应用变性高效液相色谱检测CD31563位点单核苷酸多态性

目的应用变性高效液相色谱（DHPLC）检测CD31 563位点单核苷酸多态性。方法聚合酶链反应（PCR）扩增健康正常人位于17q23编码CD31基因第8外显子563位点附近的DNA片段，应用DHPLC技术对扩增片段进行多态性分析，将不同峰型的PCR片段进行序列测定，并与参考序列对照分析。结果PCR扩增片段为203bp，经DHPLC分析有3种不同峰型，经与测序结果比较，G／G纯合峰型、A／A纯合峰型、G／A杂合峰型明显不同，3种基因型的个体得到明确区分。74名健康正常人中CD31-563S（AGC）的基因频率为0．514，CD31-563N（AAC）的基因频率为0.486。结论DHPLC可以高效、经济、准确的检测CD31-563位点单核苷酸多态性。     

脑胶质瘤病人遗传易感基因单核苷酸多态性的研究

目的筛查与脑胶质瘤发病相关基因的单核苷酸多态性，进一步寻找胶质瘤易感基因。方法收集入院脑胶质瘤病人的血液。应用PCR扩增的方法对肿瘤相关的基因的特定片段进行扩增。利用变性高效液相色谱技术进行筛查。双向DNA直接测序，在GENBANK进行对比找到突变的碱基，并进行分析。结果变性高效液相色谱筛查后表明，在HLA-DMA基因中检测到了已知杂和性突变，并发现新的突变，HLA-DMA4EC杂合性缺失突变。结论变性高效液相色谱技术在筛查基因的SNPs方面显示了其快速、高通量和准确的特点。HLA-DMA基因第4号外显子第111位碱基缺失突变是一个新的SNP，可能是胶质母细胞瘤的易感突变之一。     

变性高效液相色谱-测序技术在检测乳腺癌BRCA1基因突变中的临床诊断价值

目的探讨变性高效液相色谱（DHPLC）-测序技术在早期检测乳腺癌BRCA1基因突变的临床意义。方法用聚合酶链反应（PCR）扩增BRCA1基因，该扩增产物经琼脂糖凝胶电泳鉴定后，直接进行DHPLC分析；有峰型改变的样本作测序分析，以确认突变。结果从124例乳腺癌患者中共发现9种突变。包括7种错义突变，其中，1例Stop598，1例A807E合并E809L，1例A807E，2例Y856H，1例T967S，2例11170F，1例R1203G；一种存在于一号内含子的突变，即IVS101—10T〉C17例；一种2号外显子的5’非翻译区突变，即A118T2例。此外，在乳腺癌标本和正常对照标本中都发现有几处常见的单核苷酸多态性位点。结论本研究确定了9种乳腺癌患者可能发生的突变类型，为今后临床应用DHPLC对高危人群BRCA1基因进行早期基因检测提供了9个位点。DHPLC一测序技术可快速、方便地区分带有碱基替换和小片段缺失的DNA片段，是一种可用于早期临床诊断乳腺癌BRCA1基因改变的高效、灵敏和操作简便的方法。     

DHPLC在检测Miyoshi肌病家系致病基因突变中的应用

目的检测Miyoshi肌病家系成员的DYSF基因突变，探讨变性高效液相色谱分析法（DHPLc）在基因研究中的效能。方法用RT-PCR技术扩增DYSF基因的编码序列，利用变性高效液相色谱分析技术（DHPLC）对PCR产物进行突变筛选，出现异常峰型的片段进行核苷酸序列测定，明确突变位点。结果患者DYSF基因存在6429delG突变。结论DHPLC能有效地用于基因突变的检测，该方法快速高效，可作为大样本筛查突变位点的一种便捷可靠手段。     

DHPLC在检测Miyoshi肌病家系致病基因突变中的应用

目的检测Miyoshi肌病家系成员的DYSF基因突变,探讨变性高效液相色谱分析法(DHPLC)在基因研究中的效能。方法用RT-PCR技术扩增DYSF基因的编码序列,利用变性高效液相色谱分析技术(DHPLC)对PCR产物进行突变筛选,出现异常峰型的片段进行核苷酸序列测定,明确突变位点。结果患者DYSF基因存在6429delG突变。结论DHPLC能有效地用于基因突变的检测,该方法快速高效,可作为大样本筛查突变位点的一种便捷可靠手段。     

