人脑胶质母细胞瘤miR-4516表达与病人预后的关系

目的 探讨人胶质母细胞瘤（GBM）组织微小核糖核酸-4516（miR-4516）的表达情况及其与病人预后的关系。方法选取 2015年 1月~2019年 5月手术切除的 GBM组织 89例和颅脑损伤内减压术切除的非肿瘤脑组织 35例为对照组，采用 qRT-PCR检测 miR-4516的表达水平，根据 miR-4516表达水平的中位数分为高表达和低表达。GBM病人术后随访 2年，记录生存情况。结果 GBM组织 miR-4516表达水平（[ 5.32±1.75）]明显高于对照组（[ 1.13±0.45）；P<0.01]。术后 2年随访，42例（47.19%）生存，47例 47（52.81%）死亡。多因素 Cox回归分析显示，miR-4516高表达是 GBM生存预后病例的独立危险因素（P<0.05）。生存曲线分析显示 miR-4516高表达组 2年累积生存率（27.45%）明显低于低表达组（73.68%；P<0.001）。结论 GBM组织 miR-4516表达增高，其高表达是病人预后不良的危险因素。     

下调TTK表达改善胶质母细胞瘤裸鼠的生存预后

目的 探讨苏氨酸/酪氨酸激酶（TTK）在胶质母细胞瘤（GBM）中的表达变化及其作用。方法计算机检索TCGA数据库,利用生物信息学技术分析GBM组织TTK的表达水平及其与病人生存预后的关系。免疫组化染色分析我院生物样本库中60例脑胶质瘤组织的TTK表达水平。体外培养U251细胞,慢病毒转染构建TTK低表达细胞系,利用Alarma blue试剂盒测定细胞增殖能力,细胞克隆形成实验检测细胞克隆形成能力,流式细胞技术检测细胞凋亡和细胞周期。将不同TTK表达水平的U251细胞接种裸鼠构建移植瘤模型,分析TTK表达水平与移植瘤模型生存期的关系。结果生信分析结果显示,GBM组织TTK表达水平明显高于低级别胶质瘤及正常脑组织（P<0.05）,TTK低表达GBM病人的总生存期更长（P<0.05）。我院60例胶质瘤中,高级别胶质瘤TTK高表达率（69.0%,29/42）明显高于低级别胶质瘤（16.7%,3/18;P<0.05）。下调TTK表达明显抑制U251细胞增殖、促进细胞凋亡（P<0.05）。TTK低表达裸鼠移植瘤模型的生存期明显延长（P<0.05）。结论 GBM组织TTK呈高水平表达,具有促进细胞增殖及抑制细胞凋亡的作用,与GBM的不良预后相关。     

TRIM38基因非CpG岛DNA甲基化与胶质母细胞瘤临床预后的关系

目的 探讨免疫基因TRIM38非CpG岛DNA甲基化在胶质母细胞瘤（GBM）中改变模式和临床意义。方法 利用公共数据库，比较TRIM38甲基化在GBM与非肿瘤脑组织（NTB）中的差异程度，并通过统计分析探讨该基因甲基化水平与基因表达、病人预后、生物学背景的关系。结果 纳入3组GBM（共509例）和3组NTB（共37例）样本。TRIM38基因非CpG岛DNA甲基化位点在GBM中呈低甲基化改变（P<0.05），而其基因表达呈现高表达改变（P<0.05），并且甲基化与基因表达呈显著负相关（P<0.05）。TRIM38低甲基化病人生存时间明显短于高甲基化组（P<0.05），甲基化水平是独立的预后影响因子（P<0.05）。TRIM38低甲基化GBM样本可能富集免疫调节及Toll样受体通路相关的基因簇。结论 TRIM38可能在GBM中通过非CpG岛低甲基化介导的基因异常表达上调，参与肿瘤发生、发展；TRIM38非CpG岛甲基化可能作为指导GBM预后评价的潜在生物标记物；TRIM38甲基化导致的预后差异很可能与Toll样受体通路及免疫调节的差异有关。     

