基于网络药理学的防己茯苓汤治疗急性肾损伤机制研究

目的:利用网络药理学方法探讨防己茯苓汤治疗急性肾损伤的作用机制。方法:在网络药理学分析平台(TCMSP)检索防己茯苓汤中的化合物,经Swiss Target Prediction数据库获取其对应的靶点,运用Cytoscape3.7.1软件构建化合物-靶点网络并分析拓扑学,在CTD数据库筛选急性肾损伤的作用靶点,Venn分析化合物与疾病靶点,借助STRING数据库构建化合物与疾病靶点蛋白互作网络(PPI),最后在DAVID平台分析基因本体(GO)功能与KEGG通路富集。结果:共筛出防己茯苓汤127种化合物和273个靶点,急性肾损伤的靶点共496个,PPI共58个靶点,GO分析得到58个条目,KEGG分析得到62条信号通路。结论:本研究初步预测防己茯苓汤通过多靶点、多途径的药理作用机制治疗AKI,为深入研究其作用机制及临床运用提供新的思路。     

基于网络药理学-分子对接技术研究柴胡治疗卒中后抑郁的药效物质基础及作用机制

目的：通过网络药理学和分子对接技术,探讨柴胡治疗卒中后抑郁（Post-stroke Depression, PSD）的潜在活性成分和可能的作用机制。方法：利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）和蛋白质序列数据库（Uniprot）筛选出柴胡主要活性成分及其靶点基因,并将目标蛋白名称标准化,通过GeneCards、OMIM数据库获取PSD靶点基因;对两者靶点取交集后采用STRING数据库构建柴胡治疗PSD的潜在靶点的蛋白质-蛋白质相互作用网络图;利用Cytoscape-v3.9.1软件进行核心靶点筛选;利用DAVID数据库对潜在靶点进行基因本体（GO）功能富集分析及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。最后,利用PyMol软件和AutoDockTools-1.5.7软件对柴胡主要活性成分与核心靶点使用分子对接技术绘制相应的分子对接图。结果：共筛选得到柴胡活性成分17个,去重后对应靶点175个,疾病靶点852个,经Venny数据库预测到疾病-药物交集靶点45个。GO功能富集分析结果显示共获得323个GO功能注释,KEGG通路富集分析结果显示获得106条信号通路。分子对接...     

基于网络药理学探讨玄参-麦冬药对治疗焦虑症作用机制

目的 应用网络药理学方法探讨玄参-麦冬药对治疗焦虑症的作用机制,为临床应用玄参-麦冬药对提供依据。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）和中医药整合药理学研究平台（TCMIP）收集玄参、麦冬的化学成分,结合TCMSP、SwissADME数据库及文献筛选活性成分,利用Swiss TargetPrediction数据库预测活性成分作用靶点;通过OMIM、GeneCards、DrugBank数据库获取焦虑症的相关靶点,与活性成分作用靶点取交集;利用STRING数据库建立活性成分-疾病共同靶点蛋白相互作用（PPI）网络,采用Cytoscape3.8软件对PPI网络进行MCODE聚类分析,得出关键靶点;利用DAVID6.8数据库对活性成分-疾病共同靶点进行GO和KEGG富集分析,通过活性成分-靶点-通路网络筛选核心活性成分,用分子对接模拟核心活性成分与关键靶点的结合强度。结果 共筛选出玄参-麦冬药对37个活性成分,潜在靶点471个,焦虑症相关靶点753个,活性成分-疾病共同靶点42个,对其PPI网络进行MCODE聚类分析得到4种类簇,筛选出关键靶点14个。GO和KEGG富集分析显...     

基于网络药理学探讨水蛭防治股骨头坏死的作用机制

目的基于网络药理学探讨水蛭防治股骨头坏死(ONFH)的潜在作用机制。方法应用中药综合数据库(TCMID)及BATMAN-TCM分析工具筛选出单味中药水蛭的活性成分及作用靶点,检索与疾病靶点有关的数据库GeneCadrs、TTD、OMIM筛选ONFH的作用靶点,进而筛选水蛭与ONFH的交集核心靶点,并运用Cytoscape 3.7.1软件构建化合物-靶点-疾病网络,基于DAVID数据库对靶点进行GO功能富集和KEGG通路富集分析。结果基于BATMAN-TCM分析工具预测得出水蛭防治ONFH的活性成分13个和交集靶点28个;GO功能富集分析得到条目153个,其中生物过程条目117个、细胞组成条目10个、分子功能条目26个;KEGG通路富集分析得出条目35个,主要包括PPAR信号通路、TNF信号通路、AMPK信号通路、NF-κB信号通路、TLR信号通路等。结论基于网络药理学初步探讨并验证了水蛭防治ONFH多成分-多靶点-多通路的整体调节作用特点,预测了水蛭防治ONFH的潜在作用机制,以期为其活性成分研究与实验研究提供科学依据。     

