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| 广西地区动物HEV基因型及亚型分布 | |
| 引用本文： | 韦献飞,吉彦莉,唐荣兰,泰小云,梁靖瑞,李凌君,葛宪民,熊云新,谢益安,朱永红.广西地区动物HEV基因型及亚型分布[J].中国公共卫生,2008,24(7):778-780. |
| 作者姓名： | 韦献飞 吉彦莉 唐荣兰 泰小云 梁靖瑞 李凌君 葛宪民 熊云新 谢益安 朱永红 |
| 作者单位： | 1. 柳州医学高等专科学校公共卫生系,柳州,545006 2. 北京大学医学部病原生物学系 3. 广西职业病研究所 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金 , 国家高技术研究发展计划(863计划) , 广西科学基金 |
| 摘 要： | 目的 了解广西地区猪、鼠、狗、猕猴和鱼5种动物戌型肝炎病毒(HEV)基因型和亚型分布.方法 对广西地区猪、鼠、狗HEV抗体阳性血清170份,鼠肝组织150份,3月龄以下狗粪便标本80份,鱼胆汁标本120份,3月龄以下猪粪便标本129份,龙虎山自然景区猴粪便标本130份,用巢式逆转录聚合酶链反应法(RT-nPCR)检测戊型肝炎病毒核糖核酸(HEV RNA),对RT-nPCR阳性扩增产物进行克隆测序,用Vector NTI Suite 9.0和Treeview软件与目前新分型方法所选参考序列进行核苷酸序列相似性比较和生物进化树分析.结果 广西地区170份猪、鼠和狗血清HEV RNA检测均为阴性.在150份鼠肝组织,120份鱼胆汁标本,80份狗和130份猕猴粪便标本中均未检出HEV RNA;3月龄以下猪粪便标本HEV RNA阳性率10.08(13/129).对13株猪HEV开放读码框架(ORF)1区部分核酸序列进行分析,其与Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型HEV的相似性分别为73%～77%,76%～79%,76%～81%,82%～97%;与6个亚型的相似分别为4a:82%～94%;4b:82%～98%;4c:82%～87%;4d:81%～87%;4f:84%～86%;4g:81%～84%,其中2株与N a亚型相似性是高为82%～94%,11株与Ⅳ b亚型相似性最高为82%～98%.结论 广西地区猪HEV均为基因型4,2株属于基因型Ⅳ a,Ⅱ株为Ⅳb.HEV在猪、鼠、狗血清、鼠肝组织、鱼胆汁、狗和猕猴粪便标本中均未检出. |
| 关 键 词： | 戊型肝炎病毒 基因型 亚型 动物宿主 西地区 动物 基因型 亚型分布 animals hepatitis E virus genotypes 在猪 相似性比较 进化树分析 核酸序列 开放读码框架 阳性率 阴性 血清 结果 生物 核苷酸 参考序列 分型方法 |
Study on genotypes and subgenotypes of hepatitis E virus among animals in Cuangxi |
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