| 宁波地区新生儿轮状病毒VP7基因序列分析 |
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| 引用本文： | 高红,许国章,董红军,胡逢蛟,刘健毅,罗学辉.宁波地区新生儿轮状病毒VP7基因序列分析[J].中国预防医学杂志,2007,8(4):411-415. |
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| 作者姓名： | 高红 许国章 董红军 胡逢蛟 刘健毅 罗学辉 |
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| 作者单位： | 1. 宁波市疾病预防控制中心,浙江,315010
2. 浙江省余姚市疾病预防控制中心 |
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| 摘 要： | 目的研究宁波地区新生儿轮状病毒流行株VP7基因的分子生物学特点以及遗传变异规律。方法通过聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)检测新生儿病毒性腹泻便样中的轮状病毒核酸;选择特殊电泳带型样品通过逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增VP7全基因并测序;测序结果利用DNAstar和Blast软件进行比对。结果通过PAGE发现11份样品中有9份阳性样品,其中带型为4-2-3-2的有7份,带型为3-2-2-2和4-2-1-2的各1份。3种带型各选一株进行VP7基因的扩增并测序,测序结果经分析发现,06NB3和06NB9与G1型标准株Wa的核苷酸同源性为84.4%和91.5%,氨基酸同源性分别为87.4%和94.8%,06NB2与G3型标准株YO的核苷酸同源性为95.3%,氨基酸的同源性为96.6%。结论宁波地区在新生儿中有A组轮状病毒流行,其电泳带型以典型的4-2-3-2为主,也可见特殊带型。06NB3和06NB9的VP7基因片段属G1型,06NB2则属于G3型。06NB3与国内外近几年流行的G1型毒株基因序列有较大差异,06NB9和06NB2则差异较小。
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| 关 键 词： | 新生儿腹泻 轮状病毒 VP7基因 序列分析 |
| 修稿时间： | 2007-01-11 |
Sequence Analysis of Rotavirus VP7 Gene from Neonates in Ningbo Area |
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| CAO Hong , XU Guo-zhang, DONG Hong-jun,et al..Sequence Analysis of Rotavirus VP7 Gene from Neonates in Ningbo Area[J].China Preventive Medicine,2007,8(4):411-415. |
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| Authors: | CAO Hong XU Guo-zhang DONG Hong-jun |
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| Institution: | Center for Diseases Prevention amt Control of Ningbo, Zhefiang 315010, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Neonates diarrhea Rotavirus VP7 gene Sequence analysis |
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