扰DNA复制等途径干预肿瘤的发展,与生信分析结果相一致。此外还有一些生物标记物缺少动物、细胞或人体实验的验证,是未来中药抗肿瘤药物的研究方向。结论:微阵列分析可预测早期诊断CC的标记物,为中药的抗肿瘤功效提供生信依据,并为未来中药抗肿瘤的研发提供方向。     

COL1A1基因多态性与高度近视易感性的系统评价

目的评价COL1A1基因多态性与高度近视（high myopia）的相关性。方法检索Pubmed、万方、维普和CNKI数据库中已发表的相关文献,利用荟萃分析的方法进行病例对照研究。文献纳入标准：研究内容为COL1A1基因多态性与高度近视的病例对照研究：文章中提供了基因型频率的完整数据;研究的位点符合H-W（Hardy-Weinberg）平衡。结果经全面的文献检索最终5篇文献被纳入COL1A1基因rs2075555位点的荟萃分析,3篇文献被纳入COL1A1基因rs2269336位点的荟萃分析。合并统计量之后的结果显示,COL1A1基因rs2075555位点的基因型频率和等位基因频率4种遗传模式下在病例对照间均无明显差异（P〉0．05）,COL1A1基因rs2269336位点在隐性遗传模式下与高度近视的发生存在明显关联（P=0．02）。结论COL1A1基因rs2269336位点可能是高度近视发生的重要危险因素．增加高度近视的发病风险。     

暴马桑黄细胞色素P450家族CYP5150AW6基因克隆及表达分析

目的 为深入了解细胞色素P450家族CYP5150AW6基因在暴马桑黄Sanghuangporus baumii生长发育调控中的功能。方法 采用PCR技术获得目的基因的c DNA序列全长,通过生物信息学在线软件分析其编码的氨基酸序列;采用同源重组的方法构建原核表达载体;采用荧光定量PCR技术分析其不同发育阶段的表达特性。结果 暴马桑黄中克隆得到的基因开放阅读框（open reading frame,ORF）序列全长1758 bp,编码585个氨基酸,相对分子质量为66 080,经国际P450命名委员会命名为CYP5150AW6;跨膜区预测表明CYP5150AW6蛋白不具有跨膜结构;亚细胞定位显示CYP5150AW6蛋白在细胞质和线粒体中修饰合成;系统进化分析结果表明,暴马桑黄CYP5150AW6蛋白与灵芝CYP5150L8蛋白亲缘关系最近,符合物种分类原则;SDS-PAGE结果证实在75 000～100 000出现目的蛋白条带（包含20 000的标签蛋白）,说明所获得的基因能够成功表达出蛋白;从荧光定量分析结果中可以看出CYP5150AW6基因转录水平从菌丝体阶段到子实体阶段生长逐渐升...     

利用转录组分析款冬萜类化合物生物合成关键酶基因及表达特征

目的挖掘与款冬萜类化合物生物合成途径相关的关键酶基因。方法利用Illumina HiSeq2500测序平台对野生款冬花蕾和叶进行转录组测序,使用Trinity软件de novo从头组装,并通过基因功能注释、差异表达基因分析等生物信息学方法进行分析,挖掘款冬中萜类化合物生物合成途径相关的酶基因。结果转录组测序获得39 912 371条高质量reads(SRA号:SRR9113366,SRR9113367),组装获得91 118条Unigene,55 830条Unigene在NR、Swiss-Prot、GO、COG、KEGG等数据库得到注释。鉴定出参与款冬萜类化合物生物合成相关酶基因的129个Unigene,包括91个参与三萜骨架生物合成酶基因,32个萜类合成酶基因,6个细胞色素P450基因,其中差异表达基因25个,涉及上游MVA途径的4个差异基因在花蕾中表达量高于叶,MEP途径的5个差异基因在叶中表达高于花蕾,另外还有10个基因在叶中高表达,9个基因在花蕾中高表达。根据差异基因HMGR、TPS、AS、CYP450基因在花蕾中高表达,推测可能与花蕾中萜类物质含量高有关。结论从款冬转录组数据库中初步获得了可能参与萜类化合物生物合成途径的候选关键酶基因,为进一步阐明款冬萜类化合物生物合成的分子机制奠定基础。