miR-126表达水平及其基因启动子甲基化状态与胶质母细胞瘤术后复发的关系

目的 探讨miR-126表达水平及其基因启动子甲基化状态与胶质母细胞瘤（GBM）术后复发的关系。方法 收集2016年8月到2020年12月手术切除的GBM组织标本86例和同期颅脑损伤内减压术中切除非肿瘤脑组织30例，采用PCR和MSP法检测miR-126表达水平及其基因启动子甲基化状态。随访至2021年3月，随访时间2~56个月，中位随访时间24.0个月。术后定期复查MRI确定肿瘤复发和复发时间。结果 术后58例复发，复发率为67.44%。与非肿瘤脑组织相比，GBM组织miR-126表达水平明显降低（P<0.05），miR-126基因启动子甲基化率明显升高（P<0.05）。与未复发组相比，复发组GBM组织miR-126表达水平明显降低（P<0.05），同时miR-126基因启动子甲基化率明显升高（P<0.05）。生存曲线分析显示，miR-126甲基化组中位复发时间（16.0个月）较非甲基化组（39.0个月）明显缩短（P<0.05）。多因素logistic回归分析显示miR-126基因启动子高甲基化是GBM术后复发的独立危险因素（P<0.05）。ROC曲线分析显示，miR-126表达水平预测GBM术后复发的曲线下面积为0.894（95% CI 0.837~0.950；P<0.05），最佳截断值为0.830，灵敏度和特异度分别为90.0%和75.6%。结论 GBM组织miR-126表达水平普遍降低，与其基因启动子异常甲基化有关。检测miR-126表达水平对GBM术后复发有良好的预测价值。     

IDH突变调控BMP2、COL27A1和SERPINA5基因表达影响人脑胶质瘤的生存预后

目的 探讨异柠檬酸脱氢酶（IDH）突变影响胶质瘤临床预后的潜在分子机制。方法 计算机检索CGGA和TCGA数据库,获取胶质瘤RNA测序数据（RNA-seq）,应用生物信息学分析方法分析IDH突变改善胶质瘤临床预后的潜在分子机制。结果从TCGA数据库下载胶质母细胞瘤（GBM）和低级别胶质瘤（LGG）相关RNA-seq,从CGCA数据量下载648例胶质瘤的RNAseq(234例GBM和414例LGG),从GEO数据量下载单细胞RNA-seq数据GSE131928数据集（28例IDH野生型GBM）。GO和KEGG分析显示,IDH突变显著下调胞外基质（ECM）相关基因表达,GEPIA分析显示BMP2、COL27A1、SERPINA5、VEGFA基因表达水平与胶质瘤生存预后有关,多因素Cox比例回归风险模型分析显示BMP2、COL27A1、SERPINA5基因表达是胶质瘤生存预后独立影响因素,BMP2联合SERPINA5预测胶质瘤生存预后效果最好。结论 我们结果提示胶质瘤IDH基因突变,可能通过调控BMP2、COL27A1和SERPINA5基因表达,影响病人生存预后。     

THBS1 在胶质母细胞瘤中的表达及功能研究

目的 研究THBS1在胶质母细胞瘤（GBM）中的表达水平及功能。方法 在癌症基因组 图谱计划（TCGA）和中国脑胶质瘤基因组图谱计划（CGGA）_693、CGGA_325 和 CGGA_301 数据集中提取 数据,对基因表达数据进行标准化处理后,分析THBS1在低级别胶质瘤和 GBM 中的表达差异以及与异 柠檬酸脱氢酶（IDH）突变、1p/19q 共缺失状态和生存预后的关系。基于单细胞测序数据、空间转录组数 据,分析THBS1在胶质瘤组织中的主要分布。采用 CellCall 算法和 MAGIC 算法进一步分析THBS1在细 胞相互作用网络之中的功能和THBS1相关基因及其功能,采用 CIBERSORTx 算法分析THBS1与免疫细 胞浸润的关系。结果 THBS1在 GBM 组织中的表达水平高于正常组织,差异有统计学意义（P＜ 0.05）。 在 CGGA 和 TCGA 数据集中,THBS1在 GBM 患者中的表达水平高于低级别胶质瘤,差异有统计学意义 （P＜ 0.01）;THBS1在IDH野生型和非 1p/19q 共缺失型患者中的表达水平分别高于IDH突变型和 1p/19q 共缺失型,差异均有统计学意义（均P＜ 0.01）。在 CGGA_693 和 CGGA_325 数据集中,THBS1基因高表 达患者的生存率低于低表达患者,差异有统计学意义（P＜ 0.01）。单细胞测序数据分析显示,THBS1主 要在胶质瘤组织的单核 / 巨噬细胞中表达。空间转录组数据分析显示,表达THBS1的单核/巨噬细胞在 空间方面与星形胶质细胞、肿瘤细胞、神经元、少突细胞、少突胶质细胞前体细胞存在共定位。THBS1 阴性的单核/巨噬细胞和THBS1阳性的单核 / 巨噬细胞与肿瘤细胞、神经元之间细胞通信的通路活性及 所依赖的配体 - 受体途径不同。功能富集分析显示,THBS1相关基因参与囊泡介导的转运、自噬、DNA 结合转录因子活性的调节等生物过程。在 4 个数据集中,THBS1高表达组的巨噬细胞 M0 丰度高于低表 达组,差异有统计学意义（P＜ 0.05）。结论 THBS1在GBM中高表达,与患者较差的预后相关;THBS1 调控巨噬细胞M0浸润,表达THBS1的单核/巨噬细胞可能调控GBM的微环境,进而调控肿瘤发生。     

