首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
相似文献
 共查询到20条相似文献,搜索用时 335 毫秒
1.
目的研究广西人群中网状蛋白4(RTN4)基因rs2588519 T/C及rs7582359 A/G位点多态性的分布特征,对比分析不同种族间这两个位点基因型及等位基因频率的分布差异。方法运用多重单碱基延伸技术和DNA测序方法检测323例广西健康体检者的RTN4基因rs2588519 T/C及rs7582359 A/G位点基因型,分析其基因型及等位基因频率的分布,并对比HapMap(国际人类基因组单体型图计划)公布的欧洲人、日本人、非洲人和北京人的多态性数据。结果在广西人群中,RTN4基因rs2588519 T/C位点存在CC(53.0%)、TC(38.7%)、TT(8.3%) 3种基因型;rs7582359 A/G位点存在AA(7.4%)、AG(37.5%)、GG(55.1%) 3种基因型,这两位点的基因型及等位基因频率在男女间差异无统计学意义(P0.05)。rs2588519 T/C位点基因型与非洲人群比较差异具有统计学意义(P0.05),其等位基因则与欧洲人、日本人和非洲人差异具有统计学意义(P0.05);rs7582359 A/G位点基因型及等位基因与欧洲人、非洲人比较差异均有统计学意义(P0.05)。结论 RTN4基因rs2588519 T/C及rs7582359 A/G位点多态性分布存在不同程度的种族差异。  相似文献   

2.
为研究西北地区汉族人群IgAIg MFc高亲和力受体(Fc receptor IgAIg Mhigh affinity,FCAMR/Fcα/μR)基因单核苷酸多态性(SNP)及单体型的频率。我们采用聚合酶链反应后直接测序方法,对西北地区79(男45,女34)名没有亲缘关系的汉族健康个体FCAMR基因,T549C(rs1856746),A457G(rs3813952),G421A(rs1340232)和A298G(rs3813950)4个SNP位点进行基因分型。用SHEsis软件分析FCAMR基因的单体型频率。本研究发现西北地区汉族人群中T549C(rs1856746)位点,等位基因频率C是38.6%,T是61.4%;A457G(rs3813952)位点,等位基因频率G是5.7%,A是94.3%;G421A(rs1340232)位点,等位基因频率A是17.1%,G是82.9%,A298G(rs3813950)位点,等位基因频率G是4.4%,A是95.6%。西北地区汉族人群中FCAMR基因T549C(rs1856746)、A457G(rs3813952)、G421A(rs1340232)和A298G(rs3813950)4个位点构成的3种主要单体型率(频率>10%)T/A/G/A是60.5%,C/A/A/A是17.1%和C/A/G/A是16.7%。本研究分析了西北地区汉族人群FCAMR基因T549C(rs1856746)、A457G(rs3813952)、G421A(rs1340232)和A298G(rs3813950)4个SNP位点的基因型频率、等位基因频率和单体型频率,为研究该地区FCAMR基因单核苷酸多态性与免疫反应以及相关疾病如IgA肾病易感性之间的相关性提供研究基础。  相似文献   

3.
目的探讨IL-4基因5’和3’非编码区域单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphism,SNP)与HCV慢性感染的相关性。方法选取云南地区汉族人群HCV慢性感染患者380例,健康体检人群439例。采用Taq Man探针基因分型方法对IL-4基因5’和3’非编码区域6个SNP位点SNP-1138A/G(rs2243247)、-1098G/T(rs2243248)、-589C/T(rs2243250)、-33C/T(rs2070874)、2979C/A(rs2227284)、3’端C/T(rs2243292)进行基因分型,并构建单倍型,评估上述6个SNP位点及单倍型与HCV慢性感染的相关性。结果 IL-4基因SNP-1138A/G(rs2243247),3’端C/T(rs2243292)在病例组和对照组中无多态性;SNP位点-1098G/T(rs2243248)、-589C/T(rs2243250)、-33C/T(rs2070874)、2979C/A(rs2227284)的基因型频率和等位基因频率在病例组和对照组中差异无统计学意义(P0.05);单倍型分析结果显示:SNP位点-1098G/T(rs2243248)、-589C/T(rs2243250)、-33C/T(rs2070874)、2979C/A(rs2227284)构建的单倍型频率在病例组和对照组中差异无统计学意义(P0.05)。结论在云南汉族群体中,IL-4基因5’和3’非编码区域SNP位点-1138A/G(rs2243247)、-1098G/T(rs2243248)、-589C/T(rs2243250)、-33C/T(rs2070874)、2979C/A(rs2227284)、3’端C/T(rs2243292)与HCV慢性感染没有相关性。  相似文献   