多瘤病毒在人胶质瘤的基因表达与测序

目的:探讨人胶质瘤发生与多瘤病毒SV40、JCV和BKV的PCR扩增情况,并对扩增产物做了基因测序和序列分析.方法:采用PCR方法检测94例胶质瘤和18例正常脑组织中SV40、JCV和BKV的基因片段,并对基因片段做了克隆测序和序列分析.结果:SV40和JCV序列与GenBank序列完全同源,三条BKV序列有两条与GenBank公布的序列有部分硷基不同,但氨基酸序列分析结果则相同.结论:引起人胶质瘤的多瘤病毒存在有病毒亚型.     

人偏肺病毒亚克隆的构建与鉴定

目的 从临床标本中扩增人偏肺病毒(hMPV)基因片段进行亚克隆,为进一步全面深入地研究人偏肺病毒奠定基础.方法 根据GenBank中已知的hMPV全基因序列设计引物.收集呼吸道感染住院患儿鼻咽抽吸物697例,提取病毒核酸,运用长片段RT-PCR技术扩增目的片段,切割含目的条带的凝胶进行纯化,并将目的片段连接到PJET1.2/blunt克隆载体,转化感受态细胞TOP10,经含氨苄青霉素的抗生素平板筛选,得到阳性克隆,提取质粒,最后对重组质粒进行PCR鉴定和测序鉴定.结果 随机选取5例所获的阳性条带经PCR和测序鉴定,证实确为hMPV基因片段.结论 成功构建了hMPV基因组亚克隆,可用于后续的实验研究.     

单核苷酸多态性单倍型连锁分析诊断Duchenne肌营养不良致病基因携带者

目的用单核苷酸多态性(SNP)单倍型连锁分析法对临床诊断为Duchenne肌营养不良(DMD)家系中的2例女性个体进行连锁分析,以诊断其是否为DMD致病基因携带者。方法提取家系成员外周血基因组DNA,选取多个DMD基因内含SNP位点的片段进行PCR扩增,对扩增片段测序,进行连锁分析以确定是否为DMD致病基因携带者。结果测序结果显示在该家系扩增的9个片段中有5个片段含SNP位点,4个片段不含SNP位点,个体I-2(先证者母亲)中有诊断价值的片段为3个,含4个SNP位点。先证者在363795、1204769、1330106及1330197位点SNP单倍型为T-C-A-T,其父(I-1)为T-T-A-T,其母亲SNP单倍型为T-C-A-T/C-T-C-C,一位姐姐(Ⅱ-1)为T-T-A-T/C-T-C-C,另一位姐姐(Ⅱ-2)为T-T-A-T/T-C-A-T,即为DMD致病基因携带者。结论 SNP单倍型连锁分析法可成功诊断DMD家系中的女性DMD基因携带者。     

DSPP基因启动子多态性位点及其与牙釉质发育异常的相关性分析

目的:分析牙本质涎磷蛋白基因(dentin sialophosphoproprotein,DSPP)启动子多态性位点(SNPs)的致病易感性,探讨DSPP基因与牙釉质发育异常的相关性.方法:从基因组数据库中下载SNPs的数据,采用生物信息学软件预测SNPs所在区域是否作为潜在的转录调控元件;以近两年内来本院就诊的116例牙釉质发育异常患者作为研究对象,抽提外周血DNA,PCR扩增DSPP基因启动子片段;通过DNA测序获得SNP等位基因频率,以“千人基因组计划”所公布的等位基因频率作为对照组,统计学分析SNPs等位基因频率的差异.结果:根据NCBI数据库公布的结果,位于DSPP启动子区1 kb范围内存在4个SNPs,分别命名为S1～S4.启动子分析软件预测发现,含S3不同等位基因的同一序列分别存在不同转录因子结合元件;S2不同等位基因的同一序列存在相同的调控元件;S1和S4不同等位基因的同一序列都只能预测到含其中1个等位基因的序列存在转录因子结合元件.与对照组相比较,牙釉质发育异常患者DSPP基因启动子区S3等位基因频率差异存在显著性(P＜ 0.001),而其他SNPs没有统计学差异(P＞0.05).结论:DSPP基因启动子区SNP住点可作为牙齿发育不良相关疾病的筛查对象,其中S3位点很可能与牙釉质发育异常密切相关.     