CHST2在胶质瘤中的表达及临床意义

目的 探讨糖磺基转移酶2（CHST2）在人脑胶质瘤中的表达情况及其临床意义。方法 从Gliovis在线网站获取TCGA、CGGA、Rembrandt数据集,分析CHST2表达水平与胶质瘤病理特征、生存预后、免疫细胞浸润的关系。结果 胶质瘤母细胞瘤（GBM）组织CHST2表达水平较低级别胶质瘤（LGG）明显增高（P<0.05）,异柠檬酸脱氢酶（IDH）突变型胶质瘤CHST2表达水平较野生型明显增高（P<0.05）,1p19q未共缺失胶质瘤CHST2表达水平较未缺失胶质瘤明显增高（P<0.05）。胶质瘤、GBM和LGG病人,O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶（MGMT）启动子甲基化的GBM和LGG病人,以及仅进行化疗的GBM和LGG病人,CHST2高表达组生存时间均显著低于低表达组（P<0.05）。GBM和LGG组织CHST2表达水平与巨噬细胞和树突状细胞的浸润程度呈正相关（P<0.05）。结论 CHST2表达水平与胶质瘤病人生存预后、化疗反应和免疫细胞浸润密切相关。     

CREPT在人脑胶质母细胞瘤组织中的表达及其与病人预后的关系

目的 探讨人脑胶质母细胞瘤（GBM）组织肿瘤高表达细胞周期相关蛋白（CREPT）的表达水平及其与病人预后的关系。方法 收集2010年1月至2011年1月手术切除的GBM组织104例和2018年1~12月颅脑损伤内减压术中切除的正常脑组织40例,采用免疫组织化学染色法检测CREPT的表达,根据染色情况将GBM分为高表达组和低表达组。GBM病人术后随访截止时间为2019年4月,记录总生存期（OS）和无进展生存期（PFS）。采用多因素Cox比例回归风险模型分析GBM病人生存预后的影响因素。用Kaplan-Meier法绘制生存曲线,采用Log-rank检验。结果 GBM组织CREPT高表达率（73.08%,76/104）明显高于正常脑组织（10.00%,4/40;P<0.05）。多因素Cox比例回归风险模型分析结果显示CREPT高表达是GBM病人OS和PFS较短的独立影响因素（P<0.05）。低表达组OS和PFS均明显高于高表达组（P<0.05）。结论 人脑GBM组织CREPT呈高表达,与病人不良生存预后和肿瘤进展有关。     

胶质母细胞瘤组织RBM8A表达与病人预后及替莫唑胺化疗敏感性的关系

目的 探讨胶质母细胞瘤（GBM）组织RNA结合基序8A（RBM8A）蛋白表达与病人预后及替莫唑胺（TMZ）化疗敏感性的关系。方法 选取2015年6月至2020年6月手术切除的GBM组织130例及颅脑损伤减压术中切取的非肿瘤脑组织20例（对照）,用免疫组化法检测组织RBM8A表达。术随访时间3~50个月,中位随访时间为12个月。结果 GBM组织RBM8A高表达率[86.15%（112/130）]明显高于对照组[20%（4/20）;P<0.05]。随访期间死亡98例,失访2例;多因素Cox回归分析显示,RBM8A高表达是GBM病人生存预后不良的独立危险因素（P<0.05）。生存曲线分析显示,RBM8A高表达GBM病人中位无复发生存时间和总生存时间均明显低于低表达病人（P<0.05）;RBM8A低表达GBM病人中,TMZ化疗病人无复发生存时间和总生存时间均明显高于未化疗病人（P<0.05）;TMZ化疗与RBM8A高表达GBM病人无复发生存时间和总生存时间无明显关系（P>0.05）。结论 GBM组织RBM8A呈高表达,与病人不良生存预后有关。检测RBM8A有助于评估GBM病人对TMZ化疗敏感性。     