4.
目的 研究PATZ1基因的4个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)rs2240424、rs2057951、rs2240427和rs714909的多态性与无精症的关系.方法 用PCR-限制性片段长度多态性分析方法,在180例无精症患者和190名正常男性中对上述4个SNP位点的基因频率和基因型频率分布进行调查.结果 rs2057951位点的等位基因C(35.0%vs.27.6%,P=0.031)和带有等位基因C个体(CT+CC)(57.8%vs.46.3%,P=0.027)的频率在无精症患者显著高于正常男性.4种SNP的单倍型在两组人群中的分布差异有统计学意义(P=0.01),单倍型ACAC(11.1%vs.6.6%,P=0.029)和ACGC(11.2%vs.5.2%,P=0.003)在无精症患者中显著高于正常男性.结论 PTAZ1的rs2057951位点的等位基因C和单倍型ACAC和ACGC增加无精症的易感性,提示PTAZ1基因可能与无精症发病相关.  相似文献   

5.
目的:分析神经突起生长抑制因子(Nogo)基因rs2968795G/A位点和rs10496040A/C位点在广西人群中的多态性分布特点,并比较其在不同人群间的分布差异。方法:运用多重单碱基延伸法(SNaPshot)和DNA测序法检测323例广西人群的rs2968795G/A位点和rs10496040A/C位点基因型,并用统计学方法比较2个位点的基因型及等位基因频率在男性和女性之间以及不同人群中分布差异。结果:rs2968795G/A位点存在GG、GA、AA 3种基因型,分布频率为18.9%、46.1%、35.0%。此位点基因型及等位基因频率在广西人群的男性和女性间差异无统计学意义。其基因型和等位基因与国际人类基因组单体型图计划(HapMap)公布的欧洲和非洲人群比较差异有统计学意义;rs10496040A/C存在AA、AC、CC3种基因型,分布频率为1.2%、16.4%、82.4%。此位点基因型及等位基因频率在广西人群的男女之间差异无统计学意义。基因型和等位基因频率与欧洲、非洲和日本人群间差异均有统计学意义。结论:Nogo基因rs2968795G/A位点和rs10496040A/C位点基因多态性在不同人群间存在着不同程度差异。这种差异可能对研究其多态性和相关疾病的关系在不同人群间中的差异具有指导意义。  相似文献   

6.
目的:研究广西人群lncRNA-GAS5基因rs2235095G/A和rs2067079C/T单核苷酸多态性(SNPs)的分布特征,并比较其在不同地区人群中的分布差异。方法 :采用SNPscan技术对289例广西人群rs2235095G/A和rs2067079C/T位点进行基因分型检测,并分析其基因型和等位基因频率与国际千人基因组计划数据库公布的欧洲(CEU)、日本(JPT)、尼日利亚(YRI)和中国南方汉族人群(CHS)的分布差异。结果 :rs2235095G/A位点存在GG、AG和AA3种基因型,分布频率分别为37.0%、47.4%和15.6%;rs2067079C/T位点存在CC、CT和TT3种基因型,分布频率分别为63.0%、31.5%和5.5%。2个位点的基因型和等位基因频率在广西人群不同性别间比较差异均无统计学意义。rs2235095G/A基因型和等位基因频率与国际千人基因组计划数据库公布的CEU、JPT和YRI人群比较差异均有统计学意义;rs2067079C/T基因型和等位基因频率与YRI人群比较差异均有统计学意义。结论 :广西人群lncRNA-GAS5基因rs2235095G/A和rs2067079C/T位点存在基因多态性,且其在不同人群间存在不同程度的差异。  相似文献   

