江苏省南通地区乙型肝炎病毒基因分型与临床相关性

目的了解江苏省南通地区乙型肝炎病毒(HBV)基因型分布状况及其临床相关性。方法选择南通地区HBV-DNA阳性的乙型肝炎病毒感染者300例,其中乙型肝炎表面抗原携带者(ASC)28例,慢性乙型肝炎(CHB)189例,重型肝炎(CSH)26例,肝硬化(LC)30例,肝细胞癌(HCC)27例,采用多对型特异性引物巢式PCR法检测HBV基因型。结果300份血清标本中B型89例(29.7%),C型196例(65.3%),BC混合型15例(5.0%);C基因型在LC组、HCC组中的比例显著高于ASC组和CHB组(P<0.05)。结论南通地区HBV基因型可能以B、C型为主,C型为优势基因型并与肝硬化、肝癌的发生相关。     

多对型特异性引物巢式PCR检测乙型肝炎病毒基因型分析

目的采用多对型特异性引物通过巢式PCR法检测HBeAg阳性患者血清中乙肝病毒(HBV)基因型的分布情况。方法根据从前S1基因到S基因中的保守序列设计出10条内外引物,并将其中8条内引物分成A、B两组分别扩增A、B、C和D、E、F型HBV,然后将第2轮PCR的两组产物分别用3%琼脂糖进行电泳,根据PCR产物片段大小直接判定HBV基因型。用该法检测15例慢性乙肝患者血清中HBV基因型,了解HBV基因型分布情况。结果 HBV基因分型结果为B型7例(46.7%)、C型4例(26.7%)、B+C型2例(13.3%),另有2例未能分型。结论人群HBV优势基因型以B型为主,C型次之。     

温州地区乙型肝炎病毒基因型分布调查及意义

目的调查乙型肝炎病毒(HBV)感染者的HBV基因型分布,探讨HBV基因型与临床的相关性。方法用SP-nPCR法检测469例HBV感染者的HBV基因型,用荧光定量PCR法检测HBVDNA载量,用ELISA法检测HBV血清学标志物。结果469份标本分出基因型430例,HBV基因型分布为:A型2.6%(11/430),B型34.9%(150/430),C型49.8%(214/430),B/C型12.8%(55/430),未检出D、E、F基因型;无症状携带者(ASC)和慢性乙肝患者(CH)以C、B基因型为主,肝硬化(LC)和肝癌(HCC)以C基因型占绝对优势。基因型分布与性别无关。30岁以下人群感染以B基因型为主,30岁以上则以C基因型为优势。结论SP-nPCR法适用于慢性HBV感染者(病人和携带者)的基因分型和流行病学调查。HBV感染以C、B基因型为主,存在B/C混合基因型和A基因型。C基因型感染与肝硬化和肝细胞癌相关。     

武威地区乙型肝炎病毒基因型分布及临床特点

目的 探讨武威地区乙型肝炎病毒基因型分布及临床特点。方法 特异性引物聚合酶链反应法(PCR),检测3 400例乙型肝炎患者HBV-DNA,并对1 380例病毒复制大于103 copies/μL者,分为乙型肝炎病毒携带者(Asc)300例,慢性乙型肝炎(CHB)488例,乙型肝炎后肝硬化(LC)380例和原发性肝癌(HCC)212例,采用型特异性引物巢式PCR结合聚合酶链反应-限制性片段长度多态性法(PCR-RFLP)检测HBV基因型。结果 1 380份血清中共检出C型1 108例(80.3%),主要分布于LC、HCC患者中,B型247例(17.9%),主要分布于ASC患者中,B+C混合型25例(1.8%)。结论 武威地区乙型肝炎病毒基因型主要以C型为主,并与较严重的肝脏损伤有关。     

延安地区乙型肝炎病毒基因型分布与临床的相关性

目的了解延安地区乙型肝炎病毒(HBV)基因型分布特征,探讨其与慢性HBV感染者的性别、年龄、不同临床疾病谱等的相关性。方法随机选取HBVDNA阳性患者122例,将可检出基因型的121例患者分为慢性无症状携带者(ASC)58例,慢性乙型肝炎(CHB)46例,肝硬化(LC)17例。采用HBV核酸扩增荧光定量PCR检测HBVDNA载量,采用反向杂交技术测定HBV基因型。结果延安地区HBV基因型主要以C型为主。在121例可检出基因型的患者中,C型116例,B型2例,D型2例,B+C混合型1例。结论延安地区HBV基因型主要以C型为主。基因型C主要分布于LC、HBeAg(+)、年龄大于或等于35岁组的患者中。提示基因型C与较严重的肝脏疾病有关。     