AMOTL2与FKBP51表达水平与胶质母细胞瘤病人预后的关系

目的 探讨胶质母细胞瘤（GBM）类血管动蛋白-2（AMOTL2）与FK506结合蛋白51（FKBP51）表达变化及临床意义。方法 收集2016年6月~2019年6月手术切除的GBM标本92例,以取同期颅脑损伤内减压术切除的非肿瘤脑组织48例为对照。采用免疫组化染色法检测AMOTL2、FKBP51表达。GBM病人术后随访2年,记录无进展生存期和总生存期。结果 GBM组织AMOTL2低表达率、FKBP51高表达率均明显高于对照组（P<0.05）。GBM组织AMOTL2表达水平与P53、EGFR呈明显负相关（P<0.05）,FKBP51表达水平与P53、EGFR呈明显正相关（P<0.05）。Cox比例回归风险模型分析显示,AMOTL2低表达、FKBP51高表达是GBM生存预后不良的独立危险因素（P<0.05）。生存曲线分析显示,AMOTL2高表达组病人无进展生存期、总生存期较低表达组均明显延长（P<0.05）,FKBP51高表达组无进展生存期、总生存期较低表达组均明显缩短（P<0.05）。结论 GBM组织AMOTL2呈低表达,而FKBP51呈高表达,二者均与P53、EGFR表达相关,与病人预后密切相关。     

BRIP1在胶质瘤中的表达及临床意义

目的 探讨乳腺癌易感基因相互作用蛋白1（BRIP1）在胶质瘤中的表达及其与病人预后的相关性。方法 从GEO数据库GPL570平台选取三个BRIP1基因表达谱芯片（GSE4290、GSE50161和GSE74195）分析胶质瘤BRIP1的表达情况。使用TCGA下载有关胶质瘤BRIP1表达、生存率和临床特征的数据，多因素Cox比例回归风险模型分析胶质瘤生存预后的影响因素；利用受试者工作特征（ROC）曲线评估BRIP1表达水平与胶质瘤生存预后的关系；通过基因富集分析胶质瘤BRIP1相关的细胞信号通路。结果 胶质瘤BRIP1表达水平相比于正常样本明显升高（P<0.05）。多因素Cox回归分析结果表明，BRIP1高表达（HR=1.250；95% CI: 1.056~1.480；P<0.001）是胶质瘤不良预后的独立危险因素。生存曲线分析显示，相较于BRIP1低表达组，BRIP1高表达组胶质瘤生存期明显缩短（P<0.001）。ROC曲线分析显示BRIP1表达水平预测胶质瘤1年不良预后的曲线下面积（AUC）为0.744，最佳截断值为0.302，敏感性为0.832，特异性为0.528；预测3年不良预后的AUC为0.801，最佳截断值为0.420，敏感性为0.696，特异性为0.809；预测5年不良预后的AUC为0.767，最佳截断值为0.420时，敏感性为0.593，特异性为0.842。基因富集分析显示BRIP1基因主要富集于DNA复制、同源重组、错配修复和细胞周期等信号转导通路。结论 BRIP1在人脑胶质瘤表达上调，与胶质瘤不良预后密切相关。     