胃癌组织中EphB2受体胞外区结构域的克隆和序列测定

目的对胃癌组织中酪氨酸蛋白激酶EphB2受体胞外区结构域进行克隆。方法从胃癌患者手术切片标本中提取RNA，进行RT—PCR，将扩增片段克隆人pUC19质粒，进行测序及酶切鉴定。结果克隆片段序列正确。结论为进行表达、筛选与之相互作用的蛋白，阐明其生理功能打下基础。     

DNA损伤修复基因多态性与308 nm准分子激光治疗白癜风疗效的相关性分析

[目的]探讨DNA损伤修复基因多态性与308 nm准分子激光治疗白癜风疗效的相关性.[方法]选择2015年7月至2016年7月确诊的白癜风患者66例,所有患者均接受308 nm准分子激光治疗,治疗前清晨空腹抽取患者外周血1 mL以提取基因组DNA,通过直接测序法对ERCC1 C118T、XPC Lys939Gln这2个SNP位点行基因分型,分析DNA损伤修复基因多态性与白癜风疗效的相关性.[结果]66例患者治疗时间4个月及以下占39.39％,复色面积50％以上占34.85％,首次复色时间1个月及以下占75.76％.ERCC1 C118T rs11615与患者复色效果、首次复色时间及治疗时间均相关(P＜0.05),其中CC基因型复色面积50％以上、首次复色时间1个月及以下、治疗时间1个月及以下比例均明显大于CT+ TT基因型,差异有统计学意义(P＜0.05);而XPCLys939Gln该SNP位点与患者复色效果无关(P＞0.05).[结论]ERCC1 C118T该SNP位点与接受308nm准分子激光治疗效果显著相关,相比CT+TT基因型,CC基因型复色效果更明显;XPC Lys939Gln该SNP位点对治疗效果影响不大.     

脂联素启动子基因多态性与2型糖尿病及并发症的相关性研究

目的 观察脂联素(APN)启动子基因单核苷酸多态性(SNP)频率与2型糖尿病(T2DM)及其合并症间的相关性,探讨脂联素基因(aPM1)突变是否是T2DM遗传的危险因素.并确立一种高效、准确、经济的检测APN基因实用筛查方法,供临床检测应用.方法 对单纯T2DM49例(男28例,女21例)、T2DM合并高血压(T2DM-HP)90例(男51例,女39例)、T2DM合并冠心病(T2DM-CHD)33例(男15例,女18例)、T2DM合并肾病(T2DM-NE)41例(男18例,女23例)患者和健康对照组58名(男30名,女28名),测定空腹血清生化指标.采用变性高效液相色谱(DHPLC)技术,筛选APN基因多态性位点.结果 在APN基因(aPM1)启动子区扩增的片段与基因库中登陆的APN GeneID:9370序列相比,存在点突变(-11377G/C).GG、GC、CC基因频率在T2DM组和对照组分别为:5.16%、42.25%、52.58%和3.40%、32.75%、63.85%.T2DM患者aPM1 的SNP-11377位点G等位基因频率明显高于健康对照组(x2=6.818,OR=0.55,P=0.033).从T2DM基因型分组临床资料比较可见,-11377G/C基因型与T2DM患者的收缩压(P=0.035)、体重指数(BMI)(P=0.010)、腹围(P=0.013)和腰臀比(P=0.015)显著相关.通过对试验条件优化,在采用DHPLC技术检测APN基因多态性位点发现,本试验检测柱温以60℃最佳.结论 aPM1启动子区SNP-11377C/G多态性与T2DM及并发症的发生和T2DM患者体型肥胖形成机制有相关性,提示SNP.11377C/G多态性可能增加T2DM的遗传风险.     