慢性HBV感染者甘露糖结合蛋白基因多态性与HBV基因型的关系

目的探讨甘露糖结合蛋白(MBP)基因多态性及HBV基因型与慢性乙型肝炎(HBV)进展的关系。方法采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法和实时荧光定量PCR(FQ-PCR)技术对360例慢性HBV感染者[其中66例无症状HBV携带者组(ASC组)、182例慢性乙型肝炎患者组(CH组)、112例肝硬化患者组(LC组)和65例对照组]的MBP基因第54号密码子多态性和HBV基因分型进行检测。结果 ASC组和轻、中型CH组均以B基因型占优势,MBP基因GGC/GAC基因型频率和GAC等位基因频率与对照组比较差异无统计学意义(P>0.05);重型CH组、代偿期LC组、失代偿期LC组均以C基因型占优势,MBP基因GGC/GAC基因型频率和GAC等位基因频率显著高于对照组(P<0.05),其中失代偿期LC组突变率最高(37.7%)。结论该地区乙型肝炎人群以B和C基因型为主;MBP基因第54号密码子突变与HBV感染的慢性化无明显关系,而与HBV C基因型及慢性HBV感染者的肝病进展有关。     

应用型特异性引物巢式PCR分析温州地区乙型肝炎病毒基因型及其临床意义

目的了解温州地区乙型肝炎病毒（HBV）基因型的分布及其与临床的相关性。方法选取温州地区HBVDNA阳性的慢性HBV感染者202例,其中慢性无症状乙型肝炎表面抗原携带者52例,慢性乙型肝炎103例,肝硬化27例,肝细胞癌20例,应用型特异性引物巢式PCR检测HBV的基因型。结果202例HBVDNA阳性血清标本中,B型37例（18．3％）,C型123例（60．9％）,B／C混合型41例（20．3％）,D型1例（0．5％）,未发现A、E、F和G型;与B基因型、B／C混合型相比,C基因型在慢性乙型肝炎和肝细胞癌中明显升高,分别为56．1％和14．6％（P〈0．05）;C基因型感染者血清丙氨酸氨基转移酶水平（226±268）U／L高于B基因型的（114±183）U／L和B／C混合型的（130±222）U／L,差异有统计学意义（P〈0．05）;C基因型感染者HBeAg阳性率和HBVDNA含量明显高于B基因型和BC混合型感染者相比,差异有统计学意义（P〈0．05）。结论温州地区存在HBV的B、C、D和B／C混合基因型,C型为本地区的优势基因型．并且C型HBV感染易引起较重肝脏损伤。     

温州地区乙型肝炎病毒基因型分布调查及意义

目的 调查乙型肝炎病毒(HBV)感染者的HBV基因型分布,探讨HBV基因型与临床的相关性.方法 用SP-nPCR法检测469例HBV感染者的HBV基因型.用荧光定量PCR法检测HBV DNA载量,用ELISA法检测HBV血清学标志物.结果 469份标本分出基因型430例,HBV基因型分布为:A型2.6%(11,430),B型34.9%(150/430),C型49-8%(214/430),B/C型12.8%(55/430),未检出D、E、F基因型;无症状携带者(ASC)和慢性乙肝患者(CH)以C、B基因型为主,肝硬化(LC)和肝癌(HCC)以C基因型占绝对优势.基因型分布与性别无关.30岁以下人群感染以B基因型为主.30岁以上则以C基因型为优势.结论 SP-nPCR法适用于慢性HBV感染者(病人和携带者)的基因分型和流行病学调查.HBV感染以C、B基因型为主,存在B,C混合基因型和A基因型.C基因型感染与肝硬化和肝细胞癌相关.     