胶质母细胞瘤FMOD基因非CpG岛DNA甲基化水平与病人预后的关系

目的 探讨纤调蛋白（FMOD）基因非CpG岛区域DNA甲基化在人脑胶质母细胞瘤（GBM）中的改变模式以及与基因表达、临床预后的关系。方法 检索国癌症基因组图谱计划数据库（TCGA）和国国立卫生院下属基因表达数据库（GEO）下载人脑GBM组织基因表达芯片GSE36278、GSE22891及GSE50923。分析FMOD基因的CpG探针[cg26987645和cg03764585,均来自人类全基因组DNA甲基化芯片（Infinium HumanMethylation 27 k和450 k BeadChips）,均位于非CpG岛区域（www.illumina.com）]β值（与甲基化水平呈正相关）。结果 与非肿瘤组织相比,GBM组织FMOD基因非CpG岛区域探针cg26987645和cg03764585的β值均显著下降,提示GBM组织FMOD基因发生特异性低甲基化。将CpG岛区域探针cg26987645和cg03764585的β值与mRNA数据进行关联分析发现,DNA甲基化水平与FMOD基因表达水平呈显著负相关（P<0.001）。Cox回归分析显示,随FMOD基因CpG岛区域探针cg26987645和cg03764585的β值增加,GBM病人生存期显著延长（P<0.05）。FMOD基因非CpG岛cg03764585和cg26987645探针分析显示,非G-CIMP亚型病人甲基化水平较G-CIMP亚型病人明显降低（P<0.05）,而FMOD基因表达水平明显增高（P<0.05）。结论 本文结果提示,GBM组织FMOD基因非CpG岛区域呈低甲基化表现,与FMOD基因表达和病人生存预后均呈明显负相关。     

脑胶质瘤CHSY1的表达变化及临床意义的生信分析

目的 探讨硫酸软骨素合酶1（CHSY1）在脑胶质瘤中的表达及临床意义。方法 从Gliovis下载CHSY1在TCGA、CGGA和Rembrandt数据库中的基因表达数据和对应的临床数据,将CHSY1表达量由低到高排序,前50%为低表达组,后50%为高表达组。利用TIMER在线网站分析CHSY1在脑胶质瘤中的表达与免疫浸润的相关性。结果 胶质瘤组织CHSY1表达水平明显高于正常脑组织（P<0.05）,且与胶质瘤病理分级呈正相关（P<0.05）。多因素Cox回归分析显示CHSY1高表达是胶质瘤病人生存预后不良的独立危险因素（P<0.05）,CHSY1高表达组中位生存期较低表达组明显缩短（P<0.05）。MGMT启动子甲基化组胶质母细胞瘤病人中,CHSY1高表达组中位生存期较低表达组明显缩短（P<0.05）。CHSY1高表达组胶质瘤病人化疗后中位生存期较低表达组明显缩短（P<0.05）。TIMER分析发现,胶质母细胞瘤组织CHST1表达水平与树突状细胞的浸润程度呈正相关,低级别胶质瘤组织CHST1表达水平与B细胞、CD8+ T细胞、嗜中性粒细胞、巨噬细胞和树突状细胞的浸润程度成正比。结论 脑胶质瘤CHSY1呈高表达,与胶质瘤的恶性程度与免疫浸润呈正相关。CHSY1可作为胶质瘤预后和对化疗反应的预测因子。     

lncRNA RGMB-AS1在脑胶质瘤预后评估中的价值

目的 探讨长链非编码RNA（lncRNA）RGMB-AS1在脑胶质瘤病人预后评估中的作用。方法 选取2014年9月~2017年6月经术后病理检查证实的脑胶质瘤140例（低级别64例，高级别76例），另选取颅脑损伤内减压术中切取正常脑组织25例为对照。实时荧光定量PCR法检测lncRNA RGMB-AS1的表达水平，以RGMB-AS1表达量的中位数为截断值，分为高表达组和低表达组。用Kaplan-Meier法比较总体生存期（OS）和无进展生存期（PFS），用Cox比例回归风险模型分析影响胶质瘤病人预后的因素。结果 140例胶质瘤中，lncRNA RGMB-AS1高表达70例，低表达70例。胶质瘤组织lncRNA RGMB-AS1的相对表达量明显高于对照组（P<0.05）。多因素Cox比例回归风险模型分析结果显示年龄≥50岁、术前KPS评分<80分、WHO分级Ⅲ~Ⅳ级、lncRNA RGMB-AS1高表达是胶质瘤病人PFS和OS的独立影响因素（P<0.05）。lncRNA RGMB-AS1高表达胶质瘤病人PFS和OS较低表达病人均明显缩短（P<0.05）。无论是高级别胶质瘤，还是低级别胶质瘤，lncRNA RGMB-AS1高表达病人PFS和OS较低表达病人均明显缩短（P<0.05）。结论 lncRNA RGMB-AS1表达水平与脑胶质瘤病例级别呈正相关，lncRNA RGMB-AS1高表达脑胶质瘤病人生存期较低表达病人明显缩短。这提示lncRNA RGMB-AS1表达水平可作为脑胶质瘤病人预后评估指标。