7.
应用限制性片段长度多态性方法检测102例Graves病(Graves'disease,GD)及伴Graves眼病(Graves'ophthalmopathy,GO)亚组患者与100例正常组细胞毒性T淋巴细胞相关抗原-4(cytotoxic T lymphocyte associated antigen-4,CTLA-4)基因外显子1+49位点A/G及启动子-318位点C/T多态性。以探讨CTLA-4基因外显子1+49位点和启动子-318位点多态性与粤西汉族人GD及GO发病的关联性。结果显示GD组外显子1+49位点的GG基因型及G等位基因频率显著高于正常组(P=0.0142、0.0017),GD组AA基因型及A等位基因频率显著低于正常组(P=0.0079、P=0.006);启动子-318位点的各基因型及等位基因频率与正常组相比无统计学意义;外显子1+49位点和启动子-318位点基因型、等位基因频率在GO、无眼病GD亚组及正常组中任两组比较均无统计学意义。研究提示CTLA-4基因外显子1+49位点GG基因型及G等位基因可能是粤西汉族人GD的易感因素,但与GO无相关,AA基因型及A等位基因则是保护因素;启动子-318位点多态性与粤西汉族人GD及GO均不相关。  相似文献   

8.
目的:研究RTN4基因rs2920891A/C和rs17046647A/G位点多态性在广西人群中的分布特征,比较不同人群的分布差异。方法:本实验采用多重单碱基延伸PCR(SNa Pshot)和DNA测序方法,对323例广西健康体检者RTN4基因的rs2920891A/C和rs17046647A/G位点基因型进行检测,并与国际人类基因组单体型图计划(Hap Map)公布的不同人群(北京、日本、欧洲及非洲人群)RTN4基因多态性数据进行比较。结果:在广西人群中,RTN4基因rs2920891A/C位点存在AA、AC、CC基因型及A、C等位基因,其等位基因频率在男女间的分布差异有统计学意义(P0.05),基因型及等位基因频率与日本、欧洲及非洲人群比较差异均有统计学意义(P0.05);rs17046647A/G位点存在AA、AG、GG基因型和A、G等位基因,基因型及等位基因频率在男女间比较差异无统计学意义(P0.05),而与日本、欧洲及非洲人群比较差异均有统计学意义(P0.01)。结论:中国广西人群中RTN4基因的rs2920891A/C和rs17046647A/G位点多态性与其他种族间存在差异性。  相似文献   

9.
目的:研究广西正常人群中白细胞介素22(IL-22)基因rs2227485C/T和rs2227491A/G位点的多态性分布特点和在不同人群间的分布差异,探讨不同基因型间常见血脂指标水平的差异。方法:采取多重单碱基延伸法(SNa Pshot)和DNA测序相结合的方法对280例广西人群IL-22基因的rs2227485C/T和rs2227491A/G位点进行基因分型检测,并用统计学方法比较各组间多态性分布的差异及不同基因型间血脂指标水平的差异。结果:rs2227485C/T存在CC、CT和TT 3种基因型,分布频率分别为17.1%、49.3%和33.6%,此位点基因型及等位基因频率在广西人群不同性别间的差异无统计学显著性(P0.05),其基因型及等位基因与国际人类基因组单体型图计划公布的意大利、北京、日本和墨西哥人群相比,差异有统计学意义(P0.05);rs2227491A/G存在AA、AG和GG 3种基因型,分布频率分别为16.1%、52.8%和31.1%,此位点基因型及等位基因频率在广西人群不同性别间的差异无统计学显著性(P0.05),基因型频率与意大利、日本和墨西哥人群之间的差异有统计学意义(P0.05),等位基因分布频率与其他4个人群相比差异均有统计学意义(P0.05)。rs2227491A/G位点3种基因型间的HDL-C和LDL-C差异有统计学意义(P0.05),其中HDL-C在AG/AA与GG组比较差异有统计学意义(P0.05),LDL-C在AG/GG和AA组比较差异有统计学意义(P0.05)。结论:IL-22基因rs2227485C/T和rs2227491A/G位点多态性在不同人群间存在着差异。rs2227491A/G多态性与血脂水平相关。  相似文献   