阜阳市慢性乙型肝炎病毒感染者HBV基因型调查

目的了解阜阳市慢性乙型肝炎病毒(HBV)感染者HBV基因型分布状况。方法选择165例HBVDNA阳性的慢性HBV感染者,采用型特异性聚合酶链反应(PCR)检测HBV基因型。结果 165例慢性HBV感染者中HBV基因型B型46例(27.9%)、B/C混合型29例(17.6%)、C型90例(54.5%),未发现其他基因型。结论阜阳市慢性HBV感染者基因型为B、B/C和C型,其中基因C型是主要流行株。     

上海市金山地区乙型肝炎病毒基因型分布及其与临床的关系

目的了解上海金山地区乙型肝炎病毒（HBV）感染者基因型分布及其与临床的关系。方法401例HBVDNA阳性患者采用聚合酶链反应（PCR）-酶联免疫吸附试验（ELISA）进行HBVDNA定量、微流基因芯片法进行基因分型、ELISA检测e抗原（HBeAg）及肝功能检查后进行综合分析。结果B型198例（49．38％），C型169例（42．14％），B／C混合型20例（4．99％），未分型14例（3．49％），未发现其他基因型。B型在慢性乙型重度肝炎（CSHB）患者中的比例显著低于无症状携带者（ASC）和慢性乙型轻、中度肝炎（CMHB）（P〈0．01），而C型在CSHB患者中的比例显著高于ASC和CMHB（P〈0．01）。ASC中B型患者的HBVDNA水平最低。C型患者的丙氨酸氨基转移酶（ALT）和γ-谷氨酰基转移酶（GGT）水平均高于B型。结论上海金山地区HBV感染者基因型以B型为主，C型次之，少量B／C混合型，C型与重肝病关系比B型密切。     

昆明地区HBV DNA基因型的分布特征

目的研究云南省昆明地区乙型肝炎病毒(HBV)的基因分型特征。方法采用荧光定量PCR及基因型特异性引物PCR方法,对云南省昆明地区360例HBV感染血清进行HBV DNA定量及基因分型检测,以ELISA法检测血清乙肝标志物。结果 360例HBV感染血清中有346例(96.11%)可以直接分型,其中196例(56.65%)为C型,91例(26.30%)为B型,37例(10.69%)为C/B混合型,21例(6.07%)为D型,A型仅1例(0.29%);比较显示,C型基因分布率显著高于其他基因型(P0.01);C基因及C、B混合基因型患者HBV-DNA定量显著高于B基因及其他基因型患者(P0.01或P0.05);另除B型基因在"大三阳"模式中比例显著较低(P0.05),HBV基因型在其他各血清模式组间的分布差异无统计学意义(P0.05);14例标本未能直接分型(3.89%),其HBV-DNA定量平均水平为4.136×10~3 IU/mL显著低于其他检样(P0.05)。结论昆明地区HBV基因型的分布较为丰富,存在C型、B型、C/B混合型及D型和A型,其中以C型和B型为本区域的主要HBV基因型;当C/B混合型和C型的HBV感染时,往往伴随HBV较高水平复制,且HBV感染B基因型与HBeAg的检出呈负相关;本区域内D基因型分布率介于内地低海拔区域和拉萨高原地带之间。这些可能是本区域内HBV基因型分布的流行病学特征。未能直接分型检样的HBV-DNA定量均较低,可能说明HBV基因分型应该在一定的HBV-DNA定量水平基础上进行。     

常州地区乙型肝炎病毒基因分型及外膜大蛋白定量检测的临床研究

目的 了解常州地区乙型肝炎病毒基因型的分布,探讨检测外膜大蛋白与不同基因型肝病之间的临床意义.方法 乙型肝炎病毒基因分型采用巢式聚合酶链反应,扩增乙型肝炎病毒S基因区,用末端标记方法对PCR产物标记并直接测序,测序结果和基因库中登录的标准基因型序列进行比较;乙型肝炎病毒外膜大蛋白(LHBs)应用酶联免疫吸附试验(ELISA)进行定量检测.结果 对该地区147例不同HBV感染者血清HBV DNA进行了基因分型,其中B型63例(42.9%),C型80例(54.4%),B、C混合型1例(0.7%),B、D混合型3例(2.0%).69例慢性乙型肝炎患者中B型为33例、C型为34例;63例肝癌患者中B型15例、C型46例.二组比较,肝癌组中C型明显高于慢性乙肝组(x2=8.28,P<0.005).肝癌患者组B型、C型HBV LHBs含量分别为(61.2±59.2)υg/L和(36.9士31.7)υg/L,两组间存在统计学差异(t=2.11,P<0.05);慢性乙型肝炎患者组HBV LHBs含量则分别为(131.2土85.7)gg/L和(132.5士80.5)υg/L,两组间不存在统计学差异(t=0.064,P>0.05).结论常州地区HBV DNA基因型主要为B型和C型;C基因型与肝癌关系密切;肝癌患者组B型HBV LHBs含量明显高于C型;B、C基因型HBV感染在肝癌的发生中可能存在不同的机制.     