基于网络药理学探讨温胆汤治疗高血压分子机制

目的运用网络药理学探讨温胆汤治疗高血压的分子机制。方法通过TCMSP和中医药整合药理学研究平台(TCMIP)筛选温胆汤的潜在活性成分和作用靶点,通过药物靶标数据库(TTD)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、GeneCards数据库收集高血压疾病靶点,STRING数据库进行蛋白相互作用分析,采用Cytoscape v3.7.1构建网络,再用ClueGO进行GO功能和KEGG通路富集分析,最后以适合的分子和靶点进行分子对接。结果共筛选出温胆汤141个潜在活性成分和108个潜在治疗靶点;通过cytoHubba中MCC算法筛选出排位前20的核心靶点,GO分析包含164条显著性条目,包括生物过程133条、分子功能24条、细胞定位7条。KEGG通路富集筛选出7条枢纽通路,且活性成分与靶点间对接良好。结论温胆汤可通过多途径、多靶点治疗高血压,可为其临床应用提供数据。     

基于网络药理学探讨通窍活血汤治疗颅脑损伤的作用机制

目的：基于网络药理学探讨通窍活血汤治疗颅脑损伤(TBI)的作用机制。方法：通过检索中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）数据库筛选出通窍活血汤潜在活性成分及靶点,采用GeneCard与OMIM数据库获得颅脑损伤疾病靶点,得到通窍活血汤的中药与TBI的交集靶点,使用Cytoscape 372软件绘制活性成分靶点疾病交互网络图。采用String数据库构建靶点蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,并进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）信号通路富集分析。结果：筛选后收集得所有中药成分127个,收集疾病靶点1 811个,疾病与药物交集靶点共62个。PPI网络提示核心靶点为ALB、IL6、CASP3、EGFR、VEGFA等;GO功能注释得到73条富集结果,包括DNA结合转录激活剂活性,RNA聚合酶Ⅱ特异性等,富集得到PI3K-AKT等75条核心的KEGG通路。结论：通窍活血汤治疗颅脑损伤具有多成分、多靶点、多通路的作用机制特点。     

基于网络药理学和分子对接探讨肿节风的活性成分及药效机制

目的:运用网络药理学方法预测中药肿节风的药效物质基础与潜在机制。方法:选用TCMSP等数据库搜集肿节风的化学成分,并筛选活性成分;预测活性成分潜在的靶点;应用CTD匹配靶点对应的疾病;采用Cytoscape构建和分析网络;采用STRING进行靶点蛋白质相互作用(PPI)分析;应用GlueGO行基因本体(GO)及京都基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;采用iGEMDOCK进行分子对接。结果:筛选出22个肿节风活性成分,可作用于116个靶点治疗18类疾病。淫羊藿素、苯二甲酸等8种活性成分为肿节风的主要药效物质基础;ALB、EGFR、CASP3及MAPK8等为其关键靶点;分子对接验证了大部分关键活性成分能与关键靶点紧密结合;肿瘤、心血管及消化系统疾病是其主要针对的疾病。靶点富集到92个GO条目和43个KEGG通路上,功能涉及激素相关通路、VEGF信号通路和血小板功能等。结论:本研究运用网络药理学方法探究了肿节风的药效物质基础及其多维药理作用机制,为推广其临床应用和进一步的研究提供了思路。     

基于网络药理学探讨黄芪治疗2型糖尿病有效成分及作用机制

目的:探讨黄芪治疗2型糖尿病(T2DM)的有效成分及潜在靶点。方法:利用中药系统药理学分析平台数据库(TCMSP)筛选黄芪的有效成分,并收集对应的作用靶点;使用Gene Cards、OMIM数据库获取T2DM相关靶点,并筛选黄芪有效成分与T2DM的交集靶点,采用Cytoscape v3.7.2软件和String数据库进行"药物-活性成分-靶蛋白-疾病"及蛋白互作(PPI)网络的构建与分析;通过DAVID数据库对核心靶点进行GO注释和KEGG通路富集分析。结果:筛选出黄芪有效成分20个,与T2DM交集靶点57个。"药物-活性成分-靶蛋白-疾病"网络中Degree排前5的成分为槲皮素、山萘酚、异鼠李素、刺芒柄花素、毛蕊异黄酮。GO功能注释与KEGG通路富集分析共得到116个GO注释,46条KEGG通路,按P值大小,筛选出靠前20个GO注释和KEGG富集通路。结论:结果显示黄芪治疗T2DM的主要有效成分与潜在作用机制具有多成分、多靶点、多通路等特点,为后续深入探讨其具体机制提供思路和基础。     