10.
目的:探讨IL-10基因启动子-1082G/A(rs1800896)、-819C/T(rs1800871)、-592C/A(rs1800872)位点多态性与安徽皖南地区汉族人群支气管哮喘的相关性。方法:采用病例-对照方法,用聚合酶链反应及直接基因测序法比较183例支气管哮喘组与151例正常人对照组之间基因型、等位基因频率的差异。结果:哮喘组IL-10基因启动子-1082G/A、-592C/A位点基因型与对照组相比有差异(P<0.05),其等位基因型频率在哮喘组和对照组间亦有差异(P<0.05)。而-819C/T位点基因型及等位基因型频率在哮喘组和对照组间均无差异(P>0.05)。结论:IL-10基因启动子rs1800896(-1082G/A)位点和rs1800872(-592C/A)位点的多态性可能与安徽皖南地区汉族哮喘相关;而rs1800871(-819C/T)位点的多态性可能与安徽皖南地区汉族哮喘无相关。  相似文献   

11.
The tumor necrosis factor receptor 2 (TNF-RII, CD120b, TNF-R p75/80) gene has recently been characterised. It is located on chromosome 1p362 and consists of 10 exons and 9 introns A number of biallelic polymorphisms have been found in exons 4, 6, 9 and 10 based on differences between published sequences. In this study we have used polymerase chain reaction methodology in association with sequence-specific primers (PCR-SSP) incorporating mismatches at the 3' end to identify these polymorphisms. We were able to confirm the presence of a single biallelic polymorphism in exon 6 corresponding to a (T/G) at nucleotide 676 of TNF-RII mRNA (gb:M32315) which results in an amino acid change and three biallelic polymorphisms in exon 10 (in the3'UTR) corresponding to (A/G) at nucleotide 1663, (T/G) at nucleotide 1668 and a (C/T) at nucleotide 1690 of gb:M32315, whereas no polymorphisms were observed in exons 4 and 9. Here we report that in 192 unrelated UK Caucasian individuals the allele frequencies determined by direct counting were: 676-T (0.77), 1663-G (0.51), 1668-T (0.95), and 1690-T (0.64) and the calculated gene frequencies were; 676-T (0.52), 676-G (0.12); 1663-G (0.30), 1663-A (0.28); 1668-T (0.77), 1668-G (0.025); and 1690-T (0.40), 1690-C (0.20). Furthermore, the presence of an A allele at nucleotide position 1663 was found to be strongly associated with the presence of a C allele at nucleotide position 1690 and a G allele at nucleotide position 1668 whereas the presence of a G allele at position 1663 was associated with the absence of a C allele at nucleotide position 1690.  相似文献   

12.
PurposeAlthough the polymorphisms of erythrocyte complement receptor type 1 (CR1) in patients with malaria have been extensively studied, a question of whether the polymorphisms of CR1 are associated with severe malaria remains controversial. Furthermore, no study has examined the association of CR1 polymorphisms with malaria in Chinese population. Therefore, we investigated the relationship of CR1 gene polymorphism and malaria in Chinese population.ResultsThere were no significant differences in the genotype, allele and haplotype frequencies of CR1 gene rs2274567 G/A, rs4844600 G/A, and rs2296160 C/T polymorphisms between patients with malaria and controls. Furthermore, there was no association of polymorphisms in the CR1 gene with the severity of malaria in Chinese population.ConclusionThese findings suggest that CR1 gene rs2274567 G/A, rs4844600 G/A, and rs2296160 C/T polymorphisms may not be involved in susceptibility to malaria in Chinese population.  相似文献   

