降钙素的基因结构与表达调控

降钙素与降钙素基因相关肽(CT/CGRP)基因编码一组多肽,即降钙素(CT)、降钙素的N端肽和C端肽、降钙素基因相关肽(CGRP)及淀粉不溶素(Amylin)。CT/CGRP基因转录而成的mRNA前体,在不同组织中通过选择性加工形成CT mRNA或CGRP mRNA,再通过翻译及蛋白质加工,最后形成成熟的降钙素或降钙素基因相关肽。本文简单介绍一下降钙素的基因结构及表达调控方面的研究进展。     

组织特异性SmN蛋白不影响3T3转染细胞内源N-Cam和C-SRC RNAs选择性的剪接

一个单主基因在不同类型细胞,尤其是神经元细胞可转录产生不同的mRNA,这种选择性RNA剪接的过程已认为是广泛适用的基因调控机制。与所有细胞内剪接的主要过程中与RNA剪接之需求相对应,RNA剪接所需的剪接体中的绝大部分小分子RNA和蛋白已存在于所有的细胞类型中。其中SmN被确认是剪接体中细胞特异性成份。SmN蛋白在结构表现上与RNA剪接蛋白SmB,B蛋白关系密切,但仅出现在脑和心脏细胞。作用发现与SmN表现型相关的N-Cam mRNA VASE突变性     

降钙素基因相关肽与心血管系

降钙素基因相关肽(calcitonin gene-related peptide,CGRP)是由一级感觉神经节细胞和甲状腺C细胞产生,由感觉神经纤维末梢和甲状腺C细胞分泌的一种含37个氨基酸的多肽,它广泛分布在神经组织和其它组织中。1983年,Rosenfeld应用DNA基因重组技术和分子生物学技术的研究时发现,由降钙素基因转录的RNA在神经组织内产生了mRNA,此mRNA编码了一种新肽,并将其分离出来的遂命名为降钙素基因相关肽。本文重点介绍CGRP与心血管系的关系。一、CGRP神经纤维在心脏和血管的分布含CGRP的神经纤维象其它的感觉神经肽一样,广泛分     

胶质瘤中PTB调控长非编码RNA选择性剪接的筛选

目的探究在神经胶质瘤发生发展过程中PTB调控选择性剪接的长非编码RNA。方法全转录组芯片分析筛选受PTB蛋白介导影响选择性剪接的长非编码RNA。提取胶质瘤和正常细胞系及临床病例组织样品和敲低PTB的神经胶质瘤细胞总RNA,实时荧光定量PCR验证候选基因不同剪接异构体的表达及比值变化。核质分离实验鉴定长非编码RNA细胞定位。结果筛选出16条受PTB蛋白介导影响选择性剪接的长非编码RNA,其中linc00882的不同剪接异构体的表达模式受PTB调控所产生的差异最明显。检测到linc00882定位于细胞质。结论神经胶质瘤中PTB蛋白参与长非编码RNA linc00882的选择性剪接。     

SR蛋白在几种生物中的缺陷型研究进展

SR蛋白是在真核生物RNA剪接中发挥重要功能的一类剪接因子。它们可以结合特定的RNA ,参与识别 5′及 3′剪接位点 ,与snRNP及其他剪接因子共同完成RNA的组成性和选择性剪接。这对于生物体的发育、分化等具有决定性作用。在多种生物中 ,SR蛋白家族的某一成员功能缺陷往往会导致发育停滞、分化障碍和致死效应。本文就几种SR蛋白在不同生物中的缺陷型研究进行了综述。     

内皮素-1基因的研究进展

内皮素 (ET)具有广泛的生物活性 ,为强效的缩血管肽和血管平滑肌细胞有丝分裂原。 ET家族成员有三种异构体ET- 1、ET- 2和 ET- 3,各种异构体之间仅有 2～ 6个氨基酸不同 ,有组织特异性。人的 ET- 1基因全长 12 46 4bp,结构基因由 5个外显子和 3个内含子组成。ET- 1基因的表达决定于基因中的特异转录调节因子和其本身的结构。这些调控位点除存在于ET基因启动子区结构中外 ,也存在于 ET基因的 3′端侧翼序列。GATA与 AP1位点是 ET- 1启动子功能所必需的 ,GATA与AP1有协同作用。ET- 1基因表达受许多因素的调控 ,各种因素通过作用于其受体 ,而影响一种或多种调控因子的表达 ,最后作用于 ET- 1基因的顺式调控元件 ,促进或抑制 ET- 1基因的表达。其中 GATA和 AP1位点的调控元件是 ET- 1基因调控的主要途径。     