基于网络药理学的麻黄汤治疗新型冠状病毒肺炎潜在机制研究

目的:运用网络药理学探究麻黄汤治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在机制。方法:从TCMSP、TCM-ID数据库检索并筛选得到麻黄汤中的主要活性成分;通过检索Pub Chem数据库得到每种活性成分的SMILES结构并导入Swiss数据库得到预测靶点;采用CTD数据库筛选得到ARDS的已知治疗靶点,使用Uniprot数据库对所有靶点进行名称校正后,取靶点的交集部分导入String数据库筛选得到网络核心靶点;再采用Cyoscape 3.7.1软件构建药物-靶点-疾病网络进行数据可视化,通过CTD数据库进行GO的生物学过程富集分析和KEGG通路富集分析,预测其潜在作用机制。结果:从麻黄汤中筛选得到78个活性成分、24个潜在靶点;GO富集分析得到生物学过程809条;信号通路分析得到249条显著相关通路。结论:麻黄汤通过作用于多个靶点和多条信号通路,协同干预ARDS进程,从而实现对COVID-19的防治作用。     

基于网络药理学的清热化湿方治疗胃癌的药理机制研究

目的:基于网络药理学技术探讨清热化湿方治疗胃癌的分子作用机制。方法:采用中药系统药理学分析平台(TCMSP)对清热化湿方中可能的活性成分和靶点进行筛选和预测,并构建化合物-靶点网络;检索CTD数据库、GeneCards数据库及OMIM数据库获取胃癌相关靶点,构建疾病-靶点相互作用网络并进行拓扑学分析;筛选药物靶点和疾病靶点相互作用的有效靶点,利用DAVID对有效作用靶点进行GO分析及KEGG的相关通路富集分析。结果:根据OB≥30%及DL≥0.18筛选出118个活性成分及116个可能蛋白靶点。应用Venn图获得54个清热化湿方有效作用靶点。GO分析得到374条富集结果,根据P0.01选择靠前的富集结果;利用KEGG数据库对相关通路富集,筛选靠前的20条信号通路。结论:本研究结果验证了清热化湿方多成分、多靶点、多途径的整体调节特点,预测了清热化湿方治疗胃癌的可能作用机制,为后期实验研究提供了理论依据。     

雷公藤、防己醇提物对淋巴细胞和环氧化酶的影响

目的:探讨雷公藤、防己醇提取物对淋巴细胞和环氧化酶的影响.方法:测定两种药物的醇提物引起小鼠胸腺淋巴细胞和脾脏淋巴细胞增殖的变化,新生小公牛颈动脉内皮细胞的6-keto-PGF1α和小鼠腹腔巨噬细胞的PGE2含量.结果:雷公藤和防己醇提物对小鼠胸腺淋巴细胞和脾脏淋巴细胞的增殖有抑制作用.雷公藤醇提物对环氧化酶-1(COX-1)和环氧化酶-2(COX-2)有不同程度的抑制作用.防己醇提物对COX-1有抑制作用,而对COX-2无抑制作用.结论:两种药物的祛风湿的部分机理可能是由于抑制淋巴细胞增殖和环氧化酶而介导的.     

粉防己中三种双苄基异喹啉生物碱的高效液相色谱法测定

建立了同时测定粉防己Ｓｔｅｐｈａｎｉａ ｔｅｔｒａｎｄｒａ Ｓ．Ｍｏｏｒｅ中粉防己碱、去甲粉防己碱及小檗胺等３种双苄基异喹啉生物碱含量的简便精确的高效液相色谱法，用ＹＧＷ－Ｃ１８１０μｍ为固定相及甲醇－乙腈－水（３∶１∶１）含０．０６％二乙胺为流动相，种生物碱在１０ｍｉｎ内可以完全分离。     