13.
目的:检测卵磷脂胆固醇酰基转移酶(lecithin cholesterol acyltransferase,LCAT)基因3个编码区单核苷酸多态位点在中国人群中的分布频率,并初步探讨它们与脂代谢和冠状动脉粥样硬化性心脏病(coronary atherosclerotic heart disease,CHD)易感性的关系。方法:采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法,分析209名正常人和203例CHD患者中608C/T、911T/C和1188C/T(参照序列:NM_000229)3个位点的多态性。结果:608C和608T等位基因频率分布符合Hardy-Weinberg平衡。CHD患者组608T频率显著低于正常人群(P=0.034)。与无608T CHD患者相比,具有608T的CHD患者的血浆高密度脂蛋白胆固醇显著升高(P=0.015)。911T/C和1188C/T在两组中均未检出。结论:LCAT基因608T等位基因与CHD患者较高的血浆高密度脂蛋白胆固醇水平相关联,可能与中国人CHD相关。911T/C和1188C/T在中国人群中非常罕见。  相似文献   

14.
目的:了解中国汉族人群中白细胞介素10(IL-10)启动子区基因多态性的等位基因频率。方法:应用聚合酶链-限制性片段长度多态性分析(PCR—RFLP)技术,对131例健康中国汉族受检样本进行IL-10592、819、-1082三个位点的基因型检测。结果:IL-10-592位点A/A、C/A、C/C基因型频率分别为42.7%、36.6%、20.7%,IL-10 -819位点T/T、T/C、C/C基因型频率分别为42.7%、36.6%、20.7%;其相关等位基因频率与意大利高加索人及英国曼彻斯特人相比有显著性差异,但与韩国人之间的差异无统计学意义。结论:不同国家人群间存在IL-10启动子区基因多态性的差异。  相似文献   

15.
Aim: The aim of the present study was to investigate the association between tumor necrosis factor related apoptosis-inducing ligand (TRAIL) gene polymorphisms and the susceptibility and severity of lumbar disc degeneration (LDD) in the Chinese Han population. Methods: A total of 153 patients with LDD and 131 healthy subjects were enrolled in the study. Four single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in the 3’ untranslated region (3’UTR) of TRAIL gene, including 1289 C/A, 1525 G/A, 1588 G/A and 1595 C/T, were genotyped with polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) analysis. Results: The genotypes and alleles frequencies of TRAIL at 1525 and 1595 positions in all subjects were the same. There was a significant association between TRAIL 1525/1595 polymorphisms and the susceptibility of LDD. The frequencies of 1525 GG /1595 CC genotype, and 1525 G/1595 C allele were higher in the patients group than that in the control group. In addition, we found patients with the 1525 AA /1595 TT genotype, as well as 1525 A/1595 T allele exhibit significantly low frequency of high grades of disc degeneration. However, there were no significant differences in the genotype or allele distribution of TRAIL 1289 C/A or 1588 G/A between the patients and the control group. Conclusion: TRAIL 1525/1595 polymorphisms were associated with the susceptibility and severity of LDD in the Chinese Han population.  相似文献   

16.
血管紧张素原基因单倍型与原发性高血压的关联研究   总被引:5,自引:2,他引:3  
目的 研究中国人血管紧张素原(angiotensinogen,AGT)基因多态性及单倍型与原发性高血压的关系。方法 在335例高血压患者与196名血压正常人中采用PCR-限制性酶切片段长度多态性法检测血管紧张素原基因的多态性,同时用最大期望值方法进行两位点连锁不平衡和三位点的单倍型分析。结果 在M235T和A-20C,M235T和A-6G,A-20C和A-6G位点观察到了连锁不平衡(P<10^-4)。病例-对照检验显示T235等位基因频率在高血压组中高于对照组,但所有单倍型频率分布在高血压组和正常对照组间差异无显著性。结论 受检人群中AGT基因各单倍型与高血压未见关联,但AGT基因T235位点可能是一种重要的高血压风险因子。  相似文献   

17.
自杀未遂与5-羟色胺2A受体基因的关联分析   总被引:6,自引:1,他引:5  
目的 探讨5-羟色胺(5-HT)2A受体基因A-1438G和T102C两种多态性与自杀未遂之间的关系。方法 以149例自杀未遂者为研究对象。190名正常人为对照,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)方法,分析5-HT2A受体基因A-1438G和T102C多态性。结果 PCR-RFLP分析发现,男性自杀未遂与5-HT2A受体基因A-1438G多态性的基因型GG关联。结论 5-HT2A受体基因A-1438G多态性可能与男性的自杀易感性相关。  相似文献   