Mutational analysis of CYP2C8 in hypertensive patients using denaturing high performance liquid chromatography

What is known and Objective: CYP2C8 is involved in the cytochrome P450 (CYP) epoxygenase pathway. Arachidonic acid metabolites such as epoxyeicosatrienenoic acids and hydroxyeicosatetrenoic acids, produced may have a role in hypertension. We aimed to develop a medium through‐put method for screening samples of known and new mutations of CYP2C8 using denaturing high performance liquid chromatography (DHPLC). Methods: DNA samples from 200 subjects (hypertensive patients and healthy controls) were screened for SNPs in CYP2C8 using DHPLC. Genotypes and allelic frequencies of CYP2C8 between the healthy controls and patients with hypertension were compared. Results and Discussions: Six variants were detected and two were new; T deletion at 5063 and substitution of C to T at 33468 in exon 8. Differences in variant frequencies were detected between the controls and hypertensive patients. The controls have significantly higher prevalence of C35322C compared to the patients. The functional significance of the SNP at 35322 requires further study. Having homozygous C35322C could be a protective factor for hypertension. What is new and Conclusion: Denaturing high performance liquid chromatography is useful for population screening to identify new and existing SNPs. A higher frequency of the C35322T SNP was observed among hypertensive patients than control subjects. This potentially important observation requires confirmation and the clinical significance assessed.     

自噬相关基因5基因多态性及其单倍体型与帕金森病的相关性研究

目的 探讨自噬相关基因5( Atg5)基因3个标签单核苷酸多态性(Tag SNP,rs17587319C/G、rs573775C/T、rs9486315C/T)及其单倍体型与帕金森病(PD)发病的关系.方法 采用病例-对照研究,PD患者80例(病例组)和健康体检者87例(对照组)为对象,应用聚合酶链反应-限制性酶切片段长度多态性分析方法(PCR-RFLP)检测Atg5 Tag SNP rs17587319C/G、rs573775C/T、rs9486315C/T,并分析其基因型及等位基因频率在正常人群及PD患者中的分布特点.结果 Atg5 Tag SNP rs17587319C/G的C等位基因频率病例组为89.4％ (143/160),对照组为74.7％(130/174),差异有统计学意义(P＜0.01);病例组CC基因型频率为78.7％ (63/80),对照组为58.6％(51/87),差异有统计学意义(P＜0.01).SNP rs573775C/T和rs9486315C/T的等位基因频率及基因型频率在两组问的差异无统计学意义(P＞0.05).Logistic回归分析结果SNP rs17587319C/G的CC基因型与PD的发病有独立相关性(P＜0.01).单倍体型分析结果病例组中H1、H2单倍体型的频率高于对照组(P＜0.05和＜0.01).结论 H1,H2单倍体型和Atg5 Tag SNP rs17587319C/G的C等位基因可能是PD的危险因素.     

Associations between single-nucleotide polymorphisms of the adiponectin gene,serum adiponectin levels and increased risk of type 2 diabetes mellitus in Iranian obese individuals

Abstract

Introduction: Adiponectin is an adipose tissue-secreted hormone with important metabolic effects. There have been inconsistent reports about SNPs of the adiponectin gene and risk of type 2 diabetes (T2DM). The aim of this study was to investigate any association between SNPs (+45 T/G and +276 G/T) of the adiponectin gene with serum adiponectin levels, metabolic factors and risk of T2DM in obese individuals. Design and methods: Genotyping for two common SNPs of adiponectin gene was performed in 50 unrelated obese type 2 diabetic patients and 52 obese non-diabetic control subjects by the polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) method. Lipid profile was measured by enzymatic methods. Serum adiponectin, insulin, leptin and glucose levels were measured by immunoassay, and glucose oxidase methods, respectively. Results and conclusion: It was observed that obesity and T2DM are associated with low serum adiponectin levels. The G allele and TG/GG genotype of SNP 45 occurred more frequently than the T allele and TT genotype in T2DM patients compare to the controls (p<0.05). Subjects with the G/G + TG genotype of SNP 45 were at increased risk for T2DM [Odds Ratio (OR) 2.574; 95% Confidence Interval (CI) 1.051–6.302; p=0.036] compared with those T/T genotype. There was no statistically significant difference in allele and genotype frequencies of SNP 276 comparing control group with T2DM group. Thus, our results demonstrated that, adiponectin SNP 45T/G, rather than SNP 276G/T, is more associated with risk of T2DM in obese individuals.     