乙型肝炎病毒基因型分析以及与血清标志物的关系

目的乙型肝炎病毒六种主要基因型的分析,并探讨与乙肝血清标志物的关系。方法提取200例北京同仁医院乙型肝炎感染者血清核酸,采用型特异性引物PCR进行基因分型。用电化学发光法检测血清的乙型肝炎病毒表面抗原、表面抗体、e抗原、e抗体、核心抗体。结果B型占26%、C型64%、BC复合型10%;C型的HBeAg阳性率显著性高于B型,在不同的基因型中HBsAg转阴率无显著性差异。结论北方人群中C型占优势,且C型HBV不易发生HBeAg血清学转换。     

乙肝病毒基因变异和基因型(亚型)与肝细胞癌的关系

目的 初步探讨乙肝病毒基因变异、基因型及亚型与HCC发病的相关性。 方法 特异探针杂交法检测乙肝病毒C启动子变异，分别用特异探针杂交和特异引物PCR两种方法鉴定病毒基因型，限制性酶切片段长度多态性法鉴定部分HCC乙肝病毒的基因亚型。用SPSS10.0进行统计分析其中相关性。 结果 HCC组与NHCC组HBV-DNA载量无显著差异，两组HBV中A1762T/G1764A变异株分别占77.8%和44.4%。B和C型为HBV主要基因型，基因型B和C在HCC患者中分别为3例（11.11%）和24例（88.89%），在NHCC患者中分别为29例（42.65％）和21（50.85％），HCC组24例基因型C的HBV中21例为C2亚型。 结论 乙肝病毒C启动子A1762T/G1764A双变异、基因型C与HCC的发生密切相关，HCC患者HBV基因亚型主要为C2亚型。     

Genotype analysis,using PCR with type-specific primers,of hepatitis B virus isolates from patients coinfected with hepatitis delta virus genotype II from Miyako Island,Japan

OBJECTIVES: The aims of this study were to determine the hepatitis B virus (HBV) genotypes in hepatitis delta virus (HDV) RNA-positive patients and to characterize the HBV nucleotide sequences that may be found on a distant island of Japan. METHODS: This study included three patients with chronic hepatitis who were positive for hepatitis B surface antigen (enzyme-linked immunosorbent assay; ELISA), HDV antibody (ELISA) and HDV RNA by polymerase chain reaction (PCR). The HBV genotype was determined by nested PCR using type-specific primers. The first-round PCR products from two patients were sequenced, followed by an investigation of nucleotide homology. RESULTS: Viruses from all three patients in this study were classified as HBV genotype B. Comparison with HBV isolates from geographically neighboring regions revealed that the two HBV isolates had 97.9-98.6% identity at the nucleotide level to a Chinese isolate, 98.3-98.6% identity to the Okinawa isolate and 98.6-98.8% identity to a Japanese isolate of genotype B. On phylogenetic analysis, the HBV isolates from the two patients were classified as HBV genotype B. The HBV isolates of cases 1 and 3 clustered in the same group as isolates from the Chinese mainland and Japanese mainland, which are geographically near Miyako Island. CONCLUSION: The HBV isolates coinfected with HDV found on Miyako Island were of genotype B. The PCR method based on genotype-specific primers was useful in determining HBV genotypes.     

Genotyping of hepatitis B virus (HBV) by oligonucleotides microarray

Oligonuleotides (oligo) microarray is a promising method for virus genotyping. In this study, we developed an oligo microarray used for genotyping hepatitis B virus (HBV). It consists of 15 probes targeting HBV genotypes A-G and two genotypes of apes, and one conserved probe selected from the HBV pre-S region. To test a clinical sample, the gene targets of clinical samples were amplified and labelled with Cy5-dCTP in a PCR reaction using primers covering the flanking region of the HBV pre-S gene. Following purification, the labelled PCR products were hybridized to the microarray. In an analysis of 96 HBV patients' serum samples using our developed microarray, we identified 34 genotype B, 60 genotype C and 2 genotypes B/C coinfection samples. Sequencing results of 24 randomly selected samples agreed 100% with microarray data. Geographic distribution of genotypes C and B was also divergent, 95.7% (44/46) of genotype C and 64.0% (32/50) of genotype B samples were collected from Northern and Southern China, respectively. The accuracy of genotyping was confirmed by analyzing DNA sequences of 24 samples. It is demonstrated that low-density oligo microarray can serve as a reliable and time-saving method to HBV genotyping from patient's sera.