18.
目的 探讨白细胞介素-18(interleukin 18,IL-18)基因单核苷酸多态性与广西壮族系统性红斑狼疮(systematic lupus erythematosus,SLE)易感性之间的关系.方法 以115例SLE患者和160名健康对照者为研究对象,应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性和DNA测序的方法对IL-18基因-137G/C、-607C/A单核苷酸多态性进行基因分型.结果 IL-18基因-137G/C多态性在SLE组和正常人群中的分布差异无统计学意义(P>0.05),而IL-18基因-607C/A多态性在两组人群中的分布差异有统计学意义(P<0.05),等位基因频率的相对风险分析发现,-607 C等位基因携带者患系统性红斑狼疮的风险是-607A等位基因的1.619倍(OR=1.619,95%CI:1.150-2.281).联合基因型分析发现,IL-18的-137G/-607C等位基因频率在SLE组中显著高于对照组(P<0.05).-137G/-607C等位基因携带者显著增加了SLE的发病风险(OR=1.484,95%CI:1.056-2.087).结论 IL-18基因-607C/A多态性与SLE的发病具有相关性,其中-607 C等位基因可能是SLE的遗传易感基因.  相似文献   

19.
Objective To investigate the relationship between polymorphisms of the growth arrest specific 6 (GAS6)gene and severe preeclampsia in a South West Han Chinese population. Methods Blood samples from 167 patientswith severe preeclampsia and 312 normal pregnant women as controls from Han Chinese in Chengdu area wereanalyzed by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphisms. Results C and T allelefrequencies for +1332C/T site were 85. 63% and 14. 37% in the patient group, respectively, and 78. 04% and 21.96% in control group, respectively. The TT genotype and variant T allelic frequencies of the + 1332C/Tpolymorphism were significantly lower in patients with severe preeclampsia than in the control group (both P< 0. 05), and the odds ratio for the risk of severe preeclampsia was 0. 602 (95% CI: 0. 401-0. 904) incarriers for the variant T allele (x2 = 6. 045, P = 0.014). G and A allele frequencies for 834 +7G/A site were 72. 75% and 27. 25% in case group, respectively, and 74. 36% and 25. 64% in control group,respectively. The genotype and allele frequencies of the 834 + 7G/A polymorphism in patients with severe preeclampsia and controls showed no significant differences (both P>0. 05). In addition, there was no significant association between the polymorphisms and blood pressure levels in the patient or control groups. Conclusion The variant GAS6 +1332 T allele is associated with a decreased risk for severe preeclampsia in a South West Han Chinese population. On the other hand, the 834 + 7G/A polymorphism has no effect on the severe preeclampsia.  相似文献   

20.
目的 探讨T细胞免疫球蛋白域及黏蛋白域蛋白-4(T cells immunoglobulindomain andmucindomain protein-4,TIM-4)基因外显子2区Lys65Lys(G/A)、外显子9区Val1365Met(G/A)的单核昔酸多态性(SNP)与湖北地区汉族人群支气管哮喘易感性的关系.方法 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)的方法对湖北地区185例哮喘患者和162例健康者TIM-4基因外显子2区Lys65Lys(G/A)、外显子9区Vai365Met(G/A)的多态性进行分析,计算基因型和等位基因频率.结果 (1)湖北地区汉族人群健康者TIM-4基因外显子2区Lys65Lys(G/A)位G/G、G/A、A/A基因型频率分别为0.840、0.160、0,而哮喘人群其频率分别为0.859、0.141、0,其基因型和等位基因型频率与对照组相比差异均无统计学意义(P=0.603,P=0.618);(2)本试验未检测到TIM-4外显子9区Va1365Met(G/A)的多态性.结论 湖北地区汉族人群TIM-4基因外显子2区Lys65Lys(G/A)存在单核苷酸多态性变异,但该位点的变异与湖北地区汉族人群支气管哮喘易感性无关;TIM-4基因外显子9区Va1365Met(G/A)在湖北地区汉族人群中未发现单核苷酸多态性.  相似文献   

设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号