DVL2基因多态性与中国汉族人群先天性脊柱侧凸遗传易感性的关联研究

背景：近20年来小鼠的分子胚胎学研究进展获得了大量关于脊椎发育的分子信息,用同线性分析法确立先天性脊柱侧凸的候选基因已成为可能。目的：通过候选基因DVL2上关键单核苷酸多态性位点的筛查,探索DVL2与中国汉族人群先天性脊柱侧凸及其不同临床表型之间的关联。方法：采用病例-对照研究,入选127例中国汉族先天性脊柱侧凸患者和127例对照组。根据国际人类基因组单体型图计划提供的基因型数据,应用Haploview 4.1软件选取DVL2的标签和功能单核苷酸多态性。根据椎体畸形特点、畸形部位、畸形受累程度、有无合并肋骨畸形和椎管内畸形将病例组进一步分为不同临床表型。对所有样本应用SNPstream UHT Genotyping系统对所选单核苷酸多态性位点进行基因型鉴定;进一步进行基于基因型/等位基因频率的关联分析,并用Haploview4.1软件分析对照组单核苷酸多态性位点间是否存在连锁不平衡。结果与结论：共筛选5个位点：单核苷酸多态性1（rs2074222）、单核苷酸多态性2（rs222837）、单核苷酸多态性3（rs222835）、单核苷酸多态性4（rs10671352）和单核苷酸多态性5（rs222836）,其基因型分布在病例和对照组中均符合Hardy-Weinberg平衡;5个位点处于完全连锁不平衡状态;5个位点的基因型/等位基因/单倍体型与先天性脊柱侧凸的发生风险之间不存在相关性。在进一步与先天性脊柱侧凸临床表型的关联分析中没有发现阳性位点。提示在中国汉族人群中DVL2基因可能不是引起先天性脊柱侧凸及其不同临床表型的主要因素,有待于进一步深入研究。     

LMX1A基因多态性与中国汉族人群先天性脊柱侧凸遗传易感性的关联

背景：先天性脊柱侧凸是由于胚胎期脊柱椎体发育异常引起的脊柱侧凸,其遗传病因学假说开始引起许多学者的重视。目的：通过候选基因LMX1A上关键单核苷酸多态性位点的筛查,探索LMX1A与中国汉族人群先天性脊柱侧凸及其不同临床表型之间的关联。方法：入选127例中国汉族先天性脊柱侧凸患者,另选取外伤、感染、炎症性疾病等患者127例为对照组。根据国际人类基因组单体型图计划提供的基因型数据,应用Haploview 4.1软件选取LMX1A的标签和功能单核苷酸多态性位点。根据椎体畸形特点、畸形部位、畸形受累程度、有无合并肋骨畸形和椎管内畸形将病例组进一步分为不同临床表型。所有样本应用SNPstream UHT Genotyping系统对所选单核苷酸多态性位点进行基因型鉴定;进一步进行基于基因型/等位基因频率的关联分析,并用Haploview 4.1软件分析对照组单核苷酸多态性位点间是否存在连锁不平衡。结果与结论：共筛选6个位点：SNP1（rs 1819768）、SNP2（rs 12023709）、SNP3（rs 16841013）、SNP4（rs 4656435）和SNP5（rs 4657412）和SNP6（rs 4657411）,其基因型分布在病例组和对照组中均符合Hardy-Weinberg平衡;在基于基因型的关联分析中发现阳性位点SNP1和SNP2,单位点分析显示两位点基因型在病例组和对照组中的分布频率差异有显著性意义（P=0.026和P=0.026）,在进一步非条件Logistic回归分析中发现这两个位点的基因型分布最符合Ressessive（OR=0.38;95%CI=0.15～0.94,P=0.029,AIC=354.9）遗传模型;SNP1、SNP2、SNP3和SNP6处于连锁不平衡状态,SNP4和SNP5也处于完全连锁不平衡状态,但单倍体型与先天性脊柱侧凸的发生风险之间不存在相关性;在进一步与先天性脊柱侧凸临床表型的关联分析中发现SNP1基因型AC型、SNP2基因型AG型、SNP3基因型CT型与有椎体形成障碍先天性脊柱侧凸的易感性升高有关。结果提示在中国汉族人群中LMX1A基因可能和先天性脊柱侧凸的发生、发展相关,是一个重要的易感基因。     