内皮素—1基因的研究进展

内皮素（ET）具有广泛的生物活性,为强效的缩血管肽和血管平滑肌细胞有丝分裂原,ET有族成员有三种异构体ET－1和ET－3,各种异构体之间仅有2－6个氨基酸不同,有组织特异性,人的ET－1基因全长12464bp,结构基因由5个外显子和3个内含子组,ET－1基因的表达决定于基因中的特异转录调节因子和其本身的结构,这些调控位点除存在于ET基因启子区结构中外,也存在于ET基因的3'端侧翼序列,GATA与AP1位点是ET－1启动子功能所必需的,GATA与AP1有协同作用,ET－1基因表达受许多因素的调控,各种因素通过作用于其受体,而影响一种或多种调控因子的表达,最后作用于ET－1基因的顺式调控元件,促进或抑制ET－1基因的顺式调元件,促进或抑制ET-1基因的表达,其中GATA和AP1位点的调控元件是ET－1基因调控的主要途径。     

鼻咽癌STGC3基因转录调控元件分析与鉴定*

目的：分析并鉴定STGC3基因转录调控元件,探讨鼻咽癌STGC3基因的转录调控分子机制。方法：运用 生物信息学,预测并分析STGC3基因核心启动子区的转录因子结合位点;将相关转录因子结合位点,制备3 种探 针即生物素标记野生型、突变型及未标记野生型;提取CNE2细胞核蛋白,利用电泳迁移率变动分析（ EMSA） 及染色质免疫共沉淀（ ChIP）分析,体内外鉴定转录因子结合位点。结果：在STGC3基因核心启动子区存在21 个转录因子结合位点,其中9 个为Sp1 转录因子结合位点;进一步严格限定参数,STGC3基因核心启动子区域含 有转录因子结合位点5 个,其中Sp1 转录因子结合位点2 个;EMSA和ChIP 实验结果显示,STGC3基因中存在转 录因子Sp1 特异性结合位点,从而鉴定出STGC3基因转录调控元件。结论： STGC3基因核心启动子区含有Sp1 特异性结合位点,为该基因的转录调控元件。     

与剪接、翻译偶联的PTC-mRNA NMD降解机制

最新研究发现 ,真核细胞前体 m RNA剪接不仅仅是前体 m RNA的加工步骤 ,而且在翻译过程中也起到重要的监控作用。通过剪接 ,外显子 -外显子连接点复合物结合于 m RNA剪接位点上游 2 0 bp处。如果 m RNA剪接位点上游大于 5 0～ 5 5 bp处出现无义突变 ,则这种翻译提前终止密码子 m RNA将会在最后的翻译过程中通过外显子 -外显子连接点复合物、Upf蛋白以及帽结合蛋白之间的相互作用 ,被引入脱帽、降解过程     

细胞信号转导与可变剪接调控

大多数真核基因能够发生可变剪接,其调控对于生理和病理状态下细胞功能的实现至关重要,而异常可变剪接则可导致多种疾病.虽然已知可变剪接能够在转录后水平调节基因表达,然而目前仍不清楚特定的可变剪接模式是如何被调控的.越来越多的研究发现细胞信号和外界环境刺激能够调控靶基因的剪接模式,并且已发现一些与可变剪接调控有关的信号转导通路,而后者能够通过修饰剪接因子进而改变剪接因子的亚细胞定位或者活性,从而实现对靶基因可变剪接模式的调控.由细胞信号转导通路所构成的网络能够灵活多样地调控基因剪接,一条信号通路可调控多个基因剪接,而多条信号通路也可调控同一基因剪接,对于理解信号转导过程的分子机制具有重要意义.     

选择剪接:一种基因表达的调控方式

选择剪接是一种在转录后水平直接调节基因表达的调控方式,既可以直接在RNA水平上调节基因的表达过程,也可以改变基因的表达产物,对蛋白质的功能和活性进行调节。选择剪接在生物体发育过程中也起着重要的调控作用。     

癌症中的剪接因子突变

前体mRNA剪接是真核生物基因表达的关键步骤,剪接调控是一个高度复杂的过程.通过选择性剪接,单个基因能够产生多个不同功能的RNA和蛋白质亚型.RNA剪接调控具有重要的生物学功能,剪接异常是导致人类遗传疾病的主要原因之一.越来越多的研究表明,剪接异常与肿瘤发生发展及治疗紧密关联,已成为肿瘤生物学及肿瘤遗传领域的研究热点....     