紫外光谱法鉴别粉防己及其混伪品木防己、小果微花藤

目的：建立粉防已及其混伪品木防已、小果微花藤的紫外光谱鉴别方法。方法：采用中药鉴别紫外谱线组法进行实验。结果：粉防已及其混伪口木防已、小果酸花藤的紫外谱线组图像，最大吸收峰数目及其峰位值具有明显差异。结论：该法简便、准确、灵敏，可用于鉴别粉防已及其混伪品木防已、小果微花藤。     

基于网络药理学探索防己治疗痛风性关节炎的作用机制及物质基础＊

目的 基于网络药理学探索防己治疗痛风性关节炎的作用机制及物质基础。方法 制备防己的水提取物冻干粉，随后运用液质联用技术分析其中的化学成分。使用SwissTargetPrediction数据库预测防己化学成分的靶点。在GeneCards数据库和CTD数据库中检索痛风性关节炎的相关靶点。使用Venny 2.1.0对化学成分靶点及痛风性关节炎的相关靶点进行交集分析。运用DAVID数据库分析上述具有交集联系的靶点的KEGG通路。使用Cytoscape软件构建防己的化学成分-痛风性关节炎靶点-通路的关联网络。运用尿酸钠诱导的痛风性关节炎模型对网络药理学分析结果进行验证。结果 通过液质联用技术鉴别了防己中的63个化学成分。其中的17个化学成分有可能干预痛风性关节炎的19个靶点，其中的9个靶点参与了4个关键性通路。在验证性实验中，防己水提取物冻干粉可以逆转大鼠滑膜中由尿酸钠诱导的一氧化氮合成酶2及基质金属肽酶1的异常表达。结论 网络药理学可以用于防己治疗痛风性关节炎的作用机制及物质基础的分析。防己中的多个化学成分主要影响了痛风性关节炎的凋亡、炎症、血管新生及尿酸清除过程。     

基于网络药理学探讨益智仁-乌药治疗糖尿病肾病的有效成分及作用机制

目的基于网络药理学探讨益智仁-乌药治疗糖尿病肾病的有效成分及作用机制。方法运用多个在线数据库查找并筛选益智仁和乌药的活性成分、益智仁和乌药活性成分作用的相关靶点、糖尿病肾病相关的基因;通过UniProt数据库查询靶点对应的基因名;运用Cytoscape 3.2.1构建益智仁-乌药药对化合物对应靶基因网络;运用韦恩图筛选活性成分对应靶点与疾病相关基因的交集基因,并将交集的基因构建蛋白互作关系(PPI)网络;最后用DAVID的数据库对交集的基因做GO功能富集分析和KEGG信号通路富集分析,并将GO与KEGG的结果进行可视化处理。结果共筛选出10个潜在活性成分和相应的108个靶蛋白;益智-乌药药对潜在活性成分靶点与DN的相关基因共有36个交集基因;交集蛋白之间相互作用关联度排名前十的包括:AR与NCOA2、NCOA2与PPARG及NR3C1与NCOA2等;分子功能(MF)的条目有15条、细胞成分(CC)的条目有12条、生物过程(BP)的条目有48条及信号通路有19条(P<0.05)。结论益智仁-乌药通过多成分、多靶点及多环节的协同作用治疗DN。     

基于网络药理学和分子对接探讨防己黄芪汤治疗肾性水肿的机制与通路

[目的]基于网络药理学探讨防己黄芪汤治疗肾性水肿的潜在作用机制,并通过分子对接技术进行验证.[方法]运用中药系统药理学数据库(TCMSP)筛选防己黄芪汤所含有效化合物,分别运用Uniprot、Swiss target predic-tion数据库获取防己黄芪汤作用靶点,根据Gene Card和OMIM数据库获取肾性水肿...     

基于网络药理学探讨清肺化痰方改善慢性阻塞性肺疾病的作用机制

目的:通过网络药理学及分子对接技术探究清肺化痰方改善慢性阻塞性肺疾病急性加重期(AECOPD)气道黏液高分泌的有效成分和潜在分子机制。方法:首先使用中药系统药理学分析平台(TCMSP)收集清肺化痰方的活性成分和潜在靶点,利用GeneGards等多个数据库筛选AECOPD气道黏液高分泌的疾病靶点;然后将疾病靶点与药物预测靶点取交集,借助Cytoscape3.7.2软件构建交集靶点网络以及蛋白质-蛋白质相互作用网络,利用DAVID进行GO和KEGG富集分析。最后,将药物活性成分与疾病靶点进行分子对接。结果:清肺化痰方中54个有效活性成分可通过67个潜在靶标改善AECOPD的气道黏液高分泌,涉及TNF信号通路、IL-17、PI3K-Akt等相关信号通路。槲皮素、木犀草苷、β-谷甾醇等成分与AKT1、IL6、EGF等靶标蛋白结合稳定。结论:初步揭示清肺化痰方可直接改善AECOPD气道黏液高分泌,以及其多靶点、多通路的潜在作用机制,为后续研究提供思路。     