变性高效液相色谱对CTX-M型超广谱β内酰胺酶基因分型研究

目的 探讨湖南省CTX-M型超广谱B内酰胺酶(ESBLs)基因型分布情况和变性高效液相色谱(DHPLC)方法检测CTX-M型ESBLs基因型的准确性.方法 用多重PCR扩增标准菌株和ESBLs表型阳性的临床菌株blaCTX-M基因,扩增产物经DHPLC分析得到标准菌株和临床菌株色谱峰图,通过比对标准色谱峰图对临床菌株进行基因分型,同时采用单纯随机抽样法选择25株多重PCR扩增阳性菌株进行特异PCR扩增,其产物冉进行基因测序来评估DHPLC法的准确性.结果 142株产ESBLs的肠杆菌科细菌经多重PCR扩增证实109株携带blaCTX-M基因,检出率为76.8%(109/142).109株扩增阳性的菌株经DHPLC分析后检出4种不同的blaCTX-M基因型:33株携带CTX-M-3、19株携带CTX-M-15、5株携带CTX-M-9、52株携带CTX-M-14.25株基因测序结果与DHPLC基因分型结果作比较显示:24株DHPLC的基因分型结果与基因测序结果完全吻合,但有1株DHPLC基因分型为CTX-M-15,而测序为CTX-M-82.结论 DHPLC可对耐药进行基因快速基因分型,具有准确、快速和经济等优点.     

基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术检测药物代谢酶基因多态性平台的建立

目的 建立基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)技术检测患者体内药物代谢酶基因多态性的平台。方法 选取2013年10月～2014年6月在北京协和医院门诊就诊患者53例EDTA抗凝外周血,提取全血基因组DNA,用MALDI-TOF-MS技术检测53例患者药物代谢酶基因CYP2C9*2(rs1799853),CYP2C9*3(rs1057910),CYP2C19*2(rs4244285),CYP2C19*3(rs4986893),CYP2C19*4(rs28399504),CYP2C19*5(rs56337013)和CYP2C19*17(rs12248560)的单核苷酸多态性(SNP)位点,并用Sanger测序法进行验证。结果 用 MALDI-TOF-MS 技术可以同时完成53份样本,2个药物代谢酶基因,7个SNP位点的检测。53例患者中,发现CYP2C19*2(rs4244285)AG型25例,AA型6例,GG型22例,A等位基因频率为34.9%。CYP2C19*3(rs4986893)AG型4例,GG型49例,A等位基因频率为3.8%。CYP2C9*3(rs1057910)CA型5例,AA型48例,C等位基因频率为4.7%。未发现 CYP2C9*2(rs1799853),CYP2C19*4(rs28399504),CYP2C19*5(rs56337013)和CYP2C19*17(rs12248560)位点突变。经与Sanger测序法比较,两种检测方法结果的符合率为100%。结论 成功建立MALDI-TOF-MS技术检测药物代谢酶基因多态性的平台,该平台具有高通量、准确的特点,对个性化用药治疗具有重要的临床应用价值。     

Influence of single-nucleotide polymorphisms in the multidrug resistance-1 gene on the cellular export of nelfinavir and its clinical implication for highly active antiretroviral therapy

Protease inhibitors (PIs) such as nelfinavir (NFV) suppress HIV replication. PIs are substrates of P-glycoprotein (P-gp), the product of the multidrug-resistance-1 (MDR1) gene. Three single-nucleotide polymorphisms (SNPs) are present in exons of the MDR1 gene: MDR1 1236, MDR1 2677 and MDR1 3435. We speculated that these genetic polymorphisms affected PI concentration in the cell. To verify this hypothesis, we first genotyped these SNPs in 79 Japanese patients by the SNaPshot method and found incomplete linkage disequilibrium between the SNPs. Because the SNP at MDR1 3435 has been reported to be associated with P-gp expression, we evaluated the effect of that SNP on the export of NFV from HIV-positive patients' lymphoblastoid cell lines by measuring time-dependent decrease in the amount of intracellular NFV by high-performance liquid chromatography. We found the intracellular concentration of NFV in lymphoblastoid cell lines (LCLs) with the homozygous T/T genotype at MDR1 3435 were higher than that with C/C genotype with statistical significance. This suggests that the activity of P-gp in patients' LCL cells with the MDR1 3435 T/T genotype was lower. In a retrospective study we evaluated the effect of the SNPs on CD4 cell count recovery in response to antiretroviral treatment with PIs, and obtained statistically significant evidence that suggested marginal association of the SNP at MDR1 1236 but not at MDR1 2677 or MDR1 3435. As in vitro results were not consistent with the clinical evaluation, clinical importance of MDR1 genotyping for antiretroviral therapy remains to be investigated in a larger, case-controlled study.