| 颞叶癫痫相关基因的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 周烨,石嵘,鲍勇,李长征,谢炜,郑文岭,马文丽.颞叶癫痫相关基因的生物信息学分析[J].南方医科大学学报,2011,31(1):180-183. |
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| 作者姓名： | 周烨 石嵘 鲍勇 李长征 谢炜 郑文岭 马文丽 |
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| 作者单位： | 南方医科大学基因工程研究所;南方医科大学南方医院中医科; |
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| 基金项目： | 广东省医学科研基金(B2007115) |
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| 摘 要： | 目的从分子水平揭示癫痫的发病机制,为癫痫的基础研究和临床治疗提供新思路。方法从基因芯片公共数据库GEO中下载癫痫相关基因芯片数据,利用String、KEGG、Panther等在线分析软件对差异表达基因进行生物信息学分析。结果在71个差异表达基因所编码的蛋白中,有51个存在蛋白与蛋白的相互作用关系;其涉及的主要生物学通路包括刺激神经的配体-受体相互作用通路、促分裂原活化蛋白激酶信号通路、钙信号通路等。结论通过生物信息学分析癫痫相关基因芯片数据,提示癫痫发病是多种基因作用的结果,对相关基因的进一步分析有利于揭示癫痫的发病机制。
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| 关 键 词： | 颞叶癫痫 基因芯片 生物信息学 |
Bioinformatic analysis of genes related to temporal epilepsy |
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| ZHOU Ye,SHI Rong,BAO Yong,LI Chang-zheng,XIE Wei,ZHENG Wen-ling,MA Wen-li.Bioinformatic analysis of genes related to temporal epilepsy[J].Journal of Southern Medical University,2011,31(1):180-183. |
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| Authors: | ZHOU Ye SHI Rong BAO Yong LI Chang-zheng XIE Wei ZHENG Wen-ling MA Wen-li |
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| Institution: | ZHOU Ye1,SHI Rong1,BAO Yong2,LI Chang-zheng2,XIE Wei2,ZHENG Wen-ling1,MA Wen-li1 Institute of Genetic Engineering1,Department of Traditional Chinese Medicine,Nanfang Hospital2,Southern Medical University,Guangzhou 510515,China |
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| Abstract: | Objective To investigate the genes associated with temporal epilepsy and explore the molecular mechanism of epilepsy.Methods The microarray data of temporal epilepsy were downloaded from the Gene Expression Omnibus(GEO) database and analyzed by bioinformatics methods using String,KEGG and Panther databases.Results Of all the 71 differentially expressed genes,51 were found to encode proteins with interactions;the main biological pathways involved included neuroactive ligand-receptor interactions,MAPK signali... |
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| Keywords: | temporal epilepsy DNA microarray bioinformatics |
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