肿瘤细胞中基因选择性剪接的研究进展

选择性剪接是高等真核细胞在转录后水平调控基因表达以及产生蛋白质组多样性的重要机制。选择性剪接过程受多种顺式作用元件和反式作用因子相互作用调节。肿瘤癌基因、抑癌基因、肿瘤转移抑制基因可发生选择性剪接，与肿瘤发生发展关系密切，其蛋白异构体参与基因转录、细胞周期和凋亡等生命过程，对肿瘤生长有一定作用。以选择性剪接蛋白异构体为靶点或干预选择性剪接过程，可望进行肿瘤的分子治疗。     

组织特异性表达基因PLUNC调控元件的生物信息学分析

目的分析组织特异性表达基因PLUNC的调控元件。方法采用进化足迹法,结合生物信息学工具,预测PLUNC基因的顺式作用元件和反式作用因子。结果预测的PLUNC基因的转录起始位点位于-1～＋10bp区域间、-29bp存在TATA盒子,启动子集中在-490bp～＋89bp内,在人和小鼠PLUNC基因的启动子保守区内存在29个共同的转录因子结合部位及5个增强子。结论PLUNC基因调控元件的分析可为探讨上呼吸道特异性表达基因的调控机制提供模型。生物信息学技术结合进化足迹法,在基因表达调控机制的研究中具有重要的应用价值。     

miR-144/451基因簇在肿瘤组织中对相关基因调控概述

微RNA(microRNAs,miRNA)是真核生物中广泛存在的一种内生的小RNA分子,在基因表达、细胞周期、生物体发育时序调控等多方面发挥重要作用。在肿瘤中,miRNA参与调控肿瘤细胞的增殖、凋亡和自噬等过程。miR-144/451基因簇在多种肿瘤组织中低表达,然而其在肿瘤组织中的调控情况还不清楚。本实验室构建了转染空表达载体和过表达miR-451载体的HCT116稳转细胞株的抑制消减杂交文库,从文库中筛选得到B细胞受体相关蛋白31、真核翻译延伸因子1A1、细胞分裂周期蛋白20等基因。本文将对这些受miR144/451调控的基因和其可能参与的调控网络进行阐述。     

基因位点预测的一种特征选择优化算法

目的剪接位点是真核细胞生物基因序列中外显子和内含子的相邻区域,如果能准确预测基因序列中的剪接位点,就能将基因中的表达区域和非表达区域分开.方法从机器学习的角度出发,提出了一种有效的特征选择算法用于剪接位点的建模和预测.该算法首先将初始链模型中每一对父子节点作为特征量提取,然后通过遗传算法和最大后验分类器进行特征选择.结果及结论对剪接位点数据的预测结果显示,这种新算法能够有效地优化链模型的结构,提高对剪接位点的预测能力.同时,经过优化的模型也有助于了解真核细胞中基因转录和表达的过程.     

降钙素的结构功能及其表达调控

降钙素分于(CT)是一种单链多肽激素,在二级结构上具有高度的种间同源性。CT在体内的表达受到多层次的调控,其中包括转录水平、转录后剪切、翻译后加工等。降钙素作为一种激素分子其分泌调节亦呈现复杂的网络式。     

血栓素合酶基因结构及其调控

血栓素合酶（TXS）基因是目前所分离的最大的细胞色素P450的基因家族：13个外显子,12个内含子,跨越193kb。TXS基因有多个转录起始点,有数种转录因子结合位点,其标准的TATA盒不具功能性。TXSmRNA前体经不同剪接产生两种mRNAs,仅一种编码产生功能性的IXS-I。它含有半胱氨酸残基区域,即血红素结合域。4种哺乳动物组织TXTcDNA已克隆成功。     

降钙素基因相关肽与神经损伤修复

中枢及周围神经损伤可导致运动功能障碍,其损伤后的再生修复问题一直是困扰神经科学工作者的一大难题。中枢及周围神经损伤后可引起中枢及外周部位降钙素基因相关肽(calcitonin gene-relatedpeptide,CGRP)的表达变化。而CGRP的表达程度与神经损伤及修复再生的情况有一定的相关性。1降钙素基因相关肽CGRP是1982年Amana等利用基因重组技术发现的第一个活性多肽。1983年Rosenfold等应用基因重组和分子生物学技术分离CGRP,证实了CGRP在人和动物体内存在。CGRP和降钙素属于降钙素基因相关肽家族的成员,来自同一个基因。CGRP由37个氨…     

GLI3基因在单纯性马蹄内翻足发生中的调控机制

目的 探讨在单纯性马蹄内翻足发生过程中GLI3基因的凋控机制.方法 构建荧光素酶报告基因表达载体,分析大鼠Gli3基因5′侧翼启动子区域的活性.用P-Match软件预测Gli3基因上游序列中转录因子的结合位点,并通过染色质免疫沉淀实验、凝胶迁移实验验证.用RNA干扰实验以及构建Hoxd13表达载体,观察其在L6细胞中对Gli3基因表达的影响.结果 在大鼠Gli3基因序列的启动子区域发现2个Hoxd13的结合位点,染色质免疫沉淀和凝胶迁移实验证实Hoxd13结合于结合位点2上.Hoxd13表达下调时,Gli3基因表达明显上调.Hoxd13基因表达上调时,Gli3基因则表达下调.结论 在大鼠胚胎肢体发育中,Hoxd13蛋白可能与Gli3基因启动子区的Hoxd13结合位点2结合,调控Gli3的表达.