基于网络药理学探讨桂芍配伍治疗骨关节炎的作用机制

目的运用网络药理学技术研究“桂枝—白芍”药对治疗骨关节炎的主要活性成分和靶点,进而探讨桂芍治疗骨关节炎的潜在作用机制。方法通过检测网络数据库平台(TTD、DrugBank和GeneCards)数据库构建骨关节炎疾病靶点;通过检测TCMSP、HIT数据库筛选桂枝—白芍药对活性成分及靶点。利用Cytoscape3.7.2软件构建活性成分—靶点网络图,并对靶点进行KEGG及GO富集分析。结果从“桂枝—白芍”药对中共筛选出17个有效成分,与骨关节炎相关作用靶点40个,KEGG与GO富集分析显示“桂枝—白芍”药对主要与癌症、免疫、炎症以及细胞衰老、凋亡等信号通路有关。结论本研究利用网络药理学的方法,初步揭示了“桂枝—白芍”药对对于骨关节炎的主要活性成分、治疗靶点及相关信号通路,为进一步深入研究其作用机制提供了参考。     

防己黄芪汤抗慢性心力衰竭的作用及靶标分析

目的：探讨中医药经典名方防己黄芪汤防治慢性心力衰竭的可能药效和作用靶点。方法：采用免疫荧光和RT-qPCR方法评价给药后H9c2细胞对去氧肾上腺素诱导的心肌肥大和慢性心力衰竭标志物心房利尿钠肽(ANP)和脑利尿钠肽(BNP)表达的影响。通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)及文献调研收集防己黄芪汤的活性成分和作用靶点;从GeneCards等数据库获取慢性心力衰竭主要靶点,将疾病靶点和药物靶点取交集,利用STRING平台对潜在作用靶点进行相互作用分析,构建网络,采用DAVID以及ClusterProfiler包进行基因本体(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析,并使用Cytoscape 3.7.2软件构建网络图。结果：防己黄芪汤可缓解去氧肾上腺素诱导的心肌细胞增大,减低ANP和BNP基因的表达。防己黄芪汤成分和慢性心力衰竭交集的166个潜在作用靶点主要富集于493个生物过程和171个信号通路上。结论：防己黄芪汤具有防治慢性心力衰竭的体外药效,主要通过槲皮素、芒柄花黄素、粉防己碱、黄芪甲苷等活性成分作用于缺氧、炎症和代谢相关信号通路,达到防治慢性心力衰竭的目的。     

基于网络药理学探讨星蒌承气汤治疗急性脑梗死的作用机制

目的：基于网络药理学探讨星蒌承气汤治疗急性脑梗死的作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）结合文献检索获取星蒌承气汤有效药物成分;在Swiss Target Prediction数据库预测药物成分相关靶点;利用在线人类孟德尔遗传（OMIM）数据库、GeneCards数据库获取急性脑梗死疾病相关靶点;绘制韦恩图得到星蒌承气汤治疗急性脑梗死的潜在作用靶点;采用String数据库、Cytoscape 3.8.0软件构建潜在作用靶点蛋白质-蛋白质相互作用网络、药物-成分-疾病-靶点网络;使用DAVID 6.8数据库对潜在作用靶点进行基因本体（GO）及京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析。结果：通过TCMSP结合相关文献检索共获得星蒌承气汤药物有效成分47个,包括芹菜素、香叶木素、胆酸等;得到星蒌承气汤治疗急性脑梗死潜在作用靶点85个,包括STAT3、ESR1、CCNB1等;共获得GO富集分析功能条目225条,包括生物过程（BP）132条,细胞组分（CC）34条,分子功能（MF）59条;KEGG信号通路共20条,主要包括花生四烯酸代谢、胆汁分泌、cAMP信号通路等。结论：基于网络药理学,从分子层面阐释了星蒌承气汤治疗急性脑梗死的机制可能为抑制氧化应激、抗炎、调节能量代谢、抗凋亡等,为后续实验研究、新药研发提供了线索和依据。